張 幟,李理想,馬翠卿
(山東大學(xué) 微生物技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,濟(jì)南 250100)
2,3-丁二醇(2,3-butanediol,2,3-BD)是一種 C4平臺(tái)化合物,被廣泛應(yīng)用于食品、化工和航空航天燃料等領(lǐng)域,它可直接用作增濕劑、軟化劑和風(fēng)味添加劑等,也可用來制備聚合物、油墨、香水、熏蒸劑、增塑劑、炸藥以及藥物的手性載體等[1-5]。2,3-丁二醇的燃燒值為27 200 kJ/kg,與乙醇(29 055 kJ/kg)和甲醇(22 081 kJ/kg)相當(dāng),是一種潛在價(jià)值很高的燃料添加劑[6]。如(2R,3R)-2,3-丁二醇由于具有較低的凝固點(diǎn)(-60℃),因此可以作為抗凍劑[2,7],而 meso-2,3-丁 二 醇 還 可 用 于 聚 合 物 的生產(chǎn)[8]。
2,3-丁二醇的衍生物也具有重要用途。例如,2,3-丁二醇在脫氫酶的作用下生成的3-羥基丁酮,是一種常用的香料,用作奶油、干酪、咖啡和果實(shí)的香味增強(qiáng)劑[9];2,3-丁二醇脫水產(chǎn)物甲乙酮,是一種優(yōu)良的有機(jī)溶劑,在膠黏劑、合成革、油墨和涂料等工業(yè)領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用[2,5];2,3-丁二醇脫水產(chǎn)生的1,3-丁二烯,可用于合成樹脂和橡膠等;2,3-丁二醇與甲乙酮縮合并進(jìn)行加氫反應(yīng)生成的辛烷,可用來產(chǎn)生高質(zhì)量的航空燃料[2,5]。目前,2,3-丁二醇及其衍生物的市場需求據(jù)估計(jì)可達(dá)到每年3 000萬t以上,其市場價(jià)值高達(dá)430 億美元[10]。
芽胞桿菌屬(Bacillus)微生物是革蘭氏染色陽性菌,具有產(chǎn)生芽胞、需氧或兼性厭氧的特性。芽胞桿菌由于能夠產(chǎn)生芽胞,具有較強(qiáng)的環(huán)境抗逆性;同時(shí),芽胞桿菌具有較強(qiáng)的C源利用能力,可利用包括葡萄糖、果糖和木糖等單糖,蔗糖和纖維二糖等二糖以及淀粉等復(fù)雜C源,因此,廣泛應(yīng)用于生產(chǎn)乳酸、聚谷氨酸和乙偶姻等化學(xué)品[9,11-12]。目前,枯草芽胞桿菌(Bacillus subtilis)、地衣芽胞桿菌(B.licheniformis)、多粘類芽胞桿菌(Paenibacillus polymyxa)和淀粉液化芽胞桿菌(B.amyloliquefaciens),被用于 2,3-丁二醇的生產(chǎn)研究。本文中,筆者綜述近年來利用芽胞桿菌進(jìn)行2,3-丁二醇生產(chǎn)的研究進(jìn)展,并對其研究方向進(jìn)行展望。
芽胞桿菌廣泛分布于土壤、水體和空氣中。芽胞桿菌與其他細(xì)菌相比,具有生長繁殖迅速、代謝快、體積大、生命力頑強(qiáng)等優(yōu)點(diǎn)。芽胞桿菌發(fā)酵產(chǎn)2,3-丁二醇的研究已有很多年的歷史[5],目前已有報(bào)道的產(chǎn)2,3-丁二醇的菌株主要包括多粘類芽胞桿菌、地衣芽胞桿菌、枯草芽胞桿菌、地芽胞桿菌和解淀粉芽胞桿菌,這些菌株屬于非致病性芽胞桿菌,被認(rèn)為是GRAS(generally recongnized as safe)細(xì)菌。各菌株特點(diǎn)及產(chǎn)2,3-丁二醇能力見表1。
多粘類芽胞桿菌(Paenibacillus polymyxa)是目前研究較多的2,3-丁二醇生產(chǎn)菌株。其早期在分類學(xué)上歸為芽胞桿菌屬,且由于其在形態(tài)特征、生理生化特征、發(fā)酵特性等很多方面與芽胞桿菌類似,因此,本文中筆者將其與其他芽胞桿菌一起進(jìn)行比較。
表1 利用芽胞桿菌進(jìn)行2,3-丁二醇生產(chǎn)的研究Table 1 Researches for production of 2,3-BD by Bacillus sp.
