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酸模屬5種植物的過氧化物酶(POD)同工酶的比較

2015-01-15 15:42翁貴英孫愛群楊友聯(lián)王緒英林長松
江蘇農業(yè)科學 2014年11期
關鍵詞:聚類分析

翁貴英+孫愛群+楊友聯(lián)+王緒英+林長松

摘要:為了探明酸模屬(Rumex)植物種間親緣關系,采用聚丙烯酰胺垂直凝膠電泳技術,對酸模屬5種植物的過氧化物酶(POD)同工酶進行了研究。結果顯示,酸模屬5種植物過氧化物酶(POD)同工酶共11條酶帶,不同種間酶譜存在較大差異;聚類分析表明,齒果酸模(Rumexdentatus)、尼泊爾酸模(R.nepalensis)、鈍葉酸模(R.obtusifolius)、皺葉酸模(R.crispus)這4種植物的親緣關系較近,戟葉酸模(R.hastatus)與這4種酸模的親緣關系較遠,且戟葉酸模是5種酸模中的較原始種。由結果可知,POD酶譜在一定程度上能反映種間的遺傳差異,有助于酸模屬物種的鑒定及親緣關系的探討。

關鍵詞:酸模屬;過氧化物酶;聚類分析;親緣關系

中圖分類號:Q554+.6文獻標志碼:A文章編號:1002-1302(2014)11-0063-03

酸模屬(Rumex)是蓼科(Primulaceae)第2大屬,全世界約有150種,主產(chǎn)北溫帶,我國有26種2變種[1-2],在全國各省區(qū)均有生產(chǎn),其中貴州省有7種[3-4]。酸模屬可入藥的植物有16種,入藥部位為根,俗稱“土大黃”或“野甜菜”,主要含蒽醌類、黃酮類、萘衍生物、二苯乙烯類及鞣質類等,具有清熱解毒、活血止血、通便殺蟲之功效,主治多種皮膚病、出血癥及各種炎癥[5]?,F(xiàn)代藥學研究表明,酸模屬植物有抑菌、抗炎、抗病毒、抗氧化、防腐、抗腫瘤及免疫調節(jié)等作用[6]。目前國內外學者對酸模屬的研究主要集中在化學成分與藥理活性[5-7]、形態(tài)解剖學[8-10]及染色體核型[11]等方面,未見關于其同工酶方面的研究報道。同工酶是指催化同一種化學反應,但其酶蛋白本身的分子結構組成有所不同的一組酶,廣泛應用于植物系統(tǒng)演化研究中[12]。過氧化物酶(POD)同工酶普遍存在于各種植物組織中,易于提取和分離,并且穩(wěn)定性較好,它在種質資源的分類、系統(tǒng)發(fā)育、親緣關系[13]等方面的應用較廣。筆者采用聚丙烯酰胺垂直凝膠電泳技術,對貴州省六盤水市酸模屬5種植物的過氧化物酶同工酶進行了研究,探討其遺傳結構、親緣關系及分類,旨在為酸膜屬植物的合理利用提供一定的參考資料。

1材料與方法

1.1試驗材料

試驗材料于2011年6月采自貴州省六盤水市水城縣境內,基本情況詳見表1,由林長松教授(博士)鑒定。憑證標本存放于六盤水師范學院生命科學系的植物標本室。

1.2試驗方法

1.2.1酶液制備、電泳按實驗室的常規(guī)方法進行[14-15]。

1.2.2染色取下凝膠,用蒸餾水洗2次,參照胡能書等的醋酸聯(lián)苯胺法[16]進行染色。出現(xiàn)清晰酶帶后,棄染色液,用清水洗凈后拍照、測量并記錄,在7%乙酸中保存。

1.2.3分析方法統(tǒng)計酶帶數(shù),計算其相對遷移率Rf值、酶譜相似度指數(shù),相關公式為:

Rf值=酶帶遷移距離(cm)/溴酚藍遷移距離(cm);

