張華 李家大 羅渾金 陳紅勝 梅凌云 賀楚峰 馮永
PAX3(Pair Box 3,配對(duì)盒基因)基因位于染色體2q35-2q37,cDNA序列全長(zhǎng)1 440 bp,其編碼的PAX3蛋白是配對(duì)盒轉(zhuǎn)錄因子PAX家族成員之一。PAX3蛋白在脊椎動(dòng)物高度保守,是神經(jīng)嵴(neural crest,NC)發(fā)育的主要調(diào)控因子之一[1]。PAX3基因突變影響NC發(fā)育,可導(dǎo)致Waardenburg綜合征(Waardenburg syndrome,WS)[2]。WS是最常見(jiàn)的遺傳性綜合征型聾,又稱(chēng)聽(tīng)力-色素綜合征,屬NC病之一,是由于NC發(fā)育異常而導(dǎo)致的一組臨床癥候群,主要以NC源性細(xì)胞黑素細(xì)胞分化缺陷致發(fā)育異常導(dǎo)致的色素分布異常和耳聾為特征[3]。根據(jù)WS臨床特征及不同的伴隨表型將WS分為4型(WS1~4)[2],感音神經(jīng)性聾和虹膜異色是WS最常見(jiàn)的特征性表型,PAX3基因突變可導(dǎo)致WS1和WS3。
前期研究發(fā)現(xiàn)2個(gè)致WS1的新發(fā)PAX3基因突變H80D(c.238C>G)和H186fs(c.556delC)[4],本研究通過(guò)構(gòu)建人PAX3基因及其突變H80D和H186fs表達(dá)質(zhì)粒并觀(guān)察其在小鼠胚胎成纖維細(xì)胞(NIH3T3細(xì)胞)的表達(dá)和定位,為進(jìn)一步研究國(guó)人PAX3基因突變致WS發(fā)病的分子機(jī)制奠定一定的實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。
1.1實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1細(xì)胞 NIH3T3細(xì)胞用于構(gòu)建瞬時(shí)表達(dá)細(xì)胞模型,由中南大學(xué)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室提供。
1.1.2主要試劑 野生型PAX3基因(GenBank accession no,NM181457.3)真核細(xì)胞表達(dá)質(zhì)粒pECE-PAX3由法國(guó)Bondurand Nadege教授惠贈(zèng);pcDNA3.0-3×HA購(gòu)自Clontech公司;NucleoSpin Plasmid kit購(gòu)自德國(guó)Macherey-Nagel公司;Lipfectamine 2000購(gòu)自美國(guó)Invitrogen公司;DMEM、FBS、Pen Strep、Opti-MEM、胰酶購(gòu)自美國(guó)Gibco公司;Protease inhibitor cocktail、單克隆鼠抗HA抗體、TWEEN-20、辣根過(guò)氧化物酶(HRP)偶聯(lián)的山羊抗鼠IgG、PMSF、ONPG、DAPI、Protein-G-Agargose、Tween-20、NP-40購(gòu)自美國(guó)Sigma公司;Cy2標(biāo)記的山羊抗鼠二抗購(gòu)自美國(guó)Jackson公司;PVDF膜購(gòu)自Millipore公司;fluoromount-G購(gòu)自Southern Biotech公司;Triton X-100購(gòu)自Bio Basic公司;Phusion超保真DNA聚合酶、DpnⅠ酶、NotⅠ酶、EcoRⅠ酶購(gòu)自New England Biolabs公司;T4 DNA連接酶購(gòu)自TakaRa公司。
