晁金泉 陳月異 楊署光 田維敏
摘 要 木質(zhì)素是植物細(xì)胞壁的成分之一,其含量高低影響到細(xì)胞壁的彈性。橡膠樹乳管膨壓是割膠后膠乳排出的初動(dòng)力,乳管細(xì)胞壁的物理性能可能是影響乳管膨壓的因素之一。本研究采用QRT-PCR和RACE技術(shù), 從巴西橡膠樹無(wú)性系CATAS7-33-97的乳管細(xì)胞中克隆到一個(gè)木質(zhì)素合成關(guān)鍵酶CCoAOMT基因的同源基因,命名為HbCCoAOMT。該基因的開放閱讀框?yàn)?41 bp,編碼1個(gè)由246個(gè)氨基酸殘基組成的蛋白質(zhì)。該蛋白質(zhì)分子量為27.76 ku,理論等電點(diǎn)為5.255。實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果表明, 割膠和乙烯利處理均下調(diào)HbCCoAOMT基因在膠乳中的表達(dá)。該基因的表達(dá)量以及內(nèi)層樹皮的木質(zhì)素含量在兩個(gè)橡膠樹品種(CATAS8-79和PR107)間存在顯著差異。HbCCoAOMT差異表達(dá)可能影響到乳管細(xì)胞木質(zhì)素含量和乳管細(xì)胞壁的物理性能。
關(guān)鍵詞 橡膠樹;HbCCoAOMT;乳管細(xì)胞壁;乳管膨壓;木質(zhì)素
中圖分類號(hào) S794.1 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A
木質(zhì)素是一類由香豆醇、松柏醇和芥子醇等單體聚合而成的多酚類物質(zhì),是植物體內(nèi)一種主要的天然代謝產(chǎn)物,廣泛存在于維管植物次生結(jié)構(gòu)中,對(duì)維持植物組織的硬度和剛性有著重要的意義[1-2]??Х弱]o酶A-O-甲基轉(zhuǎn)移酶(CCoAOMT)屬于植物甲基轉(zhuǎn)移酶類,是木質(zhì)素生物合成途徑中的關(guān)鍵酶,在木質(zhì)素合成時(shí)以咖啡酰輔酶A為底物,將S-腺苷甲硫氨酸上的甲基基團(tuán)轉(zhuǎn)移到木質(zhì)素單體的苯環(huán)碳3位置上,形成阿魏酰輔酶A[3]。CCoAOMT的氨基酸序列具有A,B,C,D,E,F(xiàn),G,H共8個(gè)保守序列元件,其中A, B和C元件是植物甲基化酶所共有的序列,而D,E,F(xiàn),G和H元件為CCoAOMT特有[4]。作為木質(zhì)素合成途徑的關(guān)鍵酶,CCoAOMT的活性變化將直接調(diào)控木質(zhì)素單體的合成,改變木質(zhì)素在植物細(xì)胞壁中所占的比例,進(jìn)而影響植物次生結(jié)構(gòu)的強(qiáng)度[5-7]。
橡膠是一種重要的工業(yè)原材料,在國(guó)計(jì)民生中起著重要作用。目前世界上90%以上的天然橡膠均來(lái)源于巴西橡膠樹。橡膠樹樹皮內(nèi)層中的次生乳管細(xì)胞是天然橡膠合成和貯存的場(chǎng)所[8]。通過(guò)切割乳管使膠乳流出到乳管末端堵塞物形成導(dǎo)致排膠停止這一時(shí)間段被稱為排膠的持續(xù)時(shí)間,與天然橡膠產(chǎn)量呈顯著正相關(guān)[9]。次生乳管是由乳管細(xì)胞彼此連通形成的一種特化組織,保持約8~12個(gè)大氣壓的膨壓[10]。在割膠后,乳管膨壓作為膠乳排出的初動(dòng)力,是影響排膠時(shí)間的重要內(nèi)在因子[11]。目前人們主要從排膠動(dòng)力和排膠阻力對(duì)排膠機(jī)制進(jìn)行研究[12-15]。在排膠阻力方面,主要是探究橡膠凝集的機(jī)理,如Shi等[14]鑒定出C乳清中的Hevb7是膠乳中重要的抗凝集因子;在排膠動(dòng)力方面,主要是解析乳管膨壓形成的生理和分子機(jī)制,如An等[15]克隆了與膨壓形成相關(guān)的水通道蛋白HbPIP2;3,并發(fā)現(xiàn)其在高產(chǎn)品種CATAS8-79中的表達(dá)量要遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于PR107,但對(duì)于乳管細(xì)胞壁的物理性能對(duì)乳管膨壓的影響尚未有報(bào)道。在本研究中,筆者從乳管細(xì)胞中克隆了一個(gè)木質(zhì)素合成途徑關(guān)鍵基因的同源基因HbCCoAOMT,分析了割膠和乙烯利刺激對(duì)該基因表達(dá)的影響,以及該基因在排膠時(shí)間有顯著差異的兩個(gè)橡膠樹品種(CATAS8-79和PR107)間的表達(dá)模式與內(nèi)層樹皮木質(zhì)素含量的相關(guān)性,初步揭示該基因的差異表達(dá)可能是影響乳管細(xì)胞壁木質(zhì)素含量和乳管膨壓的因素之一。
