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基因測(cè)序的是與非

2014-05-05 04:33楊欣
百科知識(shí) 2014年9期
關(guān)鍵詞:癌癥測(cè)序基因

楊欣

國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理總局、國(guó)家衛(wèi)生計(jì)生委日前聯(lián)合發(fā)出通知,任何醫(yī)療機(jī)構(gòu)不得開(kāi)展基因測(cè)序臨床應(yīng)用,已經(jīng)開(kāi)展的要立即停止,仍繼續(xù)開(kāi)展的,衛(wèi)生行政部門(mén)要依法依規(guī)予以查處。

基因決定論與測(cè)序亂象

國(guó)家衛(wèi)生計(jì)生委等部門(mén)叫?;驕y(cè)序的理由是,目前國(guó)內(nèi)使用的基因測(cè)序儀及相關(guān)試劑、軟件,均未獲得國(guó)家的審評(píng)審批,屬于“違法醫(yī)用”。

其實(shí),這只是表面理由。深層的原因在于,基因測(cè)序在不同國(guó)家和地區(qū)都存在認(rèn)識(shí)上的模糊和使用上的亂象。

基因測(cè)序只是基因檢測(cè)的方法之一,又稱基因譜測(cè)序,是國(guó)際上公認(rèn)的一種基因檢測(cè)方式。但是,在實(shí)際中基因測(cè)序的理念和做法卻有些走樣和變形。從理念上來(lái)看,基因測(cè)序有陷入“基因決定論”的危險(xiǎn)。在歐美國(guó)家的基因測(cè)序開(kāi)始進(jìn)入臨床后,中國(guó)的一些醫(yī)院也相繼引入,甚至在一些地方基因測(cè)序成為體檢的項(xiàng)目。在觀念上一些專業(yè)人員已經(jīng)把基因測(cè)序萬(wàn)能的理念傳遞給了公眾。

有專家稱,“吸煙致癌說(shuō)”不科學(xué),如果通過(guò)基因測(cè)序發(fā)現(xiàn)一個(gè)人的基因是尼古丁依賴基因,就需要吸煙,吸煙對(duì)他的身體有好處,反之就不能吸煙。與這種觀念相似的還有飲酒、戒毒需要基因測(cè)序等,只有基因測(cè)序才能給出科學(xué)指導(dǎo)。

更有甚者,一些人還宣稱基因測(cè)序可以“包測(cè)百病”,甚至“包治百病”;基因測(cè)序可以測(cè)出“天賦基因”,實(shí)現(xiàn)對(duì)孩子的“因材施教”等。

基因固然主導(dǎo)著一個(gè)人的生老病死,是內(nèi)因,即便如此,對(duì)人一生的健康而言,基因的作用也只是占30%左右,決定人的生老病死更多的因素在于外部環(huán)境和后天因素,要占70%左右。即便只考慮基因的作用,致病基因也需要在其他基因和分子的啟動(dòng)下才能表達(dá)和發(fā)揮作用。例如,即便一個(gè)人的DNA中含有致癌基因,也需要DNA的異常甲基化才能產(chǎn)生致癌作用。早在2009年,美國(guó)加利福尼亞大學(xué)的克里斯托夫·普拉薩等人就發(fā)現(xiàn),在許多類型的癌癥中,癌細(xì)胞中的某些基因會(huì)被甲基化,從而無(wú)法正常表達(dá)。這種DNA的異常甲基化才是癌變的基礎(chǔ)。

后來(lái),研究人員進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),基因測(cè)序只是檢測(cè)遺傳信息,但是,遺傳信息的編碼和表達(dá)不僅取決于DNA的線性序列即4種堿基的排序,還取決于DNA和染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的表觀遺傳修飾。表觀遺傳修飾或表觀遺傳學(xué)現(xiàn)象主要包括DNA甲基化、染色質(zhì)構(gòu)象變化、基因組印記、基因沉默和RNA編輯等。其中,DNA甲基化是一種主要的基因表觀遺傳修飾形式,異常的DNA甲基化才是癌癥的特征和誘因。

基因測(cè)序只是檢測(cè)DNA的線性序列,即便發(fā)現(xiàn)基因變異、失序、缺失、增加、減少或重復(fù)也無(wú)法獲得人的生老病死的全面信息。

基因測(cè)序的原理和技術(shù)

