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產(chǎn)青蒿二烯的人工酵母細(xì)胞的構(gòu)建及發(fā)酵優(yōu)化

2015-06-19 07:53:12郭睿丁明珠元英進(jìn)
化工學(xué)報(bào) 2015年1期
關(guān)鍵詞:青蒿菌體釀酒

郭睿,丁明珠,元英進(jìn)

(系統(tǒng)生物工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,天津大學(xué)化工學(xué)院制藥工程系,天津化學(xué)化工協(xié)同創(chuàng)新中心,天津300072)

引 言

青蒿素及其衍生物已被世界衛(wèi)生組織認(rèn)定為目前世界上最有效的治療腦型瘧疾和抗氯喹惡性瘧疾藥物。目前主要通過青蒿類植物提取[1]、化學(xué)合成[2]以及利用合成生物學(xué)手段[3]等方式獲得青蒿素。合成生物學(xué)由于快速安全綠色環(huán)保等優(yōu)勢逐漸替代植物提取和化學(xué)全合成[4]。青蒿二烯(amorphadiene)是青蒿素的重要前體,青蒿植物中青蒿二烯的合成分兩個(gè)步驟:(1)乙酰輔酶A經(jīng)MVA途徑生成法尼基焦磷酸[5](FPP);(2)青蒿二烯合成酶(ADS)[6]催化 FPP 經(jīng)環(huán)化反應(yīng)生成青蒿二烯。FPP是倍半萜類化合物的共同前體,主要通過兩條獨(dú)立的生物途徑合成[7]:甲羥戊酸途徑(MVA途徑,存在于真核生物、古生菌和部分原核生物中)和 2-C-甲基-D-赤藻糖醇-4-磷酸途徑 (MEP途徑,存在于細(xì)菌和光合真核生物中)。

目前,利用合成生物學(xué)方法進(jìn)行青蒿二烯合成研究中應(yīng)用最廣泛的底盤細(xì)胞是大腸桿菌和釀酒酵母[7]。大腸桿菌中存在具有較大萜類合成潛力的MEP途徑,適合萜類化合物碳骨架的合成[8]。Keasling課題組在大腸桿菌體內(nèi)重構(gòu)MVA途徑,優(yōu)化后青蒿二烯產(chǎn)量達(dá)到27.4 g·L?1[9-11]。但大腸桿菌缺少糖基化和翻譯后修飾等功能,因此限制了后續(xù)青蒿酸合成基因高效表達(dá)。而釀酒酵母遺傳背景清楚、基因操作簡單、可進(jìn)行大規(guī)模發(fā)酵生產(chǎn),且次級代謝產(chǎn)物簡單[12],因此較多研究者選擇釀酒酵母作為青蒿二烯生物合成的底盤細(xì)胞。Kong等[13]通過在釀酒酵母體內(nèi)過表達(dá)tHMGR和ERG20基因,并表達(dá)突變的ADS基因,使青蒿二烯產(chǎn)量達(dá)到123.2 mg·L?1。Keasling 課題組[14]通過過表達(dá)釀酒酵母MVA路徑基因和ADS基因,抑制鯊烯合酶表達(dá),使青蒿二烯產(chǎn)量高達(dá)40 g·L?1。本課題組之前在該領(lǐng)域的工作主要集中在釀酒酵母底盤細(xì)胞與不同功能模塊之間適配性研究[15-16]。

HMGR催化MVA途徑中第一個(gè)可逆反應(yīng),是MVA途徑上第一個(gè)限速酶[17]。表達(dá)截短的HMGR基因——tHMGR(去除HMGR的調(diào)控區(qū)域)可以增加 HMGR的表達(dá)量[18],從而提高后續(xù)產(chǎn)物的產(chǎn)量[10]。增加ERG20基因的表達(dá)量[19]或減少FPP流向其他支路的流量[20],可以增加FPP的積累量,從而增加青蒿二烯的產(chǎn)量。Pitera等[21]研究發(fā)現(xiàn)增加HMGR和ERG20基因的拷貝數(shù),可以提高青蒿二烯的產(chǎn)量。Delta位點(diǎn)在基因組中拷貝數(shù)大于100,利用 Delta位點(diǎn)進(jìn)行外源基因整合,在沒有選擇壓力的存在下傳代50次整合基因型仍穩(wěn)定存在,引入的外源基因經(jīng)過傳代后仍能多拷貝存在[22-23]。

