韓瑩倩,孔江南,王 江,張 超,楊國宇
(河南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)部動物生化與營養(yǎng)重點開放實驗室,鄭州 450002)
霍亂弧菌DncV蛋白的原核表達及活性分析
韓瑩倩,孔江南,王 江,張 超,楊國宇*
(河南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)部動物生化與營養(yǎng)重點開放實驗室,鄭州 450002)
DncV(VC0179)是在霍亂弧菌中發(fā)現(xiàn)的一種雙核苷酸環(huán)化酶,其可以合成c-di-AMP、c-di-GMP和c-GAMP。研究發(fā)現(xiàn)c-di-GMP作為胞內(nèi)的第二信使,通過STING信號通路激活先天性免疫應(yīng)答。為了體外制備c-di-GMP用于深入研究其功能,構(gòu)建了VC0179融合cherry標簽的丙酸誘導(dǎo)型表達載體,并將該重組表達載體轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3)中。利用丙酸鈉誘導(dǎo)表達后,觀察菌體顏色是否為紅色判斷融合蛋白質(zhì)的表達。超聲破碎細菌后經(jīng)SDS-PAGE電泳檢測融合蛋白質(zhì)的可溶性表達。最后通過Ni-NTA Agarose親和純化重組蛋白質(zhì),獲得的重組蛋白質(zhì)進行體外酶促反應(yīng),高效液相色譜檢測合成產(chǎn)物c-di-GMP。結(jié)果表明:成功構(gòu)建VC0179丙酸誘導(dǎo)型原核表達載體并獲得了高純度的VC0179重組蛋白質(zhì)。該重組蛋白質(zhì)通過體外酶促反應(yīng)可一步生成c-di-GMP。本試驗建立了穩(wěn)定獲得具有酶活性的VC0179重組蛋白質(zhì)的方法;c-di-GMP的體外合成為其后續(xù)功能研究及大量制備奠定基礎(chǔ)。
VC0179;c-di-GMP;原核表達;酶促合成法;高效液相色譜
DncV(VC0179)是在霍亂弧菌中發(fā)現(xiàn)的一種催化合成c-di-AMP、c-di-GMP、c-GAMP雙核苷酸環(huán)化酶[1]。其合成產(chǎn)物c-di-AMP與c-di-GMP作為胞內(nèi)的第二信使可調(diào)節(jié)細菌體內(nèi)的多種應(yīng)答[2]。19世紀90年代,人們首次發(fā)現(xiàn)c-di-GMP對醋酸纖維桿菌的生物膜形成具有重要的調(diào)節(jié)作用,是一種新型纖維素合成酶變構(gòu)調(diào)節(jié)因子[3-4]。此外,c-di-GMP在細胞周期、生長發(fā)育、菌毛生成、Ⅲ型分泌系統(tǒng)、RNA調(diào)節(jié)、壓力應(yīng)激、細菌捕食、毒力等多方面發(fā)揮調(diào)控作用[2,5-6]。在哺乳動物細胞的研究中發(fā)現(xiàn),c-di-GMP、c-GAMP作為胞內(nèi)的第二信使,可直接與STING相互作用激活干擾素效應(yīng)模式識別系統(tǒng),誘導(dǎo)Ⅰ型干擾素的表達[7-9]。鑒于VC0179合成產(chǎn)物在生物體中的重要功能,本試驗構(gòu)建了VC0179丙酸誘導(dǎo)型原核表達載體,并對其進行表達分析與純化,獲得高純度的VC0179靶蛋白。體外一步法合成c-di-GMP為進一步功能研究及免疫增強劑c-di-GMP產(chǎn)品的制備奠定基礎(chǔ)。
1.1 主要試劑材料
質(zhì)粒小量快速提取試劑盒、膠回收試劑盒及PCR純化試劑盒均購自生工生物工程(上海)有限公司;Ni-NTA Agarose購自Qiagen公司;T4連接酶、限制性內(nèi)切酶BamHⅠ和XhoⅠ均購自英國NEB公司;BCA蛋白濃度測定試劑盒購自碧云天生物技術(shù)研究所;GTP標準品購于Aladdin公司;c-di-GMP標準品購于Invivogen公司;4-羥乙基哌嗪乙磺酸(HEPES)、乙酸銨和MgCl2購于Sigma公司;色譜甲醇購于Fisher公司;E.coilDH5α、E.coilBL21(DE3)感受態(tài)細胞和TEV酶均為本室保存;含全長VC0179重組質(zhì)粒pMD19-VC0179及含His和cherry標簽的丙酸誘導(dǎo)型載體由本室構(gòu)建保存。
1.2 表達載體的構(gòu)建及鑒定
用BamHⅠ和XhoⅠ雙酶切pMD19-VC0179,獲得VC0179目的片段的全長。用T4連接酶將其與同樣酶切處理的丙酸誘導(dǎo)型載體連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化E.coilDH5α。轉(zhuǎn)化菌液涂布于含氨芐青霉素(100 mg·mL-1) LB平板,37 ℃倒置培養(yǎng)過夜。挑選陽性克隆,用BamHⅠ和XhoⅠ酶切驗證后,送往生工生物工程(上海)有限公司測序鑒定。
