楊統(tǒng)一,高俊賢,劉 琦,連梓竹
(江蘇科技大學環(huán)境與化學工程學院,江蘇鎮(zhèn)江212018)
鄰苯二甲酸二丁酯高效降解菌的分離、鑒定及降解特性
楊統(tǒng)一,高俊賢,劉 琦,連梓竹
(江蘇科技大學環(huán)境與化學工程學院,江蘇鎮(zhèn)江212018)
從土壤中分離出1株能夠以鄰苯二甲酸二丁酯為碳源和能源生長的細菌XHYG.經(jīng)形態(tài)觀察、生理生化鑒定、16S rDNA序列及系統(tǒng)發(fā)育分析,鑒定該菌株為無色桿菌(Achromobacter insolitus).對該菌株的降解條件進行優(yōu)化,確定最佳降解條件為:溫度30℃,pH=6.5~8.0.在最佳降解條件下,其在48 h內(nèi)對400 mg/L DBP降解率達到90.67%,為鄰苯二甲酸二丁酯的高效降解菌.底物降解廣譜性試驗表明,該菌株對鄰苯二甲酸二辛脂(DOP)、鄰苯二甲酸(2-乙基已基)酯(DEHP)都具有良好的降解能力,表明具備良好的底物降解廣譜性,說明該菌株在處理鄰苯二甲酸酯類化合物的污染治理中有獨特的應(yīng)用潛力.
鄰苯二甲酸二丁酯;降解特性;生物降解;降解條件;16S rDNA
鄰苯二甲酸酯類(phthalic acid esters,PAEs)是一類重要的有機化合物,被廣泛用作塑料助劑、油漆溶劑、合成橡膠增塑劑及化妝品、香味品、潤滑劑等生產(chǎn)原料中[1].然而,由于鄰苯二甲酸酯增塑劑并非與樹脂共價連接,因此極易擴散到環(huán)境中.目前,PAEs在環(huán)境中已到了普遍檢出程度,包括在陸地生態(tài)系統(tǒng)及水域生態(tài)系統(tǒng)等都能檢測到PAEs的存在[2].近期研究表明,PAEs具有致畸性、致突變性、致癌性及生殖毒性,可在極低濃度下干擾人和動物的內(nèi)分泌系統(tǒng),導致其發(fā)育紊亂[3].且在環(huán)境研究領(lǐng)域,鄰苯二甲酸酯類被中國環(huán)境監(jiān)測總站、美國國家環(huán)保局(EPA)和歐盟列為優(yōu)先控制污染物[4].
PAEs在自然界中的降解分為生物降解和非生物降解兩種,而微生物降解是其降解的主要途徑[5].目前國內(nèi)外有關(guān)PAEs微生物降解的研究有很多[6-7],如 Delfia sp.[8],Sphingomonsa sp.[9],Arthrobacter sp.[10],Paenibacillus sp.[11]等.但已報道的菌株能降解DBP且能降解多種鄰苯二甲酸酯類化合物的還較少,因此有必要篩選高效廣譜的DBP降解菌,豐富降解菌種類.本研究從鎮(zhèn)江市江蘇科技大學西校區(qū)垃圾處理站土樣中分離到了1株能夠高效降解鄰苯二甲酸二丁酯的細菌,采用生理生化及16S rDNA序列分析等手段對該菌進行了鑒定,并研究其生長和降解特性,以期為PAEs污染物的治理及土壤修復(fù)提供一定的科學依據(jù).
1.1 實驗材料
實驗土樣取自鎮(zhèn)江市江蘇科技大學西校區(qū)垃圾處理站附近土壤.
基礎(chǔ)無機鹽(MSM)培養(yǎng)基(g/L):K2HPO45.8,KH2PO44.5,(NH4)2SO42.0,MgCl20.16,CaCl20.02,Na2MoO4·2H2O 0.002 4,F(xiàn)eCl30.001 8,MnCl2·2H2O 0.001 5,pH=7.0,于121℃濕熱滅菌20 min.固體培養(yǎng)基為含DBP的液體培養(yǎng)基加瓊脂20 g/L.
富集培養(yǎng)基(g/L):牛肉膏5.0,蛋白胨10.0,NaCl 5.0,pH=7.0,于121℃濕熱滅菌20 min.
主要試劑:鄰苯二甲酸二丁酯(DBP,分析純);鄰苯二甲酸(2-乙基已基)酯(DEHP,分析純);鄰苯二甲酸二辛脂(DOP,分析純);環(huán)己烷(色譜級),甲醇(色譜級).
