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松江鱸魚遺傳多樣性研究進(jìn)展

2014-11-22 05:10祝斐等
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年10期
關(guān)鍵詞:種質(zhì)資源表型染色體

祝斐等

作為我國一種降海洄游經(jīng)濟(jì)性魚類,近年來由于人類過度捕撈和棲息環(huán)境遭到破壞,野生資源量急劇下降。本文從松江鱸魚表型、染色體、蛋白質(zhì)(酶)和DNA 4個(gè)層面概述其遺傳多樣性,并分析當(dāng)前資源現(xiàn)狀。為松江鱸魚種質(zhì)資源保護(hù)和遺傳育種研究提供參考。

關(guān)鍵詞:松江鱸魚;群體遺傳多樣性;種質(zhì)資源;表型;染色體;蛋白質(zhì)(酶)

中圖分類號: S917文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號:1002-1302(2014)10-0211-03

收稿日期:2013-12-25

基金項(xiàng)目:江蘇省水產(chǎn)三新工程重大項(xiàng)目(編號:D-2013-4)。

作者簡介:祝斐(1987—),男,碩士研究生,從事海水魚類遺傳育種學(xué)研究。E-mail:ebancool@126.com。

通信作者:張志勇,研究員,主要從事海水養(yǎng)殖及海洋生物學(xué)方面的研究。Tel:(0513)85228256;E-mail:13906292412@139.com。遺傳多樣性作為物種多樣性、生態(tài)系統(tǒng)多樣性和景觀多樣性的基礎(chǔ),是評判生物進(jìn)化和適應(yīng)能力的基本方法,一般種內(nèi)遺傳多樣性越高,該物種的適應(yīng)能力越強(qiáng)。目前遺傳多樣性研究方法越來越豐富,早前一般從形態(tài)學(xué)、染色體核型分析及同工酶等手段進(jìn)行檢測,隨著生物技術(shù)的發(fā)展和測序技術(shù)的不斷完善成熟,通過分子標(biāo)記技術(shù),檢測群體的遺傳多樣性水平不僅具有重復(fù)性好且穩(wěn)定的特點(diǎn),近些年分子標(biāo)志技術(shù)被廣泛應(yīng)用于魚類分子遺傳學(xué)領(lǐng)域。近些年,野生松江鱸魚資源極其稀少,被列為國家二級保護(hù)魚類。為探討松江鱸魚種質(zhì)資源現(xiàn)狀和如何有效保護(hù)開發(fā)利用松江鱸魚資源,本文從表型、染色體、蛋白質(zhì)(酶)、DNA 4個(gè)層次簡述國內(nèi)外有關(guān)松江鱸魚遺傳多樣性的研究進(jìn)展,為今后開展松江鱸魚種質(zhì)資源保護(hù)以及遺傳育種提供參考。

1松江鱸魚的基礎(chǔ)生物學(xué)

松江鱸魚(Trachidermis fasciatus Heckel),別稱四鰓鱸、媳婦魚、花鼓魚等,隸屬于鲉形目(Scorpaeniforme)杜父魚科(Cottidae)松江鱸魚屬(Trachidermis)的一類降海洄游名貴魚類,其主要分布于日本南部海灣、朝鮮半島西岸、中國沿海東北部海區(qū)以及它們相應(yīng)的河流下游[1-3]。松江鱸魚作為一種降海產(chǎn)卵魚類,每年在淡水水域育肥后,11月份開始洄游至河口或近海水域(由于水溫等環(huán)境因素的影響,不同海區(qū)產(chǎn)卵及洄游時(shí)間略有差異)。雄雌魚除在繁殖期間,形態(tài)差異不明顯而不易區(qū)分,在自然環(huán)境中卵多產(chǎn)在隱蔽的牡蠣殼堆或石縫內(nèi),雌魚產(chǎn)卵后,由雄魚護(hù)卵直至子代出膜,其中大部分的親魚在當(dāng)年死亡。人工養(yǎng)殖條件下,不需要經(jīng)過淡水育肥直接在全海水環(huán)境下繁殖養(yǎng)殖,松江鱸魚耐受的鹽度范圍較廣(0~3.3%),生長適宜溫度為16~25 ℃。受精卵孵化適宜溫度4~14 ℃,最適溫度10~11 ℃[4-8]。從20世紀(jì)70年代以來在松江鱸魚增養(yǎng)殖技術(shù)上取得重大突破[9-16];但由于最初選用的親本為數(shù)量本已稀少的野生個(gè)體,在這種近親繁殖情況下,松江鱸魚種質(zhì)問題不容忽視。近些年來,國內(nèi)外眾多學(xué)者已認(rèn)識到保護(hù)松江鱸魚種質(zhì)的重要性和迫切性,并著手開展工作[17-23]。

