王瑋,呂青骎,朱盧璽,李春保,陳穎,葛毅強(qiáng),周光宏
(1.南京農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科技學(xué)院,國家肉品質(zhì)量安全控制工程技術(shù)研究中心,江蘇南京210095;2.南京農(nóng)業(yè)大學(xué)公共管理學(xué)院,江蘇南京210095;3.中國檢驗(yàn)檢疫科學(xué)研究院農(nóng)產(chǎn)品安全研究中心,北京100123;4.中國農(nóng)村技術(shù)開發(fā)中心,北京100045)
食品中馬源性成分的實(shí)時熒光PCR檢測
王瑋1,呂青骎1,朱盧璽2,李春保1,陳穎3,葛毅強(qiáng)4,周光宏1
(1.南京農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科技學(xué)院,國家肉品質(zhì)量安全控制工程技術(shù)研究中心,江蘇南京210095;2.南京農(nóng)業(yè)大學(xué)公共管理學(xué)院,江蘇南京210095;3.中國檢驗(yàn)檢疫科學(xué)研究院農(nóng)產(chǎn)品安全研究中心,北京100123;4.中國農(nóng)村技術(shù)開發(fā)中心,北京100045)
針對馬線粒體DNA細(xì)胞色素b基因設(shè)計特異性引物和探針,建立食品中馬源性成分實(shí)時熒光PCR檢測方法,并經(jīng)特異性和靈敏度試驗(yàn)驗(yàn)證其可行性。結(jié)果表明:該體系可擴(kuò)增馬DNA片段,長度為127 bp,其他常見畜、禽肉成分均無法正常擴(kuò)增。該體系的檢測靈敏度為1.25 pg馬DNA和質(zhì)量分?jǐn)?shù)0.001%馬肉粉。經(jīng)市售食品的檢測驗(yàn)證,表明所建立的馬引物探針體系具有特異性好、靈敏度高、快速、高效等優(yōu)點(diǎn),可用于對食品中馬源性成分的摻假鑒別檢測。關(guān)鍵詞:馬線粒體DNA細(xì)胞色素b基因;實(shí)時熒光PCR方法;定性檢測
目前,國內(nèi)市場上在肉及肉制品的生產(chǎn)銷售過程中,利用摻雜摻假、以次充好等手段欺騙消費(fèi)者而牟取暴利的事件頻出。這不僅僅涉及食品安全、營養(yǎng)與經(jīng)濟(jì)價值等問題,更關(guān)系到消費(fèi)者健康、宗教信仰等問題[1]。因此,對食品中原料肉進(jìn)行摻假、摻雜檢驗(yàn)顯得尤為重要。目前對肉類鑒別的方法主要依賴于蛋白質(zhì)鑒定(SDS-PAGE電泳法、等電聚焦電泳法、ELISA法)[2-4]和分子生物學(xué)鑒定(DNA分子雜交、PCR方法等)[5-7]。蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)現(xiàn)已成功應(yīng)用于生肉的鑒別,但當(dāng)肉類經(jīng)過切碎、混合、蒸煮和熏烤等加工工藝處理后,將改變?nèi)忸惖鞍踪|(zhì)的結(jié)構(gòu)和穩(wěn)定性,從而破壞物種特有的蛋白質(zhì)或抗原決定簇,影響其檢測的準(zhǔn)確性和可靠性[8]。而且,這些方法在實(shí)際應(yīng)用中存在操作復(fù)雜、費(fèi)時、成本高等問題,已不能滿足現(xiàn)代肉類安全檢測的需求。隨著生物技術(shù)的發(fā)展,以物種間基因差異為基礎(chǔ)的分子生物學(xué)鑒定方法成為肉類物種鑒定研究的熱點(diǎn)[9]。本研究中根據(jù)馬線粒體DNA細(xì)胞色素b基因設(shè)計特異性引物和探針,旨在建立一種快速、簡便、靈敏、準(zhǔn)確、可靠的馬源性成分定性檢測的實(shí)時熒光PCR方法,以滿足當(dāng)前相關(guān)食品摻假摻雜檢驗(yàn)的需求。
1.1材料
1.1.1實(shí)驗(yàn)材料各種市售加工食品,如熏馬肉、馬腸、豬肉腸、牛肉丸和醬驢肉,以及馬肉、豬肉、牛肉、驢肉、狗肉、山羊肉、綿羊肉、駱駝肉、兔肉、魚肉、雞肉、鵝肉、鴨肉、鵪鶉肉等樣品,均購于南京市農(nóng)貿(mào)市場或超市。
1.1.2引物和探針根據(jù)Gen Bank所公布的馬線粒體DNA細(xì)胞色素b基因序列,利用Oligo 6.0軟件,設(shè)計馬特異性引物和探針;GeneBank Accession:JF511459,擴(kuò)增目的片段長度為127 bp。擴(kuò)增所用引物和探針由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成,引物和探針序列見表1。