1.2 實驗方法
1.2.1 DBP降解菌的篩選與純化
稱取10 g土壤樣品,加入20 ml無菌水,劇烈振蕩混合均勻后于4 000 r/min離心機中離心5 min,取上清液;接著重復(fù)此步驟2次,最后取上清液獲得土壤溶液.取分別稀釋100倍、1 000倍、10 000倍的土壤溶液,涂布在固體MSM培養(yǎng)基(含DBP 100 mg/L)于30℃培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)7 d.然后挑取篩選的菌落接種于含DBP 200 mg/L的液體MSM培養(yǎng)基,150 r/min、30℃ 的搖床培養(yǎng)7 d,再用劃線法劃線于固體MSM培養(yǎng)基(含DBP 200 mg/L)于30℃培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)7 d,進一步分離單菌落.重復(fù)上述兩步并逐步提高培養(yǎng)基中DBP含量依次為200,250,300,350,400 mg/L.最后將分離出的單菌用富集培養(yǎng)基富集.
1.2.2 菌株的生理生化鑒定
降解菌株形態(tài)及生理生化特性鑒定參照常見細菌系統(tǒng)鑒定手冊[12]等文獻.
1.2.3 菌株DNA的鑒定
降解菌株分子生物學鑒定采用16S rDNA序列分析.首先提取分離的降解菌DNA作為模板,利用16S rDNA基因通用引物F27和R1492進行PCR擴增.其中,引物F27為5’-AGA GTT TGA TCC TGG CTC AG-3’,引物R1492為5’-GGC TAC CTT GTT ACG ACT T-3’.
PCR擴增條件為:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性40 s;55℃退火40 s;72℃延伸90 s,30個循環(huán); 72℃最終延伸7 min,4℃保存.
PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測后,送上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司完成測序工作.將測序結(jié)果提交GenBank,獲得序列號KM598778,并同GenBank數(shù)據(jù)庫中的基因序列進行BLAST比對,以獲得相似性較高的相關(guān)菌株,采用MEGA6.0軟件進行多序列比對,并構(gòu)建系統(tǒng)進化樹.
1.2.4 溶液中PAEs的含量測定
采用高效液相色譜法檢測溶液中PAEs,具體處理方法如下:待測溶液于超聲波振蕩器中振蕩10 min后取10 ml加入20 ml環(huán)己烷,劇烈振蕩后放入超聲波振蕩器中振蕩5 min,后倒入離心管在高速離心機(5 000 r/min)中離心分離取上層有機相,再用孔徑為0.22 μm的有機相過濾器過濾后上機測定.
高效液相色譜條件:色譜柱為5μm Eclipse XDB-C18柱;流動相為甲醇∶水=90∶10;檢測器波長為228 nm;柱溫為35℃;柱壓為15 bar;流速0.5 mL/min;進樣量為10 μL;保留時間為11 min.
1.2.5 生物量測定方法
測定菌株的生物量,采用721型可見分光光度計在600 nm處測量培養(yǎng)基的光密度OD600.
1.3 降解菌底物廣譜性測試
在基礎(chǔ)無機鹽培養(yǎng)基中分別加入鄰苯二甲酸二辛脂(400 mg/L);鄰苯二甲酸(2-乙基已基)酯(400 mg/L)于121℃濕熱滅菌20 min.以2%的接種量將降解菌種子液接種到100 mLMSM中,160 r/min、30℃搖床培養(yǎng).培養(yǎng)5 d后取樣,用高效液相色譜法測定不同鄰苯二甲酸酯的殘留量.
1.4 菌株的降解特性研究
1.4.1 降解菌對DBP的降解曲線及生長曲線
將菌液離心分離獲取菌體,再用MSM培養(yǎng)基重懸,調(diào)整菌液濃度OD600=1.0.然后將上述菌液1 ml接種到液體MSM培養(yǎng)基(DBP含量為400 mg/L) 25 ml中,在150 r/min、30℃ 的搖床培養(yǎng),并設(shè)置一組液體MSM培養(yǎng)基(DBP含量為400 mg/L)不加入菌液作為對照.每24 h定時取樣用高效液相色譜法測定其中DBP的含量,并測定其OD600值.
