杜珊珊,王穎,張東杰
(黑龍江八一農(nóng)墾大學食品學院,大慶 163319)
中性蛋白酶是一類在中性pH 條件下作用于蛋白質(zhì)肽鍵的蛋白酶[1],其能將大分子蛋白質(zhì)迅速水解成肽類和部分游離氨基酸[2],具有廣泛的市場價值,被應用于紡織、醫(yī)療、皮革、食品等行業(yè)[3-4],但中性蛋白酶產(chǎn)量低,成本高,發(fā)酵不穩(wěn)定等,為了提高酶活性,世界各國科研工作者主要在蛋白酶基因的篩選,基因序列[5-6],克隆表達[7]等方面進行研究。比如楊慶云等[8]用鳥槍法克隆得到嗜熱脂肪芽孢桿菌的中性蛋白酶基因,該基因表達量提高了約30 倍。茆軍等[9]成功克隆了高溫中性蛋白酶基因,并在畢赤酵母中正確表達。
此前對中性蛋白酶的研究主要集中在蠟狀芽孢桿菌、地衣芽孢桿菌,而對解淀粉芽孢桿菌中性蛋白酶的研究相對較少。解淀粉芽孢桿菌是一種革蘭氏陽性細菌,與枯草芽孢桿菌具有很近的親緣關(guān)系[10-11],它具有較強的胞外酶分泌能力,是淀粉酶、蛋白酶的一些主要酶制劑的生產(chǎn)菌株[12]。研究以中性蛋白酶生產(chǎn)菌株解淀粉芽孢桿菌為研究對象,利用基因工程技術(shù)對其中性蛋白酶基因進行了克隆表達,獲得了具有一定活性的中性蛋白酶。
解淀粉芽孢桿菌購自中國工業(yè)菌種保藏管理中心,E.coli BL21(DE3)與質(zhì)粒PET-28a 由實驗室保存,Taq DNA 聚合酶、限制性內(nèi)切酶BamHⅠ、SalⅠ、T4-DNA 連接酶購于大連TaKaRa 產(chǎn)品,IPTG(異丙基-β-D 硫代半乳糖苷)、DNA 提取試劑盒、膠回收試劑盒、質(zhì)粒DNA 小提中量試劑盒購自北京博大泰克生物有限公司。
1.2.1 培養(yǎng)基配制
蛋白胨2.5 g、牛肉膏5 g、酵母膏2.5 g、葡萄糖2.5 g、氯化鈉2.5 g、瓊脂5 g、蒸餾水500 mL、pH7.0。將菌種放入培養(yǎng)基,在30 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)2~3 d[13]。
1.2.2 解淀粉芽孢桿菌總DNA 的提取
以解淀粉芽孢桿菌為材料,采用細菌基因組DNA 快速提取試劑盒,提取菌株的總DNA,并用瓊脂糖凝膠電泳檢測總DNA 的含量,在-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3 解淀粉芽孢桿菌中性蛋白酶基因的克隆
根據(jù)Gene Bank 中報道的解淀粉芽孢桿菌中性蛋白酶基因序列(登錄號為:M36723.1),借助OLIGO 生物學軟件設計,并在正反向引物中添加BamHⅠ和SalⅠ酶切位點,序列如下:
正向引物:CGCGGATCCGTGGGTTTAGGTAAG AAATTG
反向引物:GCGTCGACTTACAATCCGACTGCAT TCC
通過PCR 技術(shù)擴增中性蛋白酶基因,反應體系50 μL,擴增條件為:94 ℃預變性5 min;94 ℃,變性40 s,50 ℃退火40 s,72 ℃延伸1.5 min,35 個循環(huán);72 ℃后再延伸10 min。將PCR 產(chǎn)物回收純化后與PMD18-T Vector 進行連接,轉(zhuǎn)化DH5α 感受態(tài)細胞,并涂布在Amp、X-Gal、IPTG 的固體培養(yǎng)基平板上,培養(yǎng)12~15 h 后進行藍白斑篩選,挑取白色菌落放進含氨芐的LB 液體培養(yǎng)基中振搖培養(yǎng),送到上海生工公司進行測序,將其正確的重組質(zhì)粒命名為PMD18-T-npr,并進行同源性比較。
1.2.4 重組質(zhì)粒的構(gòu)建
