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江蘇省葫蘆科作物6種病毒的多重RT-PCR方法及應(yīng)用

2015-01-01 02:14:32任春梅程兆榜周益軍
關(guān)鍵詞:葫蘆科侵染條帶

任春梅, 程兆榜, 楊 柳, 繆 倩, 周益軍

(江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所,江蘇 南京 210014)

葫蘆科作物是一種僅次于禾本科、豆科和茄科作物的世界性重要經(jīng)濟(jì)作物,主要分布于熱帶和亞熱帶[1-2]。與大田作物相比,該類作物類型多,品種雜,單品種面積小。葫蘆科作物病害中病毒病害的發(fā)生最為嚴(yán)重,國(guó)際病毒分類委員會(huì)(ICTV)發(fā)布的侵染葫蘆科作物的病毒達(dá)38個(gè)確定種和9個(gè)暫定種[3]。不僅病毒種類繁雜,株系眾多,而且不同病毒同時(shí)侵害引起的復(fù)合侵染現(xiàn)象普遍,病害發(fā)生年度間變化大,給防控和檢測(cè)都帶來(lái)很大難度[4]。

江蘇省自種植結(jié)構(gòu)調(diào)整發(fā)展高效農(nóng)業(yè)以來(lái),蔬菜種植業(yè)發(fā)展迅速,目前復(fù)種面積已達(dá)1.3×105hm2以上(含西瓜甜瓜),生產(chǎn)中病毒病是其主要病害問(wèn)題之一。江蘇省葫蘆科作物病毒病原種類主要有 西 瓜 花 葉 病 毒[5](Watermelon mosaic virus,WMV)、小西葫蘆黃花葉病毒[6](Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)、黃瓜花葉病毒[7](Cucumber mosaic virus,CMV)和黃瓜綠斑駁病毒[8](Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV),煙草花葉病毒[9](Tobacco mosaic virus,TMV)和番木瓜環(huán)斑病毒[10](Papaya ringspot virus,PRSV)偶有發(fā)生,在田間常發(fā)生復(fù)合感染現(xiàn)象。針對(duì)這一具體情況,開(kāi)發(fā)簡(jiǎn)便、快捷、穩(wěn)定、實(shí)用以及能夠同時(shí)檢測(cè)多個(gè)病毒的技術(shù)用于生產(chǎn)上病毒病害發(fā)生動(dòng)態(tài)的監(jiān)測(cè),對(duì)于葫蘆科作物病毒病防控至關(guān)重要。

多重RT-PCR檢測(cè)技術(shù)最早由Chamberian等[11]于1988年提出,現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)各個(gè)領(lǐng)域,在植物病毒病的檢測(cè)中也已成為一種重要的檢測(cè)手段[12-16]。與其他檢測(cè)方法(生物學(xué)、血清學(xué)、電鏡觀察、單重 RT-PCR、核酸雜交等[17])相比,多重RT-PCR檢測(cè)技術(shù)具有諸多優(yōu)點(diǎn),它能在同一個(gè)PCR體系中同時(shí)擴(kuò)增多個(gè)目的基因,省時(shí),省力,效率高,特別是節(jié)省昂貴的實(shí)驗(yàn)試劑和珍貴的實(shí)驗(yàn)材料。由于葫蘆科病毒病的病原多,感染情況復(fù)雜,針對(duì)單一病毒的檢測(cè)方法已遠(yuǎn)遠(yuǎn)不能滿足檢測(cè)工作的需求,所以國(guó)內(nèi)外已有一些此類病毒的多重RTPCR檢測(cè)報(bào)道。王威麟等[18]針對(duì)西瓜上普遍發(fā)生的ZYMV、WMV、TMV、SqMV和CMV 5種病毒建立了一步RT-PCR檢測(cè)方法;趙麗等[19]建立了一種同時(shí)檢測(cè)葫蘆科作物3種主要病毒ZYMV、WMV和CMV的多重RT-PCR方法;Kwon等[20]用2個(gè)多重PCR系統(tǒng)檢測(cè)侵染韓國(guó)葫蘆科作物的7種病毒。根據(jù)前人的研究結(jié)果,本試驗(yàn)針對(duì)江蘇省葫蘆科作物病毒病發(fā)生的種類和特點(diǎn),建立一種適用于江蘇省葫蘆科作物病毒病檢測(cè)的多重RT-PCR方法,并對(duì)江蘇省各地采集的樣品進(jìn)行檢測(cè)應(yīng)用,以期為江蘇省葫蘆科作物病毒病害的發(fā)生動(dòng)態(tài)進(jìn)行長(zhǎng)期有效的監(jiān)測(cè),從而有針對(duì)性地采取防控措施。

