王曉亮, 張 昊, 潘 逸, 許景升, 徐 進(jìn), 馮 潔
(中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所,植物病蟲(chóng)害生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100193)
絲狀真菌是一類(lèi)產(chǎn)生繁茂菌絲體不產(chǎn)生子實(shí)體的真菌,廣泛分布于自然界,在工業(yè)、農(nóng)業(yè)、醫(yī)藥以及基礎(chǔ)生物學(xué)研究中具有重要作用[1-2]。禾谷鐮刀菌(Fusarium graminearumSchwabe)等植物病原真菌是絲狀真菌的重要組成部分,由禾谷鐮刀菌引起的小麥赤霉病 (Fusariumhead blight,F(xiàn)HB)是一種世界范圍內(nèi)的重要病害[3],近年來(lái)在我國(guó)發(fā)生尤為嚴(yán)重。該病害的流行除了引起小麥產(chǎn)量損失外,禾谷鐮刀菌還能產(chǎn)生多種毒素,造成食品安全上的巨大隱患[4-6]。
禾谷鐮刀菌的全基因組測(cè)序已于2002年完成,測(cè)序菌株為歐洲和北美發(fā)現(xiàn)的野生型菌株P(guān)H-1,測(cè)序結(jié)果包括基因組序列、遺傳圖譜和表達(dá)序列標(biāo)簽等[7-9]。在此基礎(chǔ)上,采用比較基因組學(xué)、生物信息學(xué)方法對(duì)禾谷鐮刀菌生長(zhǎng)發(fā)育、致病和毒素合成等分子機(jī)制的研究成為熱點(diǎn)并取得了較大的進(jìn)展,禾谷鐮刀菌等植物病原絲狀真菌基因組學(xué)的時(shí)代已經(jīng)到來(lái)[10]。Wang等系統(tǒng)地對(duì)禾谷鐮刀菌所有116個(gè)蛋白激酶基因進(jìn)行了功能鑒定,獲得了96個(gè)基因的突變體,得到了大量表型數(shù)據(jù),為進(jìn)一步明確其參與代謝調(diào)控網(wǎng)絡(luò)奠定了基礎(chǔ)[11]。Jiang等鑒定了HOG途徑中多個(gè)關(guān)鍵基因的功能,明確了其信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制[12-13]。Kimura等闡明了禾谷鐮刀菌中單端孢霉烯族毒素合成的分子調(diào)控機(jī)制[14]。最近,Zhao等利用RNA-Seq技術(shù)對(duì)于禾谷鐮刀菌的基因組的注釋進(jìn)行了修訂,修改了655個(gè)錯(cuò)誤的基因注釋?zhuān)b定了2 459個(gè)轉(zhuǎn)錄活躍區(qū),確定了7 666個(gè)基因的5′UTR和3′UTR[15]。與此同時(shí),利用反向遺傳學(xué)方法,直接從基因入手,通過(guò)基因敲除和回復(fù)、基因沉默、基因過(guò)表達(dá)和對(duì)相關(guān)蛋白進(jìn)行定位等來(lái)研究基因功能的文章也已經(jīng)十分普遍。王光輝等研究得出小麥赤霉菌中的精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶基因?qū)τ诔嗝咕z的正常生長(zhǎng)和致病性都有重要的作用[16]。Min等研究得出,在禾谷鐮刀菌中敲除過(guò)氧化物酶體基因PEX5、PEX6和PEX7,影響了碳源營(yíng)養(yǎng)的利用和致病性[17]。但是,目前對(duì)于基因敲除和回復(fù)、過(guò)表達(dá)外源蛋白或熒光融合蛋白,基本上每個(gè)基因還需各自獨(dú)立構(gòu)建載體,缺少通用的載體,耗費(fèi)的時(shí)間精力非常多[1]。在構(gòu)建敲除載體的時(shí)候,兩條同源重組片段需要連接在載體抗性基因的兩側(cè),這樣就需要使用4種不同的酶切位點(diǎn)、2次成功的轉(zhuǎn)化來(lái)保證重組片段的方向性和正確性(圖1)。近些年來(lái),出現(xiàn)了很多依靠不同的限制性?xún)?nèi)切酶消化出特定酶切位點(diǎn),再將常規(guī)PCR獲得同源重組片段插入到這些位點(diǎn)上的高通量的技術(shù),包括了Xi克隆法(Xi-cloning)、連 接 酶 克 隆 法 (LIC-PCR)、重 組 克 隆 法(recombinational cloning)以及USER酶克隆技術(shù)(USER friendly cloning techniques)[18-21]。