將經(jīng)鑒定正確的重組質(zhì)粒PMD18-T-npr 和PET-28a 分別用BamHⅠ和SalⅠ進行雙酶切,采用試劑盒回收純化。將純化后的目的片段和PET-28a置于10 μL 反應體系中進行連接,16 ℃連接12 h,過夜培養(yǎng),隨后將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)到E.coli BL21(DE3)中,把平板上的白斑轉(zhuǎn)化子用PCR 和雙酶切進行鑒定。
1.2.5 重組質(zhì)粒的誘導表達
將構(gòu)建成功的BL21/PET-npr 工程菌株接種于5 mL 含卡納抗性的LB 液體培養(yǎng)基中,37 ℃振蕩培養(yǎng)過夜,按1%的接種量轉(zhuǎn)接于新液體培養(yǎng)基中繼續(xù)培養(yǎng)至OD600為0.6~0.8 h,此時加入IPTG(終濃度為1.0 mmol·L-1),37 ℃誘導4 h,以未誘導菌為對照。取適量的菌液在4 ℃8 000 r·min-1離心10 min,取上清液進行SDS-PAGE 分析,具體方法參照文獻[14]。
IPTG 是一種作用極強的誘導劑,能夠啟動E.coli BL21(DE3)中l(wèi)ac 啟動子的轉(zhuǎn)錄,但并不是IPTG 添加的越多就越好。
(1)按照上述的方法,選取不同IPTG 濃度(0.2、0.4、0.6、0.8、1.0 mmol·L-1)進行誘導,在37 ℃保溫2 h 后,測得酶活力進行分析。
(2)確定最佳的誘導溫度,試驗以IPTG 濃度為0.8 mmol·L-1,在不同溫度條件下(20 ℃、25 ℃、30℃、35 ℃、40 ℃)誘導2 h 后,對酶活力的影響。
(3)考察不同的誘導時間(1、2、3、4、5 h),其他條件固定不變(IPTG 濃度為0.8 mmol·L-1,溫度在30 ℃)進行誘導,確定最佳誘導條件。
1.2.6 蛋白酶活力的測定
按照標準GBT 23527-2009,將1 mL 酶液與1%酪蛋白1 mL 混合,在pH 7.5,40 ℃條件下,每分鐘反應產(chǎn)生1 μg 酪氨酸所需要的酶量為1 個酶活力單位(U)[15]。
根據(jù)所設計的引物,以解淀粉芽孢桿菌染色體DNA 為模板,進行PCR 擴增。電泳檢測反應結(jié)果如圖1。在1 566 bp 處可見一條與預期大小相符的特異性條帶。
將PCR 產(chǎn)物和質(zhì)粒PET-28a 分別用BamHⅠ和SalⅠ進行酶切,酶切產(chǎn)物經(jīng)純化回收后,用T4DNA連接酶16 ℃過夜連接,將其轉(zhuǎn)化感受態(tài)細胞中,得到重組質(zhì)粒PET-28a/npr,挑取陽性克隆并提取質(zhì)粒進行雙酶切驗證,如圖2 所示,得到一條約5 369 bp與質(zhì)粒PET-28a 大小相符,和另一條1 566 bp 與目的片段大小相符,表明重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。
圖1 Bacillus amyloliquefaciens 中性蛋白酶基因擴增電泳圖Fig.1 PCR product of npr gene in the Bacillus amyloliquefaciens
圖2 重組質(zhì)粒的酶切鑒定Fig.2 Enzyme identification of recombinant plasmid
將上述重組質(zhì)粒發(fā)送到上海生工生物工程股份有限公司進行測序。得到的基因全長為1 566 bp,編碼一個由522 個氨基酸組成的蛋白質(zhì),通過BLAST軟件對中性蛋白酶核苷酸序列進行同源性分析,發(fā)現(xiàn)測序結(jié)果與Genebank(登錄號:M36723.1)中解淀粉芽孢桿菌中性蛋白酶基因序列具有100%同源性。證明重組質(zhì)粒PET-28a/npr 構(gòu)建成功。
