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濟(jì)南小清河水樣細(xì)菌的分離、分子鑒定及對(duì)污染河水的修復(fù)作用

2014-12-23 03:04岳壽松邊斐鄒曉鳳王翠萍孫林波田順孫凱陳文娟
山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年11期
關(guān)鍵詞:分子鑒定細(xì)菌

岳壽松+邊斐+鄒曉鳳+王翠萍+孫林波+田順+孫凱+陳文娟

摘 要:從濟(jì)南小清河水樣中共獲得不同菌落特征的細(xì)菌微生物13種,利用分子生物學(xué)方法對(duì)培養(yǎng)得到的菌株進(jìn)行分子鑒定及系統(tǒng)發(fā)育分析,結(jié)果表明:13株微生物分屬于8個(gè)屬,分別為腸桿菌屬(Enterobacter)、氣單胞菌屬(Aeromonas)、克雷伯氏菌屬 (Klebsiella)、微桿菌屬(Microbacterium)、希瓦氏菌屬(Shewanella)、金黃桿菌屬(Chryseobacterium)、芽孢桿菌屬(Bacillus)、枸櫞酸桿菌屬(Citrobacter)和寡養(yǎng)單胞菌屬(Stenotrophomonas)。研究了地衣芽孢桿菌QH11和嗜麥芽寡養(yǎng)(窄食)單胞菌QH13對(duì)水體化學(xué)需氧量(CODCr)和氨氮(NH3-N)的去除作用,結(jié)果表明,處理5天后,QH11對(duì) CODCr和NH3-N的去除率分別為70.6%和84.8%, QH13的去除率分別為58.5%和52.3%。

關(guān)鍵詞:小清河;細(xì)菌;分子鑒定;生物修復(fù)

中圖分類號(hào):S182:X522 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A 文章編號(hào):1001-4942(2014)11-0063-05

小清河發(fā)源于濟(jì)南市,全長(zhǎng)237 km,其中濟(jì)南河段位于城區(qū)北部,是省城主城區(qū)唯一的防洪除澇和排污河道[1]。小清河為典型城市內(nèi)河,已成為濟(jì)南市城市生態(tài)系統(tǒng)重要的組成部分。近幾十年來(lái),隨著城市化進(jìn)程的不斷加快,城市人口聚集,經(jīng)濟(jì)活動(dòng)日趨頻繁,工業(yè)廢水和生活污水大量排放,河水污染逐漸加重,不但制約城市的社會(huì)、經(jīng)濟(jì)與環(huán)境可持續(xù)發(fā)展,同時(shí)危及人類身體健康。

河道水體是一個(gè)復(fù)雜的生態(tài)系統(tǒng),微生物為生態(tài)系統(tǒng)中的重要組成部分。水體中的微生物種群分布與區(qū)域環(huán)境有著密切聯(lián)系,在物質(zhì)循環(huán)與能量流動(dòng)中發(fā)揮著非常重要的作用[2~4]。河水污染產(chǎn)生的有害氣味以及主要污染指標(biāo)總氮(TH)和總磷(TP)含量等均與水體微生物的種群特點(diǎn)密切相關(guān)[5,6]。微生物對(duì)水體凈化具有重要作用,水體污染的微生物修復(fù)技術(shù)越來(lái)越受重視。在污染水體中,微生物經(jīng)過(guò)馴化后大量繁殖,通過(guò)其代謝作用將水體中有害的無(wú)機(jī)物、部分復(fù)雜的有機(jī)物分解為簡(jiǎn)單的、穩(wěn)定的無(wú)毒物質(zhì),增強(qiáng)水體的自凈能力[7~10]。與其他治污方法相比,微生物修復(fù)技術(shù)沒(méi)有二次污染、效果穩(wěn)定、持續(xù)時(shí)間長(zhǎng),有利于自然生態(tài)的恢復(fù)。根據(jù)不同水體特點(diǎn)篩選功能微生物,對(duì)提高污染修復(fù)的效率和效益具有重要意義。

本研究對(duì)濟(jì)南小清河河水細(xì)菌進(jìn)行分離培養(yǎng),并利用16S rDNA序列分析進(jìn)行鑒定與系統(tǒng)發(fā)育分析,篩選具有降低水體CODCr和氨氮含量的微生物,為濟(jì)南小清河水質(zhì)改善提供理論依據(jù),同時(shí)為城市河道污染的原位修復(fù)提供基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 樣品采集及細(xì)菌分離純化

水樣采集于濟(jì)南小清河還鄉(xiāng)店位點(diǎn)。取樣時(shí)間2013年6月19日,為雨季到來(lái)前的枯水期,河水水質(zhì)較差。利用LB培養(yǎng)基分別對(duì)水樣原液、10-1、10-2和10-3梯度稀釋液平板涂布法培養(yǎng),培養(yǎng)溫度37℃,培養(yǎng)時(shí)間48 h。選取典型菌落,記錄其形態(tài)特點(diǎn),革蘭氏染色觀察菌株形態(tài)。純化菌株進(jìn)行分子鑒定和系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析。