USER(uracil-specific excision reagent)酶克隆技術(shù),可以在不使用酶切位點(diǎn)和DNA連接酶的條件下直接將PCR產(chǎn)物克隆到載體。USER酶是一種特異性切割尿嘧啶的混合酶,包含尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG)和核酸內(nèi)切酶Ⅷ。其中,UDG催化尿嘧啶堿基的切除,形成一個(gè)脫嘧啶位點(diǎn),但同時(shí)保持了磷酸二酯鍵骨架的完整性。核酸內(nèi)切酶Ⅷ的裂解酶活性則分別在脫堿基位點(diǎn)的3′端 和5′端裂解磷酸二酯鍵骨架,釋放無(wú)堿基的脫氧核糖。此方法需在PCR引物5′端加入一段較長(zhǎng)的(8~10bp)包含有脫氧尿嘧啶dU的與載體互補(bǔ)的特異性序列。在USER酶作用下,引物兩側(cè)5′端至dU的序列被剪切,形成具有8~10個(gè)堿基的3′突出黏性末端,同時(shí)在載體上制備與之互補(bǔ)黏性末端,由于黏性末端長(zhǎng)度遠(yuǎn)長(zhǎng)于普通酶切位點(diǎn),所以不需要DNA連接酶的作用即可完成連接。本研究構(gòu)建了3個(gè)適用于USER酶克隆技術(shù)的通用載體,并通過(guò)試驗(yàn)證明這些載體在不需要酶切位點(diǎn)和DNA連接酶的條件下具有很高的連接效率,可用于大規(guī)模構(gòu)建鐮刀菌基因敲除和熒光融合蛋白表達(dá)載體,從而進(jìn)行高通量鐮刀菌基因功能分析。
圖1 基因敲除載體的兩種構(gòu)建方法Fig.1 Two methods for construction of gene replacement vectors
試驗(yàn)使用的小麥赤霉病菌株為禾谷鐮刀菌國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)菌株P(guān)H-1。將菌株接種在PDA平板上28℃避光培養(yǎng)5d,刮取菌絲于2mL離心管中,液氮速凍,破碎,采用真菌DNA小量提取試劑盒D3390-02(Omega,美國(guó))提取DNA,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
USERTM酶,PacI酶,Nt.BbvCI酶(New England Biolabs公司,美國(guó)),大腸桿菌(E.coli)感受態(tài)細(xì)胞DH5α(天根生化有限科技公司,北京),寡核苷酸退火緩沖液(碧云天生物技術(shù)研究所),PCR篩選陽(yáng)性克隆使用PCR MIX(東盛集團(tuán)有限公司,廣州),PRIMERSTAR高保真DNA聚合酶(寶生物公司,大連)所有PCR反應(yīng)以及溫度孵育過(guò)程都在Eppendorf Mastercycler gradient(Eppendorf公司,德國(guó))上進(jìn)行,引物設(shè)計(jì)根據(jù)Broad研究所提供的數(shù)據(jù)以及相關(guān)的注釋?zhuān)ňW(wǎng)址:http:∥www.broad.mit.edu/annotation)并通過(guò)Prime Premier 5進(jìn)行設(shè)計(jì),引物合成和后續(xù)的測(cè)序都由上海生工生物工程有限公司完成。
pKH質(zhì)粒和pKN質(zhì)粒由本實(shí)驗(yàn)室保存。pKH質(zhì)粒是pBluescriptⅡKS質(zhì)粒為基礎(chǔ),在EcoRⅤ位點(diǎn)插入了潮霉素抗性片段。pKN質(zhì)粒是pBluescriptⅡKS質(zhì)粒為基礎(chǔ),在XhoⅠ位點(diǎn)插入G418抗性片段。
1.3.1 基因敲除通用載體的構(gòu)建
合成互補(bǔ)的寡核苷酸序列UBamHI和UEcoRI、DXhoI和DKpnI,來(lái)構(gòu)建抗性基因兩側(cè)的USER酶克隆位點(diǎn)(USER cloning sites,UCS)。100μL退火體系:UBamHI(DXhoI)10μmol/L、UEcoRI(DKpnI)10μmol/L、退火緩沖液1×;退火程序:95℃5min,每8s下降0.1℃,降至25℃,4℃保溫,使兩條寡核苷酸序列形成雙鏈互補(bǔ)序列,UBamHI和UEcoRI形成USER酶克隆位點(diǎn)1(UCS1),DXhoI和DKpnI形成USER酶克隆位點(diǎn)2(UCS2)。將UCS1連入pKH載體的BamH I和EcoR I位點(diǎn),UCS2連入XhoI和KpnI位點(diǎn),轉(zhuǎn)化至大腸桿菌獲得單克隆測(cè)序驗(yàn)證,構(gòu)建載體命名為pKH-KO。