多粘芽胞桿菌是目前報(bào)道的唯一一種可產(chǎn)光學(xué) 純 (2R,3R)-2,3-丁 二 醇 的 野 生 菌 株。Nakashimada等[24]研究發(fā)現(xiàn),在厭氧條件下,pH 6.3、稀釋率為0.2 h-1時(shí),(2R,3R)-2,3-丁二醇的光學(xué)純度大于98%,其最高產(chǎn)量為74.4 mmol/L。進(jìn)一步的研究發(fā)現(xiàn),添加乙酸可以促進(jìn)多粘芽胞桿菌產(chǎn)2,3-丁二醇。在初始pH 6.8條件下,補(bǔ)料分批發(fā)酵中按照每摩爾葡萄糖中添加0.35 mol乙酸的量添加乙酸,2,3-丁二醇產(chǎn)量可達(dá)637 mmol/L,其光學(xué)純度大于98%,轉(zhuǎn)化率達(dá)到理論轉(zhuǎn)化率的81%[25]。H??ler等[17]研究發(fā)現(xiàn)多粘芽胞桿菌 DSM 365 具有較高的(2R,3R)-2,3-丁二醇生產(chǎn)能力,在60 g/L酵母粉條件下,補(bǔ)料分批發(fā)酵 54 h,(2R,3R)-2,3-丁二醇產(chǎn)量達(dá)到111.0 g/L,生產(chǎn)強(qiáng)度達(dá)到 2.1 g/(L·h),這是目前多粘芽胞桿菌生產(chǎn)2,3-丁二醇的最高水平。
多粘芽胞桿菌也可利用戊糖為底物發(fā)酵產(chǎn)2,3-丁二醇。Laube等[26]對比了10株多粘芽胞桿菌的木糖利用能力,發(fā)現(xiàn)菌株9035具有較高的利用木糖產(chǎn)2,3-丁二醇的能力,其利用木糖可產(chǎn)生4.4 g/L 2,3-丁二醇,相同條件下其利用L-阿拉伯糖可產(chǎn)生8.7 g/L 2,3-丁二醇。該菌株還可分別利用甘露糖、半乳糖、纖維二糖和淀粉產(chǎn)生 7.3、8.5、8.5 和 5.0 g/L的2,3-丁二醇,表明該菌株具有較廣的底物譜。Marwoto等[19]研究發(fā)現(xiàn),在39℃條件下多粘芽胞桿菌批次發(fā)酵24 h可消耗100 mmol/L的木糖,共計(jì)產(chǎn)生39 mmol/L 的(2R,3R)-2,3-丁二醇,同時(shí)還生產(chǎn)了65 mmol/L的乙醇和47 mmol/L的乙酸。而當(dāng)?shù)孜餅?00 mmol/L葡萄糖和100 mmol/L木糖的混合物時(shí),菌株仍能在24 h內(nèi)消耗完糖,產(chǎn)生82 mmol/L 的(2R,3R)-2,3-丁二醇、124 mmol/L乙醇和33 mmol/L乙酸。以上結(jié)果表明,與葡萄糖相比,多粘芽胞桿菌利用戊糖能力較弱。
菊粉是一種主要由果糖聚合而成的鏈狀非消化性寡糖,其來源于非糧原料菊芋。由于多粘類芽胞桿菌可以產(chǎn)生菊粉酶,因此其可以直接以菊粉為底物進(jìn)行2,3-丁二醇的發(fā)酵生產(chǎn)。Gao等[18]優(yōu)化了多粘類芽胞桿菌利用菊粉發(fā)酵產(chǎn)2,3-丁二醇的培養(yǎng)基,研究發(fā)現(xiàn)菊粉、K2HPO4和NH4Cl是影響2,3-丁二醇發(fā)酵生產(chǎn)的關(guān)鍵因素,并通過中心組合實(shí)驗(yàn)得到了各因素的最適濃度。在5 L發(fā)酵罐分批發(fā)酵實(shí)驗(yàn)中,(2R,3R)-2,3-丁二醇的質(zhì)量濃度達(dá)到36.92 g/L,光學(xué)純度大于98%。
枯草芽胞桿菌(B.subtilis)是芽胞桿菌屬的一種呈革蘭氏染色陽性的菌,該菌能利用多種糖類以及淀粉,能利用蛋白質(zhì),分解色氨酸形成吲哚。在工業(yè)上,枯草芽胞桿菌是重要的α-淀粉酶、中性蛋白酶和5'-核苷酶生產(chǎn)菌株,具有重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。與地衣芽胞桿菌類似,枯草芽胞桿菌及其生產(chǎn)的酶制劑被美國FDA認(rèn)定為GRAS(generally recognized as safe),菌體本身在污水處理和生物菌肥行業(yè)中廣泛應(yīng)用??莶菅堪麠U菌(最廣泛應(yīng)用的菌株為枯草芽胞桿菌168)作為芽胞桿菌屬的模式菌株,已經(jīng)測序獲得多個(gè)菌株的全基因組信息,其遺傳操作體系也是芽胞桿菌屬內(nèi)最成熟,應(yīng)用最廣泛的。早在20世紀(jì)40年代,科學(xué)家就發(fā)現(xiàn)枯草芽胞桿菌能夠發(fā)酵葡萄糖產(chǎn)生2,3-丁二醇,但是相關(guān)報(bào)道很少。Biswas等[13]報(bào)道了1株枯草芽胞桿菌168的工程菌能夠增加2,3-丁二醇的發(fā)酵生產(chǎn)能力,采用AlsSD操縱子的啟動(dòng)子PalsSD替換budA基因的啟動(dòng)子,使菌株能夠在對數(shù)生長前期表達(dá)budA基因,經(jīng)過基因工程改造后的菌株開始積累2,3-丁二醇的時(shí)間由對數(shù)后期提前到對數(shù)前期,通過添加乙酸鹽,采用好氧-厭氧兩步發(fā)酵法等策略使菌株生產(chǎn)強(qiáng)度提高6.7倍,達(dá)到 0.4 g/(L·h),2,3-丁二醇的最終總質(zhì)量濃度達(dá)到6.1 g/L。枯草芽胞桿菌發(fā)酵生產(chǎn)2,3-丁二醇的構(gòu)型以(2R,3R)-丁二醇為主。