本研究通過過表達(dá)釀酒酵母tHMGR和ERG20基因、表達(dá)外源青蒿二烯合酶基因ADS實(shí)現(xiàn)釀酒酵母生產(chǎn)青蒿二烯的目的,如圖1所示。之前的大量研究都集中在上調(diào)或基因組單位點(diǎn)整合過表達(dá)內(nèi)源基因,以基因組整合或?qū)胪庠促|(zhì)粒表達(dá)ADS基因,實(shí)現(xiàn)釀酒酵母中合成青蒿二烯的目的。內(nèi)源基因多拷貝過表達(dá),往往要進(jìn)行多次整合,加大了實(shí)驗(yàn)的工作量;若采取多拷貝游離質(zhì)粒方式表達(dá)外源ADS基因,則不能保證人工菌株基因型的穩(wěn)定性。本研究利用本實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建的酵母啟動(dòng)子、終止子載體模塊庫[24],以酵母基因組中多拷貝位點(diǎn)Delta作為整合位點(diǎn),不僅可以單次整合多個(gè)基因,并且整合后的基因都以多拷貝形式存在于基因組,從而實(shí)現(xiàn)酵母內(nèi)源基因tHMGR和ERG20的多拷貝過表達(dá)以及ADS基因的異源多拷貝表達(dá),構(gòu)建可以生產(chǎn)青蒿二烯且基因型較穩(wěn)定的人工釀酒酵母菌株。除了考慮葡萄糖濃度以及氧氣通量等常用參數(shù)外,本研究還將某些必需氨基酸作為提高青蒿二烯產(chǎn)量的關(guān)鍵調(diào)控參數(shù)。

圖1 釀酒酵母體內(nèi)青蒿二烯合成路徑的構(gòu)建Fig.1 Biosynthesis of amorphadiene in engineered S.cerevisiae

1 實(shí)驗(yàn)材料和方法

1.1 工具酶及試劑

大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞DH5α購自Biomed公司,TransStart FastPfu高保真DNA聚合酶購自TransGen公司;T4 DNA連接酶和限制性內(nèi)切酶 PstI和BamHI購自Fermentas公司;限制性內(nèi)切酶NotI-HF和BsaI-HF購自NEB公司;質(zhì)粒小提試劑盒、酵母質(zhì)粒小提試劑盒、普通 DNA產(chǎn)物純化試劑盒、瓊脂糖凝膠 DNA回收試劑盒購自天根公司;朱欒倍半萜標(biāo)準(zhǔn)品(Valencene)購自TCI公司;正十二烷購自天津市康科德試劑化工廠;PEG3350、鮭魚精DNA、各類氨基酸粉末購自鼎國昌盛公司;醋酸鋰購自北方天醫(yī)化學(xué)試劑廠;去氨基酸酵母氮源(YNB)購自GENVIEW公司。

1.2 菌株、質(zhì)粒和培養(yǎng)基

宿主菌E. coliDH5α {endA1; hsdR17; gyrA96;thi-1; relA1; supE44; recA1; ΔlacU169(?80lac ΔZM15)} 和 釀 酒 酵 母 菌 株 W303-1a(MATa{leu2-3,112; trp1-1; can1-100; ura3-1; ade2-1;his3-11,15}),釀酒酵母菌株 BY4741(MATa{his3 Δ1;leu2 Δ0; met15 Δ0; ura3 Δ0} ), 釀 酒 酵 母 菌 株CEN.PK2-1C(MATa {ura3-52; trp1-289; leu2-3_112;his3 Δ1; MAL2-8C; SUC2}), 釀 酒 酵 母 菌 株CEN.PK2-1D (MATα{ura3-52; trp1-289; leu2-3_112;his3 Δ1; MAL2-8C; SUC2})購自 Euroscarf公司,酵母表達(dá)載體 pRS425K為本實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建,詳見表1、表2。