1 材料與方法

1.1 毒源和試劑

WMV、ZYMV、CMV、CGMMV、TMV 和 PRSV 6種病毒的分離物于2012-2014年從江蘇省南京市、鹽城市鹽都區(qū)、徐州市、洪澤縣、淮安市等地發(fā)病的甜瓜、西葫蘆、西瓜、南瓜等上采集,通過(guò)6種病毒的血清學(xué)診斷試劑盒(Agdia公司)找到6種病毒單獨(dú)侵染的樣品,并在西葫蘆上接種繁殖,樣品保存于-70℃冰箱中???RNA提取試劑 Trizol購(gòu)自Invitrogen公司,Taq DNA 聚合酶、dNTP、BamHⅠ、SalⅠ購(gòu)自大連寶生物公司,反轉(zhuǎn)錄酶M-MLV、RNA酶抑制劑購(gòu)自Promega公司,瓊脂糖凝膠回收試劑盒、大腸桿菌(E.coli DH5ɑ)感受態(tài)細(xì)胞、pMD18-T載體購(gòu)自上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司。

1.2 總RNA提取

在單重RT-PCR中,分別稱取各病毒單獨(dú)侵染葉片0.1 g;在多重RT-PCR中,分別稱取等量單獨(dú)侵染6種病毒的葉片,WMV、ZYMV、CMV和CGMMV 4種葉片充分混合(標(biāo)記為H4),TMV和PRSV 2種葉片充分混合(標(biāo)記為H2),H4、H2各取0.1 g。單重和多重RT-PCR中,都以健康西葫蘆葉片為陰性對(duì)照(標(biāo)記為CK),也取0.1 g。葉片在冰浴條件下迅速?gòu)氐籽心?,然后用Trizol試劑盒按產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)提取總RNA。

1.3 引物設(shè)計(jì)與合成

根據(jù)GenBank上登錄的各病毒相對(duì)保守基因的序列,應(yīng)用Primer Premier 5.0軟件設(shè)計(jì)各病毒特異性引物。引物設(shè)計(jì)完成后,通過(guò)NCBI對(duì)其特異性進(jìn)行鑒定,結(jié)果表明均具有良好的特異性(表1)。引物由上海英俊生物技術(shù)公司合成。

表1 多重RT-PCR擴(kuò)增6種病毒的特異性引物Table 1 Specific primers for multiple RT-PCR detection of 6 viruses

1.4 單重RT-PCR

以 WMV、ZYMV、CMV、CGMMV、TMV 和 PRSV單一病毒的RNA為模版,oligodT18引物[21]反轉(zhuǎn)錄得到 cDNA第一鏈,反應(yīng)程序參照 M-MLV說(shuō)明書(shū),15.0 μl 反應(yīng)體系為:3.0 μl RNA,1.0 μl oligodT18(10 μmol/L),6.0 μl DEPC-ddH2O,65 ℃變性5 min,迅速置冰上5 min;再加入2.5 μl 5×RT buffer,0.5 μl dNTP( 各 2.5 mmol/L),0.5 μl RNase Inhibitor(40 U/μl) 和 0.5 μl M-MLV 反轉(zhuǎn)錄酶(200 U/μl),短暫離心后DEPC-ddH2O補(bǔ)足至 15.0 μl,42 ℃ 水浴 1 h,70 ℃ 滅活 5 min,置冰上待用。

25.00 μl PCR 標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系:15.75 μl ddH2O,2.50 μl 10 × PCR buffer(Mg2+free),1.50 μl MgCl2(25 mmol/L),2.00 μl dNTP Mixture(各 2.5 mmol/L),1.00 μl上游和下游引物混合物(各 10 μmol/L),0.25 μl r-Taq DNA 聚合酶(5 U/μl) 和2.00 μl cDNA模板。PCR反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性50 s,53℃退火50 s,72℃延伸1 min,循環(huán)35次;72℃延伸10 min。取5 μl PCR產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳,通過(guò)凝膠成像系統(tǒng)進(jìn)行觀察分析。