理性看待,基因測(cè)序當(dāng)然是有巨大作用的?;驕y(cè)序可以讓人們更前瞻地了解一些遺傳病和罕見(jiàn)病,發(fā)現(xiàn)致病基因,從而提早采取控制措施和及時(shí)治療。因此,基因測(cè)序?yàn)榻忉屓祟愔卮蠹膊“l(fā)病機(jī)理,開(kāi)展個(gè)性化預(yù)測(cè)、預(yù)防和診斷治療奠定了基礎(chǔ)。

簡(jiǎn)單地說(shuō),基因測(cè)序就是檢測(cè)DNA的4種堿基的線性序列。人和高級(jí)生物的細(xì)胞核(DNA)中的堿基有4種,分別是A(Adenine腺嘌呤)、T(Thymine胸腺嘧啶)、G(Guanine鳥(niǎo)嘌呤)和C(Cytosine胞嘧啶)。

目前比較普遍使用的基因測(cè)序手段是英國(guó)科學(xué)家弗雷德里克·桑格等人于1977年發(fā)明的雙脫氧鏈末端終止法,其原理是根據(jù)核苷酸在某一固定點(diǎn)開(kāi)始,隨機(jī)在某一個(gè)特定的堿基處終止,產(chǎn)生A、T、C、G4組不同長(zhǎng)度的一系列核苷酸,然后在聚丙烯酰胺凝膠上電泳檢測(cè),從而獲得DNA序列。

基因測(cè)序從20世紀(jì)70年代末桑格發(fā)明雙脫氧終止法后,經(jīng)歷了巨大的發(fā)展,主要體現(xiàn)為測(cè)序速度越來(lái)越快,精確度越來(lái)越高,但是測(cè)序的基本原理并沒(méi)有本質(zhì)變化。20世紀(jì)70年代末是雙脫氧終止法手動(dòng)測(cè)序,同位素標(biāo)記;80年代中期,出現(xiàn)自動(dòng)測(cè)序儀(應(yīng)用雙脫氧終止法原理),熒光代替同位素,計(jì)算機(jī)圖像識(shí)別;90年代中期,測(cè)序儀出現(xiàn)重大改進(jìn),集束化的毛細(xì)管電泳代替凝膠電泳。21世紀(jì)初期,又出現(xiàn)高通量測(cè)序技術(shù),能一次并行對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定。目前,以單分子測(cè)序?yàn)樘攸c(diǎn)的新一代測(cè)序技術(shù)也已臨床使用。

單分子測(cè)序的原理是,用一種聚合酶將DNA的復(fù)制限制在一個(gè)微小的間隙中,給各種堿基加上熒光示蹤標(biāo)記,當(dāng)堿基合成DNA鏈時(shí),這些熒光標(biāo)記就會(huì)發(fā)出不同顏色的閃光,根據(jù)閃光顏色可以識(shí)別不同的堿基。使用結(jié)果表明,單分子測(cè)序儀讀出堿基對(duì)的平均長(zhǎng)度是1500對(duì),這是代表該領(lǐng)域目前技術(shù)發(fā)展水平的伊盧米納公司所生產(chǎn)測(cè)序儀的10倍。閱讀長(zhǎng)度越長(zhǎng),將DNA序列片段拼接成完整基因組序列就越容易。

另一方面,在測(cè)序成本上,現(xiàn)在只花1000美元就可以對(duì)一個(gè)人的基因組測(cè)序的技術(shù)已出現(xiàn)??偛课挥诿绹?guó)加利福尼亞州卡爾斯巴德的生命技術(shù)公司推出的一款新的測(cè)序機(jī)器Ion Proton能夠在一天內(nèi)完成個(gè)人全部基因組測(cè)序,所需費(fèi)用不到1000美元。與此同時(shí),總部位于美國(guó)加利福尼亞州圣迭戈市的伊盧米納公司也不甘示弱,已推出HiSeq X Ten測(cè)序系統(tǒng),可以將個(gè)人基因組測(cè)序的機(jī)器和試劑成本控制在1000美元以內(nèi)。

基因測(cè)序應(yīng)用的優(yōu)勢(shì)和短處

基因測(cè)序的優(yōu)勢(shì)在于它能查出基因序列在線性上的變異,對(duì)于診斷和預(yù)測(cè)一些疾病是比較準(zhǔn)確的。例如,唐氏綜合征(又稱21三體綜合征,是人染色體的第21對(duì)染色體發(fā)生了變異)就是一種染色體變異中的數(shù)目變異。因此,基因測(cè)序技術(shù)已經(jīng)廣泛地應(yīng)用到唐氏綜合征產(chǎn)前診斷,基因測(cè)序的準(zhǔn)確度比傳統(tǒng)的血清測(cè)試要高出幾十個(gè)百分點(diǎn),可以達(dá)到99%以上。所以,對(duì)于這種以基因數(shù)目變化為特征的疾病,基因測(cè)序可以大顯身手。