LB 培養(yǎng)基(10 g·L?1氯化鈉;10 g·L?1胰蛋白胨;5 g·L?1酵母提取物;固體培養(yǎng)基添加1.5%瓊脂粉)用于大腸桿菌的培養(yǎng);YPD培養(yǎng)基(20 g·L?1葡萄糖;20 g·L?1胰蛋白胨;10 g·L?1酵母提取物;固體培養(yǎng)基添加 2%瓊脂粉)用于釀酒酵母的培養(yǎng);SC-ura培養(yǎng)基(20 g·L?1葡萄糖;6.7 g·L?1YNB;2 g·L?1drop-out 氨基酸混合物;固體培養(yǎng)基添加2% 瓊脂粉)用于酵母轉(zhuǎn)化子篩選和培養(yǎng)。

1.3 釀酒酵母表達(dá)載體構(gòu)建

表1 實(shí)驗(yàn)中涉及的酵母菌株Table 1 Yeast strains involved in this study

以BY4741基因組DNA為模板,通過特異性引物PCR擴(kuò)增tHMGR和ERG20、終止子片段TTPI1和TENO2,用限制性內(nèi)切酶BsaI對以上片段和本實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建 pRS425K-啟動(dòng)子-終止子模塊[24]LD55和LD19進(jìn)行酶切;純化回收產(chǎn)物經(jīng)T4連接酶連接,得到表達(dá)載體 pRS425K:TCYC1-PTEF1-tHMGR-TTEF1和 pRS425K: TTEF1-PGPM1-ERG20-TTPI1。用 overlap PCR方法得到TTPI1-TENO2片段,以BamHI和PstI對擴(kuò)增片段和載體pRS425K分別進(jìn)行酶切,純化回收片段以 T4連接酶連接,得到質(zhì)粒 pRS425K:TTPI1-TENO2。

外源基因ADS參考GeneBank ID.AF-138959報(bào)道的序列經(jīng)密碼子優(yōu)化,利用Genewiz公司合成的60bp Oligos,用overlap PCR方法合成。利用BsaI限制性內(nèi)切酶對ADS基因和相應(yīng)的啟動(dòng)子終止子元件LD01D進(jìn)行酶切,純化回收產(chǎn)物,經(jīng)T4連接酶連接得到 pRS425K:TENO2-PPDC1-ADS-TGPM1-Delta2表達(dá)載體。

表2 實(shí)驗(yàn)中涉及的質(zhì)粒Table 2 Plasmids involved in this study

1.4 表達(dá)模塊整合基因組和轉(zhuǎn)化子篩選

以上4個(gè)表達(dá)載體測序正確后,用 BamHI和PstI酶切,即可得到片段TCYC1-PTEF1-tHMGR-TTEF1、TTEF1-PGPM1-ERG20-TTPI1、TTPI1-TENO2和 TENO2-PPDC1-ADS-TGPM1-Delta2四個(gè)片段,用NotI限制性內(nèi)切酶對 LDL06[24](pRS425K: Delta1-URA3-TCYC1)進(jìn)行酶切,得到Delta-URA3-CYC1t片段。

采用醋酸鋰轉(zhuǎn)化法用上述 5個(gè)片段分別以W303-1a、BY4741、CEN.PK2-1C、CEN.PK2-1D為宿主菌株進(jìn)行酵母轉(zhuǎn)化,用SC-ura培養(yǎng)基篩選,30℃恒溫倒置培養(yǎng)2~3 d,至長出重組克隆,分別挑取8個(gè)單菌落在SC-ura固體培養(yǎng)基上劃線分純,30℃恒溫倒置培養(yǎng)至長出單菌落,挑取單菌落到SC-ura液體培養(yǎng)基,30℃、200 r·min?1培養(yǎng)至OD600約為 4,取菌液 12000 r·min?1離心 2 min,棄上清收集菌體提取基因組,基因組PCR驗(yàn)證過表達(dá)模塊和異源表達(dá)模塊,出現(xiàn)正確大小的目標(biāo)條帶,則證明篩選到了正確的陽性克隆,得到人工酵母菌株 SyBE_Sc00011103、SyBE_Sc00011106、SyBE_Sc00011101、SyBE_Sc00011107。

