吳滟輝,王曉君
(1.湖南農業(yè)大學附屬醫(yī)院,湖南 長沙 410128,2.湖南農業(yè)大學分析測試中心,湖南 長沙 410128)
致乏蚊蟲[1–2]是尖音庫蚊的一個亞種,在中國廣泛分布于上海、江蘇、安徽、河南、陜西、西藏等地區(qū),其幼蟲在臟污的水中生長,發(fā)育成蛹、蚊。雄蚊吸食花粉、花蜜和植物汁液;雌蚊叮咬人畜,吸食血液,并傳播班氏絲蟲病、流行性乙型腦炎等疫病,至于能否傳播其他疾病,目前尚缺少這方面的研究。為了準確評估致乏蚊蟲的公共衛(wèi)生意義,筆者利用PCR–DGGE技術對致乏庫蚊雌成蟲的帶菌情況進行了分析,現(xiàn)將結果報道如下。
致乏庫蚊采自湖南農業(yè)大學校園(經形態(tài)學和分子生物學鑒定認定為致乏庫蚊)。標本保存于湖南農業(yè)大學寄生蟲教研室。
2×EasyTaq PCR SuperMix、2×TransTaq HiFi SuperMix Ⅰ為北京全式金生物技術有限公司產品;細菌基因組DNA提取試劑盒、DNA片段快速純化/回收試劑盒為北京鼎國昌盛生物技術有限責任公司產品;高純質粒小提試劑盒為天根生化科技(北京)有限公司產品;EcoRⅠ、XhoⅠ、pMD18–T、E. coli DH5ɑ為寶生物工程(大連)有限公司產品。擴增引物341f(5′–CCTACGGAGGCAGCAG–3′)、907r(5′–CCC CGTCAATTCATTTGAGTTT–3′)、341fGC(5′–CGCC CGCCGCGCGCGGCGGGCGGGGCGGGGGCACG GGGGGCCTACGGAGGCAGCAG–3′)和518r(5′–AT TACCGCGGCTGCTGG–3′)由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
主要儀器:變性梯度凝膠電泳儀系統(tǒng)(JY– TD331,北京君意東方電泳設備有限公司產品); PCR儀(2720 thermal cycler,Applied Biosystems產品);凝膠成像系統(tǒng)(alphamager?EP,Alpha Innotech產品)。
1.3.1 DNA 的提取
取致乏庫蚊雌成蟲3只,于75%乙醇浸泡90 s;用無菌水沖洗,于無菌條件下研磨;加無菌生理鹽水500.00 μL,200×g離心1min,取上清液。按試劑盒說明書操作,提取細菌基因組DNA。
1.3.2 16S rDNA V3–V5 區(qū)的擴增
以341f和907r為引物擴增16S rDNA V3–V5區(qū)。擴增體系50 μL:基因組DNA 5.00 μL,上下游引物(10 μmol/L)各2.00 μL,2×EasyTaq PCR SuperMix 25.00 μL,ddH2O 16.00 μL。擴增條件:94℃預變性5min;94℃預變性30 s,61.5℃退火30 s,72℃延伸34 S,32個循環(huán);72℃延伸7min。產物于2%瓊脂糖凝膠電泳。
1.3.3 16S rDNA V3 區(qū)的擴增
以上述擴增產物為模板,以341fGC和518r為引物擴增16S rDNA V3區(qū)。擴增體系50 μL:基因組DNA 1.00 μL,上下游引物(10 μmol/L)各2.00 μL,2×TransTaq HiFi SuperMix 25.00Ⅰ μL,ddH2O 16.00 μL。擴增條件:94℃預變性5min;94℃預變性30 s,66℃退火30 s,72℃延伸12 s,31個循環(huán);72℃延伸10min。產物于2%瓊脂糖凝膠電泳。以DNA片段快速純化/回收試劑盒純化。
1.3.4 細菌16S rDNA V3 片段變形梯度凝膠電泳
取純化產物7.00 μL進行DGGE凝膠電泳;電泳條件為60℃、120 V、4 h。EB染色,拍照。
1.3.5 切膠回收、克隆和測序
切取凝膠中清晰、明顯的條帶,ddH2O洗滌3次,搗碎,加入無菌生理鹽水40.00 μL,4℃過夜。12 000×g離心過夜產物5min。
取上清液5 μL,以341f和518r為引物擴增,條件同1.2.3。以DNA片段快速純化/回收試劑盒回收PCR產物。
取回收產物4.00 μL、pMD18–T載體1 μL、Solution 5.00Ⅰ μL,16℃條件下連接12 h。連接產物轉化于E.coli DH5ɑ感受態(tài)細胞;涂布于含X–Gal、IPTG和氨芐青霉素的LB固體培養(yǎng)基,37℃振蕩培養(yǎng)12 h。挑選單個白色菌落于含Amp的LB液體培養(yǎng)基,37℃振蕩培養(yǎng)12 h。
