李?;ǎ瑥垺±?,陳龍賓,朱 琪,喬家運(yùn),王文杰
(天津市畜牧獸醫(yī)研究所,天津 300381;天津市畜禽健康養(yǎng)殖技術(shù)工程中心,天津300381)
黑曲霉中單寧酶基因的克隆表達(dá)及酶學(xué)特性分析
李?;?,張蕾,陳龍賓,朱琪,喬家運(yùn),王文杰
(天津市畜牧獸醫(yī)研究所,天津 300381;天津市畜禽健康養(yǎng)殖技術(shù)工程中心,天津300381)
本試驗(yàn)旨在從一株黑曲霉中克隆單寧酶基因,并研究其酶學(xué)性質(zhì)。利用前期分離的一株黑曲霉菌株SL-5,克隆出單寧酶基因,基因全長1533 bp,編碼510個(gè)氨基酸;使用大腸桿菌BL21作為宿主,并使用pET32a(+)作為表達(dá)載體,實(shí)現(xiàn)了單寧酶基因在大腸桿菌中的表達(dá)。純化的單寧酶能夠降解單寧,酶的最適反應(yīng)溫度為40℃,最適反應(yīng)pH為6.0。
單寧;單寧酶;大腸桿菌;克??;表達(dá)
[Abstract]This study was conducted to clone tannase gene from Aspergillus niger and investigate its tannin-degrading characterization.We cloned the tannase gene from Aspergillus niger(SL-5),and the open reading frame of the gene contained 1533 bp coding for a 510 amino-acid matured protein,and expressed the tannase protein(rTannase)in Escherichia coli by using pET32a(+)vector.We found that the purified tannase was able to degrade hydrolysable tannin,exhibiting optimal enzyme activity at 40℃and pH 6.0.
[Key words]tannins;tannase;Escherichia coli;cloning;expression
單寧廣泛分布于植物的各部位,如樹葉、樹皮、樹干和種子。根據(jù)其結(jié)構(gòu)和特性,通常分為水解單寧和縮合單寧 (Khanbabaee和 van Ree,2001)。飼料中高濃度的單寧會(huì)降低反芻動(dòng)物的生產(chǎn)性能和飼料轉(zhuǎn)化效率,通常使用聚乙二醇和聚乙烯基吡咯烷酮這兩種化學(xué)物質(zhì)去除單寧的危害(Ephraim等,2005),但通常處理成本較高。單寧酶 (E.C.3.1.1.20)能切割水解單寧之間的酯鍵(Battestin和Macedo 2007),某些微生物能分泌單寧 酶(B?er等 ,2009;O'Donovan和 Brooker,2001)。但是,由于單寧酶的產(chǎn)量較低,而且生產(chǎn)條件苛刻,限制了其在飼料中的應(yīng)用。因此,采用基因工程技術(shù)提高單寧酶的產(chǎn)量有重要意義。
本研究使用實(shí)驗(yàn)室前期分離到的一株能降解單寧的黑曲霉菌株SL-5(喬家運(yùn)等,2011),克隆其中含有的單寧酶基因,并實(shí)現(xiàn)在大腸桿菌中的表達(dá)。
1.1菌株、載體和工程菌黑曲霉SL-5菌株為本實(shí)驗(yàn)室分離,用于基因組DNA的提取。pET-32a(+)載體購自Novagen公司,用于構(gòu)建單寧酶大腸桿菌表達(dá)載體。E.coli BL21感受態(tài)細(xì)胞由中國農(nóng)業(yè)大學(xué)惠贈(zèng),用于單寧酶的表達(dá)。