將鑒定過的陽性菌轉(zhuǎn)入含有卡納抗性的大腸桿菌中,按照試驗方法對重組子進行誘導表達,離心收集上清液,根據(jù)SDS-PAGE 進行分析,結(jié)果如圖3,經(jīng)過誘導的重組子PET-28a/npr 出現(xiàn)一條明顯特異性蛋白條帶,分子質(zhì)量約為57 kDa,該條帶大小與基因序列推導的蛋白大小相符,而未經(jīng)IPTG 誘導的重組蛋白和經(jīng)IPTG 誘導的空載體則都未出現(xiàn)此條帶,此說明解淀粉芽孢桿菌中性蛋白酶在大腸桿菌中得到了成功的表達。
圖3 表達產(chǎn)物的SDS-PAGE 鑒定結(jié)果Fig.3 Identification of the expression product by SDS-PAGE
2.5.1 最佳誘導濃度的確定
如圖4 所示,隨著誘導濃度的增大,中性蛋白酶活力逐漸上升,在IPTG 濃度為0.8 mmol·L-1時酶活力達到最大,繼續(xù)加大誘導濃度,酶活力反而不高。
圖4 IPTG 濃度中性蛋白酶酶活力的影響Fig.4 Effects of concentration of IPTG on neutral protease enzyme activity
2.5.2 最佳誘導溫度的確定
溫度決定蛋白可溶性的一個重要因素,誘導溫度過高容易以包涵體形式存在,溫度過低酶活力降低,結(jié)果如圖5 所知,隨著溫度的升高,在30 ℃時酶活力達到最大值,繼續(xù)加熱不利于酶活力。
圖5 溫度對中性蛋白酶酶活力的影響Fig.5 Effects of temperature on the neutral protease enzyme activity
2.5.3 最佳誘導時間的確定
如圖6 所見,誘導1 h 后融合蛋白就有一定量的表達,隨著誘導時間的增長,中性蛋白酶酶活力緩慢升高,誘導時間在4 h 時,酶活力達到最大,而繼續(xù)誘導酶活力并沒有提高,因此最佳誘導時間為4 h。
圖6 誘導時間對中性蛋白酶酶活力的影響Fig.6 Effects of induction time on the neutral protease enzyme activity
將重組菌按照上述最佳IPTG 誘導條件進行培養(yǎng),裂解細胞離心取上清液,檢測其蛋白酶活性,并做空白對照試驗,結(jié)果顯示重組大腸桿菌陽性菌的表達產(chǎn)物最高酶活力達到450 U·mL-1。
中性蛋白酶的研究開發(fā)工作在上世紀70年代就已開始,國外最早開展基因克隆表達的有關(guān)工作,1953年Fuji[16]等從嗜熱脂肪芽孢桿菌CU21 中成功克隆了中性蛋白酶基因,并將其轉(zhuǎn)入另一菌株(MD-3)中進行表達,產(chǎn)酶量比供體菌高出15 倍。除此之外,有地衣芽孢桿菌、枯草芽孢桿菌、短小芽孢桿菌等在內(nèi)的10 余種芽孢桿菌來源的蛋白酶基因得到了克隆表達。目前,商業(yè)上所用的中性蛋白酶大部分來源于芽孢桿菌屬,中性蛋白酶在商品酶中占有較大的份額。因此,利用基因克隆技術(shù)提高中性蛋白酶的產(chǎn)量,并對其性能進行改性,為中性蛋白酶的應用具有較好的發(fā)展前景。
試驗采用分子生物學方法,用PCR 擴增得到中性蛋白酶,利用表達載體PET-28a 在大腸桿菌中高效的表達。并采用SDS-PAGE 電泳進行分析,對誘導濃度、時間和溫度進行優(yōu)化,最高酶活性達到450 U·mL-1,在今后的試驗中還將進一步分離純化,獲得的純酶用于重組中性蛋白酶的酶學性質(zhì)及其應用的研究,這將最大化提高中性蛋白酶的產(chǎn)量和活性,為工業(yè)生產(chǎn)應用具有重要的意義。
[1]王俊,蘇國萬,趙謀明,等.產(chǎn)中性蛋白酶種曲培養(yǎng)基的優(yōu)化及酶學特性研究[J].現(xiàn)代食品科技,2012,28(8):1002-1006.