酶譜相似度指數(shù)=2個物種的相同酶帶數(shù)/(2個物種的相同酶帶數(shù)+2個物種的不同酶帶數(shù))。

依據(jù)數(shù)量分類中二態(tài)特征的0/1編碼原則[17],首先將各樣本看成一類,對每個個體的每條酶帶賦值,有酶帶的記為1,無酶帶的記為0,應用DPSv3.01軟件,采用Jaccard系數(shù),用類平均法(UPGMA)對酸模屬5種植物進行聚類分析。

同工酶酶譜分析和命名參照熊全沫的方法[18-19]。以同工酶縮寫名稱的大寫字母代表酶蛋白,以1、2、3……表示向陽極遷移位點,愈靠近陽極的位點以愈小的數(shù)字表示,如POD-1、POD-2等。

2結果與分析

2.1過氧化物同工酶酶譜

由圖1可以看出,5種酸模屬植物共檢測出過氧化物酶(POD)酶譜帶11條,其中齒果酸模有7條帶(POD-2、POD-3、POD-4、POD-5、POD-6、POD-8、POD-10),其中POD-8、POD-10表達較強,POD-2、POD-3、POD-5、POD-6表達較弱;鈍葉酸模有5條帶(POD-1、POD-3、POD-4、POD-8、POD-10),其中POD-8、POD-10表達較強,POD-1、POD-3表達較弱;皺葉酸模有6條帶(POD-4、POD-5、POD-6、POD-8、POD-9、POD-11),其中POD-4、POD-5、POD-6、POD-8表達較弱;尼泊爾酸模有4條帶(POD-4、POD-7、POD-8、POD-10),其中POD-7、POD-8、POD-10表達較強,POD-4表達較弱;戟葉酸模只有1條帶(POD-7),表達較弱??梢娝崮俨煌N植物酶譜帶的位置、數(shù)量及強弱存在著一定的差異。

根據(jù)酶譜位置可分為2個區(qū):Ⅰ區(qū)(Rf=0.13~0.25)和Ⅱ區(qū)(Rf=0.48~0.66),其中Ⅰ區(qū)酶帶數(shù)為5條,Ⅱ區(qū)酶帶數(shù)為6條,可見2個區(qū)的酶帶數(shù)量、強弱不等。戟葉酸模只有1條弱帶,分布在Ⅰ區(qū),其余酸模在Ⅰ區(qū)、Ⅱ區(qū)均有酶帶,且Ⅰ區(qū)酶帶表達強度高于Ⅱ區(qū)。齒果酸模、鈍葉酸模、皺葉酸模、尼泊爾酸模具有2條共同譜帶(POD-4、POD-8),Rf值分別為0.55、0.23,占總譜帶的18.18%,說明這4種酸模具有相似的遺傳基礎,保持著一定的遺傳一致性;在2~3個種間共有酶帶數(shù)為1~4條,如齒果酸模與鈍葉酸模有4條共同酶帶(POD-3、POD-4、POD-8、POD-10),Rf值分別為0.59、0.55、0.23、0.16,占總酶帶的36.36%;齒果酸模與皺葉酸模也有4條共同酶帶(POD-4、POD-5、POD-6、POD-8),Rf值分別為0.55、0.51、0.48、0.23,占總譜帶的36.36%;尼泊爾酸模、齒果酸模、鈍葉酸模有3條共同酶帶(POD-4、POD-8、POD-10),Rf值分別為0.55、0.23、0.16,占總酶帶的27.3%;皺葉酸模、鈍葉酸模、尼泊爾酸模有2條共同酶帶(POD-4、POD-8),Rf值分別為0.55、0.23,占總酶帶的18.18%;戟葉酸模和尼泊爾酸模有1條共同酶帶(POD-7),Rf值為0.25,占總酶帶的9.09%;此外,齒果酸模、鈍葉酸模、皺葉酸模各有1條特有酶帶??傮w看來,齒果酸模、鈍葉酸模的酶帶大部分表達較強,尼泊爾酸模的酶帶表達也較強,戟葉酸模的酶帶表達較弱。5種酸模均有自己的酶譜特征,POD同工酶可以將5種酸模區(qū)分開,表明酶譜特征在一定程度上能反映物種間形態(tài)上的關系。