1.2主要試劑基因組DNA提取試劑盒、小量DNA片段快速膠回收試劑盒、小量質(zhì)粒提取試劑盒、dNTPs(10 mmol/L)和DNA分子量標(biāo)準(zhǔn),均購自天根生化科技有限公司;高保真Taq DNA聚合酶和DNA快速連接試劑盒均購自Takara公司;限制性內(nèi)切酶EcoR I和HindⅢ購自NEB公司;Gold-View核酸染料購自賽百盛;異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)購自博大泰恒生物技術(shù)有限責(zé)任公司;蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)購自Fermentas公司;BCA蛋白定量分析試劑盒購自美國Pierce公司。
1.3引物設(shè)計(jì)與合成根據(jù)GenBank已經(jīng)發(fā)表的單寧酶基因序列 (登錄號(hào):XM-001402449.1),用Premier5.0設(shè)計(jì)引物。上游引物 (Tan-F):5'-CGGAATTCTGCAATGTCACTGTTACC-3';下游引物(Tan-R):5'-CCCAAGCTTGAAAACGGGCATCT TG-3'。上下游引物分別引入EcoR I和HindⅢ酶切位點(diǎn)(下劃線)及相應(yīng)的保護(hù)性堿基。PCR產(chǎn)物包含完整的單寧酶基因,同時(shí)單寧酶基因與pET-32a(+)載體上的his-tag標(biāo)簽處于同一個(gè)ORF中,獲得的重組質(zhì)粒命名為pET32a-Tan。引物由北京奧科生物有限公司合成。
1.4單寧酶基因的克隆與表達(dá)
1.4.1單寧酶基因的克隆按照基因組DNA提取試劑盒操作說明提取黑曲霉菌DNA。以提取的DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR反應(yīng)體系(50 μL):10×PCR Buffer 5 μL,dNTPs(10 mmol/L each)1μL,上游引物和下游引物各2μL(10pmol/L),模板5 μL,高保真Taq DNA聚合酶(5 U/μL)1 μL,補(bǔ)加去離子水至50 μL。反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性4 min;94℃變性30 s,50℃退火30 s,72℃延伸2 min,共35個(gè)循環(huán);72℃終延伸5 min。PCR擴(kuò)增結(jié)束后,取5 μL反應(yīng)產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳,凝膠成像系統(tǒng)下觀察擴(kuò)增結(jié)果。
1.4.2單寧酶基因原核表達(dá)載體構(gòu)建與鑒定將PCR產(chǎn)物特異性片段切下,用小量DNA片段快速膠回收試劑盒回收目的片段。根據(jù)操作說明分別用EcoR I和HindⅢ限制性內(nèi)切酶對(duì)回收純化的PCR產(chǎn)物和pET-32a(+)載體進(jìn)行雙酶切,并對(duì)雙酶切產(chǎn)物進(jìn)行切膠回收和純化。取4 μL雙酶切目的片段、1 μL雙酶切pET-32a(+)載體和5 μL連接液(Takara公司產(chǎn)品)在16℃下連接反應(yīng)4 h。將連接產(chǎn)物(pET-32a-Tan)化學(xué)轉(zhuǎn)化E.coli BL21感受態(tài)細(xì)胞,并涂布在含Amp+ (100 μg/mL)的LB平板上,37℃培養(yǎng)12 h,進(jìn)行抗性篩選。挑取抗性篩選為陽性的單菌落培養(yǎng)后,提取重組質(zhì)粒pET-32a-TanE,利用雙酶切質(zhì)粒的方法鑒定陽性克隆。將雙酶切鑒定為陽性的克隆送往諾賽基因公司測(cè)序。利用DNAMAN軟件分析Tan基因擴(kuò)增和原核表達(dá)載體構(gòu)建的正確性。
1.4.3重組質(zhì)粒在大腸桿菌中的誘導(dǎo)表達(dá)及SDSPAGE分析將測(cè)序正確的工程菌株接種于LB液體培養(yǎng)基中 (含100 μg/mL氨芐青霉素),37℃過夜振蕩培養(yǎng)。按1%接種于100 mL含Amp的LB液體培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)至OD600為0.5~0.6,菌液經(jīng)冰浴降溫后,加入IPTG至終濃度為0.5 mmol/L,16℃低溫誘導(dǎo)培養(yǎng)12 h,收集菌體,同時(shí)設(shè)只含表達(dá)載體pET-32a(+)的E.coli BL21對(duì)照。誘導(dǎo)完成后,各取1 mL菌液,分別加入SDS上樣緩沖液,懸浮混勻,100℃水浴5 min,12000 r/min離心2 min,取上清經(jīng)12%SDS-PAGE電泳,考馬斯亮蘭染色,脫色,分析蛋白表達(dá)情況。
