武警北京市總隊第三醫(yī)院檢驗(yàn)科(北京100141)
王述蓮 鄧中平△ 呼建民 戴立忠△ 黃基容 王 軍△ 艾穎娟△
人類巨細(xì)胞病毒(Human cytomegalovirus,HCMV)亦稱細(xì)胞包涵體病毒,為皰疹病毒科β屬的雙螺旋DNA病毒,由于感染的細(xì)胞腫大,并具有巨大的核內(nèi)包涵體,所以稱為巨細(xì)胞病毒。HCMV的感染途徑主要為接觸、輸血、宮內(nèi)和產(chǎn)道等,感染較常見于胎兒、新生兒、孕婦等,孕婦感染可致新生兒先天畸形[1]。當(dāng)機(jī)體免疫缺陷或免疫系統(tǒng)處于抑制狀態(tài)下,極易受HCMV感染,如器官移植后接受免疫抑制治療、惡性腫瘤化療后、艾滋病患者等,這些患者一旦感染,常致較高的病死率和嚴(yán)重的疾?。?]。
目前國內(nèi)外已有基于實(shí)時熒光定量PCR技術(shù)定量檢測HCMV-DNA的試劑盒應(yīng)用于臨床檢測中,但這些試劑盒多半以煮沸法提取核酸,且其檢測靈敏度不高,約在10000copies/ml左右;另外,這些試劑盒大多缺乏完善的質(zhì)控體系,還需要進(jìn)一步完善和提高技術(shù)水平,使此類產(chǎn)品更加滿足臨床準(zhǔn)確診斷的需要。
最近,新出現(xiàn)了一種人巨細(xì)胞病毒核酸定量檢測試劑盒(PCR-熒光探針法),它完全免去了核酸提取中煮沸過程。根據(jù)其說明,HCMV核酸濃縮后經(jīng)核酸釋放劑裂解,全部釋放參與到PCR反應(yīng)中,整個過程無污染、操作極其簡單、迅速。本研究擬通過檢測臨床樣本,將其與市場上的煮沸試劑進(jìn)行比對,來評估這一新方法準(zhǔn)確性及特異性。
1 研究對象 本次研究共檢測血清樣本192例,其中男性97例(50.5%),女性95(49.5%),年齡0d至37歲,-20℃冰箱保存。
2 主要試劑和儀器 試劑購自湖南圣湘生物科技有限公司,采用濃縮一步法技術(shù)處理樣本(以下簡稱“新型試劑”或“濃縮一步法試劑”),具有內(nèi)標(biāo)監(jiān)控假陰性,最低檢測限為400copies/ml;同時,選擇一種臨床使用較多的國產(chǎn)HCMV核酸檢測試劑,采用煮沸法提取樣本核酸,沒有內(nèi)標(biāo)監(jiān)控,作為對照試劑,最低檢測限為1000copies/ml。核酸擴(kuò)增儀采用美國Applied Biosystems公司的ABI7500實(shí)時熒光定量PCR儀。
3 方 法 采用兩種熒光定量PCR檢測試劑對192例臨床樣本(每例樣本一分為三,保留一份樣本作為復(fù)檢)進(jìn)行檢測,方法如下:
煮沸法:取50μl臨床樣本,加入50μl DNA提取液充分混勻,100℃恒溫處理10min,12 000rpm 離心5min備用;取5μl作為PCR反應(yīng)的模板,加入分裝有PCR反應(yīng)液的反應(yīng)管中上機(jī)檢測。
濃縮一步法:取100μl血清樣本,加入等體積的濃縮液,12 000rpm離心5min,棄上清,加入50μl核酸釋放劑,用槍頭挑起沉淀,吸打幾次,將沉淀打散混勻靜置10min作為待測樣本備用。在PCR反應(yīng)管中加入10μl待檢樣本,吸打混勻,加入40μl PCR反應(yīng)液,吸打混勻上機(jī)檢測即可。
4 統(tǒng)計學(xué)方法 數(shù)據(jù)進(jìn)行一致性分析,靈敏度、特異度分析和Kappa檢驗(yàn)一致性分析。
