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魔芋芋花葉病毒的檢測

2015-08-06 22:43盛佳婧鐘琳楊朝柱胡凱王大平吳金平胡中立刁英
湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2015年10期
關(guān)鍵詞:花葉病毒魔芋靈敏度

盛佳婧 鐘琳 楊朝柱 胡凱 王大平 吳金平 胡中立 刁英

摘要: 為評價魔芋(Amorphophallus konjac)體內(nèi)芋花葉病毒檢測方法,利用人工接種芋花葉病毒的魔芋作為試驗材料,分別采用DAS-ELISA、RT-PCR、熒光定量PCR等3種方法進(jìn)行檢測。結(jié)果表明,對于人工接種芋花葉病毒1周,植株出現(xiàn)有明顯病征的魔芋,熒光定量PCR檢測的靈敏度最高、RT-PCR次之,而DAS-ELISA酶聯(lián)檢測法靈敏度較低。

關(guān)鍵詞:魔芋(Amorphophallus konjac);芋花葉病毒;DAS-ELISA;RT-PCR;熒光定量PCR

中圖分類號:S436.32 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A 文章編號:0439-8114(2015)10-2519-03

DOI:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2015.10.059

魔芋(Amorphophallus konjac)是天南星科魔芋屬多年生草本植物,已有2 000多年的種植歷史[1]。魔芋是世界上迄今為止發(fā)現(xiàn)的惟一含有大量葡甘聚糖的植物。近年來隨著葡甘聚糖營養(yǎng)保健功能的逐步被發(fā)現(xiàn)和在食品工業(yè)上的廣泛應(yīng)用,魔芋產(chǎn)品的市場需求逐年擴大,但因常年無性繁殖,使病毒積累、種性退化,其豐產(chǎn)性和品質(zhì)無法保證[2]。芋花葉病毒(Dasheen mosaic virus,DsMV)是天南星科植物上發(fā)生最普遍和危害最嚴(yán)重的病毒[3]。

目前植物病毒的檢測方法主要包括生長季隔離檢疫、指示植物接種、血清學(xué)檢測、免疫電鏡和分子生物學(xué)檢測[4,5]。已報道用ELISA和RT-PCR法來檢測魔芋中芋花葉病毒[6]。熒光定量PCR是在常規(guī)PCR基礎(chǔ)上將熒光共振能量轉(zhuǎn)移與熒光標(biāo)記探針結(jié)合,將核酸擴增、雜交、光譜分析和實時檢測技術(shù)融合在一起的一項創(chuàng)造性技術(shù),它具有快速、靈敏、高通量、特異性強、自動化程度高、重復(fù)性好、準(zhǔn)確定量等特點[7]。實時熒光定量PCR技術(shù)被廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)診斷、海關(guān)檢驗檢疫、國防軍事、新型農(nóng)業(yè)、基礎(chǔ)研究等領(lǐng)域[8,9],尤其在動物醫(yī)學(xué)病理和分子生物學(xué)研究領(lǐng)域應(yīng)用十分廣泛[10]。

本研究在前人研究的基礎(chǔ)上,結(jié)合植物病毒檢測的特點,采用DAS-ELISA、RT-PCR和熒光定量PCR對魔芋中的芋花葉病毒進(jìn)行檢測,為魔芋病毒的快速診斷提供了技術(shù)參考。

1 材料與方法

1.1 材料

芋花葉病毒由華中農(nóng)業(yè)大學(xué)洪霓教授提供,接種材料為組培得到的清江花魔芋(A. konjac cv. qingjiang)脫毒植株。

1.2 試劑

植物總RNA提取試劑盒購自天根生化科技(北京)有限公司;5×M-MuLV反轉(zhuǎn)錄酶緩沖溶液、M-MuLV 反轉(zhuǎn)錄酶購自Promega公司;dNTPs、10×Taq Reaction Buffer、Taq DNA Polymerase、DL2000 Marker購自北京鼎國昌盛生物技術(shù)有限責(zé)任公司;DSMV ELISA 試劑盒購自美國Rapidbio公司;2×SYBR Master Mix購自TOYOBO公司。引物由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成,序列測定由上海桑尼生物科技股份有限公司完成。

1.3 病毒的接種

將帶病毒的新鮮魔芋葉片用液氮研磨至粉末后溶解于接種緩沖液(5 mL PBST,0.1 g PVP-40,

0.005 g BSA,0.022 5 g 銅試劑)中,并用紗布過濾到1.5 mL EP管中,插入冰水中備用。接種前洗凈手指,用干凈的鋼絲球沾取帶病汁液在健康魔芋葉片上摩擦,接種后用無菌水沖洗葉面,去除緩沖液對葉片代謝的影響。接種1周后魔芋葉片出現(xiàn)白色斑點,葉片邊緣出現(xiàn)輕微卷邊的癥狀(圖1),說明芋花葉病毒已經(jīng)成功接種到健康魔芋植株上。