1.1.3主要儀器 Leica TCS SP5激光共聚焦顯微鏡(德國(guó)Leica公司)、Leica DMI 3000B熒光倒置式生物顯微鏡(德國(guó)Leica公司)、CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱(Thermo公司)、NanoDrop ND-1000分光光度計(jì)(Thermo公司)、Tanon-1600全自動(dòng)數(shù)碼凝膠圖像分析系統(tǒng)(上海天能科技有限公司)、37 ℃恒溫室均由中南大學(xué)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室提供。
1.2實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1PAX3基因重組真核細(xì)胞表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建
1.2.1.1野生型PAX3基因重組真核細(xì)胞表達(dá)質(zhì)粒pcDNA3.0-PAX3-HA的構(gòu)建 以獲贈(zèng)的真核細(xì)胞表達(dá)質(zhì)粒pECE-PAX3為模板,PCR擴(kuò)增目的片段PAX3。根據(jù)pcDNA3.0-HA的質(zhì)粒圖、序列以及多克隆酶切位點(diǎn),設(shè)計(jì)PCR擴(kuò)增引物,上游引物:5′-CGATAGAATTCATGACCACGC TGGCCGGCGC-3′,下游引物:5′-CGATACAGCGGCCGCCTAAAAAGTCCAAGG C-3′,斜體為保護(hù)堿基,下劃線(xiàn)為分別為EcoRⅠ和NotⅠ酶切位點(diǎn),由上海生工生物工程有限公司合成。PCR反應(yīng)體系25 μl(模板質(zhì)粒1 μl,5×HF Buffer 5 μl,dNTP 0.5 μl,Phusion超保真DNA聚合酶 0.5 μl,引物各1 μl,去離子水16 μl),反應(yīng)條件:98 ℃變性30 s后進(jìn)行循環(huán),98 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,共循環(huán)25次,最后72 ℃延伸7 min,4 ℃保存。PCR產(chǎn)物純化回收后與pcDNA3.0-HA分別由EcoRⅠ酶和NotⅠ酶雙酶切,反應(yīng)體系50 μl(純化產(chǎn)物PAX3或pcDNA3.0-HA 10 μl,EcoRⅠ 0.5 μl,NotⅠ 0.5 μl,10×Buffer 4和10×BSA各5 μl,去離子水29 μl),反應(yīng)條件:37 ℃,4~8 h。PAX3雙酶切產(chǎn)物目的片段和pcDNA3.0-HA雙酶切載體片段在1%瓊脂糖凝膠中電泳跑膠驗(yàn)證,切膠回收、純化后連接,連接體系10 μl(目的片段PAX3 4 μl,載體片段pcDNA3.0-HA 2 μl,T4DNA連接酶1 μl,10×T4DNA連接酶Buffer 1 μl,去離子水2 μl),反應(yīng)條件:16 ℃,連接過(guò)夜。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化、涂板、篩選與擴(kuò)增后,挑選鑒定克隆。雙酶切連接產(chǎn)物經(jīng)電泳初步鑒定正確后DNA測(cè)序進(jìn)一步鑒定(武漢華大基因公司測(cè)序)。
1.2.1.2突變型PAX3基因重組真核細(xì)胞表達(dá)質(zhì)粒pcDNA3.0-H80D-HA和pcDNA3.0-H186fs-HA的構(gòu)建 以pcDNA3.0-PAX3-HA為模板PCR擴(kuò)增H80D、H186fs突變型真核細(xì)胞表達(dá)質(zhì)粒,利用在線(xiàn)軟件The QuikChange?Primer Design Program(https://www.genomics.agilent.com)在PAX3基因(GenBank accession no,NM181457.3)編碼區(qū)突變位點(diǎn)兩側(cè)分別設(shè)計(jì)兩對(duì)突變引物,H80D突變位點(diǎn)引物序列:上游5′-TGCGCGTGTCCGACGGCTGCGTC-3′;下游5′-GACGCAGCCGTCGGACACGCGCA-3′。