人工酵母菌株功能模塊構(gòu)建流程如圖2所示。分別構(gòu)建tHMGR, ERG20, ADS基因的表達(dá)盒質(zhì)粒,酶切得到 DNA片段,醋酸鋰法酵母轉(zhuǎn)化,將各個(gè)片段整合到酵母染色體上,經(jīng)過PCR驗(yàn)證篩選正確克隆。

1.5 人工酵母菌株發(fā)酵

1.5.1 搖瓶發(fā)酵 將正確陽性克隆接種到 5 ml SC-ura液體培養(yǎng)基中,30℃、200 r·min?1培養(yǎng)至OD600值約為5.0,以初始OD600值0.1轉(zhuǎn)接至SC-ura液體培養(yǎng)基,30℃、200 r·min?1培養(yǎng)12 h,按初始OD600值0.05轉(zhuǎn)接到50 ml液體培養(yǎng)基中,30℃、200 r·min?1培養(yǎng),10 h后在發(fā)酵液中加入2.5 ml正十二烷進(jìn)行兩相培養(yǎng),以此條件繼續(xù)培養(yǎng)至72 h。1.5.2 發(fā)酵罐發(fā)酵 將正確陽性克隆接種到 5 ml SC-ura液體培養(yǎng)基中,30℃、200 r·min?1培養(yǎng)至OD600值約為5.0,以初始OD600值0.1轉(zhuǎn)接至SC-ura液體培養(yǎng)基中,30℃、200 r·min?1培養(yǎng)12 h,初始OD600值為0.05,初始培養(yǎng)基體積2 L,溫度30℃,pH為5.8,發(fā)酵培養(yǎng)10 h,加入400 ml正十二烷兩相培養(yǎng)。當(dāng)發(fā)酵液中葡萄糖濃度接近2 g·L?1時(shí),批式補(bǔ)料方式補(bǔ)給葡萄糖母液,使培養(yǎng)基中葡萄糖濃度到初始值。在OD600值進(jìn)入平臺期后,按初始濃度補(bǔ)加氨基酸和YNB母液1~2次,至菌體密度保持24 h不再增加為止。

1.6 青蒿二烯的提取與檢測

圖2 基因整合步驟示意圖Fig.2 Schematic of integrating genes into chrosome

發(fā)酵結(jié)束后,取發(fā)酵液 5000 r·min?1離心 10 min,吸取十二烷相,無水硫酸鈉干燥,用0.22 μm有機(jī)相濾膜過濾,用正己烷稀釋,用 GC-TOF/MS檢測產(chǎn)物。色譜條件:DB-5MS毛細(xì)管色譜柱(30 m×0.25 mm×0.25 μm);升溫程序:初始溫度100℃,保持 2 min,以8℃·min?1升溫至 160℃;以25℃·min?1升溫至250℃,保持5 min;進(jìn)樣口溫度250℃,分流進(jìn)樣(分流比1:50),進(jìn)樣體積1 μl。質(zhì)譜條件:EI+源;電子能量70 eV;離子源溫度250℃;溶劑延遲時(shí)間 5 min;質(zhì)量掃描方式為選擇全離子掃描;定性離子為m/z204(青蒿二烯分子C15H24)和189([M-CH3]+)。

定量方法:使用相同色譜條件測定青蒿二烯的同分異構(gòu)體朱欒倍半萜的標(biāo)準(zhǔn)溶液(5~150 mg·L?1),繪制濃度-峰面積標(biāo)準(zhǔn)曲線,對青蒿二烯進(jìn)行定量。

2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與結(jié)論

2.1 釀酒酵母底盤的構(gòu)建

將 TCYC1-PTEF1-tHMGR-TTEF1、TTEF1-PGPM1-ERG20-TTPI1、TENO2-PPDC1-ADS-TGPM1-Delta2、Delta-URA3-TCYC1以及TTPI1-TENO2等片段同時(shí)進(jìn)行酵母轉(zhuǎn)化,便可以多拷貝位點(diǎn)Delta為整合位點(diǎn)將tHMGR、ERG20、ADS基因依次整合到 CEN.PK2-1C、W303-1a、BY4741和CEN.PK2-1D基因組。經(jīng)基因組 PCR驗(yàn)證正確的重組轉(zhuǎn)化子,分別命名為:SyBE_Sc00011101、SyBE_Sc00011103、SyBE_Sc00011106、SyBE_Sc00011107。