1.2 細(xì)菌16S rDNA基因的克隆、測(cè)序

DNA提取、酶切、連接和轉(zhuǎn)化等操作方法參照文獻(xiàn)[11]。擴(kuò)增引物上游P1:5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′;下游P2:5′-TACGGCTACCTTGTTACGACT-3′。PCR條件:95℃ 5 min;94℃ 40 s, 55℃ 40 s, 72℃ 2 min,30個(gè)循環(huán);72℃ 10 min。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)膠回收后克隆至pMD18-T載體,轉(zhuǎn)化E. coli DH5α,將陽(yáng)性克隆送北京博尚生物公司測(cè)序。

1.3 系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建

將16S rDNA序列與GenBank已知核酸序列進(jìn)行BLAST分析。把與該序列同源性較高的已知菌株的16S rDNA基因序列,用ClustalX 1.83進(jìn)行多序列比對(duì),采用Neighbor-Joining方法,通過(guò)MEGA 5.10軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。

1.4 細(xì)菌對(duì)污染河水的修復(fù)作用

1.4.1 試驗(yàn)菌種 地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis)、短小芽孢桿菌(Bacillus pumilus)和嗜麥芽寡養(yǎng)(窄食)單胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)均分離自小清河水樣。液體培養(yǎng)繁殖,調(diào)節(jié)菌液濃度為108 cfu/mL,4℃冰箱儲(chǔ)存?zhèn)溆谩?/p>

1.4.2 菌株對(duì)河水CODCr、氨氮的去除作用 4 L反應(yīng)器(直徑15 cm)加入3.7 L小清河水樣。按1‰量(V/V)加入各菌劑,對(duì)照不加菌劑。每天測(cè)定CODCr和氨氮含量。CODCr采用重酪酸鉀法測(cè)定,氨氮采用納氏比色法測(cè)定。

2 結(jié)果與分析

2.1 小清河水樣細(xì)菌分離

利用LB培養(yǎng)基對(duì)小清河水樣中的細(xì)菌進(jìn)行分離與培養(yǎng),從各梯度培養(yǎng)基共選取13種典型菌落,記錄菌落形態(tài)特點(diǎn),革蘭氏染色觀察菌株形態(tài)(表1)。

2.2 小清河水樣細(xì)菌分子鑒定

利用引物P1/P2進(jìn)行PCR擴(kuò)增,獲得菌株QH01~QH13的16S rDNA。PCR產(chǎn)物連接到pMD18-T質(zhì)粒進(jìn)行測(cè)序分析,得到每一菌株的16S rDNA序列全長(zhǎng),將序列提交至GenBank進(jìn)行BLAST比對(duì),結(jié)果見(jiàn)表2。

2.3 系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建

進(jìn)一步利用生物軟件ClustalX 1.83和MEGA 5.10、采用鄰接法(neighbor-joining method)構(gòu)建16S rDNA系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),以自展分析 (bootstraping) 法評(píng)估發(fā)育樹(shù),去除置信度低于50%的分支。結(jié)果(圖1)表明,菌株QH02、QH06和QH10親緣關(guān)系較近,為氣單胞菌屬(Aeromonas)。其中QH02與嗜水氣單胞菌A. hydrophila CECT-5745最近緣、QH06與豚鼠氣單胞菌A. caviae P087最近緣、QH10 與A. caviae SCSB1最近緣。QH03與克雷伯氏菌聚在一群,且與Klebsiella sp. HE1最近緣。QH01與腸桿菌屬Enterobacter聚為一族,與霍氏腸桿菌E. hormaechei ASU-001 近緣。QH12 與枸櫞酸桿菌屬(Citrobacter) 聚為一族,與弗氏枸櫞酸桿菌C. freundii MRB070408-1最近緣。QH07與希瓦氏菌屬(Shewanella)聚為一族,與腐敗希瓦氏菌S. putrefaciens Hac334近緣。QH13 與寡養(yǎng)單胞菌(Stenotrophomonas)聚為一族,與嗜麥芽寡養(yǎng)(窄食)單胞菌S. maltophilia YSP48近緣。QH09和QH11與芽孢桿菌屬(Bacillus)聚為一族,QH09與短小芽孢桿菌B. pumilus N0819 最近緣,QH11與地衣芽孢桿菌B. licheniformis KVR最近緣。QH04和QH05與微桿菌屬(Microbacterium)聚為一族,QH04與微桿菌Microbacterium sp. Long-2最近緣,QH05與磚紅色微桿菌M. testaceum IARI-BHI-3最近緣。QHO8與金黃桿菌屬(Chryseobacterium)聚為一族,與C. taeanense ARB-2 最近緣。系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析結(jié)果與BLAST比對(duì)結(jié)果一致。endprint