1.3 重組蛋白質(zhì)的誘導(dǎo)表達及可溶性鑒定
將測序正確的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至E.coilBL21(DE3)。在含Amp的LB平板上挑取含重組質(zhì)粒的單個菌落,接種于含100 mg·mL-1Amp的2 mL LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃培養(yǎng)過夜。將得到的菌液按體積比1∶100接種于含100 mg·mL-1Amp的100 mL LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃、220 r·min-1振蕩培養(yǎng)至OD600 nm達0.6,將菌液分兩等份,一瓶加入20 mmol·L-1的丙酸鈉,室溫過夜誘導(dǎo)表達,另外一瓶作為空白對照不加誘導(dǎo)劑室溫過夜搖菌。次日各吸取1 mL,離心去上清,加PBS重懸,加入等體積2×SDS-PAGE上樣緩沖液混勻,沸水煮10 min。剩余的菌液離心收集沉淀,10 mL PBS重懸菌體,加溶菌酶(1 mol·L-1)冰浴30 min后,低溫超聲波破碎菌體(超聲時間4 s,間歇7 s,100次)。分別收集上清和沉淀進行SDS-PAGE分析。
1.4 重組蛋白質(zhì)的純化與酶切
將誘導(dǎo)成功的陽性重組菌液接種于2 mL LB(含Amp)培養(yǎng)液中,37 ℃、220 r·min-1振蕩培養(yǎng)過夜。次日取1 mL菌液接種于100 mL LB(含Amp)培養(yǎng)基中,37 °C振蕩培養(yǎng)至OD600 nm為0.6,加入終濃度為20 mmol·L-1的丙酸鈉,室溫、180 r·min-1誘導(dǎo)過夜。離心收集菌體細胞,加10 mL Lysis buffer重懸,加溶菌酶(1 mg·mL-1)混勻后冰浴30 min,低溫超聲破碎。破碎后低溫離心30 min,取40 μL上清制備SDS-PAGE分析樣品。剩余的上清液加到預(yù)前處理好的Ni-NTA,4 °C 200 r·min-1結(jié)合60 min,將上清-Ni-NTA混合物分為2份,一份用5倍體積的Wash buffer洗3次,最后用0.5 mL Elution buffer洗脫靶蛋白4次,收集4次的洗脫液。另外一份直接加入2 mL Wash buffer(含TEV酶) 4 °C振蕩酶切過夜,次日低速離心取上清。分別吸取40 μL的洗脫液及TEV酶切后的上清液,加入等體積2×SDS-PAGE上樣緩沖液混勻,沸水煮10 min,-20 °C保存。
1.5 c-di-GMP的合成及鑒定
1.5.1 標準品及底物溶液的配制 精確稱取一定量c-di-GMP及GTP,用水溶解配成質(zhì)量濃度為20 μg·mL-1的標準品溶液及100 mmol·L-1的底物溶液。
1.5.2 c-di-GMP的合成 純化的VC0179重組蛋白通過BCA蛋白濃度測定后,取1.2 μmol·L-1VC0179與2 mmol·L-1的GTP在含5 mmol·L-1MgCl2和20 mmol·L-1HEPES的緩沖液中37 ℃反應(yīng)2 h。
1.5.3 液相色譜條件 Venusil XBP C18(L)色譜柱(5 μmol·L-1,250×4.6 mm,Agela);檢測波長:254 nm;流速:1.0 mL·min-1;進樣量:5 μL;柱溫:25 ℃。流動相:乙酸銨(A)-甲醇(B),采用線性梯度洗脫:流動相在45 min之內(nèi)從95% A+5% B逐漸降至50% A + 50% B。
2.1 重組表達載體的構(gòu)建及鑒定
酶切獲取VC0179和丙酸誘導(dǎo)型載體的線性片段(圖1 A),連接轉(zhuǎn)化后挑取陽性菌落雙酶切鑒定,結(jié)果與預(yù)期相符(圖1 B)。陽性克隆測序結(jié)果顯示重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。
2.2 重組蛋白質(zhì)的誘導(dǎo)表達及可溶性鑒定
重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至E.coilBL21(DE3),20 mmol·L-1丙酸鈉室溫誘導(dǎo)過夜。取2 mL菌液離心后觀察菌體為紅色。超聲破碎誘導(dǎo)后菌體分別收集上清和沉淀,SDS-PAGE結(jié)果顯示誘導(dǎo)后的全菌和上清樣品在72 ku處均有一明顯的條帶(圖2)。結(jié)果表明,成功誘導(dǎo)表達重組蛋白且為可溶性表達。