2松江鱸魚的遺傳多樣性

2.1表現(xiàn)型

表現(xiàn)型多樣性就是同一物種表現(xiàn)出多種形態(tài)的現(xiàn)象。種內(nèi)和群體間表現(xiàn)型性狀均存在一定程度的差異,通過測定、分析對象的表現(xiàn)型性狀來評價(jià)遺傳多樣性。盡管利用表型性狀具有直觀、快捷等特點(diǎn),但由于魚類的某些性狀,特別是數(shù)量性狀易受到環(huán)境因素的影響。因?yàn)楸憩F(xiàn)型性狀不僅受基因控制還受到生長發(fā)育、種群大小、種群結(jié)構(gòu)、地理位置等多因素的影響。王金秋等采用差異系數(shù)和均數(shù)差異顯著性這2種數(shù)理統(tǒng)計(jì)分析方法,根據(jù)表現(xiàn)型性狀對遼寧鴨綠江、山東青龍河和錢塘江水系的富春江3個(gè)松江鱸魚種群進(jìn)行研究,認(rèn)為山東種群與錢塘江群體的形態(tài)性狀差異較與遼寧差異小[24]。蔣鑫等對黃河、灤河地域的松江鱸魚的成體皮膚進(jìn)行了顯微和亞顯微結(jié)構(gòu)分析對比,結(jié)果發(fā)現(xiàn)灤河群體幼魚真皮僅為丘狀突起,而黃河群體皮膚角質(zhì)棘狀突起,即兩者在表皮結(jié)構(gòu)存在一定差異[25]。

2.2染色體

染色體是遺傳物質(zhì)的載體,通過描述研究對象體內(nèi)所有染色體大小、形狀和數(shù)量信息等來了解染色體變異程度。染色體變異主要表現(xiàn)在染色體組型特征的變異。各種染色體形態(tài)的微小變異,其中包括染色體數(shù)目變異(整倍體、非整倍體)和染色體結(jié)構(gòu)變異(缺失、易位、倒位、重復(fù))[26]。目前染色體制片手段常見的為壓片法、胚胎細(xì)胞-低滲-空氣干燥法、外周血淋巴細(xì)胞(或腎短期)培養(yǎng)-低滲-空氣干燥法、腎細(xì)胞PHA活體注射-火焰干燥法 (或空氣干燥法),多采用吉姆薩(Giemsa)染色法,此外利用顯帶技術(shù)(CMA熒光染色、Ag-NORs、C-帶和復(fù)制帶等使得染色體分析技術(shù)出現(xiàn)多元化的特點(diǎn)[27]。國內(nèi)對松江鱸魚的染色體分析結(jié)果顯示,2n=40,NF=60[28],日本學(xué)者Abe采集日本樣本進(jìn)行染色體核型分析,得到2n=40,NF=64[29]。兩者結(jié)果在染色體臂比上存在差異,但在地理群體的細(xì)胞學(xué)差異等未見報(bào)道。

2.3蛋白質(zhì)(酶)

魚類的蛋白質(zhì)(酶)多樣性研究多集中在糖蛋白、同工酶、血清蛋白、血紅蛋白和肌肉蛋白等。主要利用蛋白質(zhì)電泳技術(shù)根據(jù)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)差異和遷移率的不同探討遺傳變異,其中同工酶技術(shù)應(yīng)用更為廣泛。王金秋等先通過6種同工酶系統(tǒng)研究遼寧鴨綠江流域野生群體,結(jié)果提示其遺傳多樣性較低[30];次年對該流域松江鱸魚天然種群的8種同工酶(EST、MDH、LDH、ME、α-AMY、GDH、ADH、G6PD)的20個(gè)基因座位進(jìn)行分析,結(jié)果表明,該野生種群的多態(tài)座位比例(P)為10%,平均雜合度(H)為0.030,均低于與其相似生活習(xí)性的其他魚類的平均值,酶水平檢測顯示其種內(nèi)遺傳變異性較小[31]。