2.2相似度指數(shù)及聚類分析

Vaughan等提出以酶譜相似度指數(shù)預測種間親緣關系,相似度指數(shù)越大,說明物種間的酶譜差異越小,親緣關系越密切[20]。5種酸模屬植物POD酶譜的相似度指數(shù)見表2。

由表2可以看出,齒果酸模與鈍葉酸模、鈍葉酸模與尼泊爾酸模似度指數(shù)最大(0.500),其次是齒果酸模與皺葉酸模(0.444),戟葉酸模與齒果酸模、皺葉酸模、鈍葉酸模的相似度指數(shù)最?。?),表明齒果酸模與鈍葉酸模、皺葉酸模親緣關系較近,戟葉酸模與齒果酸模、皺葉酸模、鈍葉酸模的親緣關系較遠。根據(jù)相似度指數(shù)的大小,這5種植物兩兩之間的親緣關系由近到遠排列依次為齒果酸模-鈍葉酸模/鈍葉酸模-尼泊爾酸模、齒果酸模-皺葉酸模、齒果酸模-尼泊爾酸模、皺葉酸模-尼泊爾酸模、尼泊爾酸模-戟葉酸模/鈍葉酸模-皺葉酸模、齒果酸模-戟葉酸模/鈍葉酸模-戟葉酸模/皺葉酸模-戟葉酸模。

采用Jaccard系數(shù),用類平均法(UPGMA)對酸模屬5種植物進行(0-1)聚類分析,結果見圖2。

從圖2可知,酸模屬5種植物被分為2個類群,類群Ⅰ包括齒果酸模、尼泊爾酸模、鈍葉酸模、皺葉酸模,類群Ⅱ為戟葉酸模。說明齒果酸模、尼泊爾酸模、鈍葉酸模、皺葉酸模4種植物間的親緣關系較近,戟葉酸模與這4種酸模間的親緣關系較遠。

3討論與結論

酸模屬不同種間POD同工酶酶譜存在較大差異,酶帶數(shù)目、位置及強弱不等,且有特有酶帶,表現(xiàn)出明顯的趨異性和遺傳差異性,表明酶譜特征可以作為酸模屬物種鑒定的依據(jù),5種酸模屬植物之間分化較明顯,是分化較好的“物種”[21]。

根據(jù)Gracia等的觀點,同工酶酶帶數(shù)越多的種分化程度較高,是較進化種,同工酶酶帶數(shù)越少的種分化程度較低,是較原始種[22]。酸模屬5種植物中,齒果酸模酶帶數(shù)最多(7條),戟葉酸模酶帶數(shù)最少(1條),說明齒果酸模為較進化物種,戟葉酸模為較原始物種。鄭水慶等的ITS結果也說明戟葉酸模是較原始物種[23],POD同工酶結果與ITS結果相吻合,說明POD同工酶可以用于酸模屬系統(tǒng)演化的研究。

相關數(shù)據(jù)和聚類分析顯示,齒果酸模、鈍葉酸模、皺葉酸模、尼泊爾酸模聚為1支,而戟葉酸模單獨聚為1支,說明齒果酸模、鈍葉酸模、皺葉酸模、尼泊爾酸模保持著一定的遺傳一致性,其親緣關系較近,戟葉酸模與這4種酸模親緣關系較遠,與鄭水慶等的ITS序列聚類結果相一致[23]。從外部形態(tài)上看,戟葉酸模為灌木,葉為戟形,其他4種酸模均為草本,葉為長橢圓形,戟葉酸模與其他4種酸模外部形態(tài)差異較大;形態(tài)分類上戟葉酸模屬于酸模亞屬,其他4種酸模屬于巴天酸模亞屬,說明同工酶聚類分析結果與形態(tài)特征相吻合,支持李安仁對酸膜亞屬及巴天酸膜亞屬的劃分[2]。

參考文獻:

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江蘇農業(yè)科學2014年第42卷第11期

藺經(jīng),李曉剛,李慧,等.沙梨新品種蘇翠1號組培快繁體系研究[J].江蘇農業(yè)科學,2014,42(11):66-67.

