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四倍體矮稈小麥拔節(jié)期赤霉素合成途徑中關(guān)鍵酶基因表達(dá)分析

2016-01-15 05:26胡召杉巫有霞楊在君王清海彭正松
種子 2016年1期
關(guān)鍵詞:矮稈赤霉素矮化

胡召杉, 巫有霞,2, 楊在君, 王清海, 彭正松

(1.西華師范大學(xué)西南野生動(dòng)植物資源保護(hù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 四川 南充637009;2.西昌一中, 四川 西昌615000)

小麥(Triticvum aestivum)是主要的糧食作物之一。研究表明,株高這一農(nóng)藝學(xué)性狀能夠影響小麥的產(chǎn)量,同時(shí),矮化植株抗倒伏能力更強(qiáng)[1]。小麥矮化育種和推廣利用獲得的成果顯示,小麥矮化育種主要與矮桿基因(Dwarfing gene)有關(guān)[2]。在小麥育種實(shí)踐中利用Rht(Reduced height)基因降低株高,有助于加大矮稈基因在小麥產(chǎn)量提高和品種遺傳改良方面的應(yīng)用。迄今,已鑒定并統(tǒng)一編號(hào)的矮稈基因有21個(gè),從Rht 1到 Rht 20及 Rht 22。有人報(bào)道 Rht 21基因,后來(lái)被證實(shí)并不存在[3-4]。21個(gè)矮桿基因中天然產(chǎn)生的有8個(gè),理化因素誘變的有13個(gè)。小麥中的Rht基因大部分源于六倍體,來(lái)自四倍體的只有7個(gè),分別為Rht 14、Rht 15 、Rht 16、Rht 18、Rht 19、RhtB 1(IC 12196)和 Rht 22。在這7個(gè)基因中,Watanabe[5]報(bào)道了一個(gè)來(lái)源于自然變異的 Rht基因,即 Rht-B 1(IC 12196),它位于4B染色體上,但還沒(méi)證實(shí)它就是一個(gè)新基因;而Peng等[6]從矮桿番麥中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)控制其半矮桿性狀的新基因,即Rht 22[7],該基因也來(lái)源于自然變異并被定位于7A染色體上。其余5個(gè)矮桿基因 Rht 14、Rht 15、Rht 16、Rht 18和 Rht 19都是通過(guò)輻照或化學(xué)誘變獲得[8]。Haque M 等[9]利用 Rht 14、Rht 16、Rht 18等矮稈基因構(gòu)建了硬粒小麥近等基因系。

赤霉素(gibberellin,GA)是一種重要的植物激素。赤霉素參與調(diào)節(jié)植物、真菌、細(xì)菌等的整個(gè)生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程,包括種子的萌發(fā)、根和莖的延伸、葉片的伸展等[10]。赤霉素缺陷型突變體通常表現(xiàn)出植株矮化等性狀[11]。GA 的合成過(guò)程十分復(fù)雜[12-13],合成途徑中需要多種酶的參與,如古巴焦磷酸合成酶(CPS)、內(nèi)根-貝殼杉烯合成酶(KS)、內(nèi)根-貝殼杉烯19-氧化酶(KO)、內(nèi)根-貝殼杉烯酸7β羥化酶、GA-7-氧化酶(GA 7ox)、GA-13-羥化酶(GA 13ox)、GA 20-氧化酶(GA 20ox)和 GA 2-氧化酶(GA 2ox)等[14];同時(shí),14-3-3、RSG、GID 1、GA-MYB、GAI、GIP、XET 等多種調(diào)控基因也參與了GA的生物合成途徑[15]。

本研究通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)對(duì)GA合成途徑中的14種關(guān)鍵酶基因在四倍體矮桿小麥及其高桿對(duì)照品系中的時(shí)空表達(dá)模式進(jìn)行了分析,以期為小麥的矮化育種奠定理論基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 實(shí)驗(yàn)材料

實(shí)驗(yàn)材料選用四倍體(AABB)圓錐小麥地方品種矮稈番麥,硬粒小麥矮桿近等基因系A(chǔ)NW 16D、ANW 16F、ANW 16G,以高桿品種小麥LD為對(duì)照。

其中LD、ANW 16D、ANW 16F、ANW 16G由日本岐阜大學(xué)農(nóng)業(yè)學(xué)院N.Watanabe提供,矮稈番麥來(lái)自四川農(nóng)業(yè)大學(xué)小麥研究所,由西華師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)室提供。在拔節(jié)期取穗下第一莖節(jié)節(jié)間部分于RNA保存液中并置于-70℃冰箱中保存待用。

1.2 引物合成

表1 各基因及內(nèi)參基因RT-PCR引物序列

根據(jù)赤霉素生物合成過(guò)程中涉及到的關(guān)鍵基因GA 20ox、CPS、GA 2ox、KAO、KO、KS、GA 3ox、GID 1、GA-MYB、XET、GIP、GAI、RSG、14-3-3和2個(gè)內(nèi)參基因Actin、GAPDH 的cDNA 序列,利用 Primer Express 3.0(Applied Biosystems)設(shè)計(jì)定量PCR的引物,引物序列及相關(guān)參數(shù)如表1所示,由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成。