淀粉液化芽胞桿菌近年來被發(fā)現(xiàn)是較好的2,3-丁二醇生產(chǎn)菌株。Yang等[14]篩選到1株產(chǎn)2,3-丁二醇的淀粉液化芽胞桿菌B10-127,該菌株能夠在200 g/L的葡萄糖培養(yǎng)基中生長并生產(chǎn)2,3-丁二醇,顯示出較高的葡萄糖耐受性。該菌株的最適發(fā)酵溫度為37℃,最適初始pH在5.5~7.5之間,其補(bǔ)料分批發(fā)酵產(chǎn)量可達(dá)92.3 g/L,生產(chǎn)強(qiáng)度為0.96 g/(L·h)。該菌株的轉(zhuǎn)化率為理論轉(zhuǎn)化率的84%,主要副產(chǎn)物為琥珀酸。進(jìn)一步的研究表明:玉米漿、豆粕和檸檬酸銨是影響該菌株發(fā)酵產(chǎn)2,3-丁二醇的關(guān)鍵因素,并利用響應(yīng)面法優(yōu)化得到了以上因素的最適濃度,在最優(yōu)培養(yǎng)基中,該菌株的產(chǎn)量提高至 62.7 g/L,生產(chǎn)強(qiáng)度提高至 1.49 g/(L·h),是原有水平的2.4倍。當(dāng)發(fā)酵體積放大到20 L后,發(fā)酵 36 h,2,3-丁二醇的終質(zhì)量濃度達(dá)到 61.4 g/L,其生產(chǎn)強(qiáng)度達(dá)到1.71 g/(L·h),轉(zhuǎn)化率為理論轉(zhuǎn)化率的76%[15]。該菌株還能夠利用甘油作為發(fā)酵底物進(jìn)行2,3-丁二醇的生產(chǎn)。研究結(jié)果表明,粗甘油的發(fā)酵特性與純甘油接近,且不抑制菌體生長。同時(shí)還發(fā)現(xiàn),添加葡萄糖或者蔗糖能夠顯著促進(jìn)甘油利用和2,3-丁二醇生產(chǎn)的速率,但其中葡萄糖對甘油的利用有抑制作用,而蔗糖沒有抑制甘油的利用,其促進(jìn)甘油利用和2,3-丁二醇生產(chǎn)的效果更為顯著。在此基礎(chǔ)上,Yang[16]利用富含蔗糖的甜菜糖蜜作為共代謝底物,補(bǔ)料分批發(fā)酵96 h,2,3-丁二醇產(chǎn)量達(dá)到83.3 g/L,轉(zhuǎn)化率為理論轉(zhuǎn)化率的84%,生產(chǎn)強(qiáng)度為0.87 g/(L·h),為目前報(bào)道的利用粗甘油發(fā)酵的最高水平。
在工業(yè)上,地衣芽胞桿菌(B.licheniformis)應(yīng)用廣泛,主要用來生產(chǎn)蛋白酶、淀粉酶和抗生素等。雖然,研究者很早就發(fā)現(xiàn)地衣芽胞桿菌可以產(chǎn)生2,3-丁二醇,但是有關(guān)地衣芽胞桿菌發(fā)酵生產(chǎn)2,3-丁二醇的文獻(xiàn)報(bào)道不多,產(chǎn)物濃度也很低。Nilegaonkar等[27]利用地衣芽胞桿菌,以葡萄糖為C源(20 g/L),在37 ℃、pH 6.0 條件下,發(fā)酵 72 h,2,3-丁二醇質(zhì)量濃度為8.7 g/L,轉(zhuǎn)化率達(dá)到理論轉(zhuǎn)化率的 94%,但生產(chǎn)強(qiáng)度僅有 0.12 g/(L·h)。Nilegaonkar等[28]進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),地衣芽胞桿菌能夠利用葡萄糖、果糖、纖維二糖、淀粉、蔗糖和甘露糖進(jìn)行2,3-丁二醇的生產(chǎn),表明該菌具有較廣的底物譜。
Wang等[21]篩選得到一株能夠在高溫(50℃)條件下積累乳酸的菌株B.licheniformis BL1,經(jīng)過木糖馴化以及敲除乳酸脫氫酶基因(ldh)后得到的菌株B.licheniformis BL8能夠在50℃高溫條件下發(fā)酵葡萄糖和木糖生產(chǎn)高光學(xué)純度(98%)的(2R,3R)-丁二醇。在pH 5.0、5%通氣條件下,發(fā)酵30 g/L的葡萄糖和木糖分別獲得135 mmol(12.16 g/L)和153.3 mmol(13.82 g/L)2,3-丁二醇,轉(zhuǎn)化率分別為0.9 mol/mol葡萄糖和0.73 mol/mol木糖,最大生產(chǎn)速率分別為 29.4 和 26.1 mmol/(L·h)。Perego等[29]利用 B.licheniformis NCIMB 8095 發(fā)酵玉米淀粉水解液生產(chǎn)2,3-丁二醇,在最佳條件下,二醇(2,3-丁二醇與乙偶姻的總量)生產(chǎn)強(qiáng)度達(dá)到0.58 g/(L·h),轉(zhuǎn)化率達(dá)到 0.87 mol/mol,其中 2,3-丁二醇為6.44 g/L,乙偶姻為0.47 g/L。Li等[23]篩選得到了高溫高產(chǎn)2,3-丁二醇的地衣芽胞桿菌10-1-A,其可在50℃條件下高效發(fā)酵葡萄糖生產(chǎn)2,3-丁二醇,產(chǎn)量高達(dá) 115.7 g/L,同時(shí)生產(chǎn)強(qiáng)度達(dá)到 2.4 g/(L·h),轉(zhuǎn)化率為理論轉(zhuǎn)化率的94%,為目前高溫菌株產(chǎn)2,3-丁二醇的最高水平。該菌株的基因組已經(jīng)完成測序,對基因組的深入分析有望闡明其2,3-丁二醇高溫高效生產(chǎn)機(jī)制。
