汪麗升,裴詩恩,黃恩玲,吳賽青,劉詩詠,鐘愛國
(臺州學(xué)院醫(yī)藥化工學(xué)院,浙江 臺州 318000)
抗艾滋病藥地達諾辛光學(xué)活性的模擬與標(biāo)注
汪麗升,裴詩恩,黃恩玲,吳賽青,劉詩詠,鐘愛國
(臺州學(xué)院醫(yī)藥化工學(xué)院,浙江 臺州 318000)
基于量子化學(xué)理論的基組和方法, 對抗艾滋病藥物地達諾辛分子的紫外-可見吸收光譜,紅外吸收光譜, 核磁共振吸收氫和碳光譜等進行了計算與標(biāo)注。自然原子軌道電荷和前線分子軌道圖模擬表明,雜環(huán)胺基官能團上的氮和氫原子可能是其生理活性的反應(yīng)位。
地達諾辛;密度泛函活性理論;電子吸收光譜
地達諾辛(Dideoxyinosine,C10H12N4O3)又稱去羥肌苷,為人免疫缺陷病毒(HIV) 復(fù)制抑制劑, 它能干擾和抑制病毒逆轉(zhuǎn)錄酶而阻止病毒的復(fù)制。由人工化學(xué)合成,1991年11月美國首次上市,為美國第二個被批準(zhǔn)用來治療HIV感染的藥物,但是市面上該新藥真假難辨[1-4]。本研究擬用量子化學(xué)理論方法, 對標(biāo)題分子(C10H12N4O3)的經(jīng)典分子-電子吸收光譜如UV-Vis,IR,Raman,1HNRM,13CNMR以及藥理作用位等進行了模擬和標(biāo)注,獲得滿意的結(jié)果[5]。
對地達諾辛分子(Dideoxyinosine,C10H12N4O3),采用量子化學(xué)理論方法在 6-311+G(d,p)上, 進行模擬(圖1)。在穩(wěn)定構(gòu)型基礎(chǔ)上,采用振動分析法, 于Gaussian 09W程序包完成光學(xué)性質(zhì)的模擬與標(biāo)注。
圖1 地達諾辛(C10H12N4O3)分子編號及結(jié)構(gòu)Fig.1 Dideoxyinosine molecule number and structure
2.1 分子紫外-可見吸收光譜
圖2 地達諾辛標(biāo)題分子紫外吸收模擬光譜圖Fig.2 UV-Vis of dideoxyinosine molecular
在用上述程序建構(gòu)分子模型后,利用基態(tài)方法在6-311+G水平上進行了結(jié)構(gòu)優(yōu)化。在獲得穩(wěn)定構(gòu)型后,采用不同方法:(1)TD-DFT下使用不同基組(包括STO-3G, 3-21G, 3-21+G, 6-31G, 6-31+G)在不同溶劑中進行計算;(2)利用半經(jīng)驗方法ZINDO計算不同氣性溶劑中的紫外-可見光譜。通過比較兩種方法的計算結(jié)果,尋找最接近實驗數(shù)據(jù)的模擬與計算條件。最后基于TD DFT/B3LYP/6-311+G(d,p)基組和方法,計算分析發(fā)現(xiàn)(圖2), 標(biāo)題去羥基苷分子在450.0 nm (強吸收)處顯示了紫外吸收峰,可對應(yīng)于 n→σ* 的躍遷。這與其實驗品標(biāo)準(zhǔn)圖譜顯示標(biāo)題分子在455.0 nm處有較強的分子電子紫外-可見吸收峰相吻合。
2.2 紅外吸收光譜
量子化學(xué)理論模擬顯示(圖3), 地達諾辛分子指紋區(qū)峰(<500 cm-1)多而復(fù)雜,沒有強的特征性,可能源于單鍵碳-氧、碳-氮和碳-鹵素原子等的面內(nèi)伸縮-振動吸收及碳-氫、氧-氫等含氫基團的面外彎曲-振動以及碳-碳骨架振動吸收產(chǎn)生。而在510 cm-1(弱,面內(nèi)彎曲振動),1 500 cm-1(弱,面外彎曲振動),2 250 cm-1(弱,甲基的C-H反對稱伸縮振動)以及5 500 cm-1等處(對稱伸縮振動)分別顯示了其紅外吸收峰,譜圖中1 700 cm-1左右有一個強吸收峰,則可斷定分子中有羰基(-C=O)。這些峰與地達諾辛分子實驗圖譜在5091, 1 510, 2 400, 5 100 cm-1等處有吸收基本吻合。