M.5 000 bp DNA相對分子質(zhì)量標準;1.pMD-19-VC0179酶切后的片段(目的片段為小片段);2.pMD-19-VC0179原質(zhì)粒;3.丙酸誘導(dǎo)型載體酶切后的片段(目的片段為大片段);4.丙酸誘導(dǎo)型載體原質(zhì)粒;5~8.重組質(zhì)粒M.DL5000 DNA marker;1.Product of pMD-19-VC0179 digested by BamHⅠ and XhoⅠ(The target fragment is the shorter one);2.Plasmid of pMD-19-VC0179;3.Product of propionate-inducible vector digested by BamHⅠ and XhoⅠ (The target fragment is the larger one);4.Plasmid of propionate-inducible vector;5-8.Recombinant plasmids圖1 酶切獲取VC0179與丙酸誘導(dǎo)型載體線性片段及重組質(zhì)粒BamHⅠ和XhoⅠ酶切鑒定Fig.1 Target fragment of VC0179 and propionate-inducible vector by restriction enzyme and identification of recombinant plasmid digested by BamHⅠ and XhoⅠ
M.蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量標準;1.未誘導(dǎo)的重組質(zhì)粒BL21(DE3) 菌總蛋白質(zhì);2.誘導(dǎo)后的重組質(zhì)粒BL21(DE3) 菌總蛋白質(zhì);3.誘導(dǎo)后的重組質(zhì)粒BL21(DE3) 菌超聲破碎的上清液;4.誘導(dǎo)后的重組質(zhì)粒BL21(DE3) 菌超聲破碎的沉淀;5.未誘導(dǎo)的重組質(zhì)粒BL21(DE3) 菌超聲破碎的上清液;6.未誘導(dǎo)的重組質(zhì)粒BL21(DE3) 菌超聲破碎的沉淀M.Protein molecular weight marker;1.Total protein of uninduced BL21(DE3) with recombinant plasmid;2.Total protein of induced BL21(DE3) with recombinant plasmid by propionate;3.Supernatant after ultrasonic of induced BL21(DE3) with recombinant plasmid by propionate;4.Inclusion after ultrasonic of induced BL21(DE3) with recombinant plasmid by propionate;5.Supernatant after ultrasonic of uninduced BL21(DE3) with recombinant plasmid;6.Inclusion after ultrasonic of uninduced BL21(DE3) with recombinant plasmid圖2 VC0179重組蛋白在大腸桿菌BL21(DE3)中表達的SDS-PAGE分析Fig.2 SDS-PAGE analysis of the recombinant VC0179 expression in E.coli BL21(DE3)
2.3 重組蛋白質(zhì)的純化與酶切
取處理好的各個樣品10 μL,經(jīng)12% SDS-PAGE電泳(圖3)??捡R斯亮藍染色結(jié)果顯示,純化后獲得較高純度的重組蛋白質(zhì),TEV酶成功切除重組蛋白質(zhì)中的融合標簽,獲得VC0179靶蛋白。
2.4 c-di-GMP的合成及鑒定
高效液相色譜生成報告顯示(圖4):VC0179重組蛋白體外酶促反應(yīng)生成產(chǎn)物的出峰時間與c-di-GMP標準品出峰時間一致。結(jié)果表明本試驗所獲得的重組蛋白質(zhì)具有功能活性,可在體外一步法生成c-di-GMP。