H186fs突變位點(diǎn)引物序列:上游5′-AGGAA AGCGAGAAGAAGGCCAAAACAGCATCGACG-3′;下游:5′-CGTCGATGCTGTTTTGGCCTTCTTCTCGCTTTCCT-3′,由上海生工生物工程有限公司合成。PCR反應(yīng)體系25 μl(pcDNA3.0-PAX3-HA 5 μl,5×HF Buffer 5 μl,dNTP 0.5 μl,Phusion超保真DNA聚合酶 0.5 μl,突變引物各1 μl,去離子水12 μl),同時(shí)將不含引物的PCR反應(yīng)體系設(shè)為陰性對(duì)照。反應(yīng)條件:98 ℃變性30 s后進(jìn)行循環(huán),98 ℃變性30 s,55 ℃退火1 min,72 ℃延伸5 min,共循環(huán)25次,4 ℃保存。加入1 μl DpnⅠ內(nèi)切酶消化,37 ℃,過(guò)夜。酶切產(chǎn)物轉(zhuǎn)化、涂板、篩選與擴(kuò)增后,挑選鑒定克隆。電泳初步鑒定正確后DNA測(cè)序進(jìn)一步鑒定(武漢華大基因公司測(cè)序)。上述構(gòu)建質(zhì)粒DNA測(cè)序鑒定正確后NucleSpin Plasmid Kit試劑盒抽提質(zhì)粒,分光光度計(jì)測(cè)質(zhì)粒濃度,-20 ℃保存。
1.2.2細(xì)胞培養(yǎng)、接種和轉(zhuǎn)染 NIH3T3細(xì)胞用DMEM+10%FBS+1% Pen Strep培養(yǎng)于37 ℃,5% CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱中。轉(zhuǎn)染前1天用胰酶消化細(xì)胞后均勻接種于24孔板或12孔板中,使每孔細(xì)胞密度達(dá)30%~40%。第二天細(xì)胞生長(zhǎng)密度達(dá)50%~60%時(shí)進(jìn)行脂質(zhì)體法轉(zhuǎn)染,每轉(zhuǎn)染1 μg DNA需3 μl Lipfectamine 2000,加入Opti-MEM,6~8 h后吸盡加入新鮮DMEM繼續(xù)培養(yǎng)。
1.2.3PAX3的核定位信號(hào)(nuclear localization signal,NLS)序列預(yù)測(cè) 應(yīng)用NLS預(yù)測(cè)軟件預(yù)測(cè)PAX3的NLS序列(http://cubic.bioc.columbia.edu/predict NLS/)。
1.2.4Western blot檢測(cè)野生型、突變型PAX3蛋白在NIH3T3細(xì)胞中的外源性表達(dá) 野生型PAX3及突變型H80D、H186fs質(zhì)粒分別單獨(dú)轉(zhuǎn)染NIH3T3細(xì)胞48 h后,吸盡12孔板中的DMEM。1×PBS清洗后每孔加入2×SDS上樣緩沖液80 μl(含Protease inhibitor cocktail 0.8μl和0.1 M PMSF 0.8 μl),冰上裂解10 min,將貼壁細(xì)胞刮下后分別移至清潔EP管中。超聲破碎后,95 ℃煮沸變性10 min,冷卻至室溫。13 000 rpm,離心1 min,將上清移至新EP管內(nèi),取10~15 μl上樣在十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠(SDS-PAGE)中進(jìn)行電泳跑膠(分離膠12%,濃縮膠5%)。轉(zhuǎn)膜后封閉、洗滌,加入一抗鼠抗HA單克隆抗體(1:2 000),4 ℃過(guò)夜。洗滌后加入HRP標(biāo)記的山羊抗鼠二抗(1:10 000),室溫1 h。ECL試劑盒顯色后曝光、顯影、成像。
