杜驍杰,郭靜靜,王 晶,李 敏,王 玲,王長軍,潘秀珍
蛋白質(zhì)磷酸化是信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)的核心,其中激酶和磷酸酶的協(xié)同作用介導(dǎo)著蛋白質(zhì)可逆的磷酸化,精確地調(diào)控細(xì)胞的各項(xiàng)生命活動(dòng),包括細(xì)胞的生長、分裂、分化以及代謝等[1]。絲氨酸/蘇氨酸激酶(serine/threonine kinase,STK)和 STP是蛋白質(zhì)可逆性磷酸化的重要酶類,長期以來認(rèn)為其只存在于真核生物中,近年來的研究表明,在原核生物中也存在真核樣 STK 和磷酸酶[1-2]。
豬鏈球菌是一種重要的人獸共患病病原菌,目前對其信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)的研究主要集中在二元信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)中[3-8]。我們的前期研究已分離出2型豬鏈球菌中國強(qiáng)毒株05ZYH33,對其進(jìn)行了全基因組測序分析[9],發(fā)現(xiàn)和真核生物同源的stk/stp。本研究對stp進(jìn)行原核表達(dá)及純化,對純化的重組蛋白進(jìn)行酶活性測定,為進(jìn)一步闡明STK/STP磷酸化系統(tǒng)的調(diào)控機(jī)制打下基礎(chǔ)。
1.1 材料
1.1.1 菌株、質(zhì)粒和引物 2005年S.suis 2 05ZYH33分離自四川資陽中毒性休克綜合征患者。E.coli BL21、E.coli DH5α、pET28a 均由本實(shí)驗(yàn)室保存。pMD18-T購自Takara公司。對stp基因設(shè)計(jì)上下游引物,引物由上海賽百盛基因技術(shù)有限公司合成,堿基序列如下堿基序列如下:STP-L:CATATGATGGCTTTTTCATCGGTCA(下劃線為引入的Nde I酶切位點(diǎn)),STP-R:CTCGAGTTACCTAGCCTCCTCCGT(下劃線為引入的XhoⅠ酶切位點(diǎn))
1.1.2 試劑 Taq polymerase、dNTP、T4 DNA 連接酶、限制性內(nèi)切酶BamH Ⅰ、XhoⅠ、DNA Marker和質(zhì)粒提取試劑盒購自TaKaRa公司,蛋白Marker購自Fermentas公司,PCR割膠回收試劑盒購自promega公司,蛋白表達(dá)誘導(dǎo)劑IPTG購自南京生興生物公司。THB培養(yǎng)基購自美國Difco公司。HRP標(biāo)記的羊抗鼠IgG、鄰苯二胺(DAB)顯色液購于武漢博士德生物工程有限公司;His-Tag單克隆抗體購自上海艾比瑪特生物醫(yī)學(xué)有限公司。pNPP stock購于ScienCell(美國)公司。Tris購于南京百斯凱公司。MnCl2、MgCl2和CaCl2購于廣東汕頭西隴化工股份有限公司。
1.2 方法
1.2.1 stp的生物信息學(xué)分析 根據(jù)S.suis中國強(qiáng)致病株05ZYH33的全基因組序列和注釋結(jié)果,利用BLAST程序,對CDSSSU0427進(jìn)行在線比對,并對蛋白進(jìn)行保守功能域檢索。MEGA 5.0軟件繪制stp的進(jìn)化樹。
1.2.2 pET28a::stp的構(gòu)建 用引物對 STP-L/STPR擴(kuò)增05ZYH33 stp目的片段,將stp PCR產(chǎn)物連入pMD18-T并轉(zhuǎn)化E.coli DH5α感受態(tài),構(gòu)建成功后測序比對,命名為 pMD18-T-stp。pMD18-T-stp和pET28a用NdeⅠ/XhoⅠ進(jìn)行雙酶切,酶切產(chǎn)物進(jìn)行回收,回收產(chǎn)物經(jīng)T4 DNA Ligase連接后轉(zhuǎn)化E.coli BL21,對轉(zhuǎn)化子進(jìn)行PCR和酶切鑒定,成功后命名為pET28a::stp。
1.2.3 pET28a::stp的表達(dá)及純化 將 pET28a::stp/BL21于5mL含Kana的LB培養(yǎng)基中過夜培養(yǎng),1∶100加入新鮮培養(yǎng)基后,37℃振蕩培養(yǎng)至A600值約0.6,加IPTG至終濃度為1 mmol/L,16℃誘導(dǎo)培養(yǎng)。離心收集菌體并用超聲波破碎細(xì)胞,離心后收集上清,利用Ni2+親和層析柱純化目的蛋白。12%SDSPAGE電泳檢測目的蛋白的相對分子質(zhì)量。
1.2.4 Western blot鑒定 取純化的STP重組蛋白進(jìn)行SDS-PAGE電泳,采用電轉(zhuǎn)印法將蛋白轉(zhuǎn)移至PVDF膜上,5%脫脂奶粉封閉1 h;加His-Tag單克隆抗體(1∶4000),4℃過夜;用HRP標(biāo)記的羊抗鼠IgG(1∶4000)孵育1 h;加DAB顯色液顯色。
1.2.5 酶活鑒定 參照文獻(xiàn)[10],重組蛋白的磷酸酶活性檢測以pNPP為底物,通過測定A450值的變化間接檢測酶的活性。將2 μg重組蛋白STP與5 μL pNpp stock混合后加入事先配置的反應(yīng)緩沖液[含 1 μmol/L Tris-HCl(pH 8.0),2 mmol/L MnCl2、MgCl2或 CaCl2],常溫孵育,每隔1 min 檢測 A405值。
2.1 05ZYH33 stp基因的生物信息學(xué)分析 通過Blastp比對發(fā)現(xiàn)STP蛋白的氨基酸序列與GenBank上的肺炎鏈球菌PhpP、變形鏈球菌pppL、無乳鏈球菌SaSTP和化膿鏈球菌SP-STP的氨基酸序列一致性分別為69%、59%、59%和60%。保守功能結(jié)構(gòu)域檢索發(fā)現(xiàn)STP屬于金屬依賴型磷酸酶家族PP2C亞家族,其在進(jìn)化上也較為保守。見圖1。