1.4.4單寧酶活性分析酶活測(cè)定:取4支潔凈的10 mL具塞試管,分別設(shè)定為對(duì)照平行管和測(cè)定平行管,在每支試管中先后各加入0.01 mol/L檸檬酸緩沖液和1 mL酶液,40℃下平衡5 min,先將4 mL 99%乙醇加入對(duì)照管中,使酶失活。5 min后,在4支試管中加入底物沒食子酸丙酯溶液,40℃保溫,準(zhǔn)確反應(yīng)10 min,在測(cè)定管中加入4 mL 99%乙醇終止反應(yīng)。從上述4支試管中各取1 mL反應(yīng)液,分別定容至10 mL,并測(cè)定其在270 nm處吸收值(A)。以重蒸水代替底物溶液重復(fù)上述操作作為空白。將反應(yīng)溫度為40℃條件下,1 mL酶液每分鐘使PG液在270 nm處減少0.001個(gè)吸收值定義為1個(gè)酶活力單位。
酶蛋白濃度測(cè)定:純化后的單寧酶濃度測(cè)定參照BCA蛋白定量分析試劑盒的方法進(jìn)行。
1.4.5單寧酶特性分析最適反應(yīng)溫度:分別在20、30、40、50、60、70℃時(shí)測(cè)定單寧酶活性,結(jié)果以相對(duì)酶活性進(jìn)行表示。
酶最適反應(yīng)pH:分別采用pH 3.0、4.0、5.0、6.0、7.0的檸檬酸緩沖液測(cè)定酶活性,結(jié)果以相對(duì)酶活性進(jìn)行表示。
2.1單寧酶基因的克隆以黑曲霉菌的全基因組為模板,以Tan-F和Tan-R為引物,按照1.4.1中的PCR反應(yīng)體系和反應(yīng)條件擴(kuò)增出大小為1500 bp的特異性條帶,與預(yù)期大小一致(圖1)。
圖1 黑曲霉菌單寧酶基因的PCR擴(kuò)增
2.2重組質(zhì)粒pET32a-Tan的構(gòu)建與鑒定將PCR擴(kuò)增的特異性片段回收純化后,用EcoR I和HindⅢ酶切并純化,連接到相同酶切回收后的原核表達(dá)載體pET-32a(+)上,獲得pET-32a-Tan原核表達(dá)載體,轉(zhuǎn)化E.coli BL21。對(duì)抗性篩選為陽性的重組質(zhì)粒用EcoR I和HindⅢ進(jìn)行雙酶切鑒定,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),結(jié)果可見載體條帶5900 bp和目的條帶1500 bp(圖2),與預(yù)期大小一致。雙酶切鑒定為陽性克隆的測(cè)序結(jié)果,通過DNAMAN軟件分析,發(fā)現(xiàn)Tan基因無核苷酸突變,Tan基因與載體上的tag-his標(biāo)簽處于同一個(gè)ORF中,說明重組質(zhì)粒pET32a-Tan構(gòu)建正確。
圖2 重組質(zhì)粒雙酶切結(jié)果
2.3原核表達(dá)產(chǎn)物的檢測(cè)將鑒定正確的pET32a-Tan轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)該工程菌12 h后,通過12%SDS-PAGE分析,可見約76 kDa的蛋白條帶,這與預(yù)期的Tan-his融合蛋白大小相符(利用EXPASY在線預(yù)測(cè))。重組蛋白可溶性分析表明,單寧酶重組蛋白是以可溶性形式表達(dá)。利用Ni-NTA柱在天然條件下純化單寧酶重組蛋白,純化的蛋白液經(jīng)12%SDSPAGE分析后,有約76 kDa的Tan-his融合蛋白條帶,并且純度較高(圖3)。試驗(yàn)結(jié)果說明,單寧酶基因在大腸桿菌中得到表達(dá),并且已經(jīng)成功獲得較高純度的單寧酶重組蛋白。
圖3 SDS-PAGE分析單寧酶重組蛋白的表達(dá)和純化
2.4重組單寧酶酶學(xué)特性分析由圖4和圖5可以看出,重組單寧酶的最適反應(yīng)溫度是40℃,最適反應(yīng)pH值在5.0~6.0。
