虞小燕++鄧百萬++陳文強(qiáng)
摘要:利用拮抗試驗(yàn),萌發(fā)試驗(yàn)和ITS序列分析技術(shù)對(duì)秦巴山區(qū)12個(gè)天麻萌發(fā)菌菌株進(jìn)行了親緣關(guān)系分析。結(jié)果表明:12個(gè)萌發(fā)菌菌株分為兩大類,其中8103-4、8103-6、8103-7、8103-8這4個(gè)菌株與其他菌株拮抗反應(yīng)明顯,并且ITS序列分析顯示在同一個(gè)分支上,親緣關(guān)系相近;萌-3、萌-7、萌MD-2、萌發(fā)菌、石斛-1、石斛-2、萌-云南此8個(gè)菌株拮抗反應(yīng)不明顯,ITS序列分析顯示在同一個(gè)分支上,8103-3、萌發(fā)菌與標(biāo)準(zhǔn)菌種Mycena citrinomarginata親緣關(guān)系相近,萌MD-2、石斛小菇-1、萌-3、萌-7、石斛小菇-2、萌-云南與Mycena purpureofusca親緣關(guān)系相近。
關(guān)鍵詞:天麻萌發(fā)菌;拮抗;rDNA序列;親緣關(guān)系
中圖分類號(hào):S182文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A文章編號(hào):1002-1302(2016)05-0245-04
萌發(fā)菌隸屬于擔(dān)子菌綱(Basidiomyeetes)傘菌目(Agarieales)口蘑科(Trieholomataeeae)小菇屬(Myeena)[1],主要包括紫萁小菇(M . mosmundicola)、石斛小菇(M . mdendrobii)和開唇小菇(M . manoectochila)三大類屬。天麻萌發(fā)菌主要分布于我國陜西、云南、甘肅、河南、河北、湖南、湖北、貴州、新疆、四川、安徽、黑龍江、吉林、廣西、海南、福建、內(nèi)蒙古、西藏及臺(tái)灣等省區(qū)[2],為天麻(Gastrodia elata)有性繁殖時(shí)的必要共生菌。天麻種子細(xì)小如粉塵,無胚乳及其營(yíng)養(yǎng)貯備,無外源營(yíng)養(yǎng)供給,種子不能發(fā)芽。它的萌發(fā)靠小菇屬(Mycena)一類真菌菌絲侵染種胚提供營(yíng)養(yǎng),促使其萌發(fā)[3]。隨著天麻藥用需求不斷增加,野生資源日益匱乏,且人工栽培中以無性繁殖來連續(xù)種植,天麻球莖明顯退化,側(cè)芽發(fā)芽率低等原因,經(jīng)過有性繁殖培育0代天麻或1代天麻,再通過無性繁殖擴(kuò)大種植已成為天麻穩(wěn)產(chǎn)和高產(chǎn)的重要途徑[4-5]。目前,國內(nèi)外對(duì)天麻萌發(fā)菌種質(zhì)資源研究報(bào)道較少,且主要集中于地區(qū)優(yōu)良栽培品種的篩選和生物學(xué)特性的研究,如冉孝琴等對(duì)貴州天麻萌發(fā)菌優(yōu)良菌株進(jìn)行了篩選[6];李方安等對(duì)紫萁小菇生物學(xué)特性進(jìn)行了初步研究[7]。
由于天麻萌發(fā)菌菌株市場(chǎng)上命名混雜,且物種間形態(tài)差異不大,通過形態(tài)鑒定較為困難。目前,秦巴山區(qū)天麻萌發(fā)菌菌種的親緣關(guān)系尚無相關(guān)研究報(bào)道,萌發(fā)菌菌種的種源關(guān)系不明確,缺少適宜地域栽培生長(zhǎng)的天麻萌發(fā)菌菌種,對(duì)于培育出適合秦巴山區(qū)栽培的優(yōu)良高產(chǎn)菌種的難度較大。利用rDNA ITS序列分析技術(shù)[8],可以直接提取蘊(yùn)含于基因組內(nèi)的遺傳信息,檢測(cè)和比較傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)無法區(qū)分的相似菌株種間或種內(nèi)差別,具有快速、靈敏、準(zhǔn)確的優(yōu)點(diǎn)。