1.4.2 DBP高效降解菌的降解條件優(yōu)化
1)溫度
將菌株的菌液離心分離獲取菌體,再用MSM培養(yǎng)基重懸,調(diào)整菌液濃度OD600=1.0.然后取上述菌液5份,每份1 ml分別接種到液體MSM培養(yǎng)基(DBP含量為400 mg/L)25 ml中,在150 r/min、溫度分別為25,30,35,40,45℃ 的搖床培養(yǎng)5 d,并設(shè)置一組液體MSM培養(yǎng)基(DBP含量為400 mg/L)不加入菌液作為對照.用高效液相色譜法測定其中DBP的含量.
2)pH
將菌株的菌液離心分離獲取菌體,再用MSM培養(yǎng)基重懸,調(diào)整菌液濃度OD600=1.0.然后取上述菌液5份,每份1 ml分別接種到液體MSM培養(yǎng)基(DBP含量為400 mg/L)25 ml中,將5份培養(yǎng)基pH分別調(diào)整為6.0,7.0,8.0,9.0,10.0在150 r/min、30℃ 的搖床培養(yǎng)5 d,并設(shè)置一組液體MSM培養(yǎng)基(DBP含量為400 mg/L)不加入菌液作為對照.用高效液相色譜法測定其中DBP的含量.
2.1 菌株XHYG的分離及部分生理生化特征
經(jīng)過富集培養(yǎng),分離得到1株能夠在DBP含量為400 mg/L的MSM培養(yǎng)基中很好生長的降解菌,此菌株能以DBP為唯一碳源很好地生長,將其命名為XHYG.XHYG菌株在MSM平板上于30℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)5 d后,菌落呈圓形,不透明,黃色,中央部分突起,邊緣部分光滑,質(zhì)地致密且有光澤,不含水溶性色素,在顯微鏡下觀察為球狀.生理生化測試發(fā)現(xiàn),菌株XHYG為革蘭氏陰性菌,接觸酶呈陽性反應(yīng),淀粉水解酶呈陰性反應(yīng),不產(chǎn)硫化氫氣體,明膠液化反應(yīng)、甲基紅反應(yīng)均呈陰性反應(yīng),能夠發(fā)酵葡萄糖(詳見表1).
2.2 降解菌底物廣譜性測試
接種5 d后觀察菌株XHYG都能很好地利用DOP和DEHP,根據(jù)圖1所示,菌株XHYG對DOP的降解較DEHP要好.這與文獻[13]中鄰苯二甲酸脂類的生物降解效果與碳鏈長度和復(fù)雜程度呈反比相一致.
表1XHYG菌株的部分生理生化特征Table 1 Biophysical and biochemical characteristics of strain XHYG
圖1 菌株XHYG對不同鄰苯二甲酸酯的降解Fig.1 Degradation rate of different PAEs by strain XHYG
2.3 菌株XHYG的16S rDNA分子鑒定與系統(tǒng)發(fā)育分析
測序結(jié)果提交 GenBank的登錄號為KM598778.在GenBank中進行BLAST比對分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)與菌株XHYG的16S rDNA序列相似性最高的是 Achromobacter insolitus,其相似性達到99%.結(jié)合其形態(tài)學和生理生化特征,可以初步確定XHYG為無色桿菌(Achromobacter insolitus).選取部分文獻報道的PAEs降解菌,用MEGA 6.0軟件包構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖2),對比降解菌的系統(tǒng)進化關(guān)系.由圖2可以看出,文中篩選的XHYG菌株與無色桿菌(Achromobacter insolitus)處于同一分支,具有相同的進化距離,因而更進一步說明菌株XHYG為無色桿菌屬.從圖2還可看出,部分PAEs降解菌與XHYG菌株進化距離較遠,說明PAEs降解基因廣泛分布在不同種屬.
圖2菌株XHYG的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2 Phylogenetic tree of strain XHYG
2.4 菌株XHYG的生長曲線和降解曲線
菌株XHYG的生長和降解曲線如圖3.
圖3 菌株XHYG利用鄰苯二甲酸二丁酯的生長和降解曲線Fig.3 Growth curves and degradation curves of DBP by strain XHYG
由圖3可以看出,在0~1 d時,菌株XHYG生長緩慢,DBP的降解率較低,培養(yǎng)基呈現(xiàn)淡淡的乳白色;菌株在1~3 d為遲滯期;3~5 d為對數(shù)生長期;5 d后進入平衡期;從降解曲線上來看,菌株在48 h時對400 mg/L DBP降解率達到90.67%,在3~6 d,菌株XHYG以DBP為唯一碳源和能源迅速繁殖生長,在培養(yǎng)基底部逐漸產(chǎn)生灰白色懸浮顆粒物即菌體,而DBP也被大量降解,培養(yǎng)基顏色逐漸澄清;在5~6 d時期,菌株的生長進入平衡期,其OD600穩(wěn)定在1.2左右,菌株的生長量逐漸達到最大值,DBP的殘留量僅為4.09 mg/L,降解率達到98.99%.因此,確認菌株XHYG為DBP的高效降解菌.