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)用樹 實(shí)驗(yàn)材料為種植于中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院試驗(yàn)場(chǎng)的割齡為3 a的巴西橡膠樹無(wú)性系CATAS7-33-97、CATAS8-79和PR107,以及CATAS7-33-97的未開割樹。
1.1.2 菌株及試劑 Escherichia coli DH10B菌株由本實(shí)驗(yàn)室保存。植物總RNA提取試劑盒和瓊脂糖凝膠回收試劑盒購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司;逆轉(zhuǎn)錄試劑盒購(gòu)自Fermentas公司;克隆載體pEASY-Blunt Simple Cloning Vector購(gòu)自北京全式金生物技術(shù)有限公司;QRT-PCR熒光染料試劑SYBR Ⅱ premix購(gòu)自TaKaRa公司;引物合成和測(cè)序由Invitrogen公司(上海)完成;其他生化試劑和常規(guī)試劑均為進(jìn)口或國(guó)產(chǎn)分析純?cè)噭?/p>
1.2 方法
1.2.1 材料處理 割膠處理選用樹圍一致的CATAS7-33-97的未開割樹和開割樹單株,采用二分之一樹圍割制(S/2)冰上收集膠乳保存于液氮用于RNA的提取。乙烯利處理選用割齡為3 a的CATAS7-33-97開割樹,選樹圍一致的單株,于割膠前2 d用0.5%乙烯利涂抹于割線及其上部約2 cm的割面,采用二分之一樹圍割制(S/2)冰上收集膠乳保存于液氮用于RNA的提取。木質(zhì)素含量測(cè)定選取樹圍一致的CATAS8-79和PR107開割樹單株,用打孔器取離地面1.2 m處樹皮內(nèi)層樣品,液氮保存。另外選取樹圍一致的CATAS8-79和PR107開割樹單株,采用二分之一樹圍割制(S/2)冰上收集膠乳保存于液氮用于RNA的提取。每種實(shí)驗(yàn)處理設(shè)3次重復(fù),每個(gè)重復(fù)為等量混合3株樹樣品。
1.2.2 總RNA提取與cDNA合成 橡膠樹RNA的提取參照RNAprep Pure多糖多酚植物總RNA提取試劑盒的操作說(shuō)明進(jìn)行。cDNA第一鏈的合成使用Fementas公司逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit),按照公司操作說(shuō)明進(jìn)行。
1.2.3 HbCCoAOMT基因的RACE擴(kuò)增和全長(zhǎng)cDNA擴(kuò)增 從課題組前期膠乳轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)中得到一段與CCoAOMT高度同源的Unigene30660片段,開放閱讀框分析顯示該序列含有5′UTR序列[9]。根據(jù)序列設(shè)計(jì)3′-RACE引物(3′-RACE-F: CCC AGG ATT GAG ATT TGC ATG,3′-RACE-R: TAC GTT TTT TTT TTT TT),采用Clontech公司Smarter TMRACE cDNA Amplification Kit試劑盒進(jìn)行3′端序列的克隆。經(jīng)DNAMAN 5.22軟件對(duì)3′端序列與Unigene30660序列進(jìn)行拼接獲取HbCCoAOMT基因的全長(zhǎng)序列(GenBank:KU301753)。以Primer Premier 5軟件設(shè)計(jì)全長(zhǎng)序列的PCR引物進(jìn)行擴(kuò)增驗(yàn)證。引物序列為:HbCCoAOMT-F(ATG GCT TCC AAC AAT GAA CAG)和HbCCoAOMT-R(TCA CTT GAT CCG ACG GCA GAG A)。