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利用正交設計優(yōu)選NR2A的Western Blot成像條件

2014-11-27 05:39:30高嵐岳
化學研究 2014年1期
關鍵詞:焦距光圈條帶

高嵐岳,苑 潔,姜 泓

(中國醫(yī)科大學 公共衛(wèi)生學院,遼寧 沈陽 110001)

Western Blot中文稱為蛋白質(zhì)印跡法,是蛋白質(zhì)分析的最流行的技術之一,現(xiàn)己廣泛應用于基因在蛋白水平的表達研究、抗體活性檢測和疾病早期診斷等方面.Western Blot測定結果采用目的蛋白的灰度值計算法,在自動曝光成像過程中,常由于背景干擾大的原因,而出現(xiàn)測量結果不準確及測定結果重現(xiàn)性差等問題.為保證良好的成像質(zhì)量及準確度、重現(xiàn)性好的條帶灰度值,有必要對成像條件進行優(yōu)化,以確保Western Blot結果的準確性.

NR2A是興奮性氨基酸谷氨酸的特異性受體(NMDA受體)的調(diào)節(jié)亞單位之一,具有調(diào)制突觸傳遞、觸發(fā)突觸可塑性以及參與學習與記憶等重要的生理功能[1-2].在前期研究中,作者通過調(diào)整蛋白上樣量、電泳和轉(zhuǎn)膜條件、封閉時間、一抗和二抗稀釋倍數(shù)用以增強雜交信號、降低背景.但采用自動曝光的凝膠成像系統(tǒng),NR2A成像結果仍然不理想,所以本研究采用手動曝光的凝膠成像系統(tǒng),以雙指標(條帶灰度值和背景灰度值)進行綜合評價優(yōu)化NR2A的成像條件,以期得到理想的成像結果.

本研究以NR2A為切入點,研究其最佳成像條件,采用正交實驗法,對影響條帶灰度值和背景灰度值的因素如光圈(A)、焦距(B)、曝光時間(C)等進行考查;探討NR2A的Western Blot最佳手動成像條件,以期為采用該技術的應用提供依據(jù).

1 實驗部分

1.1 試劑與儀器

BCA試劑盒(全士金公司)、山羊抗NR2A抗體(SANTA公司)、山羊抗β-actin抗體(SANTA公司)、ECL顯影試劑盒(全士金公司).

超聲波細胞粉碎機(寧波科生儀器廠)、3K18型超速低溫離心機(美國Sigma公司)、水平及垂直搖床(海門市麒麟醫(yī)用儀器廠)、蛋白質(zhì)電泳裝置(TANON公司)、蛋白質(zhì)電轉(zhuǎn)印裝置(TANON公司)、Gel Logic 2200型成像系統(tǒng)(KODAK公司)、Gel-Pro analyzer4圖像分析軟件.

1.2 組織蛋白的提取及濃度測定

取50mg大鼠腦海馬置于2mL EP管中,用干凈的剪刀將組織塊剪碎,加入450μL細胞裂解液進行裂解,然后置于冰上;用超聲波細胞粉碎機超聲60s后再置于冰上,重復3次使細胞破碎;4℃下12 000r/min離心15min×2次,取上清液,分裝于新離心管中;采用BCA試劑盒法測定上清液中蛋白濃度,并調(diào)整蛋白濃度至3g/L.

1.3 蛋白的分離與含量測定

采用Western Blot法進行蛋白含量分析.每孔道加15uL蛋白樣品,依次經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳,轉(zhuǎn)膜(采用PVDF膜),TBS-T洗膜,脫脂奶粉封閉,TBS-T洗膜,4℃下一抗(NR2A1∶1 000,β-actin 1∶3 000)孵育過夜,TBS-T洗膜,二抗(兔抗山羊1∶3 000)孵育2h,TBS-T洗膜,ECL法顯色.用成像系統(tǒng)采集圖像,重復3次,利用圖像分析軟件測量蛋白條帶和背景的灰度值.

1.4 正交實驗優(yōu)選成像條件與實驗安排

以條帶和背景的灰度值為考查指標,以光圈(A)、焦距(B)、曝光時間(C)作為3個因素,因素水平見表1.采用L9(34)正交設計表安排實驗.

表1 成像的因素水平Table 1 The factor level of imaging

1.5 數(shù)據(jù)處理

采用SPSS 16.0軟件對所測數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析,數(shù)據(jù)用均數(shù)±標準差(ˉx±s)表示,采用正交設計方差分析進行比較,各因素內(nèi)各水平進行多重比較,檢驗水準P<0.05.