2.2相似度指數(shù)及聚類分析

Vaughan等提出以酶譜相似度指數(shù)預測種間親緣關系,相似度指數(shù)越大,說明物種間的酶譜差異越小,親緣關系越密切[20]。5種酸模屬植物POD酶譜的相似度指數(shù)見表2。

由表2可以看出,齒果酸模與鈍葉酸模、鈍葉酸模與尼泊爾酸模似度指數(shù)最大(0.500),其次是齒果酸模與皺葉酸模(0.444),戟葉酸模與齒果酸模、皺葉酸模、鈍葉酸模的相似度指數(shù)最?。?),表明齒果酸模與鈍葉酸模、皺葉酸模親緣關系較近,戟葉酸模與齒果酸模、皺葉酸模、鈍葉酸模的親緣關系較遠。根據(jù)相似度指數(shù)的大小,這5種植物兩兩之間的親緣關系由近到遠排列依次為齒果酸模-鈍葉酸模/鈍葉酸模-尼泊爾酸模、齒果酸模-皺葉酸模、齒果酸模-尼泊爾酸模、皺葉酸模-尼泊爾酸模、尼泊爾酸模-戟葉酸模/鈍葉酸模-皺葉酸模、齒果酸模-戟葉酸模/鈍葉酸模-戟葉酸模/皺葉酸模-戟葉酸模。

采用Jaccard系數(shù),用類平均法(UPGMA)對酸模屬5種植物進行(0-1)聚類分析,結果見圖2。

從圖2可知,酸模屬5種植物被分為2個類群,類群Ⅰ包括齒果酸模、尼泊爾酸模、鈍葉酸模、皺葉酸模,類群Ⅱ為戟葉酸模。說明齒果酸模、尼泊爾酸模、鈍葉酸模、皺葉酸模4種植物間的親緣關系較近,戟葉酸模與這4種酸模間的親緣關系較遠。

3討論與結論

酸模屬不同種間POD同工酶酶譜存在較大差異,酶帶數(shù)目、位置及強弱不等,且有特有酶帶,表現(xiàn)出明顯的趨異性和遺傳差異性,表明酶譜特征可以作為酸模屬物種鑒定的依據(jù),5種酸模屬植物之間分化較明顯,是分化較好的“物種”[21]。

根據(jù)Gracia等的觀點,同工酶酶帶數(shù)越多的種分化程度較高,是較進化種,同工酶酶帶數(shù)越少的種分化程度較低,是較原始種[22]。酸模屬5種植物中,齒果酸模酶帶數(shù)最多(7條),戟葉酸模酶帶數(shù)最少(1條),說明齒果酸模為較進化物種,戟葉酸模為較原始物種。鄭水慶等的ITS結果也說明戟葉酸模是較原始物種[23],POD同工酶結果與ITS結果相吻合,說明POD同工酶可以用于酸模屬系統(tǒng)演化的研究。

相關數(shù)據(jù)和聚類分析顯示,齒果酸模、鈍葉酸模、皺葉酸模、尼泊爾酸模聚為1支,而戟葉酸模單獨聚為1支,說明齒果酸模、鈍葉酸模、皺葉酸模、尼泊爾酸模保持著一定的遺傳一致性,其親緣關系較近,戟葉酸模與這4種酸模親緣關系較遠,與鄭水慶等的ITS序列聚類結果相一致[23]。從外部形態(tài)上看,戟葉酸模為灌木,葉為戟形,其他4種酸模均為草本,葉為長橢圓形,戟葉酸模與其他4種酸模外部形態(tài)差異較大;形態(tài)分類上戟葉酸模屬于酸模亞屬,其他4種酸模屬于巴天酸模亞屬,說明同工酶聚類分析結果與形態(tài)特征相吻合,支持李安仁對酸膜亞屬及巴天酸膜亞屬的劃分[2]。