1.3.2 熒光融合蛋白表達(dá)通用載體的構(gòu)建
以pGenGFP載體為模版,用PRIMERSTAR高保真DNA聚合酶,GFPFHindⅢ和GFPRKpnⅠ為引物擴(kuò)增獲得大小1 100bp的GFP-Tnos片段,分別連入pKH和pKN兩個(gè)載體的KpnⅠ和HindⅢ位點(diǎn)之間,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌,構(gòu)建載體分別命名為pKHGFPE和pKNGFPE。
1.4.1 通用載體的制備
將含有載體pKH-KO、pKHGFPE和pKNGFPE的大腸桿菌接種于含有氨芐的LB培養(yǎng)基,37℃200r/min過(guò)夜培養(yǎng)。采用Axygen質(zhì)粒小提試劑盒(愛(ài)思進(jìn)生物技術(shù)公司,杭州)提取質(zhì)粒。超微量分光光度計(jì)NanoVue(GE公司,美國(guó))檢測(cè)質(zhì)粒濃度。采用300μL體系加入70UPacⅠ 后37℃過(guò)夜酶切約10μg質(zhì)粒。第2天,再加入20UPacI和40UNt.BbvCI,37℃溫育1h,取2~3μL酶切產(chǎn)物進(jìn)行電泳檢測(cè)。然后用Axygen DNA純化試劑盒進(jìn)行純化,得到終濃度約50ng/μL的通用載體,-20℃保存待用。
1.4.2 禾谷鐮刀菌FgPex 5基因敲除載體的構(gòu)建
根據(jù)禾谷鐮刀菌基因組信息設(shè)計(jì)FgPex 5基因上游序列擴(kuò)增引物P5UF、P5UR和下游引物P5DF、P5DR,并在引物的5′端分別添加 O1、O2和O3、O4序列:
以基因組為模版采用東盛taqmix擴(kuò)增FgPex 5基因的上下游片段P5U和P5D,電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物濃度。使用25μL體系進(jìn)行酶切連接,體系包含:
反應(yīng)條件:37℃溫浴20min,25℃溫浴20min。反應(yīng)產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌,挑取單克隆測(cè)序驗(yàn)證。
1.4.3 禾谷鐮刀菌FgPex 5熒光融合表達(dá)載體的構(gòu)建
根據(jù)FgPex5基因序列信息設(shè)計(jì)引物P5PF、P5GR,擴(kuò)增包含上游啟動(dòng)子與ORF的序列(不含終止子)P5PG,并在引物的5′端分別添加1.4.2中O3和O4序列。
以基因組為模版,采用PfuTurbo?Cx Hot-start DNA Polymerase(Agilent,600410)擴(kuò)增包含啟動(dòng)子的FgPex 5基因序列P5PG。使用25μL體系進(jìn)行酶切連接,體系包含:
反應(yīng)條件:37℃溫浴20min,25℃溫浴20min。反應(yīng)產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌,挑取單克隆測(cè)序驗(yàn)證。
1.4.4 原生質(zhì)體的轉(zhuǎn)化
參考Desmond的方法[22]制備原生質(zhì)體,并將構(gòu)建好的載體用KpnⅠ線性化后進(jìn)行原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化,獲得的轉(zhuǎn)化子使用相應(yīng)的潮霉素B或G418進(jìn)行抗性篩選。
表1 試驗(yàn)所用引物Table 1 Primers for experiments
構(gòu)建了基因敲除通用載體pKH-KO(圖2a)和熒光融合蛋白表達(dá)通用載體pKHGFPE(圖2b)和pKNGFPE(圖2c)。
本方法通過(guò)特定的酶將載體上的USER酶特異位點(diǎn)和兩條PCR重組片段產(chǎn)物消化出互補(bǔ)的黏性末端,通過(guò)一次連接反應(yīng)就能將兩條同源重組片段連接到抗性基因的兩側(cè)。在目的基因的兩條同源重組片段擴(kuò)增引物的5′端加上含有尿嘧啶脫氧核苷酸的9個(gè)堿基(圖3a),這樣PCR獲得的同源重組片段在USER酶的作用下就會(huì)被消化出特定黏性末端(圖3b)。使用PacⅠ和Nt.BbvCI兩種酶消化含有UCS序列的通用載體,使其出現(xiàn)與同源重組片段互補(bǔ)的黏性末端(圖3c)。由于互補(bǔ)序列長(zhǎng)達(dá)9個(gè)堿基,上述兩個(gè)消化產(chǎn)物可以在沒(méi)有DNA連接酶的條件下直接完成連接反應(yīng)(圖3d)。連接產(chǎn)物可以直接進(jìn)行下一步試驗(yàn)(圖3e)。熒光融合表達(dá)載體的構(gòu)建原理與之相同。