2 結果與討論

2.1 成像條件的選擇

如前所述,Western Blot是分子生物學、生物化學和免疫遺傳學中常用的一種實驗方法,用于研究目的蛋白的表達特性分析、組織定位、表達量分析及與其他蛋白的相互作用.Western Blot具有電泳技術分辨力強、免疫反應特異性強和免疫標記技術靈敏度高的特點,是一種便捷、可靠的實驗方法.Western Blot實驗結果要求所得圖片清晰,即雜交信號強、背景低,測定的目的蛋白灰度值準確、重現(xiàn)性好.在實驗過程中,除通過調(diào)整封閉時間、膜的處理、一抗和二抗稀釋倍數(shù)降低非特異性結合背景外,還需要通過調(diào)整成像效果排除背景色干擾,這是Western Blot實驗的最后、最關鍵的一步.

光圈、焦距和曝光時間是影響成像效果的三個主要因素.光圈和曝光時間調(diào)節(jié)明暗,焦距調(diào)節(jié)清晰度.光圈是用來控制光線透過鏡頭,進入機身內(nèi)感光面光量的裝置.光圈大小用F值表示,F(xiàn)值愈小,通光孔徑越大,在同一單位時間內(nèi)的進光量便越多,例如光圈從F8調(diào)整到F5.6,進光量便多一倍.此外,上一級的進光量是下一級的一倍,所以光圈F值越小,圖像越亮,反之越暗.本實驗光圈的F值范圍是1.2~16mm.前期實驗證明光圈為2~4mm時,灰度值無顯著差異(P>0.05),所以本實驗對光圈范圍(4mm≤F≤8mm)進行研究.曝光時間是為了將光投射到照相感光材料的感光面上,快門所要打開的時間,主要指CCD成像平面的感光時間.曝光時間越長,進光量便越多,拍攝的圖像越亮,反之圖像越暗.前期實驗證明曝光時間為60~120s時,灰度值無顯著差異(P>0.05).考慮到工作效率問題,選定曝光時間在60s內(nèi)進行研究.焦距指平行光入射時透鏡光心到光聚集之焦點的距離,亦是從照相機鏡片中心到CCD成像平面的距離.本實驗焦距的范圍是2.5~30mm.除以上三個因素外,視場(ZOOM=30%)、像素合并(binning=4*)均為固定值.

NR2A是NMDA受體的亞單位之一,在腦內(nèi)分布廣泛,以海馬、皮層和小腦最豐富,具有調(diào)制突觸傳遞、觸發(fā)突觸可塑性以及參與學習與記憶等重要的生理功能[3-4].已有研究發(fā)現(xiàn),在突觸后致密體(PSD)中,NMDA受體中NR2A蛋白質(zhì)C末端由于受到鈣/鈣調(diào)素依賴的蛋白激酶Ⅱ(CaMKⅡ)同突觸后致密體95(PSD-95)之間競爭性地結合從而影響海馬的突觸可塑性[5].決定受體的電生理學和藥理學特性[6-7].實驗過程中,我們采用凝膠成像系統(tǒng)自動曝光,未得到理想的NR2A成像結果,所以本研究采用具有均衡分散、綜合可比及可伸縮、效應明確等特性的正交實驗設計法,以便最快的找到最優(yōu)的水平組合[8-9].

2.2 正交實驗結果

目前關于Western Blot成像條件的優(yōu)化研究未見報道,本實驗以NR2A為切入點,以條帶灰度值和背景灰度值為考查指標進行研究.按實驗部分1.2、1.3進行操作,測量條帶和背景的灰度值,并進行方差分析,結果見表2和表3.

表2 成像的因素水平L9(34)正交實驗表Table 2 L9(34)orthogonal design table for the factor level of imaging

表3 方差分析結果Table 3 Results of variance analysis

從表2和表3的結果分析上可以看出,三個因素的影響大小依次為A>C>B,且A1>A2>A3,B2>B3>B1,C3>C2>C1,A因素和C因素的影響具有顯著性.綜合分析各個因素對條帶和背景灰度值的影響,確定最佳成像條件:光圈為4mm、焦距為30mm、曝光時間為60s.

2.3 驗證實驗

為了驗證所選條件的合理性,進行了三次驗證實驗,從表4結果可知,所選成像條件較穩(wěn)定,故確定最佳成像條件:光圈為4mm、焦距為30mm、曝光時間為60s.采集圖像如圖1所示.

表4 三次驗證實驗結果Table 4 Results of three verification tests

圖1 三次驗證實驗圖像Fig.1 Images of three verification tests

3 結論

采用正交設計的方法得到NR2A的Western Blot最佳成像條件:光圈為4mm、焦距為30mm、曝光時間為60s.

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