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長鏈非編碼RNA在肝癌中的研究進展

2016-04-05 23:01:19龔艷清韓濤章坤張倩
山東醫(yī)藥 2016年10期
關鍵詞:肝癌

龔艷清,韓濤,章坤,張倩

(1天津醫(yī)科大學第三中心臨床學院,天津300170;2天津醫(yī)科大學)

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長鏈非編碼RNA在肝癌中的研究進展

龔艷清1,韓濤1,章坤2,張倩1

(1天津醫(yī)科大學第三中心臨床學院,天津300170;2天津醫(yī)科大學)

摘要:長鏈非編碼RNA(lncRNA)是指長度超過200個核苷酸的非編碼RNA,不具有編碼蛋白質(zhì)功能。近年來研究發(fā)現(xiàn),與肝癌有關的lncRNA包括H19、HOC轉(zhuǎn)錄反義RNA、肝癌過表達轉(zhuǎn)錄本、肺腺癌轉(zhuǎn)移相關轉(zhuǎn)錄本1、人母系表達基因3等,其與肝癌的發(fā)生、發(fā)展關系密切,有望成為新型的肝癌標志物及治療靶點,在肝癌診斷、預后和治療方面應用前景良好。

關鍵詞:肝癌;長鏈非編碼核糖核酸; 母源性印記基因;HOC轉(zhuǎn)錄反義RNA;肝癌過表達轉(zhuǎn)錄本;肺腺癌轉(zhuǎn)移相關轉(zhuǎn)錄本1;人母系表達基因3

研究表明,人類基因組中至少80%的DNA序列有生物活性,其中一部分活躍轉(zhuǎn)錄成RNA,無翻譯成蛋白質(zhì)的功能,被稱為非編碼RNA(ncRNA),其中包括長鏈非編碼RNA(lncRNA)[1]。近年來,lncRNA的功能和機制備受關注,其通過染色體劑量補償作用、基因印記、表觀修飾、核質(zhì)運輸、轉(zhuǎn)錄、剪接及翻譯等多種作用模式,參與多種生命進程及多種疾病的病理生理過程[2,3]。有研究發(fā)現(xiàn),一些lncRNA在肝癌組織中表達失控,與肝癌的發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移關系密切,有望成為肝癌新的診療指標及治療靶點?,F(xiàn)就近年來研究與肝癌相關的lncRNA綜述如下。

1H19

H19是母源性印記基因,位于人染色體11p15.5;人胚胎發(fā)育階段在很多組織中高表達,但出生后僅在乳腺、心肌和骨骼肌中少量表達,在形成腫瘤時可被重新激活。胰島素樣生長因子2(IGF2)為父源性印記基因,與H19定位相近且交互印記,并在肝癌中檢測到二者異常表觀遺傳性表達[4]。H19在肝癌中可通過不同機制發(fā)揮促癌或抑癌的相反效應,與其上游調(diào)控區(qū)及下游的通路不同有關。

許多研究表明,H19在肝癌中發(fā)揮促癌作用。目前主要有以下研究證據(jù)支持:H19在肝癌組織中表達水平明顯高于正常組織;敲除H19基因后會導致肝癌細胞的增殖和侵襲能力明顯減弱;H19在HCC中出現(xiàn)雙基因表達;黃曲霉素B1可通過提高H19和轉(zhuǎn)錄因子E2F1的表達水平而促進肝癌細胞的增殖和侵襲能力,并且E2F1可與H19基因啟動子相結(jié)合[5]。H19的表達可被在肝癌細胞中頻繁過表達的癌基因產(chǎn)物c-Myc誘導,c-Myc可作為轉(zhuǎn)錄因子與活化的母源染色體上H19印記調(diào)控區(qū)附近高度保守的E盒結(jié)合,促進組蛋白乙酰化并啟動H19的表達,過表達的H19增加了肝癌細胞的增殖能力,其中一種可能機制是,H19可上調(diào)硫氧還蛋白,而該蛋白是一種信號轉(zhuǎn)導的調(diào)控因子和腫瘤形成的增效劑[6]。

近來有研究證實,H19在肝癌中發(fā)揮抑癌作用,可抑制腫瘤細胞的增殖、侵襲能力及腫瘤新血管生成。Zhang等[7]研究發(fā)現(xiàn),H19在肝癌組織中的表達低于相對應癌旁正常肝組織,且瘤內(nèi)外H19表達量的低比值與肝內(nèi)轉(zhuǎn)移率及腫瘤包膜的不完整性相關,并伴隨較短無復發(fā)生存率,是提示肝癌預后不良的獨立危險因素,進一步闡明其機制是H19可激活miRNA-200的表達,從而抑制或反轉(zhuǎn)上皮細胞間質(zhì)轉(zhuǎn)變(EMT),抑制進展期HCC的浸潤與轉(zhuǎn)移;并發(fā)現(xiàn)抑制H19和miR-675表達,可通過 AKT/GSK-3β/Cdc25A信號通路發(fā)揮效應,促進肝癌細胞的遷移與浸潤