50 μL擴(kuò)增體系中含cDNA 1 μL、2×TaKaRa PrimeSTAR Max Premix緩沖液25 μL、上下游引物(25 μmol/L)各2 μL及ddH2O 20 μL。PCR程序?yàn)椋?4 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,60 ℃復(fù)性30 s,72 ℃延伸 1.5 min,共35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠分離后經(jīng)天根生物技術(shù)有限公司的瓊脂糖凝膠回收試劑盒純化目的條帶,克隆到全式金公司的pEASY-Blunt Simple Cloning Vector載體上,轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞并挑取陽(yáng)性菌株送Invitrogen公司(上海)測(cè)序。
1.2.4 生物信息學(xué)分析 利用NCBI在線軟件ORF Finder(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html)進(jìn)行開放閱讀框預(yù)測(cè);采用DNAMAN 5.22軟件對(duì)HbCCoAOMT基因翻譯及多序列比對(duì);利用WoLF PSORT在線軟件(http://www.genscript.com/wolf-psort.html)進(jìn)行推導(dǎo)蛋白的亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè);利用ProtParam在線軟件(http://web.expasy.org/protparam/)進(jìn)行推導(dǎo)蛋白的分子量與等電點(diǎn)預(yù)測(cè);從NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)下載其他植物的CCoAOMT蛋白序列,利用軟件MEGA4.0以Neighbor Joining(NJ)模型進(jìn)行1 000次boot-strap統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn)構(gòu)建CCoAOMT蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹。
1.2.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析 采用Bio-Rad公司的CFX96實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)進(jìn)行HbCCoAOMT基因的相對(duì)定量表達(dá)分析。以合成好的cDNA第一鏈稀釋10倍后作為熒光定量PCR分析的模板。HbCCoAOMT熒光定量引物為QPCR-HbCCoAOMT-F(GAA CCC ATG AAG GAG C)和QPCR-HbCCoAOMT-R(GGA AGA GCA AGA GCA G)。內(nèi)參選取本課題組前期優(yōu)化的橡膠樹穩(wěn)定內(nèi)參HbUBC2b[16],引物序列為:QPCR-HbUBC2b-F(CGA CCA AGT TTT CAT TTC GGG TG)和QPCR-HbUBC2b-R(AGT CTC TTC TTT GCT GGG GTT G)。20 μL擴(kuò)增體系中含cDNA 1 μL、2×TaKaRa SYBR Premix Ex Taq TMⅡ 10 μL、上下游引物(25 μmol/L)各1 μL及ddH2O 7 μL。QRT-PCR程序?yàn)椋?4 ℃預(yù)變性2 min;94 ℃變性 10 s,60 ℃復(fù)性20 s,72 ℃延伸20 s,共40個(gè)循環(huán)。利用CFX manager 3.0軟件自動(dòng)進(jìn)行基線和Cq值分析。以HbUBC2b作為內(nèi)參基因,采用2-△△Ct算法分析相對(duì)表達(dá)量。