釀酒酵母MVA途徑以乙酰輔酶A為底物,提供倍半萜類化合物合成前體FPP,因此增加FPP的積累量可以增加釀酒酵母生產(chǎn)倍半萜類化合物如青蒿二烯的能力。過表達(dá)tHMGR基因和ERG20基因可以增加FPP的積累量。關(guān)鍵酶基因的拷貝數(shù)影響青蒿二烯產(chǎn)量[21],但是表達(dá)多拷貝質(zhì)粒的人工菌株往往基因型不夠穩(wěn)定[25],而單拷貝整合過表達(dá)目標(biāo)基因?qū)Ξa(chǎn)物產(chǎn)量的提升不顯著。本研究選用多拷貝序列 Delta作為整合位點(diǎn)[22-23],實(shí)現(xiàn)了關(guān)鍵酶基因的多拷貝表達(dá),并且以基因組形式穩(wěn)定存在。

2.2 人工釀酒酵母細(xì)胞底盤的優(yōu)選

進(jìn)行人工酵母菌株 50 ml搖瓶發(fā)酵。用GC-TOF/MS檢測產(chǎn)物,在保留時(shí)間為10.34 min時(shí)檢測到青蒿二烯的特征質(zhì)譜峰m/z=204和m/z=189。根據(jù)相同測定條件下得到的朱欒倍半萜濃度-峰面積標(biāo)準(zhǔn)曲線,對人工酵母細(xì)胞發(fā)酵液中青蒿二烯濃度進(jìn)行定量。

實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,表達(dá)功能模塊的底盤細(xì)胞的生長狀況以及底盤細(xì)胞與功能模塊之間適配性的差異,導(dǎo)致人工細(xì)胞的生長情況和目標(biāo)產(chǎn)物積累狀況的差異[16]。結(jié)果表明,底盤細(xì)胞 CEN.PK2由于其較好的生理學(xué)特征和生孢能力[25-26],從菌體生長狀況和青蒿二烯濃度(表 3)上都顯示出明顯優(yōu)勢。因此,選擇人工酵母菌株SyBE_Sc00011101進(jìn)行后續(xù)研究。

表3 不同底盤的人工菌株青蒿二烯產(chǎn)量Table 3 Production of amorphadiene in artificial strains with different chassis

2.3 發(fā)酵優(yōu)化提高產(chǎn)量

圖3 不同葡萄糖濃度下YPD和SC-ura培養(yǎng)基中青蒿二烯產(chǎn)量Fig.3 Production of amorphadiene in YPD and SC-ura with different glucose concentration

選擇產(chǎn)量較高的菌株 SyBE_Sc00011101進(jìn)行搖瓶發(fā)酵優(yōu)化,以期獲得更高的產(chǎn)量。

2.3.1 搖瓶發(fā)酵培養(yǎng)基成分對發(fā)酵過程中青蒿二烯積累的影響 培養(yǎng)條件對人工釀酒酵母的生長狀況和青蒿二烯產(chǎn)量影響較大。以不同培養(yǎng)基用SyBE_Sc00011101進(jìn)行50 ml搖瓶發(fā)酵實(shí)驗(yàn)。實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),菌體在SC-ura培養(yǎng)基中生長速度不及YPD培養(yǎng)基中,但圖3青蒿二烯產(chǎn)量的比較顯示,菌體在SC-ura培養(yǎng)基中青蒿二烯產(chǎn)量高于YPD培養(yǎng)基中。Albers等[27]發(fā)現(xiàn)無氧發(fā)酵條件下氮源對釀酒酵母生長速率和產(chǎn)乙醇能力影響較大,因此氮源種類可能是菌體在兩種培養(yǎng)基中的生長能力和青蒿二烯生產(chǎn)能力差別的重要因素。培養(yǎng)基中葡萄糖濃度對青蒿二烯產(chǎn)量影響明顯。葡萄糖濃度為40 g·L?1的 SC-ura培養(yǎng)基中青蒿二烯濃度最高為 225.3 mg·L?1。