圖2 載體的示意圖Fig.2 The constructed USER vector
圖3 USER酶一步法構(gòu)建基因敲除載體示意圖Fig.3 The USER enzyme strategy for single step construction of gene replacement vectors
使用基因敲除通用載體pKH-KO在禾谷鐮刀菌野生型菌株P(guān)H-1中進(jìn)行FgPex 5基因敲除。對(duì)于獲得的轉(zhuǎn)化子采用PCR鑒定的方法進(jìn)行篩選,泳道1、2、3、4為野生型菌株P(guān)H-1電泳結(jié)果,5、6、7、8為FgPex 5基因缺失突變體菌株電泳結(jié)果。用3對(duì)引物檢測(cè)轉(zhuǎn)化子其位置如圖4所示,3對(duì)引物各自作用如下:
1)引物5nF和5nR是用來(lái)檢測(cè)目的基因是否被敲除(泳道2、6);2)引物H852和H850是用來(lái)檢測(cè)hph基因的存在(泳道1、5);3)引物5wF和H852是用來(lái)檢測(cè)上游的同源重組的發(fā)生(泳道3、7);4)引物H850和5wR是用來(lái)檢測(cè)下游的同源重組的發(fā)生(泳道4、8)。只有當(dāng)如圖同源重組發(fā)生時(shí),目的基因才會(huì)被hph基因替換掉。
使用熒光融合蛋白表達(dá)通用載體pKNGFPE導(dǎo)入到菌株中,將孢子和萌發(fā)的菌絲在熒光共聚焦顯微鏡(Leica TCS SP2,德國(guó))下觀察并拍照,GFP熒光的激發(fā)波長(zhǎng)在488nm,結(jié)果如圖5所示。
圖4 PCR驗(yàn)證檢測(cè)策略及結(jié)果Fig.4 The PCR analysis of mutants
圖5 熒光定位蛋白信號(hào)圖Fig.5Subcellular localization of GFP fusion protein in the mutants
對(duì)于真菌基因組測(cè)序結(jié)果的初步注釋已經(jīng)預(yù)測(cè)到了大量沒(méi)有相關(guān)同源蛋白的假設(shè)蛋白[23]。僅就禾谷鐮刀菌PH-1而論,在13 938個(gè)假設(shè)基因里就有8 091個(gè)基因(占58%)是“保守假設(shè)蛋白”或者“假設(shè)蛋白”一類(lèi)[24]。面對(duì)如此多的假設(shè)基因和假設(shè)蛋白,我們就需要一個(gè)十分高效的基因敲除策略來(lái)研究各個(gè)基因?qū)τ谥虏⌒院痛渭?jí)代謝物方面的影響。
采用傳統(tǒng)方法構(gòu)建基因敲除載體,需要至少兩次酶切、連接、轉(zhuǎn)化分別連接兩個(gè)同源重組片段,而本方法將酶切與連接步驟合并,并且僅需一步可以同時(shí)連接上兩個(gè)片段(圖1),極大地簡(jiǎn)化了工作、提高了效率。影響載體構(gòu)建工作的另一個(gè)限制因素是酶切位點(diǎn)的選擇,克隆片段中的酶切位點(diǎn)直接影響到載體的構(gòu)建,一般的載體可以提供多個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行選擇,但面對(duì)全基因組眾多基因來(lái)說(shuō),仍然是遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠的,特別是熒光融合蛋白表達(dá)載體構(gòu)建中選擇酶切位點(diǎn)的同時(shí)還要考慮兩個(gè)基因之間linker序列的堿基數(shù)目,這就更加限制了酶切位點(diǎn)的選擇。而本方法的另一個(gè)優(yōu)勢(shì)就在于采用自身構(gòu)建的9bp互補(bǔ)序列進(jìn)行連接,完全省去了酶切位點(diǎn)選擇的步驟,這為載體的構(gòu)建從設(shè)計(jì)上減輕了很大的工作量。同時(shí),相對(duì)于普通酶切位點(diǎn)2~3個(gè)堿基黏性末端的連接,本方法中長(zhǎng)達(dá)9bp的黏性末端在不用DNA連接酶的情況下使連接效率得到了很大的提高。近年來(lái)split-marker方法[25]構(gòu)建敲除載體在鐮刀菌的基因功能分析中得到了比較廣泛的應(yīng)用[11,26],與傳統(tǒng)方法相比,步驟簡(jiǎn)單,省時(shí)省力。但在實(shí)際操作過(guò)程中發(fā)現(xiàn),不同基因重疊PCR條件差異較大,經(jīng)常出現(xiàn)重疊失敗或者重疊擴(kuò)增效率低、產(chǎn)物量少,不足以進(jìn)行下一步轉(zhuǎn)化的情況,摸索最佳條件往往花費(fèi)很長(zhǎng)時(shí)間。而本方法所采用的全部是最基礎(chǔ)的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù),成功率高,更易于上手操作。