1.2.6 橡膠樹樹皮內(nèi)層木質(zhì)素含量測(cè)定 木質(zhì)素含量測(cè)定采用乙酰溴法[17]。將保存于液氮中的CATAS8-79和PR107樹皮內(nèi)層材料研磨成粉狀,70 ℃烘箱干燥至恒重。各取5 mg干粉加入5 mL 30%乙酰溴(冰醋酸配制)和0.69 mol/L的高氯酸,封蓋后置于70 ℃水浴1 h,而后加入10 mL 2 mol/L的NaOH和10 mL冰醋酸終止反應(yīng),并用冰醋酸定容至50 mL。以冰醋酸為空白對(duì)照,在OD=280 nm處測(cè)其吸光值,根據(jù)木質(zhì)素回歸曲線[17]計(jì)算所測(cè)樣品中木質(zhì)素含量。
2 結(jié)果與分析
2.1 HbCCoAOMT基因的克隆及生物信息學(xué)分析
通過(guò)3′-RACE方法及測(cè)序從橡膠樹無(wú)性系CATAS7-33-97膠乳中得到1條長(zhǎng)236 bp的片段,經(jīng)DNAMAN將其與Unigene30660拼接后獲得1條包含橡膠樹HbCCoAOMT基因完整開放閱讀框的cDNA序列(KU301753)。該序列長(zhǎng)度為973 bp,含有1個(gè)741 bp的開放閱讀框,5′端非翻譯區(qū)為62 bp,3′端非翻譯區(qū)為170 bp(圖1)。ProtParam tool軟件預(yù)測(cè)該基因編碼了1個(gè)由246個(gè)氨基酸殘基組成的蛋白,其分子量大小約為27.76 ku,理論等電點(diǎn)為5.255,屬于弱堿性蛋白。亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)結(jié)果顯示HbCCoAOMT蛋白定位于細(xì)胞質(zhì)中。
2.2 HbCCoAOMT推導(dǎo)的氨基酸序列比對(duì)及進(jìn)化樹構(gòu)建
序列相似性分析結(jié)果表明HbCCoAOMT蛋白序列與蓖麻RcCCoAOMT(XP_002518739.1)、棉花GhCCoAOMT(ACF48821.1)、楊樹PeCCoAOMT(XP_
011000746.1)、油菜BrCCoAOMT(XP_009138259.1)、馬鈴薯StCCoAOMT(XP_006339880.1)蛋白相似性分別為92%、90%、90%、87%和86%(圖2),均含有CCoAOMT蛋白所特有A,B,C,D,E,F(xiàn),G,H結(jié)構(gòu)元件。
為研究橡膠樹HbCCoAOMT與其他CCoAOMT蛋白在進(jìn)化上的關(guān)系,選取葡萄[18]、煙草[19]、野茶樹[20]、苜蓿[21]、黃麻[22]、玉米[6]、擬南芥[23]、輻射松[5]等8個(gè)物種的CCoAOMT蛋白序列,利用Mega 6.06軟件,采用Neighbor-Joining,進(jìn)行1 000次 bootstrap統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn)構(gòu)建進(jìn)化樹(圖3)。聚類結(jié)果表明植物CCoAOMT蛋白家族可分為兩個(gè)亞類(Ⅰ和Ⅱ),其中橡膠樹與葡萄、煙草、野茶樹、苜蓿歸為Ⅰ亞類,并且與苜蓿的同源蛋白MsCCoAOMT親緣關(guān)系最近(圖3)。
2.3 割膠和乙烯利處理對(duì)HbCCoAOMT基因表達(dá)的影響
割膠是獲取天然橡膠的唯一方式[10]。QRT-PCR結(jié)果表明HbCCoAOMT基因在開割樹膠乳中的相對(duì)表達(dá)量?jī)H為未開割樹膠乳中的八分之一(圖4-A),說(shuō)明割膠可顯著抑制HbCCoAOMT基因表達(dá)。乙烯利是一種乙烯釋放劑,生產(chǎn)上可顯著延長(zhǎng)排膠時(shí)間達(dá)到增產(chǎn)的目的[24]。本研究發(fā)現(xiàn)施用乙烯利可顯著下調(diào)HbCCoAOMT基因的表達(dá),其相對(duì)表達(dá)量?jī)H為對(duì)照組的一半(圖4-B)。
2.4 不同橡膠樹品種HbCCoAOMT基因的表達(dá)量與木質(zhì)素含量測(cè)定
分別測(cè)定排膠時(shí)間長(zhǎng)的橡膠樹品種CATAS8-79和排膠時(shí)間短的橡膠樹品種PR107膠乳中HbCCoAOMT基因的表達(dá)量以及其樹皮內(nèi)層的木質(zhì)素含量。結(jié)果表明CATAS8-79的HbCCoAOMT基因表達(dá)量(圖5-A)以及木質(zhì)素含量(圖5-B)均顯著低于PR107。
3 討論