1.2.5細(xì)胞免疫熒光檢測(cè)野生型、突變型PAX3蛋白在NIH3T3細(xì)胞中的定位表達(dá) 轉(zhuǎn)染前1 d將NIH3T3細(xì)胞用胰酶消化后接種于加有滅菌圓形蓋玻片的24孔板中,使每孔細(xì)胞密度達(dá)10%~20%,野生型PAX3及突變型H80D、H186fs質(zhì)粒分別單獨(dú)轉(zhuǎn)染48 h后,吸盡24孔板中的DMEM,1×PBS洗1次。每孔加入4%多聚甲醛室溫固定30 min后吸盡,1×PBS洗滌2次;每孔加入0.2% PBST(250 ml 1×PBS +500 μl Triton X-100 1×PBS)室溫透化30~60 min,吸盡;每孔加入200 μl PBSB(牛血清白蛋白+山羊血清+0.2% PBST)封閉60 min,吸盡。每孔加入單克隆鼠抗HA抗體(1:400)于4 ℃過(guò)夜。0.2%PBST洗3次后加入Cy2標(biāo)記的山羊抗鼠二抗(1:300)室溫避光孵育60 min。0.2%PBST洗3次后加入DAPI核染色2~3 min,吸盡后1×PBS洗滌3次;fluoromount G封片后激光共聚焦顯微鏡斷層掃描后照相保存。
2.1PAX3的NLS序列預(yù)測(cè)結(jié)果 PAX3預(yù)測(cè)軟件預(yù)測(cè)PAX3的NLS序列發(fā)現(xiàn)PAX3有兩個(gè)NLS分別位于HD域的兩端。一個(gè)NLS序列是215LKRKQRR221,位于HD域的N端,另一個(gè)NLS序列是270RRARWRKQ277,位于HD域的C端(圖1)。
2.2PAX3基因重組真核細(xì)胞表達(dá)質(zhì)粒pcDNA3.0-PAX3-HA的構(gòu)建 由于獲贈(zèng)質(zhì)粒pECE-PAX3沒(méi)有蛋白標(biāo)簽,根據(jù)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和后續(xù)實(shí)驗(yàn)需要對(duì)其進(jìn)行改造與重組,以獲得具有蛋白標(biāo)簽的目的載體。利用分子克隆技術(shù)選擇EcoRⅠ/NotⅠ酶切位點(diǎn)將PAX3 cDNA從獲贈(zèng)質(zhì)粒中酶切后克隆到載體pcDNA3.0-HA上從而構(gòu)建了目的重組質(zhì)粒pcDNA3.0-PAX3-HA,其中含有PAX3基因的全長(zhǎng)cDNA 1.44 kb。在pcDNA3.0-PAX3-HA中的PAX3 cDNA片段的5′端含有HA標(biāo)簽,這樣它編碼的蛋白的N端就帶有了HA標(biāo)簽(YPYDVPDYA),可以被特異性抗HA抗體識(shí)別。
2.2.1由pECE-PAX3擴(kuò)增PAX3的電泳鑒定結(jié)果 PAX3基因cDNA全長(zhǎng)1.4 kb,PCR擴(kuò)增pECE-PAX3產(chǎn)物電泳出現(xiàn)1.44 kb大小條帶(圖2a),與目的條帶PAX3大小符合。
2.2.2PAX3與pcDNA3.0-HA雙酶切電泳鑒定結(jié)果 pcDNA3.0-HA全長(zhǎng)5.4 kb,與純化回收的PCR擴(kuò)增PAX3產(chǎn)物雙酶切后電泳,分別獲得了5.4 kb片段和1.44 kb片段(圖2b),與目的條帶pcDNA3.0-HA和PAX3大小符合。
2.2.3PAX3與pcDNA3.0-HA雙酶切產(chǎn)物連接后電泳鑒定結(jié)果 pcDNA3.0-PAX3-HA連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化涂板后挑選6個(gè)單克隆進(jìn)行雙酶切電泳鑒定,結(jié)果如圖2c所示,1~6道連接產(chǎn)物均被EcoRⅠ/ NotⅠ切開(kāi),均獲得兩條5.4 kb和1.44 kb大小片段,分別與目的條帶pcDNA3.0-HA和PAX3大小符合。重組質(zhì)粒pcDNA3.0-PAX3-HA中插入的目的基因PAX3 cDNA序列與GenBank中的相應(yīng)登錄序列比對(duì)正確,說(shuō)明PAX3基因正確的插入到了質(zhì)粒pcDNA3.0-HA的EcoRⅠ和NotⅠ之間。