圖3 地達諾辛分子紅外吸收模擬光譜圖Fig.3 IR of dideoxyinosine molecular
2.3 拉曼吸收光譜
擬用量子化學(xué)的理論及方法,我們在對標(biāo)題分子進行了分子構(gòu)型尋優(yōu)及振動分析,獲得了 13個Raman吸收峰。圖4是模擬的標(biāo)題分子去羥肌苷的拉曼散射譜特征峰,它主要位于510, 2 340,5 430 cm-1范圍內(nèi)。如對比標(biāo)準(zhǔn)品的拉曼圖譜與模擬拉曼圖譜,我們認(rèn)為它們是基本吻合的。
圖4 地達諾辛分子拉曼吸收模擬光譜圖Fig.4 Raman of dideoxyinosine molecular
2.4 核磁共振氫譜和碳譜吸收
理論模擬了標(biāo)題分子的氫核磁共振吸收譜圖(1HNMR,圖5(上),其主鏈CH(強,8.12,2.76 ×10-6),支鏈 CH(中,5.95, 2.76×10-6); 支鏈CH2(中,3.79,1.10×10-6); 支鏈CH2(弱,2.16,2.74× 10-6);羥基氫(弱,2.0,2.0×10-6) 。這些峰較好地與其實驗氫值和碳譜(13CNMR,下)吻合起來,間接驗證了計算的準(zhǔn)確性。
圖5 地達諾辛分子氫譜和碳譜吸收模擬光譜圖Fig.51HNMR and13CNMR of dideoxyinosine molecular
2.5 藥理活性
表1的模擬原子電荷顯示,藥物分子地達諾辛胺基氮(N9)的原子電荷值為最負(-0.343 e),其次為與胺基氮相連的碳原子(C8,-0.179 e); 原子電荷值最正的可能是胺基上的氫原子(H19, 0.165 e)。前線分子軌道圖(圖6)表明,雜環(huán)胺基原子(NH)可能是其發(fā)揮藥理活性的反應(yīng)位置。
Simulation of Optical Properties of Dideoxyinosine by DFT
WANG Li-sheng, PEI Shi-en, HUANG En-ling, WU Sai-qing, LIU Shi-yong, Zhong Ai-guo
(College of Chemical Engineering and Pharmacy, Taizhou University, Zhejiang Taizhou 318000, China)
Using density functional theory DFT/B3LYP/6-311+G(d, p) method and basis set on dideoxyinosine, electronic spectra of UV-Vis spectroscopy, IR spectroscopy and1HNMR spectrum were theoretically simulated and identified. Natural charge calculations show that N and H atoms on heterocyclic amine may play the pharmacological activity center.
dideoxyinosine; density functional theory; electronic spectra
表1 標(biāo)題分子的NBO凈電荷布居值Table 1 NBO charge population of Dideoxyinosine e
TQ 624.3
B
1671-0460(2015)09-2088-02
浙江省大學(xué)生科技創(chuàng)新項目(2014R428015)和國家級大學(xué)生創(chuàng)新訓(xùn)練計劃(201510350015)資助。
2015-04-10
汪麗升(1994-),男,浙江淳安人,研究方向:有機合成。從事材料化學(xué)工作。E-mail:1113669202@qq.com。