筆者選取秦巴山區(qū)8103-3、8103-4、8103-6、8103-7、8103-8、萌-3、萌-7、萌MD-2、萌發(fā)菌、石斛-1、石斛-2、萌-云南共12個(gè)天麻萌發(fā)菌主要栽培菌株,對(duì)其形態(tài)特征及核糖體轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)進(jìn)行序列分析,并進(jìn)一步對(duì)ITS序列進(jìn)行核酸序列數(shù)據(jù)庫GenBank同源性檢索比對(duì),構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,以期為基于傳統(tǒng)形態(tài)特征對(duì)秦巴山區(qū)天麻萌發(fā)菌菌株之間的親緣關(guān)系提供分子依據(jù),為天麻萌發(fā)菌建立種質(zhì)資源庫及優(yōu)良菌種的選育提供依據(jù)。
1材料與方法
1.1材料
1.1.1供試菌株8103-3、8103-4、8103-6、8103-7、8103-8、萌-3、萌-7、萌MD-2、萌發(fā)菌、石斛-1、石斛-2、萌-云南共12株萌發(fā)菌菌株:由陜西省資源生物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室食藥用菌菌種保藏中心提供。
1.1.2改良CPDA培養(yǎng)基包括馬鈴薯200.0 g,玉米粉 50.0 g,葡萄糖20.0 g,KH2PO4 5.0 g,MgSO4·7H2O 3.0 g,NH4NO3 5.0 g,維生素B1 10 mg,瓊脂 15.0 g,加水至1 000 mL,pH值自然。CPDA液體培養(yǎng)基,根據(jù)上述改良CPDA培養(yǎng)基配制,但不加添瓊脂。
1.2方法
1.2.1拮抗試驗(yàn)制備試管斜面培養(yǎng)基,活化各菌株,每株3管;取試管活化菌株在同一培養(yǎng)皿上對(duì)稱接種2個(gè)菌株,24 ℃ 恒溫培養(yǎng)7 d,觀察菌絲間的拮抗反應(yīng)情況。
1.2.2萌發(fā)試驗(yàn)青岡木樹葉浸泡24 h后,平鋪在培養(yǎng)皿表面,接種各萌發(fā)菌菌株,每株3個(gè),24 ℃ 恒溫培養(yǎng)7 d,選取未開裂、顏色較深、富有彈性且大小相近的天麻果實(shí),均勻播撒在培養(yǎng)皿中,24 ℃ 恒溫培養(yǎng)60 d,期間定期定量加水,觀察萌發(fā)情況。
1.2.3液體發(fā)酵制備CPDA液體培養(yǎng)基,分裝于250 mL三角瓶中,每瓶裝液量150 mL,于1.034×105 Pa滅菌 30 min,冷卻后將活化的菌株接種至液體搖瓶中,靜置24 h后,24 ℃、160 r/min振蕩培養(yǎng)7 ~12 d。用3層無菌紗布過濾菌絲球,再用無菌水洗滌過濾2~3次,最后用無菌濾紙吸干水分收集菌絲體。4 ℃冰箱保存,備用。
1.2.4DNA的提取及擴(kuò)增采用CTAB法提取供試菌絲體的基因組DNA[10];PCR擴(kuò)增:ITS引物:ITS 1(5′-3′)TCCGTAGGTGAA-CCTGGG,ITS 4(5′-3′)TCCTCCGCTTATTGA-TATGC。PCR反應(yīng)體系:2×Taq PCR Green Mix 15 μL,引物ITS 1、ITS 4各2 μL,模板DNA 2 μL,加滅菌雙蒸水至30 μL。PCR擴(kuò)增程序:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性1 min,55 ℃ 退火45 s,72 ℃延伸1 min,30個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。采用1%的瓊脂糖凝膠進(jìn)行45 min電泳。
1.2.5測(cè)序及構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)的上述PCR產(chǎn)物由上海生工生物技術(shù)服務(wù)有限公司進(jìn)行雙向測(cè)序。將所測(cè)的序列用Clustal-W軟件進(jìn)行對(duì)位排列,然后手工適當(dāng)校正。隨后將調(diào)整后的序列提交GenBank數(shù)據(jù)庫并進(jìn)行Blast檢索,下載同源性較高的序列。利用Mega 6軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