2.3PAX3基因突變真核細(xì)胞表達(dá)質(zhì)粒pcDNA3.0-80D-HA和pcDNA3.0-186fs-HA的構(gòu)建 重組質(zhì)粒pcDNA3.0-PAX3-HA中插入的目的基因PAX3 cDNA序列與GenBank中的相應(yīng)登錄序列比對(duì)正確后,以目的重組質(zhì)粒pcDNA3.0-PAX3-HA為模板構(gòu)建H80D和H186fs突變型真核細(xì)胞表達(dá)載體,雙酶切初步鑒定正確后經(jīng)DNA測(cè)序鑒定突變位點(diǎn)的核苷酸序列均正確(圖3、4),說(shuō)明pcDNA3.0-80D-HA和pcDNA3.0-186fs-HA構(gòu)建成功。
圖1 PAX3蛋白NLS序列預(yù)測(cè)結(jié)果
圖2 重組真核細(xì)胞表達(dá)質(zhì)粒pcDNA3.0-PAX3-HA的鑒定
a PAX3擴(kuò)增 PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖,M:1kb DNA ladder marker, 1:PAX3產(chǎn)物;b PAX3和pcDNA3.0-HA的雙酶切產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖,M:1kb DNA ladder marker,1:PAX3 2:pcDNA3.0-HA;c pcDNA3.0-PAX3-HA連接產(chǎn)物雙酶切電泳鑒定,M:1kb DNA ladder marker,1~6:pcDNA3.0-PAX3-HA雙酶切產(chǎn)物
圖3 突變型H80D與野生型PAX3的DNA測(cè)序峰圖 a:野生型PAX3 b:突變型H80D
圖4 突變型H186fs與野生型PAX3的DNA測(cè)序峰圖 a:野生型PAX3 b:突變型H186fs
2.4野生型及突變型PAX3蛋白在NIH3T3細(xì)胞中的外源性表達(dá) H80D(c.238C>G)是一錯(cuò)義突變,突變的PAX3基因的238位上的堿基C變?yōu)閴A基G,產(chǎn)生的突變蛋白的80位的組氨酸變成了天冬氨酸,但含有的氨基酸與野生PAX3蛋白相同,分子量仍為53 kDa。H186fs(c.556delC)是由于PAX3基因的556位缺失了堿基C,導(dǎo)致其后的核苷酸移位,編碼的蛋白在192位氨基酸出現(xiàn)終止密碼子,產(chǎn)生含有191個(gè)氨基酸的截?cái)嗟鞍?,最?個(gè)氨基酸由移碼的核苷酸編碼,分子量大小約21 kDa(圖5a)。
構(gòu)建成功的真核細(xì)胞表達(dá)載體中的目的基因可以在細(xì)胞中表達(dá)相應(yīng)的蛋白,為了研究突變蛋白表達(dá)是否正常,同時(shí)進(jìn)一步驗(yàn)證構(gòu)建的突變質(zhì)粒是否正確,利用Western blot對(duì)其在NIH3T3細(xì)胞中的外源性表達(dá)進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果野生PAX3蛋白和突變H80D、H186fs蛋白出現(xiàn)目的條帶,大小正確(圖5b)。
圖5 Western blot檢測(cè)野生型、突變型PAX3蛋白在293T細(xì)胞中的表達(dá)
a:野生型、突變型PAX3蛋白結(jié)構(gòu)示意圖,X后數(shù)字表示框碼移位的氨基酸的數(shù)量;b:野生型、突變型PAX3蛋白的表達(dá)