1.3 總RNA提取

總 RNA的提取按照EZgeneTM Plant Easy Spin RNA Miniprep Kit試劑盒(Biomega,R 6611),將所得RNA溶解在DEPC-treated ddH2O中。然后用1%瓊脂糖凝膠電泳和NANODROP 2 000c紫外分光光度計(jì)檢測(cè)RNA的濃度和純度,-70℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.4 cDNA的合成

以總RNA為模板,按反轉(zhuǎn)錄試劑盒PrimeScript Perfect Real-Time RT Reagent Kit(TaKaRa)步驟反轉(zhuǎn)錄出cDNA鏈。80μL反應(yīng)體系:5×Primescript buffer 16μL,PrimeScript RT Enzyme Mix 4μL,Oligo dT Primert 4μL,Random 6mers 4μL,模板RNA根據(jù)濃度計(jì)算,剩余用水補(bǔ)足80μL。反應(yīng)程序:37℃15min,85℃5s,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.5 熒光定量檢測(cè) (Realtime-PCR)

根據(jù)目的基因和內(nèi)參基因的反應(yīng)參數(shù),按照SYBR Premix Ex Tap 試劑盒(TaKaRa,中國(guó)),對(duì)反轉(zhuǎn)錄所得的cDNA進(jìn)行5倍梯度稀釋?zhuān)M(jìn)行Real-time PCR反應(yīng),繪制相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)曲線。對(duì)5個(gè)小麥品種的總RNA 反 轉(zhuǎn) 錄 樣 品 于 Bio-RAD c 1 000TMThermal Cycler儀器上進(jìn)行SYBR Green實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng),使用CFX 96TM系統(tǒng)對(duì)定量結(jié)果進(jìn)行熒光采集。通過(guò)檢測(cè)其熒光值,繪制溶解曲線[16]。

2 結(jié)果與分析

GA合成途徑中的14個(gè)關(guān)鍵酶基因,除14-3-3和CPS未檢測(cè)到表達(dá)量外,其它12個(gè)基因在矮桿品種和高桿對(duì)照的拔節(jié)期節(jié)間均有不同程度的表達(dá)(圖1)。GA 2ox在ANW 16F中的表達(dá)量最高,其次是LD,而在 ANW 16D、ANW 16G和矮稈番麥中表達(dá)量較低(圖1a)。GA 3ox在 ANW 16D、ANW 16 F、LD以及矮稈番麥中表達(dá)量極低,僅為ANW 16F中 GA 3ox表達(dá)量的1/40(圖1b);GA 20ox在LD中表達(dá)量最高,其次依次是ANW 16D、矮稈番麥,在ANW 16F和ANW 16G中表達(dá)量最低(圖1c);GAI在ANW 16F的表達(dá)量最高,ANW 16G中次之,矮稈番麥中表達(dá)量?jī)H次于ANW 16G,LD和ANW 16D表達(dá)量最低(圖1d);GA-MYB在LD中表達(dá)量最高,其次是 ANW 16G,僅為 LD 中表達(dá)量的一半,ANW 16D中表達(dá)量?jī)H次于ANW 16G,矮稈番麥中表達(dá)量則僅次于ANW 16D,ANW 16F表達(dá)量最低,僅為L(zhǎng)D的1/16(圖1e);GID 1在 ANW 16F中的表達(dá)量最高,其次是ANW 16D,再次為ANW 16G、LD,矮稈番麥中的表達(dá)量最低,僅為ANW 16F中的1/6(圖1f);KAO在 ANW 16F中表達(dá)量最高,其次是ANW 16G,剩余3種材料中表達(dá)量均較低,依次為L(zhǎng)D、ANW 16G、矮稈番麥,矮稈番麥中表達(dá)量?jī)H為ANW 16D中的1/11(圖1g);KO在5種材料中的表達(dá)量與GID 1相似,在ANW 16F中的表達(dá)量最高,其次是ANW 16D、ANW 16G、LD,矮稈番麥中的表達(dá)量最低,僅為 ANW 16F中的1/4(圖1h);RSG 在ANW 16F中的表達(dá)量最高,其次依次為ANW 16D、ANW 16G、矮 稈 番 麥、LD,LD 中 表 達(dá) 量 僅 為ANW 16F的1/9(圖1i);XET在 ANW 16F中的表達(dá)量最高,其次為 LD、ANW 16G、矮 稈番麥、ANW 16D,ANW 16G與矮稈番麥中XET表達(dá)量相近,ANW 16D中的表達(dá)量最低(圖1j);KS在 ANW 16D中表達(dá)量最高,ANW 16F和ANW 16G次之,ANW 16D中表達(dá)量大約是ANW 16F和ANW 16G表達(dá)量的一倍,在LD和矮稈番麥中幾乎沒(méi)有檢測(cè)到表達(dá)(圖1k);GIP在ANW 16D的表達(dá)量最高,其次是矮稈番麥,LD、ANW 16F和 ANW 16G中的表達(dá)量相近且較低,僅為ANW 16D表達(dá)量的1/5(圖1l)。