1.5 多重RT-PCR及體系優(yōu)化

多重RT-PCR分4重和2重2個(gè)反應(yīng)。4重和2重RT反應(yīng)體系:加入混合提取的4種和2種病毒的總 RNA(H4 和 H2)各 3.0 μl,同時(shí)將 1.0 μl oligodT18的反轉(zhuǎn)錄引物加入同一反應(yīng)管中,其他條件與單重RT相同。多重PCR體系在上述25.0 μl單重PCR標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系基礎(chǔ)上,4重PCR的4對(duì)引物混合物為4.00 μl[WMV和 CMV上下游引物各0.60 μl,ZYMV 和 CGMMV 上下游引物各 0.40 μl(各10 μmol/L)],2重 PCR 的2對(duì)引物混合物為2.00 μl[TMV 和 PRSV 上下游引物各0.5 μl(各10 μmol/L)],PCR反應(yīng)程序參數(shù)同上。取5 μl PCR產(chǎn)物進(jìn)行2%瓊脂糖凝膠電泳。

在有效mRT-PCR條件下,考察影響mPCR的主要因素,對(duì)某一因素進(jìn)行考察時(shí),其他因素不變。在試驗(yàn)過(guò)程中對(duì)Taq DNA聚合酶濃度分別設(shè)0.02 U/μl、0.04 U/μl、0.06 U/μl、0.08 U/μl、0.10 U/μl和0.12 U/μl 6個(gè)處理,Mg2+濃度分別設(shè) 1.0 mmol/L、2.0 mmol/L、3.0 mmol/L、4.0 mmol/L、5.0 mmol/L和6.0 mmol/L 6個(gè)處理,dNTPs濃度分別設(shè)0.10 mmol/L、0.25 mmol/L、0.40 mmol/L、0.55 mmol/L、0.70 mmol/L和 0.85 mmol/L 6 個(gè)處理,退火溫度分別設(shè)48℃、51℃、53℃、56℃、58℃和60℃,延伸時(shí)間分別設(shè)50 s、60 s、70 s、80 s、90 s和 100 s,循環(huán)次數(shù)設(shè)20、25、30、35、40 和45,進(jìn)行多重 RTPCR體系優(yōu)化。

1.6 多重RT-PCR產(chǎn)物的克隆和測(cè)序

多重RT-PCR擴(kuò)增DNA靶片段采用Axygen柱式膠回收試劑盒(上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司)回收,回收DNA溶于30 μl的溶解液中。回收產(chǎn)物與pMD18-T載體連接(參照pMD18-T試劑盒說(shuō)明書(shū))。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5ɑ感受態(tài)細(xì)胞,堿裂解法提取質(zhì)粒,經(jīng)PCR及酶切鑒定篩選重組質(zhì)粒。每個(gè)分離物挑選2個(gè)陽(yáng)性克隆進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司完成。

1.7 多重RT-PCR的靈敏度測(cè)定

取混合樣品H4和H2提取的病毒總RNA各5 μl,用BioPhotometer plus核酸蛋白檢測(cè)儀測(cè)定OD260和OD280,計(jì)算各自總RNA濃度。分別以100、10-1、10-2、10-3、10-4和 10-5的倍數(shù)進(jìn)行稀釋,用建立的4重和2重RT-PCR方法進(jìn)行檢測(cè),觀察結(jié)果,分析2種多重RT-PCR方法檢測(cè)的靈敏度。

1.8 多重RT-PCR的檢測(cè)應(yīng)用

應(yīng)用建立的2種多重RT-PCR方法對(duì)2014年采自江蘇省13個(gè)市縣的210份葫蘆科作物發(fā)病樣品進(jìn)行檢測(cè),并隨機(jī)挑選15個(gè)樣品用單重RT-PCR方法進(jìn)行驗(yàn)證,分析江蘇省葫蘆科作物病毒病的種類及分布狀況。

2 結(jié)果與分析

2.1 多重RT-PCR的特異性

用單重、4重和2重RT-PCR法分別從6種病毒單獨(dú)侵染、4種病毒混合侵染(H4)、2種病毒混合侵染(H2)的組織中擴(kuò)增出單一、4條或2條特異性目標(biāo)條帶,大小約為390 bp、480 bp、670 bp、1 200 bp、330 bp和400 bp,擴(kuò)增條帶的大小與待檢6種病毒基因預(yù)期條帶大小基本一致;陰性對(duì)照沒(méi)有擴(kuò)增出任何條帶,且均未出現(xiàn)非特異性條帶(圖1)。結(jié)果表明:4重和2重RT-PCR具有較高的特異性,在 4重 RT-PCR中檢測(cè)到 CMV、WMV、CGMMV和 ZYMV,在2重 RT-PCR中檢測(cè)到TMV和PRSV,且兩步反應(yīng)中的各條帶大小間有差異,可以明顯地進(jìn)行區(qū)分。

