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湖南和福建辣椒上辣椒脈斑駁病毒的檢測(cè)及系統(tǒng)發(fā)育分析

2016-07-23 19:05劉健張德詠張松柏
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2016年5期
關(guān)鍵詞:檢測(cè)

劉健++張德詠++張松柏

摘要:辣椒脈斑駁病毒(Chilli veinal mottle virus,ChiVMV),目前在我國(guó)僅有在海南黃燈籠辣椒上嚴(yán)重危害的報(bào)道。利用湖南省和福建省采集的辣椒樣本,檢測(cè)辣椒ChiVMV的檢出率,并克隆ChiVMV的CP基因序列,用鄰近法構(gòu)建了系統(tǒng)進(jìn)化樹,分析其遺傳進(jìn)化情況。結(jié)果表明,辣椒的ChiVMV省檢出率湖南省為25%,福建省為20%;克隆了湖南省和福建省ChiVMV CP基因各1個(gè),系統(tǒng)發(fā)育表明,湖南省和福建的ChiVMV株系與源于韓國(guó)ChiVMV株系聚在一個(gè)亞簇,而與我國(guó)其他地區(qū)ChiVMV親緣關(guān)系較遠(yuǎn),表明侵染辣椒的ChiVMV在我國(guó)進(jìn)一步擴(kuò)展,且存在遺傳分化趨勢(shì)。

關(guān)鍵詞:辣椒脈斑駁病毒;檢測(cè);CP基因;系統(tǒng)發(fā)育分析

中圖分類號(hào): S436.418.1+9文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2016)05-0184-02

辣椒,一種茄科辣椒屬植物,原產(chǎn)于中南美洲熱帶地區(qū),在全世界都有廣泛栽培,是世界上消費(fèi)量最大的蔬菜之一。我國(guó)辣椒種植面積高達(dá)140萬hm2以上,占據(jù)我國(guó)所有蔬菜作物種植面積的10%[1]。辣椒病毒病是威脅辣椒安全生產(chǎn)的重要病害,目前能夠侵染辣椒的病毒有40多種[2-3],其中辣椒脈斑駁病毒(Chilli veinal mottle virus,ChiVMV)是危害辣椒作物的最主要病毒之一;該病毒于1979年首次在馬來半島的辣椒作物上被發(fā)現(xiàn)[4],隨后在世界上許多國(guó)家的辣椒作物上陸續(xù)被報(bào)道[5-7]。ChiVMV主要依靠蚜蟲進(jìn)行非持久性傳播[4],還能通過病株汁液和機(jī)械接觸等方式傳播,不能通過種子傳播,因此,其傳播擴(kuò)散速度非常快。

在我國(guó),ChiVMV首先在海南省被報(bào)道,嚴(yán)重危害海南的黃燈籠椒[8],隨后在陜西、云南等地區(qū)相繼發(fā)生[8-10]。然而,到目前為止,尚未見ChiVMV在湖南以及福建等地區(qū)的報(bào)道。鑒于ChiVMV對(duì)辣椒生產(chǎn)的威脅,本研究檢測(cè)了湖南和福建等地辣椒上ChiVMV的發(fā)生情況,克隆了湖南和福建等地ChiVMV株系的CP基因,并分析了其系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,以期為明確我國(guó)ChiVMV的分布及遺傳進(jìn)化提供科學(xué)依據(jù)。

1材料與方法

1.1供試材料

辣椒樣品:2013年8月,在湖南省和福建省進(jìn)行辣椒病毒病調(diào)查,發(fā)現(xiàn)部分地塊辣椒病毒病的發(fā)病癥狀與ChiVMV類似,表現(xiàn)為植株矮小,葉片畸形(包括葉片黃化、葉卷曲、葉面枯斑、葉沿皺縮等)。采集湖南省辣椒樣本16個(gè)、福建省辣椒樣本8個(gè)。

ChiVMV ELISA檢測(cè)試劑盒購自美國(guó)RB公司;cDNA試劑盒、DNTP、氨芐青霉素、EASY Taq DNA聚合酶和DNA回收試劑盒均購自北京全氏金生物技術(shù)有限公司,Trizol試劑盒購自Ambion公司,Elisa試劑盒購自RP公司;供試引物由華大基因公司合成,DNA測(cè)序測(cè)定由生物工程(上海)有限公司完成。

1.2ELISA檢測(cè)

ELISA檢測(cè)具體操作步驟按說明書進(jìn)行。陽性對(duì)照為試劑盒自帶ChiVMV病毒初提純物;陰性對(duì)照為溫室內(nèi)健康辣椒苗的研磨液。

1.3RT-PCR

Trizol法抽提辣椒葉片總RNA,取500 ng總RNA,采用 All-in-one First-Strand cDNA合成試劑盒合成cDNA。以合成 cDNA為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR擴(kuò)增條件為:94 ℃ 3 min;94 ℃ 30 s,52 ℃ 30 s,72 ℃ 90 s,34個(gè)循環(huán);最后72 ℃延伸10 min。擴(kuò)增引物ChiVMV CP特異性引物,CPF(5′-GCGGGAGAGAGTGTTGATGCTG-3′),CPR(5′-TCGCCACTATTGAACAGCTTAAC-3′);1.0%瓊脂糖凝膠電泳觀察PCR產(chǎn)物,回收符合預(yù)期大小的條帶,送生工生物工程(上海)有限公司測(cè)序。

1.4序列進(jìn)化分析

從Genbank數(shù)據(jù)庫中下載了9個(gè)ChiVMV典型分離物的CP基因序列。利用CLUSTAL W對(duì)所有CP序列進(jìn)行多序列聯(lián)配,利用Mega 5.0采用鄰接法,構(gòu)建ChiVMV CP 基因的系統(tǒng)發(fā)育樹[11]。

