劉莉等
摘要:試驗設(shè)計了南美白對蝦超氧岐化酶和酚氧化酶的熒光定量PCR檢測的特異性引物,用于檢測肝胰腺中超氧化物歧化酶(SOD)和酚氧化酶(PO)的表達(dá)。該方法避免了血清學(xué)檢測免疫指標(biāo)的不穩(wěn)定性、測定值波動性較大的缺點,可作為評估南美白對蝦免疫狀態(tài)的一種分子檢測方法。
關(guān)鍵詞:南美白對蝦;肝胰腺;SOD;PO;熒光定量PCR
中圖分類號: S945.4+9文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號:1002-1302(2015)09-0290-02
南美白對蝦屬甲殼類動物,其免疫主要為非特異性免疫。包括體液免疫中的一些非特異性的酶或因子來進(jìn)行的[1-2]??寡趸甘菬o脊椎動物機體非特異性免疫的一個重要方面,其中SOD是一種能夠催化超氧化物通過歧化反應(yīng)轉(zhuǎn)化為O2和H2O2的酶。超氧化物歧化酶(SOD)是抗氧化系統(tǒng)中起關(guān)鍵作用的酶,不僅具有清除體內(nèi)自由基的作用,而且在機體免疫調(diào)節(jié)中具有重要的作用[3-4]。酚氧化酶(PO)是一種含銅的氧化還原酶,能夠催化單酚羥化成二酚,再把二酚氧化成醌,醌在非酶促條件下形成反應(yīng)終產(chǎn)物黑色素。其反應(yīng)鏈的短暫中間產(chǎn)物擁有很高的生物毒性,能夠抑制病原體胞外蛋白酶以及幾丁質(zhì)酶的活性,屬于一種酶級聯(lián)反應(yīng)系統(tǒng),在南美白對蝦抵抗病原菌侵襲過程中具有重要作用[5-9]。
目前檢測南美白對蝦免疫活性因子通常是通過采集血清,采用生化反應(yīng)方法檢測免疫相關(guān)酶。由于采集過程及檢測過程,酶活性極易受外界環(huán)境的影響,常導(dǎo)致檢測結(jié)果波動性很大,檢測的可靠性受影響。酶的產(chǎn)生是通過基因的轉(zhuǎn)錄、翻譯及后加工形成的,其轉(zhuǎn)錄水平也可反映機體的免疫狀態(tài)。蝦肝胰腺是其血細(xì)胞產(chǎn)生的主要場所,肝胰腺組織免疫因子的轉(zhuǎn)錄表達(dá)也可作為評價機體免疫能力的指標(biāo)之一。熒光定量PCR檢測技術(shù)已經(jīng)成為國際上檢測基因表達(dá)通用的方法,能對低豐度mRNA水平進(jìn)行定量分析[10]。設(shè)計特異性強的引物以及合適的反應(yīng)條件是利用熒光定量PCR檢測南美白對蝦免疫相關(guān)因子的關(guān)鍵。本發(fā)明設(shè)計的引物及反應(yīng)條件可同時用于檢測南美白對蝦肝胰腺SOD和PO的轉(zhuǎn)錄相對定量表達(dá)檢測,為今后準(zhǔn)確分析其南美白對蝦免疫狀態(tài)提供新的方法。
1材料與方法
1.1材料
南美白對蝦來自浙江省紹興縣某養(yǎng)殖場,SYBGreen反應(yīng)預(yù)混液購自Bio-Rad公司,M-MLV酶、dNTP、RNase抑制劑購自TaKaRa(大連)公司,Trizol購自Invotrigen公司。
1.2肝胰腺總 RNA的提取
取南美白對蝦完整肝胰腺組織,加入500 μL Trizol裂解液,用研磨棒研磨,等徹底勻漿后,取50 μL勻漿液加入1 mL Trizol 繼續(xù)裂解5 min。其余勻漿液置-80 ℃保存?zhèn)溆?,或?qū)⑼暾我认僭谝旱兴賰龊笾糜谟?80 ℃下保存。使用時將組織全部碾磨后,取100 mg加入1 mL Trizol裂解,其余組織粉末置-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
取出的50 μL勻漿液或100 mg組織粉末繼續(xù)裂解5 min后,12 000 r/min條件下離心2 min,吸取上清至新的離心管。加入200 μL三氯甲烷,渦旋混勻,12 000 r/min條件下離心15 min,吸取上清。加入等體積異丙醇,顛倒混勻數(shù)次,靜置10 min,12 000 r/min 條件下離心10 min,棄上清。用500 μL DEPC水配制的70%乙醇洗滌沉淀,12 000 r/min 條件下離心 5 min,棄去上清。100 μL DEPC水溶解RNA。 測定RNA濃度和純度后,-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3引物設(shè)計與合成
引物是根據(jù)GenBank公布的南美白對蝦SOD(登錄號:AY486424.1)、PO(登錄號:JN393011.1)及β-actin內(nèi)參基因序列(登錄號:JF288784.1),由軟件Primer Premier 5.0設(shè)計和手工修改后獲得(表1),均由蘇州金維智生物科技有限公司合成。
1.4cDNA合成