2.3.2 發(fā)酵罐分批次補(bǔ)料發(fā)酵 選擇 SyBE_Sc00011101以葡萄糖濃度為20 g·L?1的SC-ura培養(yǎng)基進(jìn)行5 L發(fā)酵罐實(shí)驗(yàn),初始培養(yǎng)基體積2 L,溫度30℃,pH恒定為5.8,在發(fā)酵培養(yǎng)10 h時(shí),加入400 ml正十二烷兩相培養(yǎng)。

為研究發(fā)酵罐中溶氧對發(fā)酵過程和產(chǎn)物積累的影響,設(shè)定轉(zhuǎn)速和空氣流量分別為250 r·min?1、2 L·min?1和 500 r·min?1、4 L·min?1,以 SC-ura(葡萄糖 20 g·L?1)培養(yǎng)基對 SyBE_Sc00011101菌株進(jìn)行發(fā)酵培養(yǎng),發(fā)酵過程中以分批補(bǔ)料方式補(bǔ)給葡萄糖,在不限制生長潛力的前提下,保證菌體有氧呼吸代謝[28]。生長進(jìn)入平臺期后,補(bǔ)加氨基酸和YNB至初始濃度。結(jié)果(圖4)表明,在轉(zhuǎn)速較快、空氣流量較大時(shí),OD600值明顯較高;發(fā)酵培養(yǎng)至155 h時(shí),轉(zhuǎn)速為250 r·min?1、空氣流量為2 L·min?1的發(fā)酵罐中青蒿二烯濃度為 335.51 mg·L?1;而轉(zhuǎn)速為 500 r·min?1、空氣流量為 4 L·min?1的發(fā)酵罐中青蒿二烯濃度為562.81 mg·L?1,是前者的1.68倍。

圖4 發(fā)酵罐轉(zhuǎn)速和空氣通量的優(yōu)化Fig.4 Optimization of rotation speed and air flux

這可能是由于隨著溶氧量的增大,人工酵母細(xì)胞的呼吸代謝加強(qiáng),葡萄糖生成丙酮酸的過程加快,同時(shí)削弱了無氧條件下丙酮酸生成乙醇和乙酸的過程,而生成更多乙酰輔酶A,經(jīng)MVA途徑為青蒿二烯合成提供更充足的FPP。通過增加底物濃度加快反應(yīng)速率,從動(dòng)力學(xué)上加快青蒿二烯積累;根據(jù)巴斯德效應(yīng),酵母在氧氣充足時(shí)消耗更少的葡萄糖,產(chǎn)生更多的能量,在熱力學(xué)上促進(jìn)了青蒿二烯的積累。

由于底盤細(xì)胞 CEN.PK2-1C部分氨基酸基因缺陷,經(jīng)外源基因整合后仍不能合成部分必需氨基酸,如亮氨酸(Leu)、組氨酸(His)和色氨酸(Trp),需要在培養(yǎng)基中添加這些氨基酸。Watson[29]研究發(fā)現(xiàn)不同氮源和氨基酸比例影響酵母生長。培養(yǎng)基中這3種氨基酸的濃度是否會(huì)影響產(chǎn)量,仍需要進(jìn)一步探索。選取 Leu、His、Trp初始濃度分別為 0.1 g·L?1、0.02 g·L?1、0.02 g·L?1和 1 g·L?1、0.2 g·L?1、0.2 g·L?1的 SC-ura 培養(yǎng)基(分別記為 SC-ura和 SC-ura+10aa),設(shè)定發(fā)酵條件為:初始OD600為0.05,培養(yǎng)基體積2 L,pH為5.8,轉(zhuǎn)速 500 r·min?1,空氣流量 4 L·min?1,10 h 后加入400 ml正十二烷兩相培養(yǎng)。當(dāng)葡萄糖濃度接近2 g·L?1時(shí),補(bǔ)加葡萄糖母液使其濃度達(dá)到約20 g·L?1,菌體進(jìn)入生長平臺期時(shí)按初始濃度補(bǔ)加YNB和氨基酸。

