国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

六株湖北省ALV—J地方分離株的gp85基因序列分析

2016-01-08 21:04汪宏才羅青平溫國(guó)元張騰飛楊峻艾地云
湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2015年23期
關(guān)鍵詞:進(jìn)化樹相似性

汪宏才+羅青平+溫國(guó)元+張騰飛+楊峻+艾地云

摘要:通過對(duì)ALV-J病毒gp85基因進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)6個(gè)湖北分離株與國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)的肉雞分離毒株HPRS103株核苷酸序列相似性為93.9%~98.2%,氨基酸序列相似性為88.8%~97.8%。其中HuB09XZ01株、HuB09JY03株、HuB09JY04株與HPRS103株核苷酸序列相似性達(dá)到98.1%~98.2%,氨基酸序列相似性達(dá)到97.4%~97.8%。系統(tǒng)遺傳進(jìn)化表明,湖北分離株HuB09XZ01株、HuB09JY03株、HuB09JY04株與ALV-J國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)毒株HPRS103遺傳距離最近。通過分析表明,湖北省ALV-J主要來源于肉雞,大都通過引種感染,這對(duì)于湖北省禽白血病的凈化以及家禽品種的選育具有重要參考意義。

關(guān)鍵詞:禽白血病;J亞群;相似性;進(jìn)化樹

中圖分類號(hào):S858.31 ? ? ? ?文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A ? ? ? ?文章編號(hào):0439-8114(2015)23-5956-03

DOI:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2015.23.041

Analysis of gp85 Gene Sequences of 6 ALV-J isolates in Hubei Province

WANG Hong-cai, LUO Qing-ping, WEN Guo-yuan, ZHANG Teng-fei, YANG Jun, AI Di-yun

(Institute of Animal Husbandry and Veterinary Sciences/Hubei Key Laboratory ?of Animal Embryo Engineering and Molecular Breeding,Hubei Academy of Agricultural Sciences,Wuhan 430064,China)

Abstract: Through the analysis of gp85 gene of ALV-J virus,the nucleotide sequences of 6 strains isolated from Hubei show 93.9%~98.2% similarity to the international standard strainHPRS103 isolated from broiler,the similarity of amino acid sequences range between in 88.8%~97.8%. Hereinto,The similarity of nucleotide sequence and ?amino acid sequence between strains HuB09XZ01,HuB09JY03,HuB09JY04 and ?the international standard strain HPRS103 reached 98.1%~98.2% and97.4%~97.8% respectively.Phylogenetic tree showed that,Hubei isolates HuB09XZ01,HuB09JY03and HuB09JY04 were close to HPRS103.These results suggested that ALV-J in Hubei province mainly comes ?from broiler,and has the reference significance to poultry breeding ?in our province.

Key words:avian leukosis;subgroup J;sequence similarity;phylogenetic tree

禽白血病是由禽白血病病毒(Avian leukosis virus,ALV)引起的一種傳染性腫瘤病。1908年首次報(bào)道,至今該病已在許多國(guó)家發(fā)生和流行。中國(guó)最早是在肉雞群中發(fā)現(xiàn)此病例,近年來,蛋雞和地方雞的病例也時(shí)有報(bào)道,發(fā)病呈上升趨勢(shì)[1]。ALV可分為A~J共10個(gè)亞群,其中只有A、B、C、D、E和J亞群能感染雞。致病性ALV以A、B和J 這3 種亞群為主,也是目前中國(guó)雞群中流行最為廣泛的3個(gè)外源性病毒亞群[2]。自2008年以來,ALV-J誘發(fā)的腫瘤/血管瘤在蛋雞中形成了流行趨勢(shì)。隨后,地方雞群檢出率明顯增加,這對(duì)禽白血病的防控帶來嚴(yán)重的挑戰(zhàn)。ALV-J前病毒基因組具有典型的C型反轉(zhuǎn)錄病毒基因組結(jié)構(gòu),即5LTR-5UTR-gag-pol- env-3UTR-3LTR。由于env基因變化大,與其他ALV env相似性低,且與致瘤性密切相關(guān),并決定病毒感染的宿主范圍。env基因編碼2種病毒囊膜蛋白,即gp85蛋白和gp37蛋白。gp85蛋白含有病毒受體決定簇,決定亞群特異性和宿主范圍[3]。通過對(duì)已公開發(fā)表的6株ALV-J湖北地方分離株gp85基因進(jìn)行了分析,重點(diǎn)研究ALV-J病毒gp85基因的同源性,分析ALV-J流行株分子演化過程,為湖北省禽白血病的防治和凈化提供參考。

1 ?材料與方法

1.1 ?禽白血病參考株

選取湖北省ALV-J亞群6個(gè)地方分離株(HuB09-1株、HuB09XZ01株、HuB09WH02株、HuB09WH03株、HuB09JY03株、HuB09JY04株)[4, 5]、國(guó)內(nèi)其他地區(qū)ALV-J亞群參考株8株(JS09GY3株、WN100402株、HLJ13SH01株、JL093-1株、SD09DP03株、GD1109株、SX090915J株、HB09-1株),以及ALV-J國(guó)際原型毒株HPRS103株。登錄Genbank查詢各參考毒株的核苷酸和氨基酸序列。15株ALV-J病毒Genbank名稱、登錄號(hào)、分離時(shí)間以及分離地點(diǎn)見表1。endprint