表1 實(shí)時熒光PCR引物和探針序列Table 1 Sequences of primers and probe for Real-time PCR
天根生化科技有限公司;溴化乙錠(EB)、蛋白酶K,購自大連寶生物公司;瓊脂糖(電泳純)、三氯甲烷、無水乙醇、異丙醇,購自上海生工公司;DNA MarkerⅠ,購自上海紀(jì)寧實(shí)業(yè)有限公司;實(shí)時熒光PCR混合液[FastStart Universal Probe Master(ROX)],購自美國羅氏公司。
CTAB提取緩沖液(20 g/L CTAB,1.4 mol/L NaCl,0.1 mol/L Tris-HCl,0.02 mol/L Na2EDTA,pH 8.0);CTAB沉淀液(5 g/L CTAB,40 mmol/L NaCl);蛋白酶K溶液(20 mg/mL);TE緩沖液(10 mmol/L Tris-HCl,1 mmol/L EDTA,pH 8.0);1.2 mol/L NaCl。均由作者所在實(shí)驗(yàn)室配制。
1.1.4儀器各種量程微量移液器,5804R離心機(jī),德國Eppendorf公司制造;PHS-3C精密pH計,上海雷磁公司制造;BS電子天平,德國Sartorius公司制造;VORTEX 3型渦旋振蕩器,德國IKA公司制造;Venticell精密烘箱,德國MMM公司制造;SPEX型冷凍研磨機(jī),美國SPEX 6850公司制造;ABI7700型實(shí)時熒光PCR儀,美國ABI公司制造;DU640型核酸蛋白質(zhì)分析儀,美國Beckman公司制造;DYY-6C電泳儀,北京六一儀器廠制造;凝膠成像儀,德國Gene Genius公司制造。
1.2方法
1.2.1樣品的制備用冷凍研磨機(jī)將上述動物材料樣品研磨成粉狀,并于60℃烘干3 h。用馬肉粉和牛肉粉混合,配制成分別含有質(zhì)量分?jǐn)?shù)10%、1%、0.5%、0.1%、0.05%、0.01%、0.001%和0.000 1%馬肉粉的混合樣品。
1.2.2DNA的提取稱取100 mg已制備好的樣品置于2 mL的離心管中,加入1.5 mL CTAB提取緩沖液和10 μL蛋白酶K溶液。60℃振蕩過夜后13 000 g離心10 min,轉(zhuǎn)移上清液至新的離心管中;加入750 μL三氯甲烷后用力振蕩,13 000 g離心5 min,將上清液轉(zhuǎn)移到新的離心管中;加入2倍體積的CTAB沉淀液,室溫靜置60 min,13 000 g離心15 min,棄去上清液。加入350 μL NaCl溶液將沉淀物進(jìn)行懸浮。再加入350 μL三氯甲烷,渦旋振蕩進(jìn)行混勻,13 000 g離心10 min。轉(zhuǎn)移上清液后加入0.6倍體積的異丙醇,室溫放置20 min,13 000 g離心10 min,棄去上清液。加入500 μL體積分?jǐn)?shù)70%乙醇溶液洗滌沉淀,溶解于100 μL TE溶液中,立即使用或-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3DNA質(zhì)量濃度測定及配制用美國Beckman DU640型核酸蛋白質(zhì)分析儀測定抽提樣品DNA的質(zhì)量濃度。用牛肉DNA溶液(100 ng/μL)將馬肉DNA溶液(100 ng/μL)分別稀釋成為2.5、0.25、0.025、0.002 5、0.000 25、0.000 025 ng/μL的DNA混合樣品,用于靈敏度檢測。
1.2.4PCR擴(kuò)增馬源性成分實(shí)時熒光PCR反應(yīng)體系:實(shí)時熒光PCR混合液12.5 μL,正反向引物(10 μmol/L)各1 μL,探針(10 μmol/L)1 μL,DNA模板5 μL,加滅菌ddH2O至25 μL。擴(kuò)增反應(yīng)程序?yàn)椋?0℃預(yù)變性2 min;95℃變性15 min,95℃退火15 s,60℃延伸1 min,40個循環(huán)。
馬源性成分普通PCR反應(yīng)體系:10×Multi Hotstart buffer(含Mg2+)2.5 μL,dNTPs(2.5 mol/L)1.0 μL,5 U/μL HotMaster Taq DNA polymerase 0.2 μL,正反向引物(10 μmol/L)各0.5 μL,DNA模板5.0 μL,加滅菌ddH2O至25 μL。擴(kuò)增反應(yīng)程序?yàn)椋?5℃預(yù)變性15 min;94℃變性30 s,58℃退火30 s,72℃延伸20 s,40個循環(huán);72℃延伸5 min。擴(kuò)增結(jié)束,質(zhì)量分?jǐn)?shù)2%瓊脂糖凝膠電泳分析結(jié)果。