GA 20ox和GA-MYB在矮稈小麥和高稈小麥中的表達(dá)模式相似,均是高稈小麥中的表達(dá)量高于其余4種矮稈小麥中的表達(dá)量。

3 討 論

小麥的株高主要通過(guò)莖的伸長(zhǎng)來(lái)實(shí)現(xiàn),而拔節(jié)期則是小麥長(zhǎng)高最關(guān)鍵的時(shí)期[17]。本實(shí)驗(yàn)通過(guò)對(duì)4個(gè)矮桿小麥品系和高稈對(duì)照品系小麥拔節(jié)期節(jié)間部分各赤霉素關(guān)鍵酶基因的Real-time PCR檢測(cè)分析得出,CPS與14-3-3基因在5種小麥材料中均沒(méi)有表達(dá)。前體物質(zhì)GGPP合成GA的第一個(gè)階段,在柯巴焦磷酸合成酶的催化下,生成柯巴焦磷酸(ent-copalyl pyrophosphate,CPP)[18-19]。CPS可能為赤霉素合成途徑中前體物質(zhì)GGPP轉(zhuǎn)化為CPP的催化酶,是赤霉素合成途徑的最開(kāi)始階段,由于拔節(jié)期是一個(gè)時(shí)間段而不是一個(gè)時(shí)間點(diǎn),在取材的這個(gè)時(shí)間點(diǎn)上CPS可能已經(jīng)完成了催化任務(wù),因此檢測(cè)不到表達(dá)量。14-3-3是RSG的負(fù)調(diào)控因子,拔節(jié)期需要赤霉素促進(jìn)莖的伸長(zhǎng),此時(shí)RSG的活性不應(yīng)該受到抑制,因此檢測(cè)不到表達(dá)量也是合理的。GA 20ox、GA 2ox、KAO、KO、KS、GA 3ox、GID 1、GA-MYB、XET、GIP、GAI、RSG在5種小麥材料中都有表達(dá),其中GA 20ox和GA-MYB在高稈小麥和矮稈小麥中的表達(dá)模式相同,均是高稈小麥中的表達(dá)量略高于矮桿小麥。這與Zhang等[20]的研究結(jié)果類(lèi)似,GA 20ox過(guò)表達(dá)的植物通常表現(xiàn)為節(jié)間伸長(zhǎng)的特征。在拔節(jié)期,具有生物活性的GA的量將影響小麥莖的伸長(zhǎng)程度,因而拔節(jié)期小麥內(nèi)源赤霉素缺失就會(huì)抑制小麥莖節(jié)間的伸長(zhǎng)[21]。高桿小麥和矮桿小麥株高差異的關(guān)鍵時(shí)期就在于拔節(jié)期,莖桿在該時(shí)期迅速伸長(zhǎng),植株也迅速增高,該時(shí)期對(duì)GA的需求量可能是最大的。GA 20ox在矮稈中的表達(dá)量較高桿小麥中低,這可能導(dǎo)致矮桿小麥ANW 16D、ANW 16F、ANW 16G和矮稈番麥在拔節(jié)期因赤霉素量合成不足而影響了細(xì)胞的伸長(zhǎng),最終導(dǎo)致 ANW 16D、ANW 16F、ANW 16G和矮稈番麥出現(xiàn)矮化性狀。此外,GA-MYB在高稈小麥中的表達(dá)量略高于矮桿小麥。Zhang等研究表明,GA-MYB是赤霉素合成途徑中一個(gè)重要的正向調(diào)節(jié)器,提高GA-MYB基因的表達(dá)量,可以提高赤霉素合成水平或赤霉素信號(hào)的靈敏度,使細(xì)胞伸長(zhǎng),植株增高[20]。本實(shí)驗(yàn)中,GA-MYB的表達(dá)量在拔節(jié)期矮稈小麥ANW 16D、ANW 16F、ANW 16G和矮稈番麥較LD低,這可能導(dǎo)致在矮化小麥中赤霉素的合成途徑受阻或使其對(duì)赤霉素的信號(hào)靈敏度降低,從而導(dǎo)致ANW 16D、ANW 16F、ANW 16G和矮稈番麥的株高較LD矮小。

圖1 GA 2ox、GA 3ox、GA 20ox、GAI、GAMYB、GID 1、KAO、KO、RSG、XET、KS、GIP基因在不同小麥拔節(jié)期的表達(dá)情況

在小麥、水稻等禾本科作物中,莖的伸長(zhǎng)一般都是由細(xì)胞有絲分裂增加細(xì)胞數(shù)目以及使細(xì)胞伸長(zhǎng)增加細(xì)胞長(zhǎng)度兩方面作用的共同結(jié)果[22]。拔節(jié)期是小麥莖稈伸長(zhǎng)最迅速的時(shí)期,但在檢測(cè)到表達(dá)量的12個(gè)基因中只有2個(gè)基因在高稈小麥和矮稈小麥中差異性表達(dá),但是這種差異并不大,不能夠認(rèn)定為拔節(jié)的原因。這與蔡鵬[23]對(duì)簇毛麥(Dasypyrum villosum)矮化突變體的研究結(jié)果一致。

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