圖1 S.suis 2 05ZYH33 STP的生物信息學(xué)分析Figure 1 Bioinformation of STP
2.2 重組表達(dá)載體pET28a::stp的構(gòu)建和鑒定以05ZYH33基因組DNA為模板,STP-L/STP-R擴(kuò)增stp全長基因,擴(kuò)增產(chǎn)物大小約為810 bp,與理論值一致。將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物割膠回收進(jìn)行純化,與pMD18-T載體相連后測序,測序結(jié)果經(jīng)比對正確,將stp連入pET28a后構(gòu)建重組表達(dá)載體pET28a::stp,雙酶切結(jié)果證實(shí)了pET28a::stp的成功構(gòu)建。
圖2 重組質(zhì)粒的PCR及酶切鑒定Figure 2 Identification of the recombinant plasmid by PCR and restriction enzymes
2.3 pET28a::stp的表達(dá)及重組蛋白的純化pET28a::stp/BL21經(jīng)IPTG誘導(dǎo)后,16℃下誘導(dǎo)培養(yǎng),超聲波破碎細(xì)胞后離心收集上清及沉淀,SDS-PAGE分析表明,16℃下STP可正常表達(dá),且主要存在于上清中。利用Ni2+親和層析柱對表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行純化,250 mmol/L洗脫目的蛋白,透析去除咪唑,得到重組蛋白STP。見圖3。
圖3 pET28a::stp的誘導(dǎo)表達(dá)及STP純化檢測Figure 3 Expression of STP and the detection of purified STP protein
2.4 STP的 Western blot分析 Western blot結(jié)果顯示,STP可以和His-Tag單抗發(fā)生反應(yīng),在蛋白相對分子質(zhì)量大小約32 000處有明顯的特異蛋白條帶,說明該重組蛋白的確是stp的表達(dá)產(chǎn)物。見圖4。
圖4 用His-Tag單抗對重組表達(dá)蛋白進(jìn)行免疫印跡檢測Figure 4 Western blot of the recombinant STP
2.5 重組蛋白磷酸酶活性的鑒定 用含有3種不同離子(Mn2+、Mg2+或Ca2+)的緩沖液孵育蛋白與作用底物的混合物,通過檢測A405值的變化,間接檢測磷酸酶的活性。我們發(fā)現(xiàn),只有Mn2+存在下,STP才具有磷酸酶活性,提示該蛋白具有金屬離子依賴性。見圖5。
圖5 STP磷酸酶活性的間接檢測Figure 5 Phosphatase assays of STP
STP通過催化底物蛋白絲氨酸或蘇氨酸磷酸化羥基的去磷酸化,完成對信號(hào)的傳遞。根據(jù)分子結(jié)構(gòu)、對金屬離子的依賴性以及對抑制劑的敏感性的不同,STP被分為兩大家族,即磷蛋白磷酸酶(phosphoprotein phosphatase,PPP)和金屬依賴型磷酸酶(metal-dependent phosphatase,PPM)[11]。本研究在2型豬鏈球菌中發(fā)現(xiàn)STP編碼基因stp,生物信息學(xué)分析顯示STP蛋白屬于PPM家族PP2C亞家族,該亞家族成員結(jié)構(gòu)類似人蛋白質(zhì)磷酸酶2C[11]。其與常見致病菌株肺炎鏈球菌、無乳鏈球菌、化膿鏈球菌、變形鏈球菌STP蛋白具有很高的同源性,在進(jìn)化上具有保守性。
在枯草芽孢桿菌中,stk/stp激活細(xì)菌孢子萌發(fā)的轉(zhuǎn)錄因子[12]。在金黃色葡萄球菌中,stk/stp調(diào)節(jié)細(xì)菌細(xì)胞壁的結(jié)構(gòu)和對抗生素的敏感性[13]。無乳鏈球菌中,stk/stp影響著細(xì)菌的毒力和形態(tài)結(jié)構(gòu)[14-15]。目前對stk/stp系統(tǒng)的研究主要集中在stk中,單獨(dú)對stp的報(bào)道并不多見,且在某些菌株中stp是必須基因,對該基因不能進(jìn)行突變研究[16]。本課題組前期發(fā)現(xiàn) S.suis 2中國強(qiáng)毒株 05ZYH33 STK/STP編碼基因,對激酶 stk進(jìn)行敲除株的構(gòu)建[17]。本研究針對stk相鄰的磷酸酶stp開展相關(guān)研究,以05ZYH33基因組為模板擴(kuò)增出stp基因,將其連入表達(dá)載體pET28a并轉(zhuǎn)入宿主菌后進(jìn)行原核表達(dá),親和層析獲得了純度較高的STP蛋白。
PPM家族蛋白的酶活性需要有金屬離子(Mg2+或Mn2+)的參與[11],本實(shí)驗(yàn)間接地測定出重組STP蛋白的磷酸酶活性,且只有在Mn2+存在的條件下才具有該活性,在Mg2+或Ca2+存在下則沒有活性。本研究結(jié)果為進(jìn)一步闡明STK/STP系統(tǒng)在豬鏈球菌磷酸化信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)中的作用打下基礎(chǔ)。
[1]Kellie B,Lakshmi R.Aspects of eukaryotic-like signaling in Gram-positive cocci:a focus on virulence[J].Future Microbiol,2011,6(7):747-761.