以高純質粒小提試劑盒提取質粒;取質粒7.00 μL, EcoRⅠ、XhoⅠ各1.00 μL,10×H Buffer 2.00 μL,ddH2O 9.00 μL,37℃酶切1 h;產物于2%瓊脂糖凝膠電泳。陽性質粒送生工生物工程(上海)股份有限公司測序。
1.3.6 數(shù)據(jù)處理
將所測序列與GenBank登錄序列Blast進行比對,尋找親緣關系最為相近的菌種或序列。用Quantity One4.6.2對DGGE圖譜進行分析。
以341f和907r為引物擴增致乏庫蚊雌成蟲細菌基因組DNA的產物大小(圖1–A)與預計大小一致。以341fGC和518r為引物擴增,獲得細菌16S rDNA V3區(qū)產物的大小約為180 bp(圖1–B),與預計大小相符。
圖1 細菌16S rDNA V3–V5區(qū)(A)和16S rDNA V3 (B)擴增結果 Fig.1 Amplification fragments of the bacteria 16S rDNA V3–V5 region (A) and V3 region (B)
對致乏庫蚊成蚊攜帶菌16S rDNA V3區(qū)片段進行DGGE的結果見圖2–A;以Quantity One繪制DGGE示意圖(圖2–B)。
圖2 細菌16S rDNAV3 區(qū)DGGE 指紋 Fig.2 DGGE profiles of the bacteria 16S rDNA V3 region
由圖2可知,DGGE凝膠中較亮的條帶共6條,表明有6 種優(yōu)勢菌。6個條帶內的DNA 序列與GenBank數(shù)據(jù)比對的結果(表1)為:1種為派畢梯斯沃巴契亞體(Wolbachia pipientis),另外5種分別與假單胞菌屬、埃希氏桿菌屬、沃爾巴克氏體屬和γ–變形綱、α–變形綱未知種的親緣關系極近。
表1 DGGE 條帶序列分析比對結果 Table 1 Analysis and blast result of the DGGE band sequences
本研究結果表明,致乏庫蚊攜帶的優(yōu)勢菌共6種,其中1種為派畢梯斯沃巴契亞體(Wolbachia pipientis),另外5種尚未被鑒定,分別隸屬于假單胞菌屬、埃希氏桿菌屬、沃爾巴克氏體屬和γ–變形綱、α–變形綱某未知種屬。
PCR–DGGE技術[3]已廣泛應用于環(huán)境、食品微生物等諸多領域。2010年,李美等[4]曾利用該技術分析了中華按蚊的中腸菌群結構,并發(fā)現(xiàn)短芽孢桿菌、氣單胞菌、叢毛單胞菌、金黃桿菌以及γ–變形綱的某未知細菌在中華按蚊中腸內存在。本研究結果與前人的研究結果一致。凌天翼[5]從飼養(yǎng)和野生的致乏庫蚊幼蟲體內分離出假單胞菌屬(Pseudomonas sp.)和埃希氏桿菌屬(Escherichia sp.)10株細菌;Demaio等[6]利用定量培養(yǎng)的方法分析不同狀態(tài)、不同階段的尖音庫蚊Culex pipiens)中腸菌群的變化,認為假單胞菌屬和埃希氏桿菌屬在尖音庫蚊中腸內為優(yōu)勢菌群。Pidiyar等[7]結合傳統(tǒng)分離培養(yǎng)與16SrRNA文庫鑒定野生致乏庫蚊中腸細菌,發(fā)現(xiàn)γ–變形綱的細菌占已分離細菌總數(shù)的70%以上。Hertig等[8]以尖音庫蚊卵巢為研究對象,首次發(fā)現(xiàn)Wolbachia pipientis,之后,Wright等[9]證明該菌也存在于伊蚊屬。本研究DGGE 圖譜中代表Wolbachia 的條帶最亮,表明Wolbachia在致乏庫蚊體內數(shù)量較多,為優(yōu)勢細菌。
環(huán)境中存在大量的細菌[10]。為了減少蚊蟲體表的細菌污染,本試驗中使用了大劑量的75%乙醇和無菌水進行洗滌、稀釋,另外DGGE僅能顯示優(yōu)勢菌群的V3區(qū)條帶,故筆者推測本研究中鑒定的6種細菌可能為致乏庫蚊雌成蚊體內的優(yōu)勢菌群。
[1] 陸寶麟,李蓓思,姬淑紅,等.中國動物志,昆蟲綱,第8卷,雙翅目:蚊科(上卷)[M].北京:科學出版社,1997.
[2] 陸寶麟,李蓓思,姬淑紅,等.中國動物志,昆蟲綱,第8卷,雙翅目:蚊科(下卷)[M].北京:科學出版社,1997.
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