2.5野生型/突變型PAX3蛋白在NIH3T3細(xì)胞中的定位表達(dá) 為進(jìn)一步了解并研究2個(gè)PAX3突變蛋白的亞細(xì)胞定位,利用細(xì)胞免疫熒光對(duì)他們?cè)贜IH3T3細(xì)胞中的定位表達(dá)進(jìn)行觀(guān)察。結(jié)果發(fā)現(xiàn)H80D突變蛋白和野生PAX3蛋白一樣只在細(xì)胞核中分布,而H186fs突變蛋白則出現(xiàn)異常亞細(xì)胞定位,在細(xì)胞核與細(xì)胞質(zhì)中均有分布(圖6)。
圖6 野生型、突變型PAX3蛋白在NIH3T3細(xì)胞中定位(×1 200)
PAX3野生蛋白和H80D突變蛋白僅在細(xì)胞核內(nèi)分布,H186fs突變蛋白在細(xì)胞核與細(xì)胞質(zhì)內(nèi)均有分布。綠色:cy2染色,示野生PAX3蛋白(a),H80D突變蛋白(d),H186fs突變蛋白(g);藍(lán)色:DAPI染色,示細(xì)胞核(b,e,h);綠色和藍(lán)色疊加后的圖像(c,f,i);WT:野生型(wild type)
PAX3基因編碼的PAX3蛋白由479個(gè)氨基酸組成,主要含有配對(duì)盒結(jié)構(gòu)域(paired box domain,PD)、同源結(jié)構(gòu)域(homeodomain,HD)、高度保守的鋅肽序列和富含絲氨酸-蘇氨酸-脯氨酸的轉(zhuǎn)錄激活域(transcriptional activation,TA)[2],其分子量大小約53 kD。PAX3最早于NC遷徙前在背神經(jīng)管表達(dá),后隨神經(jīng)管的發(fā)育逐漸在中樞神經(jīng)系統(tǒng)、關(guān)節(jié)、骨骼肌以及NC源性組織如周?chē)窠?jīng)系統(tǒng)、心肌間質(zhì)、平滑肌、胸腺、腎上腺髓質(zhì)、皮膚毛發(fā)和內(nèi)耳的黑素細(xì)胞中廣泛表達(dá)。PAX3通過(guò)調(diào)節(jié)NC發(fā)育而參與胚胎生長(zhǎng)發(fā)育的調(diào)控,在骨骼肌及黑色素的形成過(guò)程中發(fā)揮重要作用[1,5]。在黑素細(xì)胞的發(fā)育中,PAX3主要通過(guò)直接或與其它轉(zhuǎn)錄因子協(xié)同作用激活或抑制小眼球畸形相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子(microphthalmiaassciated transcription factor,MITF)、多巴色素異構(gòu)酶(dopachrome tautomerase,DCT)、酪氨酸酶相關(guān)蛋白1(tyrosinase related protein 1,TRP1)的表達(dá),參與調(diào)控黑素細(xì)胞的生長(zhǎng)、發(fā)育與分化,既能促進(jìn)也能抑制黑色素合成[1,6]。MITF、TRP1和DCT是黑素細(xì)胞發(fā)育和黑色素合成中的關(guān)鍵調(diào)控因子。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)研究顯示黑素細(xì)胞發(fā)育不良會(huì)引起血管紋中黑素細(xì)胞源性的中間細(xì)胞缺乏進(jìn)而造成Corti器退化變性,最終導(dǎo)致感音神經(jīng)性聾[7]。PAX3基因突變通過(guò)影響NC發(fā)育尤其是NC源性黑素細(xì)胞發(fā)育導(dǎo)致WS。