2 肝癌過表達轉(zhuǎn)錄本(HULC)

HULC是首個被發(fā)現(xiàn)的肝癌細胞質(zhì)中特異性過表達的ncRNA,定位于人染色體Chr6p24.3。其在多數(shù)正常組織中不表達,在乙型病毒肝炎導致的肝癌(HBV-HCC)中發(fā)揮重要作用,不僅在肝癌組織中可檢測到,在結(jié)腸癌肝轉(zhuǎn)移瘤中也過表達,亦可在血液中檢測到,為其臨床應用提供有利條件。HULC在肝癌細胞質(zhì)中過表達可能的機制是: HULC可作為ceRNA吸附并抑制多種miRNA的活性,包括與miRNA-372結(jié)合,使miRNA-372對靶基因PRKACB(一種cAMP依賴性的蛋白激酶的催化亞基)抑制作用減弱,從而促進激酶生成并使環(huán)磷腺苷效應元件結(jié)合蛋白(CREB)磷酸化,而HULC在肝癌細胞中的表達受轉(zhuǎn)錄因子CREB的調(diào)控,最終結(jié)果增加HULC的表達,是一種正反饋自調(diào)節(jié)過程[14]。有研究表明,HBV-HCC組織中HULC表達水平與乙型肝炎x蛋白(HBx)呈正相關,而HBx對HCC的發(fā)生、發(fā)展起重要作用;且體外實驗中證明,人肝正常細胞L-02和HepG2癌細胞中HBx可利用CREB上調(diào)HULC表達,上調(diào)的HULC會通過抑制p18促進肝癌細胞的增殖[8]。另外,有研究顯示,結(jié)腸癌肝臟轉(zhuǎn)移瘤也能檢測到HULC過表達,而結(jié)腸原發(fā)癌中未檢測到HULC過表達,這提示HULC過表達可能與肝臟的內(nèi)環(huán)境有關[9]。

3HOC轉(zhuǎn)錄反義RNA(HOTAIR)和肺腺癌轉(zhuǎn)移相關轉(zhuǎn)錄本1(MALAT1)

HOTAIR來源于人類染色體12q13.13 HOXC基因的反義鏈,是第1個被發(fā)現(xiàn)的具有反式調(diào)控作用的lncRNA,遠距離調(diào)控2號染色體上的HOXD基因。HOTAIR在肝癌中的表達明顯上調(diào),促進肝癌生長、轉(zhuǎn)移,與肝癌術后復發(fā)及預后密切相關。有研究顯示,肝癌組織中過表達HOTAIR的患者肝移植術后易出現(xiàn)腫瘤復發(fā)及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,無復發(fā)生存期縮短,是肝移植術后肝癌復發(fā)的獨立危險因素;且體外實驗中利用siRNA抑制肝癌細胞系中HOTAIR的表達,可影響肝癌細胞的生存力和侵襲力,并提高對化療藥物的敏感性[10]。以上提示肝癌中過表達的lncRNA-HOTAIR可促進肝癌細胞的生長及轉(zhuǎn)移,并有望成為新的肝癌預后分子及治療靶點。值得注意的是,最近有研究發(fā)現(xiàn)HOTAIR在一部分肝癌細胞中低表達,需進一步研究。

MALAT1是最早被確定的轉(zhuǎn)移相關基因,來源于人染色體chr11p。其在人體大多數(shù)正常組織中均表達,可以通過調(diào)節(jié)細胞核中磷酸化形式的絲氨酸/精氨酸豐富剪接因子(SR蛋白)的水平來調(diào)控選擇性剪接,在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因表達。與HOTAIR類似,研究表明MALAT1在體外肝癌細胞株和體內(nèi)肝癌組織中均上調(diào)表達,過表達的MALAT1可作為肝移植術后復發(fā)的獨立危險因素,尤其適用于超出米蘭標準的患者;且體外實驗中干擾HepG2細胞珠中MALAT1的表達會明顯影響細胞的生存力、遷移活力和侵襲能力,增加對化療藥物的敏感性[11]。

綜合分析,lncRNA-HOTAIR及MALAT1單獨或聯(lián)合作用可能在肝癌進展中發(fā)揮重要作用,并且有機會作為肝移植后肝癌復發(fā)新的生物標記物和肝癌治療靶點。

4人母系表達基因3 (MEG3)