2.2 多重RT-PCR主要影響因素的優(yōu)化

2.2.1 多重RT-PCR反應(yīng)體系的優(yōu)化 為了摸索出既高效又經(jīng)濟(jì)的多重RT-PCR擴(kuò)增體系,在保證2個(gè)反應(yīng)體系中都有足夠量的r-Taq DNA聚合酶和dNTPs的基礎(chǔ)上,設(shè)置 dNTPs、r-Taq DNA聚合酶、Mg2+的濃度梯度。結(jié)果(圖2)表明:當(dāng)dNTPs濃度在0.25~0.85 mmol/L時(shí),4重和2重PCR都能產(chǎn)生較好的條帶;當(dāng)r-Taq DNA聚合酶濃度為0.10~0.12 U/μl時(shí),4重PCR能擴(kuò)增出4條帶,2重PCR能擴(kuò)增出2條帶,濃度越高條帶越亮;當(dāng)Mg2+濃度達(dá)到3.0 mmol/L時(shí),4重和2重PCR都能分別較好地?cái)U(kuò)增出4條和2條特異性條帶,隨濃度增加條帶變亮,但4重PCR中濃度增加到一定值后反而減弱了mRT-PCR的擴(kuò)增效果。因此優(yōu)化后的4重和2重反應(yīng)體系各參數(shù)最終都確定為:dNTPs濃度0.25 mmol/L,r-Taq DNA 聚合酶濃度為 0.10 U/μl,Mg2+濃度3.0 mmol/L。

圖1 多重RT-PCR的特異性Fig.1 Specificity of multiple RT-PCR

2.2.2 多重RT-PCR反應(yīng)條件的優(yōu)化 對(duì)4重和2重PCR的退火溫度、循環(huán)次數(shù)和延伸時(shí)間都進(jìn)行了優(yōu)化。結(jié)果(圖3)顯示,4重PCR的退火溫度從53℃到58℃都能獲得理想的條帶,但61℃時(shí)擴(kuò)增效果變?nèi)?循環(huán)數(shù)在 30~40次時(shí)擴(kuò)增的條帶都較清晰,延伸時(shí)間80 s時(shí)PCR條帶的亮度最為合適。2重PCR的退火溫度從53℃到61℃時(shí)條帶都較為清晰;循環(huán)數(shù)25~35次時(shí)均能獲得特異而清晰的目的條帶;延伸時(shí)間從50 s到80 s均能同時(shí)出現(xiàn)2條帶,但在60s時(shí)條帶最清晰。因此最終確定多重RT-PCR反應(yīng)的條件為:4重PCR的退火溫度為53℃,循環(huán)次數(shù)35次,延伸時(shí)間80 s;2重PCR的退火溫度為56℃,循環(huán)次數(shù)30次,延伸時(shí)間60 s。

圖2 多重RT-PCR反應(yīng)體系的優(yōu)化Fig.2 Optimization for the reaction conditions of mRT-PCR

圖3 多重RT-PCR反應(yīng)條件參數(shù)的優(yōu)化Fig.3 Optimization for the reaction conditions of mRT-PCR

2.3 多重RT-PCR產(chǎn)物的序列分析

4重和2重RT-PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)割膠回收,分別與pMD 18-T vector進(jìn)行體外連接,挑取陽(yáng)性克隆,提取質(zhì)粒測(cè)序。測(cè)序結(jié)果表明,ZYMV、WMV、CMV、CGMMV、TMV和PRSV的擴(kuò)增產(chǎn)物序列分別由1 180、485、389、660、410 和325 個(gè)核苷酸組成,與設(shè)計(jì)的PCR產(chǎn)物大小相同,分別為ZYMV-cp基因、WMV-cp基因、CMV-復(fù)制酶基因、CGMMV-cp基因、TMV-cp基因和PRSV-cp基因的部分序列。序列同源性分析結(jié)果表明,所得序列與GenBank中參考序列的同源性分別達(dá)到98.25% 、99.01%、99.93%、98.22%、97.33%和99.32%,證明了2種多重RTPCR檢測(cè)結(jié)果的可靠性。