圖4 單寧酶最適反應(yīng)溫度分析
圖5 單寧酶最適pH反應(yīng)分析
單寧廣泛存在于各種植物當(dāng)中,與纖維素、蛋白質(zhì)、酶、脂肪、核酸和氨基酸等物質(zhì)形成復(fù)合物,可對(duì)微生物產(chǎn)生抗性 (O'Donovan和 Brooker,2001)。當(dāng)飼料干物質(zhì)中單寧含量超過6%時(shí),會(huì)降低動(dòng)物的飼料采食量、生長速度、體增重和養(yǎng)分利用效率,采食單寧量更高時(shí)會(huì)造成動(dòng)物死亡,這是由于在動(dòng)物的解毒過程中,沒有消除單寧或者其降解產(chǎn)物的毒性(Bhat等,1996)。通過分泌脯氨酸含量豐富的唾液蛋白,小鼠能耐受高濃度的單寧(Mehansho等,1987),但對(duì)于牛和羊等反芻動(dòng)物來說,脯氨酸含量豐富的唾液蛋白并不起關(guān)鍵作用(Bhat等,1996),這說明不同動(dòng)物耐受單寧能力的機(jī)制并不相同。
從不同來源的樣品中分離到能降解單寧的細(xì)菌和真菌(Bo·er等,2009;O'Donovan和Brooker,2001),其中部分微生物能產(chǎn)生胞外單寧酶(Belur等,2010;Kasieczka-Burnecka等,2007)。有研究報(bào)道黑曲霉產(chǎn)單寧酶的能力很強(qiáng),因此,黑曲霉已被應(yīng)用于多種工業(yè)生產(chǎn)中(Gupta等,1997)。
采用基因工程技術(shù)生產(chǎn)目標(biāo)蛋白有很多優(yōu)點(diǎn),如培養(yǎng)條件簡單、目標(biāo)蛋白產(chǎn)量和純度高、價(jià)格便宜等。目前已經(jīng)從不同有機(jī)體中克隆了單寧酶的基因,如黑曲霉 CBS(GenBank No.XM-001402449)、米曲霉(GenBank No.D63338)和褶皺裸胞殼NH4(GenBank No.JX104141),不同來源的單寧酶的分子量為186~300 kDa(Hatamoto等,1996)。研究發(fā)現(xiàn),米曲霉所產(chǎn)的單寧酶是由兩個(gè)分子量分別為30 kDa和33 kDa的亞基通過二硫鍵交聯(lián)而成(Hatamoto等,1996)。本研究從黑曲霉克隆到的單寧酶基因(GenBank No.JN848716),通過序列比對(duì),與已經(jīng)公布的不同來源的單寧酶核酸序列相似性分別為93%(黑曲霉CBS,GenBank No.XM-001402449)、92%(褶皺裸胞殼,GenBank No.JX104141)和76%(米曲霉,GenBankNo.D63338)。酵母表達(dá)系統(tǒng)需翻譯后修飾,并且表達(dá)量高,通常用于生產(chǎn)真核蛋白。研究報(bào)道,采用酵母表達(dá)系統(tǒng)成功表達(dá)重組單寧酶 (B?er等,2011;Zhang等,2004)。本研究中,嘗試使用大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)生產(chǎn)單寧酶,并實(shí)現(xiàn)成功表達(dá)。當(dāng)使用大腸桿菌BL21菌株作用宿主,并使用pET32a(+)作為載體進(jìn)行外源蛋白表達(dá)時(shí),一部分蛋白分泌進(jìn)入細(xì)胞周質(zhì)中,另一部分形成包涵體。測(cè)定酶活性時(shí)僅限于純化的細(xì)胞周質(zhì)中的酶蛋白,因此本研究測(cè)定的重組單寧酶活性較低。在下一步研究當(dāng)中,需要關(guān)注是否有其他因素影響單寧酶的活性,如何采用其他表達(dá)系統(tǒng)提高酶的產(chǎn)量,以及酶活性和酶蛋白結(jié)構(gòu)之間的關(guān)系。
本研究從產(chǎn)單寧酶的黑曲霉菌株中克隆出了單寧酶基因,并實(shí)現(xiàn)其在大腸桿菌中的表達(dá),純化的重組單寧酶最適反應(yīng)溫度是40℃,最適反應(yīng)pH是6.0。
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