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白介素13基因+2044G/A多態(tài)性與支氣管哮喘的關(guān)聯(lián)研究

2015-11-22 01:59席素雅劉建強(qiáng)陳樹珍張玲王少穎
貴州醫(yī)藥 2015年10期
關(guān)鍵詞:等位基因多態(tài)性基因型

席素雅 劉建強(qiáng) 陳樹珍 張玲 王少穎

(1.河北省胸科醫(yī)院呼吸科;2.河北省老年病醫(yī)院,河北 石家莊 050000)

支氣管哮喘(哮喘)是一種以氣道阻塞、氣道炎癥和氣道高反應(yīng)為特征的炎癥性疾病,呈家族聚集性,其發(fā)病涉及了遺傳、環(huán)境、免疫、神經(jīng)等因素[1]。多項(xiàng)研究[2-3]表明,白細(xì)胞介素13(IL-13)基因多態(tài)性與哮喘的發(fā)病密切相關(guān)。本研究以河北地區(qū)漢族人群為研究對(duì)象,采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(PCR-RFLP)方法,分析該地區(qū)正常人群和哮喘患者IL-13基因+2044G/A 的基因型和等位基因頻率分布情況,以探討該基因多態(tài)性與河北地區(qū)漢族人群哮喘的相關(guān)性,為哮喘患者的早期預(yù)防、早期治療提供理論依據(jù)。

1 資料與方法

1.1 臨床資料 哮喘組:選擇2011年7月至2013年7月河北省胸科醫(yī)院收治的哮喘患者100例,均符合中華醫(yī)學(xué)會(huì)呼吸病學(xué)分會(huì)哮喘學(xué)組2013年制定的《支氣管哮喘防治指南》標(biāo)準(zhǔn)[4],其中男48例,女52例,年齡20~65歲。對(duì)照組:同期選擇我院體檢中心健康體檢者100例,男50例,女50例,年齡18~66歲,該組人群均無(wú)哮喘病史。兩組人群年齡、性別差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。研究對(duì)象均為無(wú)血緣關(guān)系的我國(guó)北方漢族人,除外罹患嚴(yán)重全身感染、腫瘤、心臟病及肝、腎疾病等系統(tǒng)性疾病。全部入選對(duì)象均提前征得患者同意并填寫知情同意書。

1.2 方法(1)基因組DNA 提?。喝⊥庵苎?mL,加入含1.5mg/mL乙二胺四乙酸二鈉(EDTA-Na2)的抗凝管中,搖勻,常規(guī)酚-氯仿法抽提基因組DNA,-20 ℃冰箱儲(chǔ)存?zhèn)溆?。PCR-RFLP檢測(cè)基因型:聚合酶鏈反應(yīng)擴(kuò)增基因組DNA。參照文獻(xiàn)[5],IL-13基因+2044G/A 位點(diǎn)引物序列如下:上游:5′-CTTCCGTGAGGACTGAATGAGACGGTC-3′,下 游:5′-GCAAATAATGATGCTTTCGAAGTTTCAGTGGA-3′。25μL PCR反應(yīng)體系中含:10×緩沖液2.5μL;4×脫氧三組磷組酸組核組苷(dNTP,10 mmol/L)2.0μL;MgCl2(25mmol/L)2.5組μL,10組μmol/L組引組物組各1.0μL,模板DNA(10μmol/L)3.0μL;rTaq DNA聚合酶(5U/L)0.25μL,去離子水加至25μL。擴(kuò)增反應(yīng)在熱循環(huán)儀上完成。循環(huán)參數(shù)為:95 ℃預(yù)變性10min;94℃變性30s,56 ℃退火30s,72 ℃延伸1min,共35個(gè)循環(huán);72 ℃最后延伸5min。PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物用限制性內(nèi)切酶Pst I于37 ℃水浴消化8h,再在3%瓊脂糖凝膠上加溴化乙錠(終濃度為0.7μg/mL),取8μL酶切產(chǎn)物在凝膠上上樣電泳,紫外線燈照射下觀察拍照。(2)測(cè)序:PCR 產(chǎn)物純化并送上海生物工程有限公司進(jìn)行測(cè)序。

1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS 13.0統(tǒng)計(jì)軟件。研究資料的可靠性通過(guò)Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)檢測(cè),基因型和等位基因頻率通過(guò)基因計(jì)數(shù)法計(jì)算。單個(gè)基因型及組間等位基因頻率比較采用χ2檢驗(yàn)。