實(shí)驗(yàn)結(jié)果(圖5)表明:(1)發(fā)酵培養(yǎng)155 h時(shí) SC-ura+10aa培養(yǎng)基中青蒿二烯濃度為 1.05 g·L?1;SC-ura培養(yǎng)基中青蒿二烯濃度為 562.81 mg·L?1,說明該人工酵母菌株生產(chǎn)青蒿二烯的過程受到氨基酸濃度的影響。(2)發(fā)酵培養(yǎng)35 h后,SC-ura培養(yǎng)基中人工菌株生長進(jìn)入平臺期,在40 h補(bǔ)加 YNB和氨基酸母液至初始濃度,隨后菌體二次生長,說明氮源以及氨基酸濃度會(huì)限制該菌株的生長。但若菌株生長速度過快,而空氣通量保持不變,則單位OD600菌體溶氧量降低,一定程度上加快了單位菌體消耗葡萄糖的速率,而氮源的不充足使得人工菌株相關(guān)代謝失衡,所以SC-ura培養(yǎng)基中雖然有較高的菌體終密度,但青蒿二烯終濃度卻遠(yuǎn)低于SC-ura+10aa培養(yǎng)基中。

本文通過多拷貝位點(diǎn)整合過表達(dá)MVA途徑關(guān)鍵基因HMGR以及FPP合成酶基因ERG20,增加MVA路徑通量以及FPP的積累量;同時(shí)表達(dá)青蒿二烯合成酶ADS,雖然經(jīng)過發(fā)酵優(yōu)化,在5 L發(fā)酵罐中青蒿二烯的產(chǎn)量達(dá)到1.05 g·L?1,但仍與國內(nèi)外該領(lǐng)域相關(guān)研究存在差距。因此除了HMGR和ERG20之外,F(xiàn)PP向萜類物質(zhì)的通量應(yīng)該還受到其他因素的抑制,比如代謝流的平衡以及支路分流的作用。因此,在后續(xù)的研究中,將會(huì)繼續(xù)對相關(guān)代謝路徑上物料的均衡分配進(jìn)行相關(guān)研究以達(dá)到提高青蒿二烯產(chǎn)量的目的。

圖5 氨基酸濃度和補(bǔ)料發(fā)酵過程的優(yōu)化Fig.5 Optimization of amino acid concentration and fed-batch process

3 結(jié) 論

(1)為了增加基因拷貝數(shù),同時(shí)克服多拷貝質(zhì)粒容易丟失的問題,選用基因組上多拷貝位點(diǎn)Delta作為整合位點(diǎn),可以增加人工釀酒酵母細(xì)胞經(jīng)過MVA途徑合成FPP的能力,從而提高青蒿二烯的產(chǎn)量。

(2)發(fā)酵過程中,培養(yǎng)基不同會(huì)影響菌體濃度和青蒿二烯產(chǎn)量。本研究中SC-ura培養(yǎng)基中青蒿二烯的產(chǎn)量高于 YPD培養(yǎng)基;并且菌體的生長和生產(chǎn)之間存在平衡關(guān)系,菌體的生長速率和青蒿二烯的生產(chǎn)速率并不呈正相關(guān)。

(3)培養(yǎng)基中葡萄糖濃度影響菌體生長,并且這種影響會(huì)反映到青蒿二烯的積累過程上。同時(shí)菌體生長依賴于部分必需氨基酸,由于氨基酸是組成蛋白的基本單位,因此對菌體生長以及青蒿二烯的生產(chǎn)影響顯著。本研究中發(fā)酵罐培養(yǎng)時(shí),選用高濃度氨基酸發(fā)酵,可以改善菌體生長狀況,從而提高發(fā)酵液中青蒿二烯的濃度。

(4)發(fā)酵罐培養(yǎng)時(shí),選擇較大轉(zhuǎn)速和較高空氣通量,能改善菌體生長狀況,增強(qiáng)其生產(chǎn)青蒿二烯的能力。

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