2結(jié)果與分析
2.112株天麻萌發(fā)菌的拮抗反應(yīng)
12株天麻萌發(fā)菌通過相互之間的兩兩接觸性試驗(yàn),結(jié)果見圖1、表1,分析得出8103-4、8103-6、8103-7、8203-8之間無拮抗反應(yīng)或反應(yīng)不明顯,與其他菌株之間拮抗反應(yīng)明顯,故此4株菌親緣性相近;萌-3、萌-7、萌發(fā)菌、石斛-1、萌-云南之間無拮抗反應(yīng)或反應(yīng)不明顯,與8103-3,萌MD-2,石斛-2之間拮抗反應(yīng)微弱,故可將此8株菌分成2組來進(jìn)一步研究。
2.212株萌發(fā)菌對(duì)天麻種子萌發(fā)研究
12株天麻萌發(fā)菌與天麻種子伴栽后萌發(fā)情況見圖2、表2。萌-3、萌-7、萌發(fā)菌、石斛-1、萌-云南 5株菌中天麻種子萌發(fā)數(shù)量多,萌發(fā)均勻,天麻生長(zhǎng)健壯,色澤鮮艷;8103-4、8103-6、8103-7、8203-8這4株菌中天麻種子萌發(fā)數(shù)量稀少或沒有,天麻瘦小萎蔫,色澤暗淡;8103-3、萌MD-2、石斛-2中天麻種子萌發(fā)數(shù)量較少,天麻種子萌發(fā)不均勻,天麻生長(zhǎng)良好,色澤鮮艷。
2.3供試菌株ITS-PCR擴(kuò)增后電泳結(jié)果
取5 μL PCR產(chǎn)物,用10 g/L瓊脂糖凝膠(TBE緩沖液)電泳檢測(cè),于Tanon 3500R凝膠成像系統(tǒng)(中國TANON公司產(chǎn)品)拍照,電泳結(jié)果見圖3。
由圖3可見,12個(gè)天麻萌發(fā)菌菌株的基因組DNA經(jīng)PCR擴(kuò)增后獲得了單一的條帶,菌種的rDNA ITS區(qū)域的序列片段長(zhǎng)度大小為600 bp。將所獲得的12個(gè)ITS序列提交給NCBI公共數(shù)據(jù)GenBank進(jìn)行比對(duì),分析得到8103-3、8103-4、8103-6、8103-7、8103-8、萌-3、萌-7、萌MD-2、萌發(fā)菌、石斛-1、石斛-2、萌-云南收錄號(hào)依次為:KT149154、KT149155、KT149156、KT149157、KT149158、KT149159、KT149160、KT149161、KT149162、KT149163、KT149164、KT149165。
2.3系統(tǒng)發(fā)育樹分析
從GenBank上進(jìn)行Blast檢索,下載同源性較高的菌株序列,用Clustal-W軟件對(duì)所有序列進(jìn)行人工校正,再用MEGA 6采用臨近相鄰法聚類,經(jīng)自舉法檢驗(yàn)(1 000次重復(fù))構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
菌株菌絲特征天麻長(zhǎng)勢(shì)特征種子出芽快慢8103-3潔白,致密,絨毛狀分布不均勻,個(gè)體差異大,出現(xiàn)畸形,色澤鮮艷,分支多緩慢8103-4潔白,稀疏,絨毛狀分布均勻,個(gè)體瘦小萎蔫,色澤暗淡較快8103-6潔白,稀疏,絨毛狀分布均勻,個(gè)體瘦小萎蔫,色澤暗淡較快8103-7潔白,稀疏,絨毛狀分布均勻,個(gè)體瘦小萎蔫,色澤暗淡較快8103-8潔白,稀疏,絨毛狀分布均勻,個(gè)體瘦小萎蔫,色澤暗淡較快萌-3潔白,致密,絨毛狀大小均一,生長(zhǎng)健壯,色澤鮮艷,分支多,分布均勻快萌-7潔白,稀疏,絨毛狀大小均一,生長(zhǎng)健壯,色澤鮮艷,分支多,分布均勻快萌MD-2潔白,稀疏,絨毛狀分布不均勻,個(gè)體差異大,出現(xiàn)畸形,色澤鮮艷,分支多緩慢萌發(fā)菌潔白,稀疏,絨毛狀大