1 擴(kuò)增曲線對比:兩種試劑對比檢測結(jié)果表明:濃縮一步法試劑檢測樣本擴(kuò)增效率高,擴(kuò)增曲線挺拔美觀,呈典型的“S”型;體系中含有內(nèi)標(biāo),內(nèi)標(biāo)曲線整齊集中,可以很好的判斷檢測樣本中是否具有PCR抑制物,避免假陰性。
2 根據(jù)煮沸法試劑檢測結(jié)果將臨床樣本分為陽性組和陰性組,統(tǒng)計結(jié)果見表1。
表1 煮沸法試劑與濃縮一步法試劑檢測結(jié)果統(tǒng)計表
3 濃縮一步法試劑與煮沸法試劑檢測結(jié)果的一致性分析:總一致性百分比符合率=(a+d)/(a+b+c+d)=(101+85)/192×100%=96.88%,用SPSS統(tǒng)計學(xué)軟件進(jìn)行一致性檢驗(yàn),Kappa值等于0.973,說明兩方法高度一致。
4 濃縮一步法試劑與HCMV-pp65抗原結(jié)果的對比統(tǒng)計分析,見表2。
表2 濃縮一步法試劑的準(zhǔn)確性評價
靈敏度Se=a/(a+c)×100%=80/(80+8)×100%=90.91%;特異度Sp=d/(b+d)×100%=79/(25+79)×100%=75.96%;靈敏度Se+特異度Sp=90.91%+75.96%=166.87%>100%。
5 煮沸法試劑與HCMV-pp65抗原結(jié)果的對比統(tǒng)計分析,見表3。
表3 煮沸法試劑的準(zhǔn)確性評價
6 不符樣本的復(fù)核結(jié)果及其分析:根據(jù)結(jié)果,有6例樣本(樣本信息見表4)濃縮一步法試劑與煮沸法試劑檢測結(jié)果不符,其中4例(編號分別為:230814、231061、231128以及231952)煮沸法試劑檢測為陰性(檢測濃度處于400~1000copies/ml且樣本性狀相對復(fù)雜),而濃縮一步法試劑檢測為陽性(檢測濃度高于400copies/ml);另2例(編號為230949、231812)煮沸法試劑檢測為陽性,而濃縮一步法試劑檢測為陰性。在兩個試劑盒的靶基因擴(kuò)增區(qū)域外圍序列,設(shè)計引物對,對這6例樣本進(jìn)行PCR擴(kuò)增,克隆測序復(fù)核,結(jié)果4例濃縮一步法試劑檢測為陽性的樣本測序結(jié)果均包含HCMV-DNA序列,可能其靈敏度較之煮沸法試劑更高或抗干擾能力更強(qiáng);而煮沸法試劑檢測陽性的2例樣本無PCR擴(kuò)增片段,懷疑為交叉污染所致。
表4 6例不符樣本臨床信息表
應(yīng)用Kappa評價方法對濃縮一步法試劑和煮沸法試劑檢測結(jié)果進(jìn)行診斷一致性分析,檢驗(yàn)水準(zhǔn)為α=0.05。對Kappa值的參考評價原則如下:0.75<κ≤1時,診斷一致性好;0.4<κ≤0.75時,診斷一致性一般;0≤κ≤0.4時,診斷一致性差。經(jīng)SPSS15.0軟件Kappa檢驗(yàn)的輸出結(jié)果顯示,Kappa值=0.973,P=1.000。α=0.05檢驗(yàn)水準(zhǔn)下,濃縮一步法試劑與煮沸法試劑檢測結(jié)果的一致性有統(tǒng)計學(xué)意義,診斷一致性好。
HCMV感染常用的實(shí)驗(yàn)室診斷方法有血清學(xué)檢查、抗原血癥檢測及基于PCR技術(shù)的檢測方法等。血清學(xué)方法很多,酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)是最常用的方法,有靈敏度高、特異性好和重復(fù)性好等長處,方法簡單,不需要特殊儀器,但該方法靈敏度明顯不如抗原血癥檢測,且不利于早期診斷。