目前,關(guān)于高溫條件下(50~60℃)產(chǎn)乳酸和乙醇的菌株研究較多,而在該條件下產(chǎn)2,3-丁二醇的菌株鮮見報(bào)道。Xiao等[22]首次報(bào)道了1株在高溫條件下產(chǎn)2,3-丁二醇和乙偶姻的嗜熱地芽胞桿菌,采油采出水經(jīng)100℃滅菌后涂布篩選平板,篩選得到了能夠產(chǎn)2,3-丁二醇和乙偶姻的菌株XT15,經(jīng)鑒定為Geobacillus。該菌株的最適生長溫度為45~55℃,其在pH 8.0時(shí),產(chǎn)物乙偶姻的產(chǎn)量最高,達(dá)到8.0 g/L。在優(yōu)化后的條件下培養(yǎng) 48 h,2,3-丁二醇和乙偶姻的產(chǎn)量分別為14.5和7.7 g/L。
微生物發(fā)酵生產(chǎn)2,3-丁二醇受到很多因素的影響,其中溶氧(DO)和pH被認(rèn)為是影響最大的2個(gè)因素。此外,部分芽胞桿菌具有在高溫下生長并產(chǎn)生2,3-丁二醇的能力,且溫度對于2,3-丁二醇產(chǎn)量影響較大。因此,筆者總結(jié)了以下3個(gè)因素對芽胞桿菌2,3-丁二醇生產(chǎn)的影響。
溶氧是影響微生物2,3-丁二醇發(fā)酵的關(guān)鍵因素,其水平高低影響到2,3-丁二醇的產(chǎn)量、生產(chǎn)強(qiáng)度以及副產(chǎn)物的形成[5]。一般來說,高的溶氧水平會(huì)導(dǎo)致生物量的提高,從而提高生產(chǎn)強(qiáng)度,但往往會(huì)造成2,3-丁二醇產(chǎn)量的降低;而低的溶氧會(huì)提高2,3-丁二醇的產(chǎn)量,但由于低溶氧條件下細(xì)胞密度的降低,會(huì)導(dǎo)致低的2,3-丁二醇生產(chǎn)強(qiáng)度。因此,為了提高2,3-丁二醇的生產(chǎn)效率,需要優(yōu)化一個(gè)適當(dāng)?shù)娜苎蹩刂撇呗浴?/p>
Yang等[14]研究發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)速能顯著影響B(tài).amyloliquefaciens B10-127 發(fā)酵 2,3-丁二醇產(chǎn)量。隨著轉(zhuǎn)速的增加,菌體干質(zhì)量提高,發(fā)酵周期縮短,但是2,3-丁二醇產(chǎn)量有所降低,而副產(chǎn)物乙偶姻的產(chǎn)量逐漸提高。
(2R,3R)-2,3-丁二醇是多粘芽胞桿菌發(fā)酵的主要產(chǎn)物,研究表明溶氧水平還影響多粘芽胞桿菌的光學(xué)純度。Nakashimada等[24]研究發(fā)現(xiàn),溶氧水平影響多粘芽胞桿菌所產(chǎn)(2R,3R)-2,3-BD的e.e.值,其首先在搖瓶中驗(yàn)證了裝液量對產(chǎn)物e.e.值的影響,發(fā)現(xiàn)低裝液量條件下發(fā)酵產(chǎn)物主要為乙偶姻,(2R,3R)-2,3-BD 僅為 12.9 mmol/L。隨著裝液量的增加,2,3-丁二醇產(chǎn)量逐漸提高至97.4 mmol/L,e.e.值可達(dá)到 94%;而厭氧條件下,產(chǎn)量有所降低,僅為 74.4 mmol/L,但e.e.值則高達(dá) 99%。5 L發(fā)酵罐水平的實(shí)驗(yàn)也表明,多粘芽胞桿菌在厭氧條件下產(chǎn)生的(2R,3R)-2,3-BD光學(xué)純度大于98%[25]。H??ler等[17]在發(fā)酵罐上研究了不同攪拌轉(zhuǎn)速和通風(fēng)速率對多粘芽胞桿菌(2R,3R)-2,3-BD的產(chǎn)量和e.e.值的影響,結(jié)果表明隨著轉(zhuǎn)速的提高,2,3-丁二醇產(chǎn)量逐漸升高,而產(chǎn)物中(2R,3R)-2,3-BD所占比例不斷降低,通風(fēng)的作用小于轉(zhuǎn)速,這可能是由于高轉(zhuǎn)速條件下的表面產(chǎn)氣效應(yīng)提高了O2的溶解效率。該菌株在500 r/min、0.2 vvm(每分鐘通氣量與罐體實(shí)際料液體積的比值)以及60 g/L酵母粉作為N源的條件下,補(bǔ)料分批發(fā)酵54 h,(2R,3R)-2,3-丁 二 醇 產(chǎn) 量 達(dá) 到 111.0 g/L,e.e.值 大于98%。
pH是影響芽胞桿菌2,3-丁二醇產(chǎn)量及其不同異構(gòu)體的合成的重要因素。一般而言,堿性環(huán)境有利于有機(jī)酸的形成,從而降低2,3-丁二醇的產(chǎn)量;而在酸性環(huán)境中,有機(jī)酸的合成量顯著降低,醇類化合物的合成量顯著提高。不同菌株2,3-丁二醇生產(chǎn)的最適pH往往不同。
嗜熱地芽胞桿菌XT15在初始pH 8.0的條件下,2,3-丁二醇和乙偶姻的產(chǎn)量最高[22]。對于 B.amyloliquefaciens B10-127而言,初始 pH在5.5 ~7.5 之間時(shí),2,3-丁二醇產(chǎn)量較高,其中 pH 6.5 時(shí),2,3-丁二醇產(chǎn)量最高,達(dá)到 61.6 g/L[14]。Nilegaonkar等[27]研究發(fā)現(xiàn)地衣芽胞桿菌發(fā)酵生產(chǎn) 2,3-丁二醇的最適 pH是 6.0;而Wang等[21]利用敲除了 ldh基因的地衣芽胞桿菌BL5在50℃條件下發(fā)酵2,3-丁二醇時(shí)發(fā)現(xiàn):在pH 7.0時(shí),會(huì)產(chǎn)生大量副產(chǎn)物甲酸和乙醇;在 pH 5.0條件下,2,3-丁二醇為主要發(fā)酵產(chǎn)物,因 此,該 菌 的 最 適 pH 為 pH 5.0。Nakashimada等[24]研究發(fā)現(xiàn),在 pH 5.7 時(shí),多粘芽胞桿菌所產(chǎn)生的meso-2,3-BD含量明顯提高,導(dǎo)致(2R,3R)-2,3-BD 的 e.e.值降低至94%;而 pH 在6.0 ~6.9 之間時(shí),(2R,3R)-2,3-BD的e.e.值可達(dá)98%。菌株在pH 6.6時(shí)的產(chǎn)量降低較為顯著,僅為pH 6.0時(shí)產(chǎn)量的35%。以上結(jié)果表明:pH對于不同菌株2,3-丁二醇的生產(chǎn)有不同的影響,對于篩選到的新菌株,發(fā)酵pH的優(yōu)化尤為重要。