2 結(jié)果

2.1 IL-13基因型分析 IL-13基因+2044G/A 多態(tài)性位點(diǎn)PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物大小為236bp,其上游引物設(shè)計(jì)的錯(cuò)配堿基G 使該位點(diǎn)擴(kuò)增產(chǎn)物均存在一個(gè)NIaIV 酶切位點(diǎn),均會(huì)被切下一26bp產(chǎn)物。經(jīng)酶切后,電泳結(jié)果可見3種基因型:GG 型(含酶切位點(diǎn)的純合子,酶切產(chǎn)物為178bp、32bp及26bp);AA 型(不含酶切位點(diǎn)的純合子,酶切產(chǎn)物為210bp和26bp);GA 雜合子型(雜合子,酶切產(chǎn)物為210bp、178bp、32bp和26bp)。酶切結(jié)果見圖1,由于32bp和26bp分子量較小,電泳時(shí)均已出膠。隨機(jī)選取3 種基因型樣本的PCR 產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,其結(jié)果與PCR-RFLP結(jié)果完全一致。

圖1 IL-13基因+2044G/A 多態(tài)性PCR 產(chǎn)物NIaIV 酶切電泳結(jié)果

2.2 兩組IL-13基因+2044G/A 基因型和等位基因分布頻率比較(1)經(jīng)Hardy-Weinberg 平衡檢驗(yàn),兩組基因型符合遺傳平衡,具有群體代表性。見表1。(2)IL-13+2044G/A 位點(diǎn)基因多態(tài)性分布特點(diǎn):IL-13基因+2044G/A組多態(tài)性有3組種基因型,GG組型、AA組型、GA組型,兩組組人組群組中組均組以GG組型組為主,GA 型次之,AA 型最少。分析顯示:哮喘組IL-13+2044G/A 位點(diǎn)基因型分布與正常對(duì)照組有差異(χ2=7.71,P<0.05)。A 等位基因攜帶者(GA+AA 基因型)在哮喘組(49例,49.0%)明顯高于對(duì)照組(30例,30.0%)(χ2=7.55,P<0.01),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。見表2。

表1 IL-13基因+2044G/A 位點(diǎn)基因型分布的Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)(%)

表2 IL-13基因外顯子+2044G/A 多態(tài)性基因型和等位基因頻率分布比較[n(%)]

3 討論

支氣管哮喘是由免疫球蛋白E(IgE)介導(dǎo)的Ⅰ型變態(tài)反應(yīng)性疾病,其發(fā)生過(guò)程中有多種細(xì)胞因子參與。IL-13是一種主要由活化的CD4+Th2細(xì)胞分泌的多效能細(xì)胞因子,具有多種生物學(xué)功能,通過(guò)提高B細(xì)胞的活性、刺激B 細(xì)胞的增殖和誘導(dǎo)IgE的合成,從而導(dǎo)致氣道反應(yīng)性增高以及小氣道結(jié)構(gòu)重建,參與哮喘炎癥的發(fā)生與維持[6]。

人IL-13(hIL-13)基因序列長(zhǎng)度為4.6kb,含有4個(gè)外顯子和3 個(gè)內(nèi)含子。編碼hIL-13的基因定位于5q31,分子量約12KD,是由132個(gè)氨基酸組成的非糖基化蛋白。近年國(guó)內(nèi)外多項(xiàng)研究[7-11]及Meta分組析[12-14]顯組示,IL-13基組因A2044G組單核組苷組酸多態(tài)性與哮喘發(fā)病密切相關(guān),是哮喘發(fā)病的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。文獻(xiàn)[7-11]研究發(fā)現(xiàn),+2044G/AA 等位基因與哮喘的發(fā)病密切相關(guān)。而華麗等[15]研究發(fā)現(xiàn),G 等位基因可能是哮喘的易感基因。

本研究以河北地區(qū)漢族人群為研究對(duì)象,分析了100例哮喘患者和100例健康人群的IL-13 +2044G/A 基因型和等位基因分布頻率。結(jié)果顯示,中國(guó)北方漢族人群IL-13 基因+2044G/A 位點(diǎn)存在G→A 突變,且該基因型已達(dá)到遺傳平衡,具有群體代表性。哮喘組AA 型和A 等位基因頻率明顯高于對(duì)照組,A 等位基因頻率在哮喘組(29.5%)明顯高于對(duì)照組(17.5%),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,表明A等位基因可能是河北地區(qū)哮喘發(fā)病的易感基因。

研究發(fā)現(xiàn),IL-13基因第4外顯子的2044位堿基存在G→A 突變,從而導(dǎo)致編碼的相應(yīng)蛋白質(zhì)的多態(tài)鏈第130位氨基酸由精氨酸(Arg)轉(zhuǎn)變?yōu)楣劝滨0罚℅ln),Gln 可能促進(jìn)受體與IL-13 結(jié)合,由于空間結(jié)構(gòu)的改變使IL-13 信號(hào)傳導(dǎo)途徑JAKSTAT6異常,從而影響IL-13的生物學(xué)活性。因此在堿基改變的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上,進(jìn)一步從蛋白功能角度研究這一改變對(duì)IL-13 轉(zhuǎn)錄及表達(dá)的影響,將對(duì)哮喘疾病的診斷和治療有重要意義。

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