當(dāng)然,基因測(cè)序的優(yōu)勢(shì)還在于,可以進(jìn)行微衛(wèi)星序列分析、長(zhǎng)片段多聚酶鏈反應(yīng)(PCR)、定量多聚酶鏈反應(yīng)等分析,臨床上在進(jìn)行常規(guī)DNA測(cè)序外,還可進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性分析、基因突變檢測(cè)、親子和個(gè)體鑒定、微生物與病毒的分型與鑒定等。

在解析病原體上,基因測(cè)序當(dāng)然也發(fā)揮著重要作用,可以了解病原微生物和解碼其功能基因,找到攻克病原體的好方法,如研制藥物、疫苗等。例如,2011年5月德國(guó)爆發(fā)大腸桿菌疫情,進(jìn)而并發(fā)溶血性尿毒綜合征(HUS),到6月導(dǎo)致26人死亡,約500人入院。中國(guó)華大基因研究院和德國(guó)漢堡-埃本德多夫大學(xué)醫(yī)療中心通過(guò)基因測(cè)序發(fā)現(xiàn),致病大腸桿菌O104∶H4基因序列與2001年德國(guó)從腹瀉病人大便中分離到的大腸桿菌01-09591和2002年從中非長(zhǎng)期腹瀉的艾滋病患者大便中分離到的大腸桿菌55989有高度相似性,這也為治療和預(yù)防大腸桿菌疫情提供了線索。

但是,基因測(cè)序也存在短處。其一,它不能提供基因綜合發(fā)揮作用的其他信息,如無(wú)法提供表觀遺傳修飾、垃圾基因的作用和后天環(huán)境作用的信息。其二,它可能為人們帶來(lái)兩難選擇。其三,它會(huì)造成倫理問(wèn)題。

基因測(cè)序造成人的兩難選擇可以從美國(guó)好萊塢電影明星安吉麗娜·朱莉切除雙乳乳腺談起。朱莉通過(guò)基因測(cè)序得知,她的身體攜帶致癌基因BRCA1,醫(yī)生據(jù)此認(rèn)為,她患乳腺癌的幾率大約是87%,患卵巢癌的幾率是50%。于是,朱莉決定先發(fā)制人,將發(fā)病的可能性減到最小,從2013年2月開(kāi)始切除乳腺并重塑乳房。未來(lái)她還將繼續(xù)進(jìn)行卵巢切除手術(shù),以徹底降低致癌風(fēng)險(xiǎn)。

不過(guò),切除了乳腺和卵巢是否就能擔(dān)保朱莉未來(lái)不會(huì)患癌呢,這是一個(gè)未知數(shù)。癌癥如同其他疾病一樣,既有先天遺傳原因,也有后天生活方式的因素。即便以癌癥的基因遺傳因素來(lái)看,目前的認(rèn)識(shí)也是多因素的。人體內(nèi)既有致癌基因,也有抑(抗)癌基因,而且這些基因都并非是一兩個(gè),而是有很多。目前發(fā)現(xiàn)的致癌基因和抑癌基因就有好幾十個(gè)。癌癥的發(fā)生與否是致癌基因和抑癌基因在整體水平上此消彼長(zhǎng)的結(jié)果。

同時(shí),對(duì)于具體的癌癥來(lái)看,每種癌癥也有特定的致癌基因和抑癌基因,例如乳腺癌不僅有致癌基因BRCA1,也有BRCA2,同時(shí)還有抑癌基因p15、p16和Rb等。因此,在基因?qū)用嬉呀?jīng)存在抗衡癌癥的力量。

另一方面,即便切除乳腺和卵巢,也只是切除了癌癥發(fā)生的靶器官,但不可能根除一個(gè)人所有細(xì)胞染色體上的致癌基因。當(dāng)靶器官切除了,致癌基因固然不能作用于靶器官而致癌,但同樣可以作用于類似的組織和器官,例如,與卵巢相似的組織——子宮內(nèi)膜,因此,這些部位同樣有患癌的可能。

更重要的是,基因和遺傳對(duì)癌癥的發(fā)生起到的作用不過(guò)30%左右,后天的生活方式和個(gè)體的免疫功能至少占60%。也就是說(shuō),如果在衣食住行方面健康、合理,并且加強(qiáng)鍛煉,提高免疫力,則防癌的作用要高于基因致癌的作用。