以轉(zhuǎn)染為基礎(chǔ)的體外實(shí)驗(yàn)是研究突變對(duì)基因功能影響最常用的實(shí)驗(yàn)方法[6,8,9],需要利用分子克隆技術(shù)將目的基因克隆到載體構(gòu)建真核細(xì)胞表達(dá)載體后導(dǎo)入細(xì)胞。本實(shí)驗(yàn)在以野生型質(zhì)粒為模板構(gòu)建突變質(zhì)粒時(shí)應(yīng)用Phusion超保真DNA聚合酶較高效率地通過(guò)PCR將突變的cDNA片段擴(kuò)增出來(lái)。利用成功構(gòu)建的野生型和突變型PAX3真核細(xì)胞重組表達(dá)質(zhì)粒通過(guò)瞬時(shí)轉(zhuǎn)染NIH3T3細(xì)胞進(jìn)行蛋白表達(dá)檢測(cè),結(jié)果顯示野生PAX3、突變H80D和H186fs蛋白在NIH3T3細(xì)胞均正確表達(dá),進(jìn)一步驗(yàn)證了構(gòu)建的突變表達(dá)質(zhì)粒的正確性,也為下一步亞細(xì)胞定位實(shí)驗(yàn)奠定了基礎(chǔ)。盡管錯(cuò)義突變H80D未影響氨基酸合成數(shù)量,其翻譯成的突變蛋白與野生蛋白具有相同的多肽鏈,但80位氨基酸的改變可能使突變蛋白多肽鏈在構(gòu)象、極性等方面與野生蛋白出現(xiàn)差異而導(dǎo)致其蛋白功能的異常,有待進(jìn)一步研究。
PAX3蛋白是轉(zhuǎn)錄因子,屬于核蛋白,僅在細(xì)胞核中分布并行使其正常功能,在其氨基酸序列上擁有特異的核定位信號(hào)NLS,可以被相應(yīng)的核轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白識(shí)別后通過(guò)細(xì)胞核膜上的核孔復(fù)合體(nuclear pore complex,NPC)進(jìn)入到細(xì)胞核,然后和靶基因的啟動(dòng)子結(jié)合啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄。因此,正常的細(xì)胞分布是PAX3行使其正常的生理功能的前提條件,異常的細(xì)胞分布必然導(dǎo)致其功能的異常。PAX3蛋白的NLS序列還沒(méi)有文獻(xiàn)報(bào)道,本研究利用NLS預(yù)測(cè)軟件預(yù)測(cè)了PAX3的NLS序列(http://cubic.bioc.columbia.edu/predictNLS/),發(fā)現(xiàn)PAX3有兩個(gè)NLS分別位于HD域的兩端。一個(gè)NLS序列是215LKRKQRR221,位于HD域的N端,另一個(gè)NLS序列是270RRARWR KQ277,位于HD域的C端。HD是PAX3蛋白與DNA結(jié)合以及與其他蛋白相互作用的重要功能域,由第220~277位共58個(gè)氨基酸組成。H80D突變蛋白的HD域及兩個(gè)NLS序列完整,可以被轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白識(shí)別并被轉(zhuǎn)運(yùn)通過(guò)NPC進(jìn)入細(xì)胞核,所以其亞細(xì)胞定位與野生PAX3一樣。而H186fs突變蛋白失去了HD域和兩個(gè)NLS序列,成為大小約21 kDa的截?cái)嗟鞍?,可以通過(guò)被動(dòng)擴(kuò)散經(jīng)NPC進(jìn)入細(xì)胞核內(nèi),出現(xiàn)異常的亞細(xì)胞定位,在細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)內(nèi)均有分布,提示H186fs突變蛋白功能異常。
PAX3基因突變可導(dǎo)致PAX3蛋白功能的異常進(jìn)而影響黑素細(xì)胞發(fā)育,本研究初步顯示了基因突變對(duì)PAX3蛋白在細(xì)胞中分布的影響。但PAX3基因突變體H80D和H186fs如何影響PAX3對(duì)靶基因的調(diào)控導(dǎo)致國(guó)人WS的發(fā)病機(jī)制尚需進(jìn)一步研究,本研究為其奠定了實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。
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