2結(jié)果與分析

2.1ChiVMV ELISA檢測(cè)

ELISA檢測(cè)結(jié)果表明,從湖南采集的16個(gè)辣椒樣本中,共有4個(gè)樣本呈現(xiàn)陽性;而從福建采集的8個(gè)樣本中,檢測(cè)出2個(gè)陽性樣本。

2.2ChiVMV CP基因克隆與序列分析

RT-PCR結(jié)果表明,擴(kuò)增得到大小為1 100 bp的條帶(含ChiVMV CP全基因序列以及部分上游基因序列),與預(yù)期大小一致。將RT-PCR擴(kuò)增得到的條帶進(jìn)行序列測(cè)定,截取ChiVMV CP基因序列,輸入NCBI進(jìn)行比對(duì),比對(duì)結(jié)果表明,福建和湖南等地的ChiVMV株系CP基因與來源于韓國(guó)辣椒的ChiVMV序列同源性最高(>97%)。

2.3序列的系統(tǒng)發(fā)育分析

從ChiVMV-hn和ChiVMV-fj的系統(tǒng)發(fā)育樹(圖1)可以看出,發(fā)育樹共分成3個(gè)分支,分別為韓國(guó)株系分支、印度株系分支和中國(guó)株系分支,具有很強(qiáng)的地域性;而ChiVMV-hn和ChiVMV-fj與韓國(guó)的2個(gè)分離物(AJ972878.1和AM909717.1)構(gòu)成1個(gè)分支,表明湖南和福建等地的ChiVMV株系與韓國(guó)ChiVMV的親緣關(guān)系較近。系統(tǒng)發(fā)育分析還表明,我國(guó)辣椒上的ChiVMV具有遺傳分化的趨勢(shì)。

3結(jié)論

ChiVMV是一種(+)ssRNA病毒,是Potyvirus Y病毒屬的確定種,該病毒的存在嚴(yán)重制約著韓國(guó)、印度、泰國(guó)等國(guó)和我國(guó)臺(tái)灣等地的辣椒生產(chǎn),是造成這些地方辣椒減產(chǎn)的最主要原因之一[4,12]。本研究采用ELISA以及RT-PCR方法在湖南省和福建省等地的辣椒病樣檢測(cè)到ChiVMV,表明ChiVMV在我國(guó)的侵染范圍正逐步擴(kuò)展,對(duì)我國(guó)辣椒的生產(chǎn)具有潛在的威脅。

ChiVMV湖南和福建等地的CP基因序列的系統(tǒng)發(fā)育分析顯示,我國(guó)的ChiVMV存在遺傳分化的趨勢(shì);由于ChiVMV不同株系對(duì)辣椒的致病性存在差異,因此,我國(guó)ChiVMV的株系分化情況,急需開展進(jìn)一步的研究,為分析ChiVMV對(duì)辣椒的危害提供科學(xué)依據(jù),同時(shí)為該病毒的科學(xué)防控提供科學(xué)參考。

參考文獻(xiàn):

[1]孫國(guó)勝,馬志虎,孫春青,等. 早春辣椒連作免耕栽培技術(shù)[J]. 中國(guó)蔬菜,2015,28(1):55-56.

[2]Watterson J C. Development and breeding of resistance to pepper and tomato viruses[M]//Kyle M M. Resistance to viral diseases of vegetables:genetics and breeding. New York:Timber,1993:80-101.

[3]Green S K,Kim J S.Characteristics and control of viruses infecting peppers:a literature review[R]. Taiwan:Asian Vegetable Research and Development Center,1991.

[4]Ong C A,Varghese G,Ting W P. Aetiological investigations on a veinal mottle virus of chill(Capsicum annuum L.)newly recorded from peninsula Malaysia[J]. Mardi Res Bull,1979,7:78-88.

[5]Chiemsombat P,Sac-Ung N,Attathom S,et a1.Molecular taxonomy of a new potyvirus isolated from chilli pepper in Thailand[J]. Archive of Virology,1998,143(10):1855-1863.

[6]Nono-Womdim R,Swai I S,Chadha M L,et a1.Occurrence of Chilli veinal mottle virus in Solanum aethiopicum in Tanzania[J]. Plant Disease,2001,85(7):801-801.

[7]Anindya R,Joseph J,Gowri T D S,et a1.Complete genomic sequence of pepper vein banding virus(PVBV):a distinct member of the genus Potyvirus[J]. Arch Virol,2004,149:625-632.

[8]Wang J,Liu Z,Niu S,et a1. Natural occurrence of Chilli veinal mottle virus on Capsicum chinense in China[J]. Plant Disease,2006,90(3):377.

[9]Tan G T,Shi L L,Shang H L,et a1.Diagnosis of viruses in chili pepper in Shanxi Province[J]. China Capsicum,2003,3:32.

[10]Ding M,Yang C,Zhang L,et a1.Occurrence of Chilli veinal mottle virus in Nicotiana tabacum in Yunnan,China[J]. Plant Disease,2011,95(3):357.

[11]K. Tamura,D. Peterson,N. Peterson,et a1. MEGA5:molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood,evolutionary distance,and maximum parsimony methods[J]. Molecular Biology and Evolution,2011,28:2731-2739 .

[12]Nono-Womdim R.An overview of major virus diseases of vegetable crops in Africa and some aspects of their control[M]//Hughes J,Odu B. Plant virology in sub-Saharan Africa.Ibadan:International Institute for Tropical Agriculture,2004:211-232.朱弘元,康健,范昕,等. 解淀粉芽孢桿菌B15產(chǎn)脂肽的分離鑒定及抑菌機(jī)理[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué),2016,44(5):186-189.

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