1.2 ?對(duì)15株ALV-J gp85基因核苷酸及氨基酸序列進(jìn)行分析比較

應(yīng)用ClustalX、DNASTAR以及MEGA等軟件,對(duì)15株ALV-J參考株的gp85基因核苷酸序列和氨基酸序列進(jìn)行比對(duì),分析6個(gè)ALV-J湖北分離株與其它參考毒株間的相似性,并分別依據(jù)gp85基因的核苷酸序列和氨基酸序列建立系統(tǒng)進(jìn)化圖譜,進(jìn)一步分析其進(jìn)化親緣關(guān)系。

2 ?結(jié)果與分析

2.1 ?15株ALV-J病毒gp85基因核苷酸序列和氨基酸序列分析結(jié)果

15株ALV-J病毒gp85基因核苷酸序列相似性比較見圖1,氨基酸序列相似性見圖2。通過對(duì)15株ALV-J gp85基因的核苷酸序列進(jìn)行比對(duì)分析,15株參考株的核苷酸序列相似性在93.0%~99.9%,氨基酸序列相似性在88.1%~99.6%。6個(gè)湖北分離株與國(guó)際原型毒株HPRS103株核苷酸序列相似性在93.9%~98.2%,氨基酸序列相似性在88.8%~97.8%。其中HuB09XZ01株、HuB09JY03株、HuB09JY04株與HPRS103株核苷酸相似性達(dá)到98.1%~98.2%,氨基酸序列相似性達(dá)到97.4%~97.8%。HuB09WH02株、HuB09WH03株與JS09GY3株核苷酸同源相似性在98.8%~99.2%,氨基酸相似性在97.3%~98.7%。HuB09-1株則與HLJ13SH01株、JL093-1株、SD09DP03株相似性較高。

2.2 ?15株ALV-J病毒系統(tǒng)發(fā)育樹

對(duì)15株ALV-J gp85基因的核苷酸序列和氨基酸序列分別制作系統(tǒng)發(fā)育圖譜,ALV-J病毒核苷酸序列系統(tǒng)發(fā)育樹見圖3,蛋白質(zhì)序列系統(tǒng)發(fā)育樹見圖4。

兩種方法制作的系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,15株參考毒株分屬兩個(gè)大的分枝,湖北分離株HuB09XZ01株、HuB09JY03株、HuB09JY04株與國(guó)際ALV-J原型株HPRS103遺傳距離最近,這與潘偉等[6]對(duì)HuB09JY03株分析結(jié)果相似。而HuB09WH03株、HuB09WH02株與JS09GY3株遺傳距離最近,HuB09-1株和SX090915J株、HB09-1株同屬一組分枝。

3 ?討論

通過對(duì)ALV-J病毒gp85基因的核苷酸和氨基酸序列進(jìn)行對(duì)比分析,兩種分析方法所得結(jié)果基本一致。

ALV-J屬于種源性疾病,防治十分困難。2009年,J亞群白血病在華中局部地區(qū)蛋雞場(chǎng)大面積流行,發(fā)病率最高達(dá)到46%[7]。據(jù)彭伏虎等[8]的調(diào)查結(jié)果發(fā)現(xiàn),由于湖北省缺乏相應(yīng)品種的祖代場(chǎng),種蛋和雞苗主要從外地引進(jìn),種源質(zhì)量難以控制。本地品種雞在選育過程中,為了提高生產(chǎn)性能,常引進(jìn)外來血液,也會(huì)造成ALV-J的傳播。因此,引種是造成ALV-J傳播的主要原因。

通過分析表明,湖北分離株主要位于進(jìn)化樹2個(gè)分支,說明在湖北地區(qū)ALV-J流行毒株存在多樣性。HuB09XZ01株、HuB09JY03株、HuB09JY04株與國(guó)際ALV-J原型株HPRS103同屬一個(gè)分支,遺傳距離近,說明湖北地區(qū)ALV-J病毒可能來源于肉雞。ALV-J最早由英國(guó)Payne于1988年從肉雞中分離得到,1999年國(guó)內(nèi)由杜巖等首次分離和鑒定到ALV-J。目前J亞群禽白血病在我國(guó)各地廣泛存在,而且該亞群病毒有很廣的宿主范圍,導(dǎo)致禽群死淘率明顯升高,生產(chǎn)性能降低等,已成為危害中國(guó)養(yǎng)禽業(yè)最嚴(yán)重的疾病之一[9]。