取1 μg 總RNA為模板,加入1 μL 10 mmol/L dNTP、1 μL 50 mmol/L Oligo(dT)15,加DEPC水至總體積6.25 μL,65 ℃變性5 min,冰上驟冷2 min。上述反應(yīng)液加入2 μL 5× M-MLV buffer、0.25 μL RNA酶抑制劑、0.5 μL MMLV逆轉(zhuǎn)錄酶、1 μL 10 mmol/L二硫蘇糖醇,使最終反應(yīng)總體積達(dá) 10 μL。42 ℃反應(yīng)1 h后,65 ℃孵育10 min,cDNA合成完畢。表1熒光定量PCR所用引物
檢測基因名稱引物序列(5′→3′)擴增長度(bp)SOD SOD-F:CGCCCTTGAACCTCACATCT;SOD-R:ATTGCGCTTACGTCATTGGC135POPO-F:AATGACCGCGTTGAGGAGTT;PO-R:AGTGGGATCTTCAGCTTGCC134β-actin(內(nèi)參)β-actin-F:CGAGCGAGAAATCGTTCGTG;β-actin-R:GAATGAGGGCTGGAACAGGG187
合成的cDNA加入90 μL無菌雙蒸水,用于后續(xù)熒光定量PCR擴增。1.5熒光定量的反應(yīng)體系及條件
取5 μL上述合成的cDNA稀釋液作為擴增模板,加入2×Sybgreen反應(yīng)預(yù)混液12.5 μL,分別加入5 μmol/L相應(yīng)特異性上、下游引物各0.5 μL,加6.5 μL無菌雙蒸水,使反應(yīng)總體系達(dá)25 μL,置于熒光定量PCR儀上進(jìn)行PCR反應(yīng)。PCR反應(yīng)條件為:95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性30 s,60 ℃退火15 s,72 ℃延伸30 s,40個循環(huán);60~90 ℃熔解曲線。
2結(jié)果與分析
2.1熒光定量PCR擴增效果
從擴增曲線可以看出,SOD、PO及內(nèi)參基因β-actin的擴增曲線均較好,曲線拐點清楚,基線平,無上揚現(xiàn)象;SOD的CT值為23.85,PO的CT值為28.33,能較好地反映各基因的表達(dá)差異(圖1)。通過CT值計算該樣品中SOD和PO表達(dá)量相對于β-actin的表達(dá)量分別為0.140 63、0.006 30倍。
2.2熒光定量PCR擴增產(chǎn)物的熔解曲線
從擴增產(chǎn)物的熔解曲線看,SOD、PO及內(nèi)參基因β-actin均為單峰,且峰值較高(圖2),表明各擴增產(chǎn)物的特異性較好,且擴增效率較高。
2.3熒光定量PCR擴增產(chǎn)物的瓊脂糖電泳檢測
將熒光定量PCR的擴增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖電泳檢測,結(jié)果顯示SOD、PO及內(nèi)參基因β-actin的各擴增產(chǎn)物的條帶單一,亮度較好,并能一定程度上看出各基因的表達(dá)差異(圖3)。進(jìn)一步證實了其較好的擴增效率和較高的擴增特異性。
3結(jié)論與討論
非特異性免疫因子的測定是評估南美白對蝦免疫狀態(tài)的主要指標(biāo),建立可靠的檢測方法對于南美白對蝦的免疫學(xué)研究、抗病育種研究等都具有重要意義。傳統(tǒng)的體液免疫指標(biāo)的測定常采用酶法檢測,但易受多種因素干擾,測定值偏差較大。近幾年,隨著分子生物學(xué)迅猛發(fā)展,熒光定量PCR方法開始被廣泛應(yīng)用于多種免疫因子定量檢測[11-12]。熒光定量PCR檢測方法的可靠性與所設(shè)計引物的特異性和擴增有效性密切相關(guān)。本方法針對SOD和PO等2個重要的非特異免疫指標(biāo)設(shè)計了特異性較好、擴增效率較高的引物,建立了利用熒光定量PCR方法對南美白對蝦肝胰腺SOD、PO的檢測方法。該方法特異性強,敏感性高,克服了酶法測定易波動的問題,適合南美白對蝦免疫活力的評估。
與酶法檢測技術(shù)比較,本方法所提供的南美白對蝦肝胰腺SOD、PO的熒光定量PCR檢測方法具有以下優(yōu)點:(1)所采用的肝胰腺組織較對蝦血液采集更容易。(2)所采集的組織直接用Trizol處理或通過速凍方式保存,可有效減少RNA降解;較血清采集過程可能發(fā)生的溶血或其他導(dǎo)致酶失活的因素更易于控制,保證結(jié)果的可靠性。(3)設(shè)計的引物特異性好,擴增效率高,提高了檢測的準(zhǔn)確性。(4)采用相對定量方式,通過與內(nèi)參基因表達(dá)量的對比,可同時測定多個免疫相關(guān)因子。
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