2.5 溫度對菌株XHYG降解DBP的影響
由圖4看出,菌株XHYG對DBP的降解效果先隨溫度的升高而升高,達到最大值后,隨著溫度的升高而降低,菌株XHYG的最適生長溫度為30℃,在溫度超過35℃后降解活性大大降低.由此表明,溫度過高或過低都會使菌株XHYG的生長受到抑制,降解活性降低.這與文獻[11]的研究結(jié)果一致.這可能由于當溫度過低時,菌體內(nèi)酶的活性在低溫下大大降低,導致菌株對DBP的降解效率降低;當溫度過高時酶活性失活導致降解效率降低.
圖4 溫度對菌株XHYG降解鄰苯二甲酸二丁酯的影響Fig.4 Effect of temperature on DBP degradation by strain XHYG
2.6 pH對菌株XHYG降解DBP的影響
由圖5可以看出菌株XHYG的最適生長pH值在6.5~8.0左右,菌株的降解率能達到85%以上,而當pH值過低或者過高時菌株的生長均受到抑制,降解活性降低.由此表明,中性環(huán)境更利于這株菌株對DBP的降解.這與文獻[16]分離出的HS-B1菌株相似,該菌株被鑒定為不動桿菌(Acinetobacter sp.),當pH>8.0,菌株的降解效率大大降低.
圖5 pH對菌株XHYG降解鄰苯二甲酸二丁酯的影響Fig.5 Effect of pH on DBP degradation by strain XHYG
1)從土壤中分離得到了一株能夠以DBP為碳源和能源生長的細菌XHYG,經(jīng)過形態(tài)學特征、生理生化特征和16S rDNA序列系統(tǒng)學分析,初步鑒定該菌株為無色桿菌(Achromobacter insolitus).
2)XHYG生長和降解DBP的最佳培養(yǎng)條件為:溫度30℃,pH 7.0;在此條件下,菌株迅速利用DBP作為碳源和能源進行生長,能夠在DBP濃度為400 mg·L-1的無機鹽培養(yǎng)基中生長良好,有較高的耐受性和降解效率.
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(責任編輯:顧 琳)
Isolation and identification of highly efficient DBP-degrading strain and its degradation study
Yang Tongyi,Gao Junxian,Liu Qi,Lian Zizhu
(School of Environmental and Chemical Engineering,Jiangsu University of Science and Technology,Zhenjiang Jiangsu 212018,China)
A bacterial strain XHYG which can utilize Dibutyl phthalate(DBP)as the source of carbon and energy was isolated from soil.Based on its morphology,physiological and biochemical identification,and 16S r DNA sequence analysis,XHYG was identified as Achromobacter insolitus.The results also showed that the optimum temperature and pH for its growth and styrene-degradation were 30℃and 6.5~8.0,respectively.Under the optimal conditions,strain XHYG degraded more than 90.67%of 400 mg/L DBP within 48 h.Diversity of degradable substrates also showed that HS-B1 can efficiently utilize many other phthalate esters such as di-n-octyl phthalate(DOP)and bis(2-ethylhexyl)phthalate(DEHP).It revealed that the strain XHYG has special application potential in dealing with the pollution caused by phthalate esters.
DBP;degrading characteristics;biodegradation;degradation condition; 16S rDNA
X172
A
1673-4807(2015)06-0607-05
10.3969/j.issn.1673-4807.2015.06.018
2015-03-18
國家自然科學基金資助項目(31400448);江蘇省博士后基金資助項目(1401084B);江蘇科技大學本科生創(chuàng)新計劃資助項目
楊統(tǒng)一(1980—),男,博士,講師,研究方向環(huán)境生物技術(shù)及土壤生態(tài)學.E-mail:tongyi@just.edu.cn
楊統(tǒng)一,高俊賢,劉琦,等.鄰苯二甲酸二丁酯高效降解菌的分離、鑒定及降解特性[J].江蘇科技大學學報(自然科學版),2015,29(6):607-611.