2.1引物有效性驗(yàn)證
利用所設(shè)計的引物,對馬DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增。由圖1可知,5個樣品均能擴(kuò)增出約127 bp的DNA片段,與預(yù)期所設(shè)計的片段長度相符合。
圖1 PCR產(chǎn)物電泳圖Fig.1 Gel electrophoresis of PCR products
2.2馬源性成分的實(shí)時熒光PCR特異性檢測
以馬線粒體DNA細(xì)胞色素b基因?yàn)閿U(kuò)增靶基因,設(shè)計合成馬源性檢測引物和探針序列,用于對馬和供試的其他動物進(jìn)行檢測分析,在馬DNA中出現(xiàn)擴(kuò)增,而在豬肉、牛肉、驢肉、山羊肉、綿羊肉、駱駝肉、狗肉、兔肉、野兔肉、魚肉、雞肉、鵝肉、鴨肉、鵪鶉肉等14種動物樣品DNA中均無擴(kuò)增,見圖2。證實(shí)該檢測方法具有物種特異性。
圖2 馬源性成分的物種特異性實(shí)時熒光PCR檢測結(jié)果Fig.2 Specific detection of real-time PCR for horse
2.3馬源性成分的實(shí)時熒光PCR靈敏度檢測
使用馬源性檢測引物和探針對2.5、0.25、0.025、0.002 5、0.000 25、0.000 025 ng/μL馬DNA進(jìn)行實(shí)時熒光PCR測試,在2.5、0.25、0.025、0.002 5、0.000 25 ng/μL馬DNA中均出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,在0.000 025 ng/μL馬DNA中未出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,見圖3。表明馬源性檢測引物檢測靈敏度為1.25pg馬DNA。
圖3 馬DNA實(shí)時熒光PCR檢測靈敏度實(shí)驗(yàn)結(jié)果Fig.3 Amplification curve generated by serial dilution of Horse DNA
使用馬源性檢測引物和探針對質(zhì)量分?jǐn)?shù)10%、1%、0.5%、0.1%、0.05%、0.01%、0.001%和0.000 1%馬肉粉含量的樣品DNA進(jìn)行檢測。質(zhì)量分?jǐn)?shù)10%、1%、0.5%、0.1%、0.05%、0.01%和0.001%馬肉粉均出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,而質(zhì)量分?jǐn)?shù)0.000 1%馬肉粉未出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,見圖4。實(shí)驗(yàn)表明,該方法的檢測靈敏度為質(zhì)量分?jǐn)?shù)0.001%(10 mg/kg)馬肉粉。
2.4市售食品中馬源性成分的實(shí)時熒光PCR檢測
見圖5。使用建立的檢測方法對5種市售食品檢測,以驗(yàn)證檢測方法的實(shí)用性。
圖4 馬肉粉質(zhì)量分?jǐn)?shù)實(shí)時熒光PCR檢測靈敏度實(shí)驗(yàn)結(jié)果Fig.4Amplification curve generated by different horsepercentage
圖5 食品中馬源性成分的實(shí)時熒光PCR檢測結(jié)果Fig.5 Detectionofhorse-derivedcomponentsin commercial food products
可知,市售的豬肉腸、牛肉丸、醬驢肉中均未檢測到馬源性成分,而熏馬肉和馬腸中確實(shí)能檢測到馬源性成分,其檢測結(jié)果與食品標(biāo)簽相符合。表明該檢測方法適用于食品中馬源性成分的檢測。