使用本文的方法進(jìn)行載體構(gòu)建由于擴(kuò)增引物中含有dU,所以需要注意DNA聚合酶的選擇。來(lái)源于真細(xì)菌的Taq酶可以擴(kuò)增dU,對(duì)于片段較短、保真性要求不高的基因敲除載體構(gòu)建可以選用Taq酶。而構(gòu)建熒光融合表達(dá)載體則需要擴(kuò)增包含啟動(dòng)子的整個(gè)基因,片段較長(zhǎng)并且要求不能有堿基錯(cuò)誤,這就需要用高保真DNA聚合酶。但一般來(lái)源于古細(xì)菌的高保真DNA聚合酶如Vent、Pfu等均無(wú)法正常擴(kuò)增dU[27]。因此,本研究選用了目前唯一能夠擴(kuò)增dU的高保真DNA聚合酶PfuTurbo?Cx Hotstart DNA Polymerase(Agilent,600410)進(jìn)行擴(kuò)增,取得了很好的效果。
本實(shí)驗(yàn)室通過(guò)使用USER酶一步載體構(gòu)建法構(gòu)建了禾谷鐮刀菌十幾個(gè)過(guò)氧化物酶體基因(如Fg-Pex5基因)的敲除載體與綠色熒光蛋白融合表達(dá)載體,進(jìn)行了原生質(zhì)體的轉(zhuǎn)化,獲得了大量的基因敲除轉(zhuǎn)化子,在轉(zhuǎn)化效率上與傳統(tǒng)載體構(gòu)建方法相比沒(méi)有明顯差異。采用這種方法構(gòu)建目的載體十分適合高通量的基因敲除與熒光融合表達(dá)試驗(yàn)[27]。這種方法對(duì)于在實(shí)驗(yàn)室條件下進(jìn)行鐮刀菌基因敲除和蛋白定位等基因功能的研究有著很大的應(yīng)用前景。
[1]李海嬌,盧建平,劉小紅,等.適用于稻瘟病菌基因敲除、過(guò)表達(dá)和熒光融合蛋白表達(dá)載體的構(gòu)建和使用[J].農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào),2012,20(1):94-104.
[2]陳獻(xiàn)忠,沈微,樊游,等.后基因組時(shí)代的絲狀真菌基因組學(xué)與代謝工程[J].遺傳,2011,33(10):1067-1078.
[3]Watters M K,Randall T A,Margolin B S,et al.Action of repeat-induced point mutation on both strands of a duplex and on tandem duplications of various sizes in Neurospora[J].Genetics,1999,153(2):705-714.
[4]O’Donnell K,Kistler H C,Tacke B K,et al.Gene genealogies reveal global phylogeographic structure and reproductive isolation among lineages of Fusarium graminearum,the fungus causing wheat scab[J].Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,2000,97(14):7905-7910.
[5]Tanaka T,Hasegawa A,Yamamoto S,et al.Worldwide contamination of cereals by the Fusarium mycotoxins nivalenol,deoxynivalenol,and zearalenone.1.Survey of 19countries[J].Journal of Agricultural and Food Chemistry,1988,36(5):979-983.
[6]Windels C E.Economic and social impacts of Fusarium head blight:changing farms and rural communities in the Northern Great Plains[J].Phytopathology,2000,90(1):17-21.