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2.2相似度指數(shù)及聚類分析

Vaughan等提出以酶譜相似度指數(shù)預測種間親緣關系,相似度指數(shù)越大,說明物種間的酶譜差異越小,親緣關系越密切[20]。5種酸模屬植物POD酶譜的相似度指數(shù)見表2。

由表2可以看出,齒果酸模與鈍葉酸模、鈍葉酸模與尼泊爾酸模似度指數(shù)最大(0.500),其次是齒果酸模與皺葉酸模(0.444),戟葉酸模與齒果酸模、皺葉酸模、鈍葉酸模的相似度指數(shù)最?。?),表明齒果酸模與鈍葉酸模、皺葉酸模親緣關系較近,戟葉酸模與齒果酸模、皺葉酸模、鈍葉酸模的親緣關系較遠。根據(jù)相似度指數(shù)的大小,這5種植物兩兩之間的親緣關系由近到遠排列依次為齒果酸模-鈍葉酸模/鈍葉酸模-尼泊爾酸模、齒果酸模-皺葉酸模、齒果酸模-尼泊爾酸模、皺葉酸模-尼泊爾酸模、尼泊爾酸模-戟葉酸模/鈍葉酸模-皺葉酸模、齒果酸模-戟葉酸模/鈍葉酸模-戟葉酸模/皺葉酸模-戟葉酸模。

采用Jaccard系數(shù),用類平均法(UPGMA)對酸模屬5種植物進行(0-1)聚類分析,結果見圖2。

從圖2可知,酸模屬5種植物被分為2個類群,類群Ⅰ包括齒果酸模、尼泊爾酸模、鈍葉酸模、皺葉酸模,類群Ⅱ為戟葉酸模。說明齒果酸模、尼泊爾酸模、鈍葉酸模、皺葉酸模4種植物間的親緣關系較近,戟葉酸模與這4種酸模間的親緣關系較遠。

3討論與結論

酸模屬不同種間POD同工酶酶譜存在較大差異,酶帶數(shù)目、位置及強弱不等,且有特有酶帶,表現(xiàn)出明顯的趨異性和遺傳差異性,表明酶譜特征可以作為酸模屬物種鑒定的依據(jù),5種酸模屬植物之間分化較明顯,是分化較好的“物種”[21]。

根據(jù)Gracia等的觀點,同工酶酶帶數(shù)越多的種分化程度較高,是較進化種,同工酶酶帶數(shù)越少的種分化程度較低,是較原始種[22]。酸模屬5種植物中,齒果酸模酶帶數(shù)最多(7條),戟葉酸模酶帶數(shù)最少(1條),說明齒果酸模為較進化物種,戟葉酸模為較原始物種。鄭水慶等的ITS結果也說明戟葉酸模是較原始物種[23],POD同工酶結果與ITS結果相吻合,說明POD同工酶可以用于酸模屬系統(tǒng)演化的研究。

相關數(shù)據(jù)和聚類分析顯示,齒果酸模、鈍葉酸模、皺葉酸模、尼泊爾酸模聚為1支,而戟葉酸模單獨聚為1支,說明齒果酸模、鈍葉酸模、皺葉酸模、尼泊爾酸模保持著一定的遺傳一致性,其親緣關系較近,戟葉酸模與這4種酸模親緣關系較遠,與鄭水慶等的ITS序列聚類結果相一致[23]。從外部形態(tài)上看,戟葉酸模為灌木,葉為戟形,其他4種酸模均為草本,葉為長橢圓形,戟葉酸模與其他4種酸模外部形態(tài)差異較大;形態(tài)分類上戟葉酸模屬于酸模亞屬,其他4種酸模屬于巴天酸模亞屬,說明同工酶聚類分析結果與形態(tài)特征相吻合,支持李安仁對酸膜亞屬及巴天酸膜亞屬的劃分[2]。

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