實(shí)時熒光PCR方法因其高靈敏度和高特異性等優(yōu)點(diǎn)被廣泛應(yīng)用于加工產(chǎn)品(尤其是深加工產(chǎn)品)的檢測。靶基因的選擇是影響實(shí)時熒光PCR檢測靈敏度和特異性的關(guān)鍵因素,本研究中選擇的目的基因(細(xì)胞色素b基因)位于線粒體,而大量的線粒體存在于多數(shù)細(xì)胞中,且該基因?yàn)槎嗫截惢颍士蛇_(dá)到較高靈敏度而宜于種源的定性研究[10]。實(shí)驗(yàn)中建立的方法可檢測到1.25 pg馬DNA和質(zhì)量分?jǐn)?shù)0.001%馬肉粉的存在,且該馬特異性引物和探針體系僅能擴(kuò)增馬源性成分,對其他畜禽肉樣品均無法正常擴(kuò)增,從而能保證特異、準(zhǔn)確地檢測出混合樣品中的馬源性成分。在陰性樣品控制方面,Dooley等[11]將Ct值檢測陽性限定為30循環(huán),本研究中將Ct值限定在35循環(huán)以內(nèi),在檢測的特異性、靈敏性和假陽性控制方面均可達(dá)到較好的效果。該方法經(jīng)市售食品檢測驗(yàn)證,可靠性和準(zhǔn)確性良好,能滿足對加工食品中馬源性成分摻假定性檢測的需要。
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Detection for Horse-Derived Components in Foods by Real-Time Polymerase Chain Reaction
WANG Wei1,LV Qingqin1,ZHU Luxi2,LI Chunbao1,CHEN Ying3,GE Yiqiang4,ZHOU Guanghong1
(1.College of Food Science and Technology,Nanjing Agricultural University;National center of Meat Quality and Safety Control,Nanjing 210095,China;2.College of Public Administration,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China;3.Agro-product Safety Research Center,Chinese Academy of Inspection and Quarantine,Beijing 100123,China;4.China Rural Technology Development Center,Beijing 100045,China)
Species-specific real-time PCR assay was developed for the detection of horse-derived materials in foods.Primers and probes were designed with horse conservative regions of the mitochondrial cytochrome b gene(amplicon=127 bp).The specificity was evaluated and no amplifications on DNA from other meats came under observation.The method was specific for horse-derived materials,and the limit of detection was 1.25 pg of horse DNA and 0.001%(w/w)for horse powder.All these results confirmed that the real-time PCR assay is a rapid,sensitive and specific routine food analysis for the detection of horse in foods.
horse mitochondrial DNA cytochrome b gene,real-time PCR,qualitative detection
Q 949.329.7
A
1673—1689(2015)09—0961—04
2014-06-04
國家“十二五”科技支撐計劃項(xiàng)目(2012BAD28B02-03);江蘇省產(chǎn)學(xué)研聯(lián)合創(chuàng)新資金前瞻性聯(lián)合研究項(xiàng)目(BY2011181);南京農(nóng)業(yè)大學(xué)青年科技創(chuàng)新基金項(xiàng)目(KJ2013031)。
王瑋(1982—),男,江蘇泗洪人,工學(xué)博士,講師,主要從事肉及肉制品質(zhì)量安全控制研究。E-mail:wangwei821220@njau.edu.cn