2.4 多重RT-PCR的靈敏度

經(jīng)核酸蛋白檢測(cè)儀測(cè)定H4和H2的RNA濃度分別為 35.60 μg/μl和 19.33 μg/μl。靈敏度檢測(cè)結(jié)果(圖4)顯示,4重RT-PCR中RNA稀釋倍數(shù)為10-2后有些病毒的條帶微弱或消失,這可能與組織中病毒含量的過(guò)低有關(guān),所以能夠同時(shí)檢測(cè)到4條清晰條帶的最大稀釋倍數(shù)為10-2,也即該體系中4重RT-PCR的RNA檢測(cè)濃度為0.356 μg/μl;2重RT-PCR中RNA稀釋倍數(shù)為10-3時(shí)能夠同時(shí)檢測(cè)到2條清晰的條帶,所以該體系中2重RT-PCR的RNA檢測(cè)濃度為19.33 ng/μl。

圖4 2個(gè)多重RT-PCR的靈敏度Fig.4 The sensitivities of two mRT-PCR techniques

2.5 多重RT-PCR的檢測(cè)應(yīng)用

應(yīng)用建立的2種多重RT-PCR方法對(duì)采自江蘇省13個(gè)市縣210份葫蘆科作物病樣進(jìn)行檢測(cè)。首先隨機(jī)選出15個(gè)病樣分別進(jìn)行單重RT-PCR檢測(cè),再進(jìn)行2種多重RT-PCR檢測(cè)(圖5)。將檢測(cè)圖譜進(jìn)行比較,結(jié)果顯示各樣品多重RT-PCR檢測(cè)結(jié)果與單重RT-PCR結(jié)果相一致,說(shuō)明建立的2種多重RT-PCR方法可應(yīng)用于田間樣品的檢測(cè)。田間樣品檢測(cè)結(jié)果(表2)表明,210份檢測(cè)樣品中單獨(dú)侵染率僅為24.76%,復(fù)合侵染率達(dá)75.24%,其中有3個(gè)病樣為6種病毒的復(fù)合侵染。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)江蘇省13個(gè)市縣葫蘆科作物病毒的種類以ZYMV和CGMMV為主,主要分布在西瓜、南瓜、葫蘆、甜瓜等作物上,WMV和CMV次之,主要分布在黃瓜、甜瓜、南瓜等作物上,TMV和PRSV只在極少數(shù)作物上檢測(cè)到,主要在絲瓜、南瓜等上。6種病毒沒(méi)有明顯的地域分布傾向,究其原因可能與這幾種病毒的傳播途徑有關(guān)。

表2 田間210份葫蘆科作物病樣多重RT-PCR檢測(cè)結(jié)果Table 2 Detection results of 210 naturally infected samples collected from fields by multiplex RT-PCR

圖5 多重RT-PCR的檢測(cè)應(yīng)用Fig.5 The detection of six viruses in Cucurbit crops by mRT-PCR

3 討論

江蘇省是農(nóng)業(yè)大省,近年來(lái)設(shè)施農(nóng)業(yè)迅猛發(fā)展,據(jù)統(tǒng)計(jì)近幾年江蘇省葫蘆科作物的種植面積每年穩(wěn)定在400 000 hm2左右,其中西瓜和甜瓜種植面積約130 000 hm2,已經(jīng)成為江蘇省農(nóng)業(yè)的支柱產(chǎn)業(yè)之一。設(shè)施農(nóng)業(yè)的發(fā)展,使病毒及其傳毒蚜蟲(chóng)在棚內(nèi)順利越冬后,在早春即散布于棚外并大量復(fù)制和繁殖,從而導(dǎo)致病害的提前發(fā)生和生長(zhǎng)季節(jié)早期病毒累積量的偏高,形成惡性循環(huán)。以上因素加大了病毒病的發(fā)生頻率,提高了流行風(fēng)險(xiǎn),從而加重了病害。根據(jù)前期我們對(duì)江蘇省設(shè)施大棚中葫蘆科作物病毒病的調(diào)查,發(fā)現(xiàn)4種主要病毒(ZYMV、WMV、CMV、CGMMV)對(duì)葫蘆科作物種植業(yè)造成的危害日趨嚴(yán)重,2種次要病毒(TMV和PRSV)的危害也不容忽視。本研究根據(jù)江蘇省葫蘆科作物生產(chǎn)上病毒病的發(fā)生情況,建立了能同時(shí)檢測(cè)這6種病毒的多重RT-PCR方法,在葫蘆科作物的栽培生產(chǎn)中,能夠既快速、準(zhǔn)確,又簡(jiǎn)便、經(jīng)濟(jì)地檢測(cè)出幼苗帶毒情況。對(duì)控制病害在田間的發(fā)生,減少經(jīng)濟(jì)損失,抗病篩選和病害流行預(yù)測(cè)具有十分重要的意義。