[2]Pereira SFF,Goss L,Dworkin J.Eukaryote-like serine/threonine kinases and phosphatases in bacteria[J].Microbial Mol Biol Rev,2011,75(3):192-212.
[3]李 明,胡福泉,唐家琪.二元信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)與細(xì)菌的致病性[J].微生物學(xué)雜志,2007,27(1):50-54.
[4]Hoch JA.Two-component and phosphorelay signal transduction[J].Curr Opin Microbiol,2000,3:165-170.
[5]施仕德,邵海峰.細(xì)菌生物膜感染的研究進(jìn)展[J].醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào),2011,24(12):1319-1323.
[6]Pan X,Ge J,Li M,et al.The Orphan Response Regulator CovR:a Globally Negative Modulator of Virulence in Streptococcus suis serotype 2[J].J Bacteriol,2009,191(8):2601-2612.
[7]李先富,郝喜娜,韓明月,等.豬鏈球菌反應(yīng)調(diào)節(jié)因子CovR單克隆抗體的制備與鑒定[J].醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào),2010,23(8):809-812.
[8]郭靜靜,王 玲,杜驍杰,等.染色質(zhì)免疫共沉淀方法篩選豬鏈球菌反應(yīng)調(diào)節(jié)因子CovR調(diào)控的靶基因[J].醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào),2013,26(7):680-684.
[9]Chen C,Tang J,Dong W,et al.A glimpse of streptococcal toxic shock syndrome from comparative genomics of S.suis 2 Chinese isolates[J].PLoS One,2007,2(3):e315.
[10]Zhu H,Huang D,Wei Z,et al.The novel virulence-related gene stp of Streptococcus suis serotype 9 strain contributes to a significant reduction in mouse mortality[J].Microb Pathog,2011,51:443-453.
[11]Barford DDA,Egloff MP.The structure and mechanism of protein phosphatases:insights into catalysis and regulation[J].Annu Rev Biophys Biomol Struct,1998,27:133-164.
[12]Yang X,Kang CM,Brody MS,et al.Opposing pairs of serine protein kinases and phosphatases transmit signals of environmental stress to activate a bacterial transcription factor[J].Genes Dev,1996,10(18):2265-2275.
[13]Beltramini AM,Mukhopadhyay CD,Pancholi V.Modulation of cell wall structure and antimicrobial susceptibility by a Staphylococcus aureus eukaryote-like serine/threonine kinase and phosphatase[J].Infect Immun,2009,77(4):1406-1416.
[14]Rajagopal L,Vo A,Silvestroni A,et al.Regulation of cytotoxin expression by converging eukaryotic-type and two-component signaling mechanisms in Streptococcus agalactiae[J].Mol Microbiol,2006,62(4):941-957.
[15]Rajagopal L,Clancy A,Rubens CE.A eukaryotic type serine/threonine kinase and phosphatase in Streptococcus agalactiae reversibly phosphorylate an inorganic pyrophosphatase and affect growth,cell segregation,and virulence[J],J Bio Chem 2003,278(16):14429-14441.
[16]Jin H,Pancholi V.Identification and biochemical characterization of a eukaryotic-type serine/threonine kinase and its cognate phosphatase in Streptococcus pyogenes:their biological functions and substrate identification[J].J Mol Biol,2006,357(5):1351-1372.
[17]杜驍杰,王 玲,鄭 峰,等.豬鏈球菌真核樣絲氨酸/蘇氨酸激酶stk基因敲除株的構(gòu)建[J].中國人獸共患病學(xué)報(bào),2013,29(12):1162-1167.