2.4DNA

從表現(xiàn)型、蛋白質(zhì)、染色體來研究遺傳多樣性,可利用的多態(tài)位點(diǎn)較少,易受環(huán)境影響,且可重復(fù)性差。由于親本的遺傳差異加上多代的變異性,導(dǎo)致在DNA水平上個(gè)體之間也存在差異。這種差異從本質(zhì)上講是DNA堿基存在的差異,并可通過孟德爾方式遺傳。隨著分子遺傳學(xué)的發(fā)展,利用分子手段研究生物多樣性具有結(jié)果穩(wěn)定可靠,可重復(fù)性高的特點(diǎn),越來越受到研究者的青睞。分子標(biāo)記在遺傳學(xué)研究上主要集中在:(1)對不同群體遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳分化進(jìn)行評估;(2)人類的生產(chǎn)活動(dòng)(包括人工養(yǎng)殖、種苗繁育及選育等操作)對群體遺傳多樣性的影響程度;(3)群體間親緣關(guān)系及系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系研究[32]。當(dāng)前,線粒體標(biāo)記和微衛(wèi)星標(biāo)記對松江鱸魚遺傳多樣性、系統(tǒng)分類和種質(zhì)鑒定等方面進(jìn)行研究。

2.4.1線粒體DNA(mtDNA)線粒體DNA(Mitochondrial DNA,簡稱mtDNA)結(jié)構(gòu)簡單,具有半自主復(fù)制的特點(diǎn),其中(COI、Cytb、16rRNA、D-loop控制區(qū)等)作為一種母性遺傳的分子標(biāo)記被廣泛地應(yīng)用于物種遺傳多樣性研究。魚類mtDNA基因組一般為13.5~19.3 kb,包括2個(gè)rRNA基因、13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、1個(gè)非編碼區(qū)和22個(gè)tRNA編碼基因[33]。Zeng等獲得近緣物種設(shè)計(jì)引物,再通過測序拼接的方法得到線粒體全基因組序列信息[34]。劉亞楠通過mtDNA控制區(qū)多樣性分析威海海域松江鱸魚,其研究結(jié)果表明該海域的松江鱸魚具有較高的遺傳多樣性水平[35]。高天翔等對中國沿海7個(gè)松江鱸魚群體和日本有明海松江鱸魚群體的線粒體Cytb 基因全序列進(jìn)行了測定、分析,其結(jié)果顯示:47個(gè)個(gè)體共檢測到31個(gè)單倍型,8個(gè)群體均呈現(xiàn)出較高的單倍型多樣性(060~1.00) 和較低的核苷酸多樣性(0.000 5~0.004 1)的特點(diǎn)[36]。邵芳等利用線粒體D-loop控制區(qū)序列分析了長江、丹東和葫蘆島三個(gè)地理群體的系統(tǒng)進(jìn)化,結(jié)果為三個(gè)地理群體未發(fā)現(xiàn)明顯的地理序列特征,表明3個(gè)地理群體松江鱸的分隔時(shí)間短[37]。

2.4.2ISSR標(biāo)記ISSR標(biāo)記最早由Zietkiewicz等[38]提出。其作為一種高精度、高容量的分子標(biāo)記,近年來已被廣泛地應(yīng)用于親緣關(guān)系鑒定和遺傳遺傳多樣性分析以及連鎖圖譜的構(gòu)建。Bi等利用ISSR標(biāo)記對松江鱸魚的野生群體和養(yǎng)殖群體進(jìn)行比較后發(fā)現(xiàn),養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性顯著降低,其中養(yǎng)殖群體(QHD)多態(tài)位點(diǎn)百分率73.80%,Neis基因多樣性0178 2,香農(nóng)指數(shù)0.276 9;野生群體(DD) 多態(tài)位點(diǎn)百分率86.36%,Neis基因多樣性0.0.230 2,香農(nóng)信息指數(shù) 0.350 7[39]。馬召騰等利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)分析了松江鱸魚4個(gè)不同地理群體(浙江富春江、山東黃河入海口、河北灤河和遼寧鴨綠江)群體間的遺傳變異,結(jié)果表明,河北灤河與其他地理群體遺傳距離較遠(yuǎn);4群體中,河北灤河群體多態(tài)位點(diǎn)百分率、Neis基因多樣性、香農(nóng)信息指數(shù)均為最低,分別為4917%、0.153 0、0.232 2;而遼寧鴨綠江群體的相應(yīng)值為最高,分別為74.03%、0.277 7、0.411 2[40]。此外徐建榮等利用ISSR和AFLP分子標(biāo)記共同對遼寧丹東和河北秦皇島2個(gè)地區(qū)松江鱸群體遺傳多樣性的分析,結(jié)果表明,2個(gè)群體遺傳多樣性處于一個(gè)水平,多態(tài)位點(diǎn)百分率分別為50.28%、5000%,平均雜合度和香農(nóng)信息指數(shù)分別為0.169 0、0.173 3 和0.253 4、0.259 2[41-42]。