溫度也是影響2,3-丁二醇發(fā)酵生產(chǎn)的重要因素。對于 B.amyloliquefaciens B10-127來說,其 2,3-丁二醇的最適發(fā)酵溫度是37℃,而當(dāng)溫度低于37℃時(shí),該菌株主要發(fā)酵產(chǎn)物為乙偶姻,這一現(xiàn)象與菌株 Klebsiella oxytoca M1 相似[14,30],推測其原因可能是菌株B10-127中的2,3-丁二醇脫氫酶的轉(zhuǎn)錄水平受到溫度的影響,導(dǎo)致其胞內(nèi)2,3-丁二醇脫氫酶活性在30℃時(shí)遠(yuǎn)低于37℃,從而積累乙偶姻。對多粘芽胞桿菌來說,溫度是影響其發(fā)酵木糖產(chǎn)2,3-丁二醇的顯著因素,當(dāng)溫度在30~39℃范圍內(nèi),(2R,3R)-2,3-丁二醇產(chǎn)量隨著溫度的升高而升高[19]。而對菌株嗜熱地芽胞桿菌XT15來說,45~55 ℃是其最適生長溫度[22]。Nilegaonkar等[27]研究地衣芽胞桿菌發(fā)酵生產(chǎn)2,3-丁二醇時(shí)發(fā)現(xiàn)其最適溫度是37℃;但筆者所在課題組Li等[23]利用篩選到的高溫菌株10-1-A進(jìn)行2,3-丁二醇生產(chǎn)研究時(shí)發(fā)現(xiàn),與Nilegaonkar等報(bào)道的結(jié)果不同,地衣芽胞桿菌10-1-A的最適溫度是50℃。由此可知,溫度對于不同微生物有不同影響,即使是同一個(gè)種的不同菌株,也可能有不同的影響,因此有必要對新菌株進(jìn)行發(fā)酵溫度的優(yōu)化。
微生物中2,3-丁二醇合成途徑是經(jīng)由混合酸途徑得到的,產(chǎn)物中除了2,3-丁二醇還有一系列副產(chǎn)物,主要有乙醇、乳酸、乙酸、甲酸和琥珀酸等副產(chǎn)物[2]。已有報(bào)道的2,3-丁二醇合成途徑主要包括3條(圖1)。其一為丙酮酸在α-乙酰乳酸合成酶作用下生成α-乙酰乳酸,并在α-乙酰乳酸脫羧酶作用下生成(3R)-乙偶姻,(3R)-乙偶姻在2,3-丁二醇脫氫酶的作用下還原得到2,3-丁二醇,這條途徑是微生物中2,3-丁二醇合成的主要途徑,其關(guān)鍵酶研究較多;其二為在有氧條件下,α-乙酰乳酸發(fā)生自發(fā)氧化脫羧生成雙乙酰,雙乙酰在2,3-丁二醇脫氫酶(或者叫做雙乙酰還原酶)的作用下,生成乙偶姻,再進(jìn)一步生成2,3-丁二醇,該途徑被認(rèn)為是2,3-丁二醇合成的支路途徑;其三為在葡萄糖消耗完的情況下,碳代謝阻遏(CCR)現(xiàn)象消失,此時(shí)雙乙酰在乙偶姻脫氫酶復(fù)合體(acetoin dehydrogenase enzyme system,AoDH ES)的作用下生成乙酰乙偶姻,并進(jìn)一步在乙酰乙偶姻還原酶(AACR)的作用下,生成乙酰丁二醇,乙酰丁二醇可進(jìn)一步生成2,3-丁二醇,但是催化此步反應(yīng)的酶不詳,且由于發(fā)酵過程中底物葡萄糖的存在會(huì)抑制該途徑,因此其在2,3-丁二醇發(fā)酵生產(chǎn)中的作用可以忽略[2,5,31-32]。
在芽胞桿菌中2,3-丁二醇合成基因簇總結(jié)如圖2所示。由圖2可以看出:芽胞桿菌中的2,3-丁二醇合成基因簇結(jié)構(gòu)與革蘭氏陰性菌(如肺炎克雷伯氏菌),有較大差異,主要表現(xiàn)為3個(gè)方面:①在芽胞桿菌中該基因簇的第2個(gè)基因是α-乙酰乳酸脫羧酶基因,第3個(gè)是α-乙酰乳酸合成酶基因,而肺炎克雷伯氏菌中α-乙酰乳酸合成酶基因在α-乙酰乳酸脫羧酶基因之前,這樣會(huì)影響2個(gè)酶的表達(dá)水平;②在芽胞桿菌中2,3-丁二醇脫氫酶獨(dú)立存在,而肺炎克雷伯氏菌中2,3-丁二醇脫氫酶基因bdh與alsR、alsD和alsS共同組成一個(gè)完整的基因簇;③絕大部分芽胞桿菌中的2,3-丁二醇脫氫酶為中鏈家族2,3-丁二醇脫氫酶(圖3),其可同時(shí)催化(2R,3R)-2,3-BD 和 meso-2,3-BD 與(3R)-AC 和(3S)-AC間的可逆反應(yīng)[33-34],而在肺炎克雷伯氏菌中的2,3-丁二醇脫氫酶屬于短鏈家族2,3-丁二醇脫氫酶(圖3),該類酶主要催化 meso-2,3-BD與(3R)-AC間的可逆反應(yīng)[35]。目前,僅有在地衣芽胞桿菌中的2,3-丁二醇脫氫酶屬于短鏈家族2,3-丁二醇脫氫酶[23]。由于α-乙酰乳酸脫羧酶催化α-乙酰乳酸僅生成(3R)-AC,因此,2,3-丁二醇脫氫酶的不同導(dǎo)致了芽胞桿菌生成的2,3-丁二醇異構(gòu)體和肺炎克雷伯氏菌的不同。
圖1 芽胞桿菌中2,3-丁二醇合成途徑Fig.1 The 2,3-BD synthesis pathway in Bacillus sp.