最常用于抗原血癥檢測的抗原為pp65,它是HCMV活動性感染的早期標(biāo)志性產(chǎn)物,是目前監(jiān)測HCMV活動性感染和指導(dǎo)抗病毒治療的重要方法,但是pp65抗原血癥檢測僅適合于血標(biāo)本,且標(biāo)本要求及時處理。PCR技術(shù)由于高靈敏度、高特異性、快速、簡便等優(yōu)點(diǎn),使其為人巨細(xì)胞病毒的檢測提供了又一新的途徑。定量PCR的出現(xiàn),打破PCR只能定性的局面,其中熒光定量PCR以其高靈敏度、高特異性、低污染率、實(shí)時監(jiān)測等特點(diǎn),可為臨床提供更加準(zhǔn)確、客觀的檢測結(jié)果,并及時地了解病情及預(yù)后[4]。目前國內(nèi)臨床上主要采用煮沸法對人巨細(xì)胞病毒的核酸進(jìn)行提取,具體是先將樣本高速離心,再加裂解液,煮沸,高速離心,取上清為模板。該方法核酸提取過程較復(fù)雜,樣本處理耗時長,且在處理樣本時,經(jīng)過煮沸裂解、高速離心富集DNA等多個步驟,樣本中的DNA存在損耗,同時由于采用了水浴或金屬浴的高溫加熱步驟,容易造成氣溶膠污。
本研究對人巨細(xì)胞病毒熒光定量PCR檢測方法與常規(guī)的煮沸法進(jìn)行對比研究。整個臨床試驗(yàn)過程均在嚴(yán)格控制下進(jìn)行,由經(jīng)專門培訓(xùn)的測試人員進(jìn)行檢測分析。用濃縮一步法檢測,處理簡單,無需加熱,可大大減少污染的發(fā)生,擴(kuò)增和熒光檢測均由儀器自動進(jìn)行,通過查看樣本的Ct值判斷陰陽性。
本次研究共檢測樣本192例,根據(jù)煮沸法試劑檢測結(jié)果分為兩組:其中陽性組103例,陰性組89例。新型人巨細(xì)胞病毒核酸檢測試劑與煮沸法試劑的陽性一致性百分比98.06%,陰性一致性百分比95.51%,總一致性百分比96.88%;對6例不符樣本的復(fù)核結(jié)果表明:6例樣本的測序結(jié)果均與新型試劑相符。對復(fù)核后的結(jié)果進(jìn)行Kappa檢驗(yàn)一致性分析:結(jié)果Kappa值=0.973,表明新型試劑與煮沸法試劑及復(fù)核檢測的結(jié)果具有很好的一致性。在與HCMV-pp65抗原檢測結(jié)果的對比中,兩種試劑均表現(xiàn)出較好的準(zhǔn)確性。
整個品評過程發(fā)現(xiàn),濃縮一步法的樣本處理和檢驗(yàn)過程在一個離心管和一個PCR反應(yīng)管中即可完成,樣本中的核酸在濃縮液和核酸釋放劑的作用下釋放并參與到PCR反應(yīng)過程中,只需一次離心,無需加熱,抗污染能力強(qiáng),操作過程簡單,實(shí)驗(yàn)結(jié)果的重復(fù)性大大提高,對操作人員的技術(shù)要求較低。濃縮一步法還可以節(jié)省檢驗(yàn)時間,可以讓臨床醫(yī)生及患者及早得到診斷結(jié)果,避免等待試驗(yàn)結(jié)果的焦慮。從兩種試劑的擴(kuò)增曲線來看濃縮一步法試劑檢測樣本擴(kuò)增效率高,擴(kuò)增曲線平滑、挺拔美觀,呈典型的“S”型;體系中含有內(nèi)標(biāo),內(nèi)標(biāo)曲線整齊集中,曲線優(yōu)美。
通過本次對比品評可以看出,濃縮一步法擴(kuò)增檢測方法操作極其簡單,減少污染環(huán)節(jié),有內(nèi)標(biāo)監(jiān)控假陰性,結(jié)果準(zhǔn)確,比已上市的煮沸法試劑具更好的靈敏度和準(zhǔn)確性,具有較高的臨床應(yīng)用價值。
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