在中國(guó),ALV-J不僅隨著引進(jìn)的白羽肉種雞帶進(jìn)了我國(guó)白羽肉雞群,還進(jìn)一步蔓延至我國(guó)的蛋雞和中國(guó)地方雞種。這不僅給中國(guó)規(guī)模養(yǎng)雞業(yè)帶來很大損失,也威脅到地方雞品種的種質(zhì)基因庫(kù)。隨著地方雞產(chǎn)業(yè)的發(fā)展,人們正在對(duì)地方雞進(jìn)行品種改良。湖北地方雞品種較多,現(xiàn)已有不同程度的感染。因此,在引進(jìn)外來血液的過程中,需要嚴(yán)格對(duì)ALV進(jìn)行檢測(cè),防止地方雞核心群受到ALV-J的感染。

禽白血病傳播的途徑主要有種蛋垂直傳播、疫苗污染等。因此對(duì)引進(jìn)的父母代以上的種蛋、雞苗,在引種前需對(duì)ALV-J進(jìn)行評(píng)估,以免造成重大經(jīng)濟(jì)損失。疫苗應(yīng)選擇正規(guī)廠家的產(chǎn)品,減少因接種而引起的病毒傳播。

由于禽白血病病毒容易產(chǎn)生變異,且目前尚無有效的藥物進(jìn)行控制,因此,減少禽白血病的發(fā)生主要通過凈化淘汰的方法。尤其是種雞場(chǎng),根據(jù)ALV的增殖規(guī)律,需要進(jìn)行3~4個(gè)世代的凈化,降低ALV的陽性率。由于ALV易產(chǎn)生變異,構(gòu)筑生物安全措施勢(shì)在必行。

參考文獻(xiàn):

[1] 俞 ?燕,朱鴻媛,高明燕,等.地方雞種禽白血病病毒感染動(dòng)態(tài)及檢測(cè)方法比較[J].中國(guó)家禽,2014(8):23-26.

[2] 毛婭卿,李衛(wèi)華,董 ?宣,等.差異極大的不同準(zhǔn)種隱藏于同一J亞型禽白血病病毒野毒株中[J].中國(guó)科學(xué):生命科學(xué),2013(6):492-498.

[3] 潘 ?偉.蛋雞J亞群禽白血病分子流行病學(xué)調(diào)查及致病性研究[D].北京:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院,2011.

[4] PAN W, GAO Y, QIN L, et al. Genetic diversity and phylogenetic analysis of glycoprotein GP85 of ALV-J isolates from Mainland China between 1999 and 2010: coexistence of two extremely ?different subgroups in layers[J]. Vet Microbiol, 2012,156(1-2):205-212.

[5] GAO Y, YUN B, QIN L, et al. Molecular epidemiology of avian leukosis virus subgroup J in layer flocks in China[J]. J Clin Microbiol,2012,50(3):953-960.

[6] 潘 ?偉,高玉龍,孫芬芬,等.蛋雞J亞群禽白血病病毒HB09JY03株的分離鑒定及其全基因組序列分析[J].中國(guó)獸醫(yī)科學(xué),2010(11):1110-1114.

[7] 羅青平,張蓉蓉,邵璐璐,等.2009年湖北省雞J亞群白血病的初步調(diào)查分析[J].中國(guó)家禽,2010(16):63-65.

[8] 彭伏虎,宋念華,陶淑珍,等.蛋雞J亞群禽白血病的流行病學(xué)調(diào)查[J].中國(guó)畜牧獸醫(yī),2010,37(8):203-206.

[9] 張小桃,賴漢漳,曹偉勝.禽白血病病毒檢測(cè)方法研究進(jìn)展[J]. 養(yǎng)禽與禽病防治,2009(4):4-6.endprint

猜你喜歡
進(jìn)化樹相似性
一類上三角算子矩陣的相似性與酉相似性
基于心理旋轉(zhuǎn)的小學(xué)生物進(jìn)化樹教學(xué)實(shí)驗(yàn)報(bào)告
常見的進(jìn)化樹錯(cuò)誤概念及其辨析*
淺析當(dāng)代中西方繪畫的相似性
大學(xué)生對(duì)進(jìn)化樹的常見誤解
福州2009—2014年甲型H1N1流感病毒株HA基因進(jìn)化分析
艾草白粉病的病原菌鑒定
低滲透黏土中氯離子彌散作用離心模擬相似性
層次聚類在進(jìn)化樹構(gòu)建中的應(yīng)用
一種新的基于對(duì)稱性的字符串相似性處理算法
正宁县| 平安县| 台北市| 普兰县| 舒城县| 富平县| 哈尔滨市| 基隆市| 武夷山市| 定日县| 海安县| 洪江市| 治县。| 桑日县| 滦平县| 昌平区| 黄浦区| 仪征市| 锡林浩特市| 普陀区| 聂拉木县| 陆良县| 尉氏县| 朝阳市| 鲜城| 聂荣县| 怀宁县| 海口市| 珠海市| 西盟| 永安市| 水富县| 平湖市| 仙桃市| 迁安市| 苏尼特左旗| 田林县| 始兴县| 南靖县| 沙湾县| 马山县|