[7]Trail F,Xu J R,Miguel P S,et al.Analysis of expressed sequence tags fromGibberella zeae(anamorph Fusarium graminearum)[J].Fungal Genetics and Biology,2003,38(2):187-197.
[8]Jurgenson J E,Zeller K A,Leslie J F.Expanded genetic map of Gibberella moniliformis (Fusarium verticillioides)[J].Applied and Environmental Microbiology,2002,68(4):1972-1979.
[9]Lee J,Jurgenson J E,Leslie J F,et al.Alignment of genetic and physical maps of Gibberella zeae [J].Applied and Environmental Microbiology,2008,74(8):2349-2359.
[10]Xu J R,Peng Y L,Dickman M B,et al.The dawn of fungal pathogen genomics[J].Annual Review of Phytopathology,2006,44:337-366.
[11]Wang C,Zhang S,Hou R,et al.Functional analysis of the kinome of the wheat scab fungus Fusarium graminearum[J].PLoS Pathogens,2011,7(12):e1002460.
[12]Jiang J,Liu X,Yin Y,et al.Involvement of a velvet protein FgVeA in the regulation of asexual development,lipid and secondary metabolisms and virulence in Fusarium graminearum[J].PloS One,2011,6(11):e28291.
[13]Jiang J H,Yun Y Z,Yang Q Q,et al.A type 2Cprotein phosphatase FgPtc3is involved in cell wall integrity,lipid metabolism,and virulence in Fusarium graminearum[J].PloS One,2011,6(9):e25311.
[14]Kimura M,Tokai T,Takahashi-Ando N,et al.Molecular and genetic studies of Fusariumtrichothecene biosynthesis:pathways,genes,and evolution[J].Bioscience,Biotechnology,and Biochemistry,2007,71(9):2105-2123.
[15]Zhao C,Waalwijk C,de Wit P J,et al.RNA-Seq analysis reveals new gene models and alternative splicing in the fungal pathogen Fusarium graminearum [J].BioMed Central Genomics,2013,14(1):21.
[16]Wang G H,Wang C F,Hou R,et al.The AMT1arginine methyltransferase gene is important for plant infection and normal hyphal growth in Fusarium graminearum [J].PloS One,2012,7(5):e38324.
[17]Min K,Son H,Lee J,et al.Peroxisome function is required for virulence and survival of Fusarium graminearum[J].Molecular Plant-Microbe Interactions,2012,25(12):1617-1627.
[18]Liang X,Teng A,Chen S,et al.Rapid and enzymeless cloning of nucleic acid fragments:United States of America,US 6936470B2[P].2005-08-30.
[19]Aslanidis C,De Jong P J.Ligation-independent cloning of PCR products(LIC-PCR)[J].Nucleic Acids Research,1990,18(20):6069-6074.
[20]Marsischky G,LaBaer J.Many paths to many clones:a comparative look at high-throughput cloning methods[J].Genome Research,2004,14:2020-2028.
[21]Kodumal S J,Patel K G,Reid R,et al.Total synthesis of long DNA sequences:synthesis of a contiguous 32-kb polyketide synthase gene cluster[J].Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,2004,101(44):15573-15578.
[22]Desmond O J,Manners J M,Stephens A E,et al.The Fusariummycotoxin deoxynivalenol elicits hydrogen peroxide production,programmed cell death and defence responses in wheat[J].Molecular Plant Pathology,2008,9(4):435-445.
[23]Frandsen R J,Andersson J A,Kristensen M B,et al.Efficient four fragment cloning for the construction of vectors for targeted gene replacement in filamentous fungi[J].BioMed Central Molecular Biology,2008,9:70.
[24]Guldener U,Mannhaupt G,Münsterkütter M,et al.FGDB:a comprehensive fungal genome resource on the plant pathogen Fusarium graminearum[J].Nucleic Acids Research,2006,34:D456-D458.
[25]Catlett N,Lee B N,Yoder O,et al.Split-marker recombination for efficient targeted deletion of fungal genes[J].Fungal Genetics Newsletter,2003,50:9-11.
[26]Son H,Seo Y S,Min K,et al.A phenome-based functional analysis of transcription factors in the cereal head blight fungus,F(xiàn)usarium graminearum [J].PLoS Pathogens,2011,7(10):e1002310.
[27]Greagg M A,F(xiàn)ogg M J,Panayotou G,et al.A read-ahead function in archaeal DNA polymerases detects promutagenic template-strand uracil[J].Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,1999,96(16):9045-9050.