小均一,生長(zhǎng)健壯,色澤鮮艷,分支多,分布均勻快石斛-1潔白,致密,絨毛狀大小均一,生長(zhǎng)健壯,色澤鮮艷,分支多,分布均勻快石斛-2潔白,稀疏,絨毛狀分布不均勻,個(gè)體差異大,出現(xiàn)畸形,色澤鮮艷,分支多緩慢萌-云南潔白,致密,絨毛狀大小均一,生長(zhǎng)健壯,色澤鮮艷,分支多,分布均勻快8103-4、8103-6、8103-7、8103-8這4個(gè)菌在同一個(gè)分支上,親緣關(guān)系密切,與已知序列相似度為99%,但在進(jìn)化樹上形成了單獨(dú)的分支,這可能是新的分類單元;8103-3、萌-3、萌-7、萌MD-2、萌發(fā)菌、石斛-1、石斛-2、萌-云南這8個(gè)菌在同一個(gè)分支上,其中8103-3、萌發(fā)菌與標(biāo)準(zhǔn)菌Mycena citrinomarginat親緣關(guān)系比較近,萌MD-2、石斛小菇-1與標(biāo)準(zhǔn)菌種Mycena purpureofusca親緣關(guān)系非常近。
3討論與結(jié)論
真菌的拮抗反應(yīng)是體細(xì)胞不親和的直接體現(xiàn)。在真菌界,體細(xì)胞不親和現(xiàn)象普遍存在。此方法具有簡(jiǎn)單、快捷、直觀等優(yōu)點(diǎn)。是常用的真菌菌種鑒定方法;ITS rDNA區(qū)進(jìn)化速率較快,在絕大多數(shù)真核生物中表現(xiàn)出極為廣泛的序列多態(tài)性,對(duì)高等植物和大型真菌鑒定有很好的準(zhǔn)確性和靈敏性,適用于不同真菌鑒定及系統(tǒng)發(fā)育分析。結(jié)合拮抗反應(yīng)和ITS序列分析對(duì)天麻萌發(fā)菌進(jìn)行親緣關(guān)系分析具有極高的準(zhǔn)確性。
本研究應(yīng)用拮抗反應(yīng)和萌發(fā)特性對(duì)萌發(fā)菌菌株進(jìn)行研究,對(duì)其中菌絲粗壯,菌落致密,生長(zhǎng)速度快萌發(fā)效果好的菌種進(jìn)行標(biāo)記篩選,通過對(duì)12株天麻萌發(fā)菌間的拮抗反應(yīng)以及與天麻種子萌發(fā)試驗(yàn)的分析,大致將12株萌發(fā)菌分為3類:萌-3、萌-7、萌發(fā)菌、石斛-1、萌-云南,此5株菌株長(zhǎng)勢(shì)相同,萌發(fā)效果好,株長(zhǎng)勢(shì)相同,與其他菌株拮抗反應(yīng)明顯,萌發(fā)效果不理想;103-3、萌MD-2、石斛-2此3株菌與8103-4、8103-6、8103-7、 8103-8拮抗反應(yīng)明顯與其他菌株拮抗反應(yīng)不明顯,萌發(fā)效果較好。應(yīng)用ITS序列分析技術(shù),對(duì)秦巴山區(qū)天麻萌發(fā)菌菌種進(jìn)行了測(cè)序分析,將其分為2類,其中8103-4、8103-6、8103-7、 8103-8這4個(gè)菌在同一個(gè)分支上,相似度為100%,親緣關(guān)系相近,但在進(jìn)化樹上形成了單獨(dú)的分支,形成了新的分類單元;萌-3、萌-7、萌MD-2、萌發(fā)菌、石斛小菇-1、石斛小菇-2、萌-云南8個(gè)菌在同一個(gè)分支上,其中8103-3、萌發(fā)菌與標(biāo)準(zhǔn)菌Mycena citrinomarginata親緣關(guān)系比較近,萌MD-2、石斛-1、萌-3、萌-7、石斛-2、萌-云南與標(biāo)準(zhǔn)菌株Mycena purpureofusca親緣關(guān)系較近。這與拮抗試驗(yàn)及萌發(fā)試驗(yàn)得到的結(jié)論大致相同。由于在實(shí)際生產(chǎn)種存在突變、變異、進(jìn)化的原因,菌株間存在物種多樣性的影響,對(duì)秦巴山區(qū)12個(gè)天麻萌發(fā)菌供試菌株進(jìn)行RAPD和酯酶同工酶指紋圖譜的分析還有待進(jìn)一步研究。
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