在微生物中2,3-丁二醇合成受到乙酸鹽、群體感應(yīng)等因素的調(diào)控,對于調(diào)控機(jī)制的深入研究有望開發(fā)基于基因調(diào)控的2,3-丁二醇高效生產(chǎn)策略。因此,2,3-丁二醇調(diào)控機(jī)制是目前生物法生產(chǎn)2,3-丁二醇研究的熱點(diǎn)之一。B.subtilis是目前唯一一種2,3-丁二醇合成基因簇調(diào)控機(jī)制得到研究的芽胞桿菌菌株。
圖2 產(chǎn)2,3-丁二醇芽胞桿菌中2,3-丁二醇合成基因簇Fig.2 Gene clusters for 2,3-BD biosynthesis in Bacillus sp.
圖3 2,3-丁二醇脫氫酶的進(jìn)化樹分析Fig.3 Phylogenetic tree analysis of BDHs
Renna等[36]敲除了 B.subtilis中的 alsR 基因,發(fā)現(xiàn)alsSD操縱子不表達(dá),而融合轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)也表明,AlsR蛋白對于alsSD操縱子的表達(dá)是必需的,且在穩(wěn)定期時(shí)表達(dá)量明顯提高。Fr?drich等[37]研究發(fā)現(xiàn),alsSD操縱子對厭氧條件下的乙酸積累、乙酸的添加、低pH和好氧發(fā)酵的穩(wěn)定期等幾種條件的響應(yīng)均依賴于調(diào)控基因alsR的存在;利用B.subtilis的RNA polymerase進(jìn)行的體外轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)證明,alsSD操縱子的啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄需要調(diào)控蛋白AlsR的存在;對該啟動(dòng)子分析發(fā)現(xiàn),其包含一個(gè)高親和度結(jié)合位點(diǎn)——調(diào)控結(jié)合區(qū)(regulatory binding site)和一個(gè)低親和度結(jié)合位點(diǎn)——激活因子結(jié)合區(qū)(activator binding site),兩者對該啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄都是必需的,且AlsR蛋白與RBS和ABS結(jié)合后會(huì)形成穩(wěn)定的四聚體結(jié)構(gòu),該結(jié)構(gòu)的調(diào)控蛋白能夠起始alsSD操縱子的啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄。
由于在B.subtilis中的2,3-丁二醇脫氫酶基因bdhA與alsSD操縱子分布在基因組的不同位置,其是否受到調(diào)控蛋白AlsR的調(diào)控成為2,3-丁二醇合成調(diào)控的另一個(gè)問題。de Oliveira等[38]構(gòu)建了alsR基因敲除的菌株,并分別比較了野生菌株和突變菌株中bdhA-lacZ融合基因表達(dá)水平、穩(wěn)定期bdhA基因mRNA表達(dá)水平和2,3-丁二醇脫氫酶活力,結(jié)果發(fā)現(xiàn)AlsR對bdhA基因表達(dá)的激活作用僅在穩(wěn)定期早期,敲除alsR基因后,bdhA基因的表達(dá)降低,但并未完全喪失。同時(shí),體外實(shí)驗(yàn)表明,AlsR并不能與bdhA基因的啟動(dòng)子相結(jié)合。以上結(jié)果表明,AlsR蛋白并不直接調(diào)控bdhA基因的表達(dá),其可能通過其他蛋白間接調(diào)控bdhA基因的表達(dá)。
目前,產(chǎn)2,3-丁二醇的菌株其生長溫度一般為30~40℃,在此溫度條件下容易染菌[22]。而在50~60℃條件下進(jìn)行發(fā)酵生產(chǎn)可以大大降低染菌的機(jī)會(huì),同時(shí)該溫度條件有利于纖維素原料的同步糖化發(fā)酵,因此高溫條件下發(fā)酵生產(chǎn)乳酸、乙醇等產(chǎn)品的研究成為近年來研究的熱點(diǎn)。但是目前在可高效生產(chǎn)2,3-丁二醇的微生物中,肺炎克雷伯氏菌、產(chǎn)酸克雷伯氏菌和黏質(zhì)沙雷氏菌均不能在此條件下生長,同時(shí)部分芽胞桿菌如枯草芽胞桿菌和多粘芽胞桿菌也不能在50~60℃條件下生長。因此,這些菌株不能夠用于高溫條件下生產(chǎn)2,3-丁二醇。但部分芽胞桿菌能夠在高溫條件下生長,如地衣芽胞桿菌、嗜熱地芽胞桿菌和凝結(jié)芽胞桿菌等,可以在50~60℃時(shí)生長并代謝葡萄糖、木糖等C源,生產(chǎn)2,3-丁二醇,但是其產(chǎn)量較克雷伯氏菌低。因此,篩選高效生產(chǎn)2,3-丁二醇的嗜熱芽胞桿菌將成為今后2,3-丁二醇發(fā)酵生產(chǎn)研究的熱點(diǎn)之一。
芽胞桿菌的遺傳操作較為困難,目前在用于生產(chǎn)2,3-丁二醇的芽胞桿菌中,僅枯草芽胞桿菌和地衣芽胞桿菌BL1成功進(jìn)行了基因工程改造,尚未有關(guān)于解淀粉芽胞桿菌和多粘芽胞桿菌基因工程改造的研究報(bào)道。雖然以上菌株2,3-丁二醇產(chǎn)量較高,但其轉(zhuǎn)化率較低,對其副產(chǎn)物合成途徑進(jìn)行代謝工程改造,有望提高其轉(zhuǎn)化率,從而提高2,3-丁二醇生產(chǎn)的經(jīng)濟(jì)性。同時(shí),凝結(jié)芽胞桿菌2-6、XZL9分別是高效利用葡萄糖和木糖生產(chǎn)乳酸的高溫菌株,其基因組中有2,3-丁二醇合成基因簇,具有 2,3-丁二醇生產(chǎn)能力,對其進(jìn)行基因工程改造有望得到高效利用葡萄糖和木糖生產(chǎn)2,3-丁二醇的高溫菌株,甚至可實(shí)現(xiàn)2,3-丁二醇的開放式發(fā)酵生產(chǎn)。