2.4.3其他分子標(biāo)記曾珍等對富春江、黃河、灤河和鴨綠江等4個(gè)松江鱸魚野生群體共120 尾個(gè)體進(jìn)行 RAPD 分析,結(jié)果表明,松江鱸魚野生群體的遺傳多樣性較為豐富[43]。張文學(xué)利用MHCⅠA基因?qū)ν:蜄|營群體進(jìn)行了同源比對和進(jìn)化分析,結(jié)果表明威海和東營群體之間有中等的遺傳分化,即2個(gè)群體之間已經(jīng)出現(xiàn)了形態(tài)和遺傳學(xué)上的分化,但還未達(dá)到亞種的水平。因此,它們之間的差異仍然是屬于不同地理群體間的差異[44]。此外,Ren等[45]和Liu等[46]從松江鱸魚基因組中獲得一定數(shù)量的微衛(wèi)星標(biāo)記,有助于松江鱸魚的群體遺傳學(xué)研究。

3展望

中國松江鱸魚群體與日本南部群體不僅在受精卵徑、初孵化幼苗體長存在顯著差異,而且國內(nèi)報(bào)道松江鱸魚在鹽度為3.0%~3.2%的海區(qū)中進(jìn)行產(chǎn)卵[4];而日本南部松江鱸魚的產(chǎn)卵場在河口附近,而非海區(qū)內(nèi),其河口鹽度為0.8%~22%[47];國內(nèi)黃河群體與灤河群體從表型性狀——真皮顯微結(jié)構(gòu)也存在差異。以上證據(jù)提示了不僅中國群體與日本南部群體間存在生物學(xué)差異,而且在中國境內(nèi)的松江鱸魚也存在種群差異現(xiàn)象。但目前野生群體的遺傳多樣性水平不容樂觀,加之人工養(yǎng)殖群體遺傳多樣性呈現(xiàn)顯著降低的趨勢,該問題必須引起高度重視。

3.1松江鱸魚自然資源的保護(hù)和科學(xué)人工養(yǎng)殖

為降低松江鱸魚野生種群種質(zhì)退化的危險(xiǎn),必須首先加強(qiáng)對野生種質(zhì)資源的保護(hù),在自然水域就地建立松江鱸魚種質(zhì)保護(hù)區(qū),防止松江鱸魚種質(zhì)退化;其次加強(qiáng)監(jiān)控,嚴(yán)格控制野生松江鱸魚的捕撈和銷售;同時(shí)加強(qiáng)對野生資源的補(bǔ)充,加強(qiáng)人工增殖放流,以其漸漸恢復(fù)松江鱸魚野生種群數(shù)量。各地人工養(yǎng)殖地區(qū)應(yīng)盡早建立以本地野生松江鱸魚為親本的良種場,積極開展種質(zhì)資源保護(hù)親本的更新,為各地資源恢復(fù)和增養(yǎng)殖提供有力保障。

3.2制定松江鱸魚種質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)

以我國各大水系野生松江鱸魚資源為藍(lán)本,盡快建立松江鱸魚種質(zhì)標(biāo)準(zhǔn),以便為保護(hù)松江鱸魚遺傳多樣性提供理論依據(jù)。

3.3構(gòu)建松江鱸魚種質(zhì)基因庫

構(gòu)建種質(zhì)資源基因庫對廣泛開展分子生物學(xué)研究提供基礎(chǔ),這將有利于開展松江鱸魚分子標(biāo)記、遺傳學(xué)研究、系統(tǒng)分類、遺傳圖譜構(gòu)建和QTL定位,乃至分子輔助育種工作。

3.4以選育優(yōu)良品種為目標(biāo),開展松江鱸魚育種工作

選育出具有生長快、抗逆性強(qiáng)的優(yōu)良品種一直是魚類人工養(yǎng)殖的目標(biāo)之一,而遺傳育種的本質(zhì)即篩選得到具有這些經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的基因。松江鱸魚種質(zhì)資源分布廣泛,松江鱸魚遺傳多樣性研究為選育出具有這些優(yōu)良基因的松江鱸魚品種奠定良好的基礎(chǔ)。

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