VC0179是人們發(fā)現(xiàn)的首個可以在革蘭陰性菌中合成c-di-AMP、c-di-GMP、c-GAMP的一種新型的雙核苷酸環(huán)化酶[1]。VC0179作為環(huán)化酶可有效促進霍亂弧菌的腸道定殖,同時還可調(diào)節(jié)趨化性的細菌定殖[1]。隨后的研究發(fā)現(xiàn),真核細胞在轉(zhuǎn)染dsDNA或DNA病毒侵染后也可生成c-GAMP,c-GAMP與STING結(jié)合后活化TBK1-IRF3信號通路介導(dǎo)Ⅰ型干擾素應(yīng)答[10]。c-di-GMP也可通過該信號通路誘導(dǎo)Ⅰ型干擾素表達[11]。研究證實c-di-GMP可作為一種疫苗佐劑促進黏膜途徑的免疫[12-13]。鑒于VC0179的合成產(chǎn)物在先天性免疫中的重要功能,本試驗構(gòu)建了VC0179原核表達載體對其進行表達及純化,旨于建立一種穩(wěn)定獲得可溶性表達的有活性的VC0179重組蛋白的方法,進而用于體外酶促反應(yīng)研究。
M.蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量標準;1.誘導(dǎo)前重組質(zhì)粒BL21(DE3) 菌總蛋白質(zhì);2.誘導(dǎo)后重組質(zhì)粒BL21(DE3) 菌總蛋白質(zhì);3.誘導(dǎo)后重組質(zhì)粒BL21(DE3) 菌超聲破碎的上清液;4.純化的重組蛋白質(zhì);5.TEV酶切后的VC0179蛋白M.Protein molecular weight marker;1.Total protein of BL21(DE3) with recombinant plasmid before induction;2.Total protein of induced BL21(DE3) with recombinant plasmid by propionate;3.Supernatant after ultrasonic of induced BL21(DE3) with recombinant VC0179 plasmid by propionate;4.Puried recombinant protein;5.VC0179 protein after TEV cleavage圖3 純化及TEV酶切后VC0179重組蛋白的SDS-PAGE分析Fig.3 SDS-PAGE analysis of purification and TEV cleavage of VC0179 recombinant protein
本試驗構(gòu)建的VC0179原核表達載體可使重組蛋白在E.coil中大量廉價表達,便于分離純化,避免了對包涵體變性復(fù)性處理,為純化保持VC0179活性提供保證。本試驗雖然成功獲得c-di-GMP,但最佳的合成條件還需進一步摸索以提高GTP的利用率及產(chǎn)量。B.W.Davies等[1]曾用RPHPLC、LCMS、MS/MS、變性凝膠電泳等多種方法檢測VC0179的體外合成產(chǎn)物c-di-AMP、c-di-GMP及c-GAMP。本試驗僅用高效液相色譜法檢測VC0179體外合成產(chǎn)物,更加簡便低成本的檢測手段還有待進一步研究。
圖4 高效液相色譜Fig.4 Chromatograms of high performance liquid chromatography
成功構(gòu)建VC0179丙酸誘導(dǎo)型原核表達載體,并建立獲得有活性VC0179重組蛋白的方法。c-di-GMP的體外合成為后續(xù)c-di-GMP功能研究奠定基礎(chǔ)。
[1] DAVIES B W,BOGARD R W,YOUNG T S,et al.Coordinated regulation of accessory genetic elements produces cyclic di-nucleotides for V.cholerae virulence[J].Cell,2012,149(2):358-370.
[2] TAMAYO R,PRATT J T,CAMILLI A.Roles of cyclic diguanylate in the regulation of bacterial pathogenesis[J].AnnuRevMicrobiol,2007,61:131-148.
[3] ALONI Y,COHEN R,BENZIMAN M,et al.Solubilization of the UDP-glucose:1,4- beta-D-glucan 4-beta-D-glucosyltransferase(cellulose synthase) from Acetobacter xylinum.A comparison of regulatory properties with those of the membrane-bound form of the enzyme[J].JBiolChem,1983,258(7):4419-4423.