MEG3來源于人染色體14q32.3的母系印記基因, 是小鼠母系印記基因Gtl2的人類同源物,在多數(shù)正常細胞中表達,在很多人的腫瘤中起抑癌作用并表達下調(diào)。有研究顯示,MEG3在肝癌中表達下調(diào)210倍,其表達抑制受表觀遺傳學的調(diào)控。肝癌細胞中MEG3的啟動子的CRE區(qū)域存在CpG超甲基化,從而影響MEG3的轉(zhuǎn)錄;且MEG3可作為miRNA-29的靶分子,調(diào)控肝癌細胞生長。研究表明,MEG3在肝癌中通過p53依賴途徑和p53非依賴途徑發(fā)揮抑癌作用,MEG3可使E3泛素連接酶MDM2水平下調(diào),進而減少p53泛素化而提高p53蛋白水平,同時增加p53與細胞增殖抑制劑GDF15啟動子的結(jié)合并促進后者轉(zhuǎn)錄而抑制肝癌的發(fā)生;實驗進一步發(fā)現(xiàn),MEG3也可抑制敲除了p53基因的肝癌細胞增殖。因此,MEG3可通過其他途徑發(fā)揮抑癌作用[12]。

5其他lncRNA

研究發(fā)現(xiàn),MVIH是一種過表達的肝癌微血管侵犯相關lncRNA,其可通過抑制肝癌細胞分泌磷酸甘油酸激酶1(PGK1),從而使PGK1的抗腫瘤血管生成作用受到抑制,促進腫瘤誘導的微血管生成作用,從而促進肝癌生長和肝內(nèi)外轉(zhuǎn)移[13]。

HEIH是一種在肝癌中高表達的lncRNA,可通過與Zeste 同源序列2的增強子(EZH2)相互作用,從而作用于其靶基因如p15、p16、p21、p57,催化啟動子組蛋白過度甲基化而抑制細胞周期相關基因的表達,在表觀遺傳學層面參與肝癌細胞周期調(diào)控,促進腫瘤細胞增殖[14]。

Huang等[15]研究發(fā)現(xiàn),Dreh是由HBx下調(diào)表達的一種lncRNA,可以通過抑制中間絲的波形蛋白,導致正常的細胞骨架結(jié)構(gòu)改變,在體內(nèi)外均抑制肝癌細胞的生長與轉(zhuǎn)移,在HBV-HCC發(fā)展過程中起抑癌作用。

LET是一種在腫瘤中低表達的lncRNA,在正常組織中發(fā)揮抑癌基因作用,而在癌組織中與低氧誘導癌轉(zhuǎn)移相關。癌組織形成的低氧微環(huán)境促使組蛋白去乙酰酶3水平升高,后者抑制調(diào)控LET表達,進而減少核因子90(NF90)的降解,使得NF90下游靶基因HIF1 等蛋白水平發(fā)生改變,從而促進肝細胞轉(zhuǎn)移。體內(nèi)外實驗表明,LET可有效抑制肝癌的侵襲轉(zhuǎn)移能力[16]。

uc002mbe.2是一種在肝癌組織中低表達的lncRNA,是潛在的抑癌基因,能介導組蛋白去乙酰化酶抑制劑曲古抑菌素A(TSA)誘導的肝癌細胞凋亡。最近研究顯示,在HCC的TSA的治療中,uc002mbe.2表達反應性上調(diào)300倍,并且敲除uc002mbe.2基因可有效降低TSA的促凋亡效應,證明TSA誘導的癌細胞凋亡作用依賴于uc002mbe.2的參與[17]。

有研究報道,RNA結(jié)合蛋白PCBP2基因9號外顯子位置有可轉(zhuǎn)錄出一種命名為TUC338的超保守元件,獨立于PCBP2蛋白表達。TUC338高表達于肝癌細胞中,并可調(diào)控癌變細胞增殖及周期,促進肝癌發(fā)展,其機制仍需進一步研究。另外,還有很多l(xiāng)ncRNA被發(fā)現(xiàn),如ROR也是在肝細胞癌中呈高表達的lncRNA,可誘導多功能干細胞及表皮干細胞的活性,促進癌細胞無限增殖,并與耐藥形成有關[18]。

現(xiàn)階段人們對lncRNA及其功能的研究只是冰山一角,但已為人類對于基因組表達和疾病的發(fā)生機制提供了新的視角。隨著人們對lncRNA與肝癌關系的日益重視,越來越多的與肝癌相關的lncRNA會被發(fā)現(xiàn)和研究;同時,它們在肝癌發(fā)生、發(fā)展中的作用機制將逐漸被豐富,有望幫助人們對肝癌有更深入的了解,并期待能為臨床做出貢獻,在肝癌的預測、診斷、預后和治療中有新的應用。

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(收稿日期:2015-12-02)

中圖分類號:R735.7

文獻標志碼:A

文章編號:1002-266X(2016)10-0096-03

doi:10.3969/j.issn.1002-266X.2016.10.044

通信作者:韓濤(E-mail: hantaomd@126.com)

基金項目:國家科技第十二五重大專項(2012ZX10002004-011);天津市科委基金項目(13RCGFSY19200)。

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