[1] Syu M J.Biological production of 2,3-butanediol[J].Appl Microbiol Biotechnol,2001,55:10-18.
[2] Celinska E,Grajek W.Biotechnological production of 2,3-butanediol:current state and prospects[J].Biotechnol Adv,2009,27:715-725.
[3] 馬翠卿,李理想,高超.基于生物質(zhì)與資源的化工多元醇生物煉制研究進(jìn)展[J].生物加工過程,2013,11(2):44-52.
[4] 秦加陽,肖梓軍,張兆斌,等.一種簡單的高產(chǎn)2,3-丁二醇發(fā)酵生產(chǎn)方法[J].生物加工過程,2005,3(4):71-73.
[5] Ji X J,Huang H,Ouyang P K.Microbial 2,3-butanediol production:a state-of-the-art review[J].Biotechnol Adv,2011,29:351-364.
[6] Garg S K,Jain A.Fermentative production of 2,3-butanediol:a review[J].Bioresour Technol,1995,51:103-109.
[7] Yan Y,Lee C C,Liao J C.Enantioselective synthesis of pure(R,R)-2,3-butanediol in Escherichia coli with stereospecific secondary alcohol dehydrogenases[J].Org Biomol Chem,2009,7:3914-3917.
[8] Gubbels E,Jasinska-WalcL,KoningC E.Synthesisand characterization of novel renewable polyesters based on 2,5-furandicarboxylic acid and 2,3-butanediol[J].Polym Sci Pol Chem,2013,51:890-898.
[9] Xiao Z J,Liu P H,Qin J Y,et al.Statistical optimization of medium componentsforenhanced acetoin production from molasses and soybean meal hydrolysate[J].Appl Microbiol Biotechnol,2007,74(1):61-68.
[10] Kopke M,Mihalcea C,Liew F,et al.2,3-Butanediol production by acetogenic bacteria,an alternative route to chemical synthesis,using industrial waste gas[J].Appl Environ Microbiol,2011,77(15):5467-5475.
[11] Ko Y H,Gross R A.Effects of glucose and glycerol on γ-poly(glutamic acid)formation by Bacillus licheniformis ATCC 9945a[J].Biotechnol Bioeng,1998,57(4):430-437.
[12] Qin J,Zhao B,Wang X,et al.Non-sterilized fermentative production of polymer-grade L-lactic acid by a newly isolated thermophilic strain Bacillus sp.2-6[J].PLoS One,2009,4(2):e4359.
[13] Biswas R,Yamaoka M,Nakayama H,et al.Enhanced production of 2,3-butanediol by engineered Bacillus subtilis[J].Appl Microbiol Biotechnol,2012,94(3):651-658.
[14] Yang T,Rao Z,Zhang X,et al.Production of 2,3-butanediol from glucose by GRAS microorganism Bacillus amyloliquefaciens[J].J Basic Microbiol,2011,51:650-658.
[15] Yang T,Zhang X,Rao Z,et al,Optimization and scale-up of 2,3-butanediol production by Bacillus amyloliquefaciens B10-127[J].World J Microb Biotech,2011,28(4):1563-1574.