植物細(xì)胞膨壓是細(xì)胞吸水對(duì)細(xì)胞壁產(chǎn)生的壓力,對(duì)于保持細(xì)胞的緊張度,維持植物體正常的生命活動(dòng)有著重要的生理學(xué)意義[25]。根據(jù)細(xì)胞壁體積彈性模量學(xué)說(shuō),細(xì)胞壁的可塑性越大表明細(xì)胞壁越柔軟,維持的膨壓越高;相反細(xì)胞壁越堅(jiān)硬,膨壓也就越低[26]。木質(zhì)素是植物細(xì)胞壁的成分之一,其含量高低與細(xì)胞壁的可塑性負(fù)相關(guān),影響植物生長(zhǎng)。Zhang等[27]對(duì)白樺的木質(zhì)素合成關(guān)鍵基因BpCCR干涉后發(fā)現(xiàn),與對(duì)照相比,轉(zhuǎn)基因株系的木質(zhì)素含量顯著下降,但生長(zhǎng)速度卻得到了明顯提高,這可能是由于木質(zhì)素含量降低增強(qiáng)了細(xì)胞壁的可塑性,利于細(xì)胞膨大。謝兆森等[28]研究表明在葡萄的第1次快速生長(zhǎng)期內(nèi)果肉細(xì)胞膨壓快速升高,這一過(guò)程伴隨著維管束結(jié)構(gòu)大量消失,認(rèn)為木質(zhì)素減少導(dǎo)致的細(xì)胞壁延伸性增強(qiáng)是葡萄果實(shí)急劇膨大的原因所在。在天然橡膠生產(chǎn)中,割膠后的排膠持續(xù)時(shí)間是影響天然橡膠產(chǎn)量的重要因素之一。不同橡膠樹品種間排膠持續(xù)時(shí)間有明顯差異,并且割膠和施用乙烯利均可顯著延長(zhǎng)排膠時(shí)間,進(jìn)而達(dá)到增產(chǎn)的目的[9-10,24]。作為膠乳排出的初動(dòng)力,人們長(zhǎng)期以來(lái)對(duì)于乳管膨壓的認(rèn)識(shí)僅僅停留在水份進(jìn)出乳管細(xì)胞以及割膠后的傷口阻礙方面[12-13,15,29],而忽視了次生乳管細(xì)胞壁的物理性能在其中的作用。
本研究從橡膠樹膠乳中克隆了一個(gè)編碼木質(zhì)素合成途徑關(guān)鍵酶CCoAOMT的基因的同源基因HbCCoAOMT。氨基酸序列分析表明,HbCCoAOMT具有典型的CCoAOMT家族保守結(jié)構(gòu)域,其中A,B,E,F(xiàn),G,H元件在不同成員間保守性較高,而C和D元件保守性較差,這可能與物種特異性有關(guān)。系統(tǒng)發(fā)生樹分析表明HbCCoAOMT屬于植物CCoAOMT家族I亞類,與來(lái)自苜蓿的同源蛋白MsCCoAOMT親緣關(guān)系最近。在苜蓿中,抑制MsCCoAOMT基因的表達(dá)可顯著降低木質(zhì)素的含量,并且通過(guò)降低G型木質(zhì)素單體進(jìn)而改變G/S木質(zhì)素比例[21]。割膠和乙烯利刺激均可顯著延長(zhǎng)橡膠樹的排膠持續(xù)時(shí)間[10,24]。在排膠動(dòng)力方面,主要認(rèn)為乙烯利刺激的這種效應(yīng)與調(diào)節(jié)水通道蛋白有關(guān)[15]。在排膠阻力方面,以往認(rèn)為乙烯利刺激的這種效應(yīng)與提高黃色體的穩(wěn)定性有關(guān)[24]。但最近研究證明,這種效應(yīng)與膠乳C-乳清中的一種Hevb7蛋白有關(guān)。該蛋白可抑制橡膠粒子與黃色體膜碎片和B-乳清中的蛋白結(jié)合,從而延緩乳管傷口堵塞[14]。在本研究中,發(fā)現(xiàn)割膠和乙烯利刺激均可顯著下調(diào)HbCCoAOMT基因的表達(dá),這可能導(dǎo)致乳管細(xì)胞壁的木質(zhì)素含量降低,進(jìn)而降低乳管細(xì)胞壁剛性,維持較高的乳管膨壓,增大排膠的初動(dòng)力。橡膠樹品種CATAS8-79和PR107在排膠持續(xù)時(shí)間上存在顯著差異,前者的排膠持續(xù)時(shí)間顯著長(zhǎng)于后者[9]。An 等[26]利用實(shí)時(shí)膨壓測(cè)定儀測(cè)定了兩者的樹干樹皮膨壓,證明CATAS8-79的乳管膨壓要明顯高于PR107。本研究表明,HbCCoAOMT在CATAS8-79膠乳中的表達(dá)量顯著低于PR107,并且CATAS8-79樹皮內(nèi)層的木質(zhì)素含量也顯著低于PR107。這些結(jié)果表明HbCCoAOMT差異表達(dá)可能與乳管細(xì)胞木質(zhì)素含量差異有關(guān),是影響乳管細(xì)胞壁的物理性能和乳管細(xì)胞膨壓的因素之一。
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