2.4 不同菌株對(duì)污染河水的修復(fù)作用

2.4.1 不同菌株對(duì)河水CODCr的去除作用 研究了地衣芽孢桿菌QH11、短小芽孢桿菌QH09和嗜麥芽寡養(yǎng)(窄食)單胞菌QH13對(duì)水體CODCr含量的影響。加入菌劑2天后水體CODCr下降趨勢(shì)明顯,到第5天時(shí),與對(duì)照相比,各處理的水體CODCr去除率分別為地衣芽孢桿菌70.6%、嗜麥芽寡養(yǎng)(窄食)單胞菌58.5%、短小芽孢桿菌48.5%(圖2)。地衣芽孢桿菌和嗜麥芽寡養(yǎng)(窄食)單胞菌表現(xiàn)了明顯的水體CODCr清除能力。

2.4.2 不同菌株對(duì)河水氨氮(NH3-N)的去除作用 不同菌株處理水體NH3-N含量變化趨勢(shì)不同。各菌株對(duì)水體NH3-N均有去除作用。與對(duì)照相比,去除率分別為地衣芽孢桿菌84.8%、嗜麥芽寡養(yǎng)(窄食)單胞菌52.3%、短小芽孢桿菌39.4%(圖3)。地衣芽孢桿菌和嗜麥芽寡養(yǎng)(窄食)單胞菌表現(xiàn)了較強(qiáng)的降低水體氨氮的能力。

濟(jì)南小清河水樣中分離鑒定的13株細(xì)菌微生物分屬于8個(gè)屬,分別為腸桿菌屬(Enterobacter)、氣單胞菌屬(Aeromonas)、克雷伯氏菌屬 (Klebsiella)、微桿菌屬(Microbacterium)、希瓦氏菌屬(Shewanella)、金黃桿菌屬(Chryseobacterium)、芽孢桿菌屬(Bacillus)、枸櫞酸桿菌屬(Citrobacter)和寡養(yǎng)單胞菌屬(Stenotrophomonas),表明小清河細(xì)菌微生物種群的多樣性。這些細(xì)菌中既有常見(jiàn)菌,如各類氣單胞菌和微桿菌等,也有條件致病菌如希瓦氏菌、弗氏枸櫞酸桿菌和嗜麥芽寡養(yǎng)(窄食)單胞菌,特別是存在對(duì)人和動(dòng)物健康有嚴(yán)重威脅的致病菌如克雷伯氏菌、金黃桿菌,因此在修復(fù)水環(huán)境、凈化水質(zhì)的同時(shí),要進(jìn)一步考慮對(duì)有害致病菌的防控。

本試驗(yàn)還研究了從河水中分離鑒定的地衣芽孢桿菌QH11、短小芽孢桿菌QH09和嗜麥芽寡養(yǎng)(窄食)單胞菌QH13對(duì)水污染重要指標(biāo)CODCr和氨氮含量的去除能力。結(jié)果表明,地衣芽孢桿菌對(duì)CODCr和NH3-N的去除率分別為70.6%和84.8%,嗜麥芽寡養(yǎng)(窄食)單胞菌的去除率分別為58.5%和52.3%,短小芽孢桿菌的去除率分別為48.5%和39.4%。地衣芽孢桿菌QH11和嗜麥芽寡養(yǎng)(窄食)單胞菌QH13均表現(xiàn)出較強(qiáng)的去除污染水體CODCr和NH3-N的能力,對(duì)水體污染修復(fù)具有開(kāi)發(fā)應(yīng)用價(jià)值。芽孢桿菌是一類重要的益生菌資源,具有降解工業(yè)廢水和有機(jī)污染物的作用[12~15],關(guān)于芽孢桿菌對(duì)城市河水污染修復(fù)的報(bào)道較少。本研究表明,分離自小清河水中的地衣芽孢桿菌具有很強(qiáng)的去除污染水體CODCr和氨氮去除率的能力,短小芽孢桿菌對(duì)水質(zhì)改良也具有一定作用。嗜麥芽寡養(yǎng)(窄食)單胞菌屬條件致病菌,近年來(lái)發(fā)現(xiàn)有些菌株具有特異性降解羽毛等角蛋白質(zhì)能力[16~18]和對(duì)水中重金屬污染的吸附與去除能力[19]。本研究首次發(fā)現(xiàn)嗜麥芽寡養(yǎng)(窄食)單胞菌對(duì)水體CODCr和氨氮具有明顯的去除作用。今后將繼續(xù)開(kāi)展地衣芽孢桿菌QH11和嗜麥芽寡養(yǎng)(窄食)單胞菌QH13對(duì)水質(zhì)修復(fù)的作用機(jī)制研究,為利用微生物技術(shù)修復(fù)河水污染提供理論和技術(shù)基礎(chǔ)。

參 考 文 獻(xiàn):

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