1.4 病毒的檢測

1.4.1 DAS-ELISA檢測 稱取0.3 g的帶病葉片,加入到3 mL PBS(pH 7.4)溶液中,用勻漿器將標(biāo)本充分勻漿,離心20 min收集上清。按照ELISA試劑盒的步驟進(jìn)行操作,測定405 nm 波長下的OD值。數(shù)據(jù)判斷標(biāo)準(zhǔn):陽性對照孔平均值≥1.00,陰性對照平均值≤0.10,臨界值計算:臨界值=陰性對照孔平均值+0.15。陰性判定標(biāo)準(zhǔn):樣品OD405 nm<臨界值者為陰性;陽性判定標(biāo)準(zhǔn):樣品OD405 nm≥臨界值者為陽性。

1.4.2 RT-PCR 檢測 參考文獻(xiàn)[6]合成檢測引物(5′-GGGCTTGGGTGATGATGGA-3′,5′-GCCTTTCAGTGTTCTCGCTTG-3′),擴增的目的片段長度為310 bp。采用植物總RNA提取試劑盒提取魔芋葉片總RNA,具體方法依照說明書進(jìn)行。PCR體系采用25 μL反應(yīng)體系進(jìn)行,包括cDNA 1.5 μL,上、下游引物各1 μL(10 μmol/L),dNTPs 0.5 μL(10 mmol/L),10×PCR Buffer 2.5 μL,MgCl2 2 μL(25 mmol/L),Taq DNA酶1 U,ddH2O 15.5 μL。PCR反應(yīng)程序:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,56 ℃退火30 s,72 ℃延伸5 min,36個循環(huán);再72 ℃延伸5 min。PCR產(chǎn)物以1.0%的瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳,并將PCR產(chǎn)物送至上海桑尼生物科技股份有限公司進(jìn)行序列測定。

1.4.3 熒光定量PCR檢測 以cDNA(稀釋100倍)為模板進(jìn)行熒光定量PCR檢測。熒光定量PCR反應(yīng)體系為20 μL,包括cDNA模板2 μL、2×SYBR Master Mix 10 μL,上、下游引物各0.5 μL(20 μmol/ L)。PCR 反應(yīng)程序:95 ℃變性15 s,60 ℃退火1 min,共40個循環(huán)。每個樣品設(shè)定3個平行,反應(yīng)在ABI實時熒光PCR 儀上進(jìn)行。

2 結(jié)果與分析

2.1 DAS-ELISA檢測結(jié)果

DAS-ELISA檢測結(jié)果如圖2所示。由圖2可以看出,陽性對照1和7的OD405 nm分別為2.987 1、3.172 3;陰性對照2和8的OD405 nm分別為0.080 2、0.073 5;空白對照6的OD405 nm是0.070 2;平行樣品3、4、5的OD405 nm分別為0.981 7、0.706 7、0.123 4;平行樣品9、10、11、12的OD405 nm分別為1.020 6、0.119 3、0.103 6、0.105 2。雖然接種芋花葉病毒的魔芋葉片有稍許顏色反應(yīng),但達(dá)不到檢測試劑盒要求的陽性標(biāo)準(zhǔn),DAS-ELISA檢測的靈敏度較低。

2.2 RT-PCR檢測結(jié)果

接種芋花葉病毒的魔芋能擴增到預(yù)期大小的條帶(圖3),而健康魔芋樣本無此片段出現(xiàn)。BLAST比對結(jié)果表明,本研究中擴增的序列與DsMV其他株系的對應(yīng)序列覆蓋率可達(dá)到100%,相似性最高達(dá)到99%,說明所得DNA片段確為DsMV的基因片段。

2.3 熒光定量PCR檢測結(jié)果

熒光定量PCR檢測了稀釋100倍的病毒樣品,檢測到熒光信號,25個循環(huán)數(shù)左右達(dá)到平臺期,條帶特異性較強,能確定是目的序列擴增(圖4)。結(jié)果表明,熒光定量PCR能夠檢測魔芋花葉病毒。

3 小結(jié)與討論

基于免疫學(xué)原理的ELISA相關(guān)方法對設(shè)備要求低、操作簡單、成本偏低,可用于基層大量樣品的檢測等優(yōu)點,廣泛用于病毒的檢測,但往往非特異性反應(yīng)(即假陽性)的問題較普遍,對于某些材料的檢測靈敏度也不夠高。本研究中接種病毒的植株已經(jīng)明顯出現(xiàn)的病癥,但采用ELISA方法進(jìn)行檢測,卻并未得到可靠的陽性結(jié)果?;诜肿由飳W(xué)技術(shù)的RT-PCR方法在反應(yīng)特異性和靈敏度方面大大提高,而且沒有免疫學(xué)方法中制備抗血清的限制,檢測的時間較短,但對于帶毒量偏低的材料仍有其局限性。熒光定量PCR技術(shù)是最近幾年發(fā)展最快的技術(shù)之一,是由熒光技術(shù)和普通PCR擴增系統(tǒng)相結(jié)合,克服了普通PCR技術(shù)的不足,且簡化了檢測過程,特異性和靈敏度都較高,可以用于帶毒量偏低的帶病植株的分子檢測。本研究中熒光定量PCR的模板濃度比RT-PCR低100倍,仍然能夠檢測出陽性結(jié)果,表明熒光定量PCR的靈敏度確實優(yōu)于RT-PCR。但是熒光定量PCR檢測對儀器要求較高,需要專門的熒光定量PCR儀,而RT-PCR在普通的PCR儀上就能進(jìn)行,一般實驗室即可以開展檢測工作。

參考文獻(xiàn):

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