考慮到6種病毒的特點(diǎn)和數(shù)量,將其檢測(cè)分成2個(gè)RT-PCR反應(yīng)進(jìn)行,一個(gè)PCR反應(yīng)中同時(shí)檢測(cè)4種主要病毒(WMV、ZYMV、CMV、CGMMV),另一個(gè)RT-PCR反應(yīng)中同時(shí)檢測(cè)2種次要病毒(TMV和PRSV)。該方法的關(guān)鍵因素為特異性引物的選擇,首先使用DNAMAN5.0軟件,對(duì)GenBank中收錄的WMV、ZYMV、CMV、CGMMV、TMV 和 PRSV 病毒各株系、各區(qū)域分離物全基因組序列進(jìn)行比對(duì),確定病毒序列中相對(duì)保守區(qū)域,在選定的保守區(qū)域內(nèi)使用Oligo5.0軟件設(shè)計(jì)引物,再通過(guò)BLAST分析確保引物的特異性,還利用DNAStar 5.0對(duì)這6對(duì)引物進(jìn)行了同源性、二級(jí)結(jié)構(gòu)分析,以避免2個(gè)多重RTPCR反應(yīng)引物之間形成復(fù)雜的二級(jí)結(jié)構(gòu)及引物二聚體而影響擴(kuò)增效果,最終選擇了G+C含量為45% ~60%、退火溫度相近、擴(kuò)增片段大小易區(qū)分的6對(duì)引物。在反轉(zhuǎn)錄中選擇了OligodT18作為其引物,此引物較為適合植物樣品RNA的反轉(zhuǎn)錄,能夠較為完整地保留cDNA基礎(chǔ)含量,特異性較高,而且只需一次反轉(zhuǎn)錄,大大節(jié)省了時(shí)間和實(shí)驗(yàn)材料。在2個(gè)RT-PCR反應(yīng)中又整合優(yōu)化了各自體系所需的引物、Mg2+、DNA聚合酶、dNTPs濃度,以及退火溫度、延伸溫度和循環(huán)數(shù),對(duì)各自PCR體系的靈敏度進(jìn)行了測(cè)定,最終建立了6種病毒多重RT-PCR的方法。用此方法對(duì)江蘇的210份葫蘆科作物病樣進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果顯示多重RT-PCR和單重RT-PCR檢測(cè)結(jié)果相當(dāng),充分說(shuō)明了多重RT-PCR方法的實(shí)用性。跟蹤監(jiān)測(cè)2014年江蘇省設(shè)施大棚中葫蘆科作物的病毒種類,發(fā)現(xiàn)主要以種子傳播的CGMMV和ZYMV病毒為主,提示我們此病害的控制應(yīng)從源頭出發(fā),對(duì)種子和幼苗進(jìn)行早期檢測(cè)和處理,也體現(xiàn)了快捷、高效、低成本檢測(cè)方法研制的必要性。

本研究根據(jù)江蘇省生產(chǎn)上葫蘆科作物易受多種病毒復(fù)合侵染的特點(diǎn),選擇性地對(duì)這些病毒進(jìn)行了2種多重RT-PCR篩選鑒定,較之單一RT-PCR方法具有能節(jié)省時(shí)間、降低成本、提高效率等優(yōu)點(diǎn)。以往報(bào)道的5重及以上RT-PCR方法[12-16]在實(shí)際應(yīng)用過(guò)程中存在干擾因素多、靈敏度低和檢出率低等缺陷,本方法能夠減少污染和反應(yīng)中的影響因素,提高檢測(cè)靈敏度,大大降低漏檢幾率。在葫蘆科作物的生產(chǎn)上,本方法可實(shí)現(xiàn)對(duì)病毒病的早期診斷,實(shí)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)室內(nèi)對(duì)病毒病害種類的快速、高效、低成本、大批量檢測(cè),對(duì)病害的流行預(yù)測(cè)預(yù)報(bào)具有十分重要的意義。

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