基因測(cè)序的倫理問(wèn)題

基因測(cè)序當(dāng)然要遵循知情、自愿的原則,這對(duì)于成年人來(lái)說(shuō)問(wèn)題不大。但是,對(duì)于新出生的孩子,就會(huì)深陷倫理泥淖。

2013年9月4日,美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院宣布,將在未來(lái)5年總共投入2500萬(wàn)美元,用于資助為新生兒基因測(cè)序,參與這個(gè)測(cè)序項(xiàng)目的有數(shù)百名即將出生的美國(guó)嬰兒,科學(xué)家將為他們測(cè)序基因。

對(duì)于為何要為新生兒進(jìn)行基因測(cè)序,美國(guó)國(guó)立兒童健康與人類發(fā)展研究所所長(zhǎng)阿蘭·古特馬策稱,每個(gè)新生兒在出生時(shí),將會(huì)有自己的基因序列,它將成為電子健康記錄的一部分,并且終其一生都會(huì)被用來(lái)幫助更好地預(yù)防疾病,尤其是探測(cè)遺傳疾病以及更多地警示一種疾病的早期臨床表現(xiàn)。

古特馬策也承認(rèn),盡管基因測(cè)序能在嬰兒生命之初就發(fā)現(xiàn)疾病風(fēng)險(xiǎn),但這種破譯個(gè)人遺傳密碼的能力也伴隨許多臨床與倫理問(wèn)題,因此探討與新生兒階段有關(guān)的基因組研究技術(shù)、臨床與倫理這三重問(wèn)題至關(guān)重要。

新生兒基因測(cè)序的倫理問(wèn)題首先體現(xiàn)在,作為監(jiān)護(hù)人的父母是否有權(quán)代替孩子決定進(jìn)行基因測(cè)序,如果有一天孩子長(zhǎng)大了,認(rèn)為這種測(cè)序不是他們所想要的,是否侵犯了孩子的權(quán)利。但是,更為重要的是美國(guó)人類基因組倫理委員會(huì)主席露絲·查德威克提出的幾點(diǎn)問(wèn)題。假如一個(gè)孩子出生后通過(guò)基因測(cè)序發(fā)現(xiàn)像朱莉一樣帶有乳腺癌基因,家長(zhǎng)該如何處理這種情況?假如在胎兒時(shí)期就發(fā)現(xiàn)問(wèn)題,是否會(huì)導(dǎo)致流產(chǎn)決定?而且這種病有可能50年后才發(fā)作,甚至一輩子都不出現(xiàn)?那么,該如何應(yīng)對(duì)基因測(cè)序的結(jié)果?

如果不回答和解決這些問(wèn)題,基因測(cè)序必然陷入困境,甚至?xí)`入歧途。

另一方面,過(guò)去的研究發(fā)現(xiàn),基因測(cè)序可能在15%~50%患有未確診疾病的兒童身上找到相關(guān)疾病的遺傳原因,那么參與測(cè)序的其他健康兒童的基因信息該如何處理?醫(yī)生應(yīng)該從患者基因中檢測(cè)何種信息?多少信息應(yīng)該告知其家庭?誰(shuí)應(yīng)該擁有和控制這些基因數(shù)據(jù)?

其實(shí),基因測(cè)序的倫理難題和危險(xiǎn)性同樣存在于成年人。因此,可以說(shuō),基因測(cè)序?qū)τ谝话闳藖?lái)說(shuō)是一把雙刃劍?;驕y(cè)序即便將來(lái)要開(kāi)展,也需要在制定完整的規(guī)則和倫理原則之后方可進(jìn)行。

不過(guò),叫?;驕y(cè)序也許不能一刀切。如果現(xiàn)在叫停一些已經(jīng)成熟的基因測(cè)序診斷,如對(duì)唐氏綜合征的診斷,就有可能逼迫孕婦要么去接受羊水穿刺、臍血檢查等不太準(zhǔn)確有效的產(chǎn)前檢測(cè),要么讓孕婦冒著風(fēng)險(xiǎn)生下有缺陷的孩子。

因此,叫?;驕y(cè)序應(yīng)當(dāng)有針對(duì)性。對(duì)成熟的基因測(cè)序技術(shù)不必叫停,同時(shí)嚴(yán)格監(jiān)管,但對(duì)不成熟者叫停。

【責(zé)任編輯】張?zhí)锟?/p>

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