[4] ALONI Y,DELMER D P,BENZIMAN M.Achievement of high rates ofinvitrosynthesis of 1,4-beta-D-glucan:activation by cooperative interaction of the Acetobacter xylinum enzyme system with GTP,polyethylene glycol,and a protein factor[J].ProcNatlAcadSciUSA,1982,79(21):6448-6452.
[5] JENAL U,MALONE J.Mechanisms of cyclic-di-GMP signaling in bacteria[J].AnnuRevGenet,2006,40:385-407.
[6] HENGGE R.Principles of c-di-GMP signalling in bacteria[J].NatRevMicrobiol,2009,7(4):263-273.
[7] SUN L,WU J,DU F,et al.Cyclic GMP-AMP synthase is a cytosolic DNA sensor that activates the type I interferon pathway[J].Science,2013,339(6121):786-791.
[8] BURDETTE D L,MONROE K M,SOTELO-TROHA K,et al.STING is a direct innate immune sensor of cyclic di-GMP[J].Nature,2011,478(7370):515-518.
[9] WU J,SUN L,CHEN X,et al.Cyclic GMP-AMP is an endogenous second messenger in innate immune signaling by cytosolic DNA[J].Science,2013,339(6121):826-830.
[10] ISHII K J,CHOON K T.Biological DNA sensor:The Impact of Nucleic Acids on Diseases and Vaccinology[C].Waltham:Elsevier,2014:33.
[11] PARVATIYAR K,ZHANG Z,TELES R M,et al.The helicase DDX41 recognizes the bacterial secondary messengers cyclic di-GMP and cyclic di-AMP to activate a type I interferon immune response[J].NatImmunol,2012,13(12):1155-1161.
[12] CHEN W,KUOLEE R,YAN H.The potential of 3′,5′-cyclic diguanylic acid(c-di-GMP) as an effective vaccine adjuvant[J].Vaccine,2010,28(18):3080-3085.
[13] PEDERSEN G K,EBENSEN T,GJERAKER I H,et al.Evaluation of the sublingual route for administration of influenza H5N1 virosomes in combination with the bacterial second messenger c-di-GMP[J].PLoSOne,2011,6(11):e26973.
(編輯 白永平)
Prokaryotic Expression and Activity Analysis of DncV fromVibrioCholera
HAN Ying-qian,KONG Jiang-nan,WANG Jiang,ZHANG Chao,YANG Guo-yu*
(KeyLaboratoryofAnimalBiochemistryandNutrition,MinistryofAgriculture,HenanAgriculturalUniversity,Zhengzhou450002,China)
DncV(VC0179) is the member of a new family of di-nucleotide cyclases inVibriocholeraand it can catalyzes the synthesis of c-di-AMP,c-di-GMP and c-GAMP.c-di-GMP serves as the second messenger molecule to activate the innate immunity through STING signaling pathway.To generate c-di-GMP in vitro and further investigate its functions,we constructed the propionate-inducible VC0179 prokaryotic expression plasmid fused with cherry-Tag.The recombinant plasmid was transformed intoE.coilBL21(DE3) and induced by propionate.The expression of recombinant protein was observed by red color.SDS-PAGE analysis was used to identify the soluble expression of recombinant protein after ultrasonic decomposition.Moreover,c-di-GMP was enzymatically synthesizedinvitrowith the recombinant protein purified by Ni-NTA purification system and detected by high performance liquid chromatography.We successfully constructed the propionate-inducible VC0179 prokaryotic expression plasmid and acquired the high quality fusion protein,which could catalyze the synthesis of c-di-GMPinvitroby a one-step process.These results suggested that we established a method to generate enzymatically active VC0179 recombinant protein.The synthesis of c-di-GMPinvitrocould facilitate the functional study and high volume production of c-di-GMP.
VC0179;c-di-GMP;prokaryotic expression;enzymatic synthesis;high performance liquid chromatography
10.11843/j.issn.0366-6964.2015.05.026
2014-09-09
農(nóng)業(yè)部948重點計劃(2011-G35);河南省重點科技攻關(guān)(112102310705)
韓瑩倩(1990-),女,蒙古族,內(nèi)蒙古呼倫貝爾人,碩士生,主要從事動物生物技術(shù)研究,E-mail:twgjl@163.com
*通信作者:楊國宇,教授,博士生導(dǎo)師,E-mail:haubiochem@163.com
S852.61
A
0366-6964(2015)05-0868-05