[2]粟桂嬌,閻欲曉,陳春寧,等.雙水相萃取分離米曲霉中性蛋白酶[J].食品科技,2012,37(1):9-13.
[3]張樹政.酶制劑工業(yè)[M].北京:科學出版社,1998.
[4]Pastor M D,Lorda G S,Balatti A.Protease obtention using Bacillus subtilis 3411 and amaranth seed meal medium at different aeration rates[J].Braz.J.Microbiol,2001,32(1):1-8.
[5]Tran L,Wu X C,Wong S L.Cloning and expression of a novel protease gene encoding an extracellular neutral protease from Bacillus subtilis[J].Journal of Bacteriology,1991,173(20):6364-6372.
[6]Donohue M J,Roques B P,Beaumont A.Cloning and expression in Bacillus subtilis of the npr gene from Bacillus thermoproteolyticus Rokko coding for the thermostable metalloprotease thermolysin[J].Biochemical Journal,1994,300(2):599-603.
[7]張紅梅,白云,魏賢斌.等.野生大豆GsRNF12 基因的克隆及表達載體的構(gòu)建[J].黑龍江八一農(nóng)墾大學學報,2013,25(4):15-17.
[8]楊慶云,江行娟,吳琳,等.嗜熱脂肪芽孢桿菌中耐熱蛋白酶基因的克?。跩].生物工程學報,1991,7(3):207-212.
[9]茆軍,王瑋,張志東,等.高溫中性蛋白酶基因的克隆、表達及驗證研究[J].新疆農(nóng)業(yè)科學,2008,45(5):956-959.
[10]車曉曦,李校堃.解淀粉芽孢桿菌的研究進展[J].北京農(nóng)業(yè),2010(3):7-9.
[11]Chen X H,Koumoutsi A,Scholz R,et al.Comparative analysis of the complete genome sequence of the plant growth-promoting bacterium Bacillus amyloliquefaciens FZB42 [J].Nature Biotechnology,2007,25(9):1007-1014.
[12]Vehmaanpera J,Steinborn G,Hofemeister J.Genetic manipulation of Bacillus amyloliquefaciens [J].J Biotechnology,1991,19(2-3):221-240.
[13]朱林江,鄭飛云,趙亞洲,等.Rep -PCR 應用于快速鑒定啤酒污染菌的研究[J].生物工程學報,2006,22(6):1013 -1020.
[14]Teng D,Wang J H,F(xiàn)an Y,et al.Cloning of β-1,3 -1,4- glucanase gene from Bacillus licheniformis EGW039(CGMCC 0635)and its expression in Escherichia coli BL21(DE3)[J].Appl Microbiol Biotechnology,2006,72(4):705-712.
[15]許波,穆躍林,黃遵錫,等.中性蛋白酶基因的克隆與表達載體的構(gòu)建[J].云南師范大學學報,2002,22(1):47-50.
[16]Fujii M,Takagi M,Imanaka T,et al.Molecular cloning of a thermostable neutral protease gene from Bacillus stearothermophilus in a vector plasmid and its expression in Bacillus stearothermophilus and Bacillus subtilis[J].J Bacteriollogy,1983,154(2):831-837.