[16] Yang T W,Rao Z M,Zhang X,et al.Fermentation of biodieselderived glycerol by Bacillus amyloliquefaciens:effects of cosubstrates on 2,3-butanediol production[J].Appl Microbiol Biotechnol,2013,97(17):7651-7658.
[17] H??ler T,Schieder D,Pfaller R,et al.Enhanced fed-batch fermentation of 2,3-butanediol by Paenibacillus polymyxa DSM 365[J].Bioresour Technol,2012,124:237-244.
[18] Gao J,Xu H,Li Q,et al.Optimization of medium for one-step fermentation of inulin extract from Jerusalem artichoke tubers using Paenibacilluspolymyxa ZJ-9 to produce R,R-2,3-butanediol[J].Bioresour Technol,2010,101(18):7076-7082.
[19] Marwoto B,Nakashimada Y,Kakizono T,et al.Enhancement of(R,R)-2,3-butanediol production from xylose by Paenibacillus polymyxa at elevated temperatures[J].Biotechnol Lett,2002,24(2):109-114.
[20] Jurchescu I M,Hamann J,Zhou X,et al.Enhanced 2,3-butanediolproduction in fed-batch cultures offree and immobilized Bacillus licheniformis DSM 8785[J].Appl Microbiol Biotechnol,2013,97(15):6715-6723.
[21] Wang Q,Chen T,Zhao X,et al.Metabolic engineering of thermophilic Bacilluslicheniformisforchiralpure d-2,3-butanediol production[J].BiotechnolBioeng,2012,109:1610-1621.
[22] Xiao Z,Wang X,Huang Y,et al.Thermophilic fermentation of acetoin and 2,3-butanediol by a novel Geobacillus strain[J].Biotechnol Biofuels,2012,5:88-98.
[23] Li L,Zhang L,Li K,et al.A newly isolated Bacillus licheniformis strain thermophilically produces 2,3-butanediol,a platform and fuel bio-chemical[J].Biotechnol Biofuels,2013,6(1):123.
[24] Nakashimada Y,Kanai K,Nishio N.Optimization of dilution rate,pH and oxygen supply on optical purity of 2,3-butanediol produced by Paenibacillus polymyxa in chemostat culture[J].Biotechnol Lett,1998,20(12):1133-1138.
[25] Nakashimada Y,Marwoto B,Kashiwamura T,et al.Enhanced 2,3-butanediol production by addition of acetic acid in Paenibacillus polymyxa[J].J Biosci Bioeng,2000,90(6):661-664.
[26] Laube V M,Groleau D,Martin S M.2,3-Butanediol production from xylose and other hemicellulosic components by Bacillus polymyxa[J].Biotechnol Lett,1984,6(4):257-262.
[27] Nilegaonkar S,Bhosale S B,Kshirsagar D C,et al.Production of 2,3-butanediol from glucose by Bacillus licheniformis[J].World J Microbiol Biotechnol,1992,8:378-381.
[28] Nilegaonkar S S,Bhosale S B,Dandage C N,et al.Potential of Bacillus licheniformis for the production of 2,3-butanediol[J].J Ferment Bioeng,1996,82(4):408-410.
[29] Perego P,Converti A,Del Borghi M.Effects of temperature,inoculum size and starch hydrolyzate concentration on butanediol production by Bacillus licheniformis[J].Bioresour Technol,2003,89(2):125-131.
[30] Cho S,Kim K D,Ahn J H,et al.Selective production of 2,3-butanediol and acetoin by a newly isolated bacterium Klebsiella oxytoca M1[J].Appl Biochem Biotechnol,2013,170(8):1922-1933.
[31] Xiao Z,Xu P.Acetoin metabolism in bacteria[J].Crit Rev Microbiol,2007,33(2):127-140.
[32] Ui S,Hosaka T,Watanabe K,et al.Discovery of a new mechanism of 2,3-butanediol stereoisomer formation in Bacillus cereus YUF-4 J[J].J Ferment Bioeng,1998,85(1):79-83.
[33] Yu B,Sun J,Bommareddy R R,et al.Novel(2R,3R)-2,3-butanediol dehydrogenase from potential industrial strain Paenibacillus polymyxa ATCC 12321[J]. Appl Environ Microbiol,2011,77(12):4230-4233.
[34] Xiao Z,Lv C,Gao C,et al.A novel whole cell biocatalyst with NAD+regeneration for production of chiral chemicals[J].PLoS One,2010,5(1):e8860.
[35] Zhang L,Xu Q,Zhan S,et al.A new NAD(H)-dependent meso-2,3-butanediol dehydrogenase from an industrially potential strain Serratia marcescens H30[J].Appl Microbiol Biotechnol,2014,98(3):1175-1184.
[36] Renna M C,Najimudin N,Winik L R,et al.Regulation of the Bacillus subtilis alsS,alsD,and alsR genes involved in postexponential-phase production of acetoin[J].J Bacteriol,1993,175(12):3863-3875.
[37] Fr?drich C,March A,F(xiàn)iege K,et al.The transcription factor AlsR binds and regulates the promoter of the alsSD operon responsible for acetoin formation in Bacillus subtilis[J].J Bacteriol,2012,194(5):1100-1112.
[38] de Oliveira R R,Nicholson W L.The LysR-type transcriptional regulator(LTTR)AlsR indirectly regulates expression of the Bacillus subtilis bdhA gene encoding 2,3-butanediol dehydrogenase[J].Appl Microbiol Biotechnol,2013,97(16):7307-7316.