李振玲等
【摘要】蛋白結(jié)構(gòu)域是指蛋白質(zhì)亞基結(jié)構(gòu)中明顯分開(kāi)的緊密球狀結(jié)構(gòu)區(qū)域。Bsp蛋白結(jié)構(gòu)域基因編碼的是一種65kDa的蛋白,含有N-末端,是GBS中的控制細(xì)胞形態(tài)的蛋白。不同細(xì)菌中存在類似于Bsp的蛋白結(jié)構(gòu)域。
【關(guān)鍵詞】結(jié)構(gòu)域;Bsp;Smb;CWB
【中圖分類號(hào)】Q518. 2 【文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼】B【文章編號(hào)】1004-4949(2014)01-0334-01
1蛋白結(jié)構(gòu)域概述
結(jié)構(gòu)域(Structural Domain)是介于二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)之間的另一種結(jié)構(gòu)層次。所謂結(jié)構(gòu)域是指蛋白質(zhì)亞基結(jié)構(gòu)中明顯分開(kāi)的緊密球狀結(jié)構(gòu)區(qū)域,又稱為轄區(qū)。多肽鏈?zhǔn)紫仁窃谀承﹨^(qū)域相鄰的氨基酸殘基形成有規(guī)則的二級(jí)結(jié)構(gòu),然后,又由相鄰的二級(jí)結(jié)構(gòu)片段集裝在一起形成超二級(jí)結(jié)構(gòu),在此基礎(chǔ)上多肽鏈折疊成近似于球狀的三級(jí)結(jié)構(gòu)。對(duì)于較大的蛋白質(zhì)分子或亞基,多肽鏈往往由兩個(gè)或多個(gè)在空間上可明顯區(qū)分的、相對(duì)獨(dú)立的區(qū)域性結(jié)構(gòu)締合而成三級(jí)結(jié)構(gòu),這種相對(duì)獨(dú)立的區(qū)域性結(jié)構(gòu)就稱為結(jié)構(gòu)域。對(duì)于較小的蛋白質(zhì)分子或亞基來(lái)說(shuō),結(jié)構(gòu)域和它的三級(jí)結(jié)構(gòu)往往是一個(gè)意思,也就是說(shuō)這些蛋白質(zhì)或亞基是單結(jié)構(gòu)域。結(jié)構(gòu)域自身是緊密裝配的,但結(jié)構(gòu)域與結(jié)構(gòu)域之間關(guān)系松懈。結(jié)構(gòu)域與結(jié)構(gòu)域之間常常有一段長(zhǎng)短不等的肽鏈相連,形成所謂鉸鏈區(qū)。不同蛋白質(zhì)分子中結(jié)構(gòu)域的數(shù)目不同,同一蛋白質(zhì)分子中的幾個(gè)結(jié)構(gòu)域彼此相似或很不相同。
2 變性鏈球菌的概述
2.1 變形鏈球菌的致齲性
變形鏈球菌群[8][9]是存在于口腔中的正常菌群, 是革蘭陽(yáng)性菌,在微需氧環(huán)境中生長(zhǎng)最好,能利用蔗糖產(chǎn)生細(xì)胞外多糖, 借此附著于牙面。變形鏈球菌能以蔗糖為底物合成胞外葡聚糖、果聚糖及胞內(nèi)多糖。葡聚糖介導(dǎo)細(xì)菌的黏附,促進(jìn)菌斑的形成,是變鏈球菌重要的致齲毒力因子。該菌合成的水溶性葡聚糖、果聚糖、胞內(nèi)多糖還可作為代謝底物提供能量,增強(qiáng)致齲力。變形鏈球菌表面蛋白和脂磷壁酸是菌體表面粘結(jié)素,它們與獲得性膜中的不同受體結(jié)合,促進(jìn)該菌黏附和菌斑的形成。牙菌斑的致齲作用可以概括為菌斑中細(xì)菌代謝碳水化合物產(chǎn)物,由于菌斑基質(zhì)的屏障作用,這些酸不易擴(kuò)散,使局部PH下降,從而造成牙體硬組織脫礦,最終形成齲齒。變形鏈球菌的主要致齲作用是: 黏附、產(chǎn)酸和耐酸。
2.2變形鏈球菌的黏附性
牙菌斑生物膜是齲病的始動(dòng)因子。它作為典型的細(xì)菌性生物膜 , 由鏈球菌屬、乳桿菌屬及其他菌屬微生物細(xì)胞和細(xì)胞外多糖基質(zhì)組成。各種細(xì)菌存在于宿主和細(xì)菌胞外多聚物基質(zhì)包繞的結(jié)構(gòu)中 , 相互黏附或附著、定植于牙表面及界面。 牙菌斑生物膜成為菌群賴以生存及細(xì)胞間信號(hào)交流的場(chǎng)所。黏附[10]是微生物在特定的組織表面定植的首要條件,是微生物與宿主發(fā)生關(guān)系和致病的基礎(chǔ)??谇患?xì)菌在牙面的選擇性定居,主要是其表面黏結(jié)素與牙面受體分子特異性結(jié)合的結(jié)果。黏結(jié)素通常是指細(xì)菌表面某種特定的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)或糖脂成分,可存在于細(xì)菌細(xì)胞壁、外膜蛋白、鞭毛、菌毛和微毛等結(jié)構(gòu)中,在黏附中充當(dāng)配體角色。受體則是存在于唾液中的一種能夠識(shí)別和選擇性結(jié)合特定配體的大分子物質(zhì),多為糖蛋白。黏結(jié)素-受體介導(dǎo)的特異性黏附在細(xì)菌生物膜形成中起著決定性的作用。當(dāng)受體與配體結(jié)合后,受體的構(gòu)象改變并產(chǎn)生活性,啟動(dòng)一系列信號(hào)傳導(dǎo)過(guò)程,最終表現(xiàn)為生物學(xué)效應(yīng)。
2.3變形鏈球菌的產(chǎn)酸性
變形鏈球菌是口腔齲病的主要致齲菌,變形鏈球菌可以蔗糖、葡萄糖等糖類為原料,通過(guò)物質(zhì)代謝,產(chǎn)酸,使口腔環(huán)境的PH值降低,進(jìn)一步導(dǎo)致牙齒硬組織脫礦,進(jìn)而引起齲病的發(fā)生。產(chǎn)酸力的強(qiáng)弱為變形鏈球菌致齲的重要毒力特征。大量研究證實(shí),牙菌斑產(chǎn)酸活性與齲病發(fā)病密切相關(guān),消除這種因素則能控制齲病。
2.4變形鏈球菌的耐酸性
變形鏈球菌在人類口腔中占有重要的生態(tài)地位。它既是牙菌斑生物膜的重要組分,也是公認(rèn)的主要致齲菌。在S.mutans[11] 的致齲毒力中,耐酸性是其中一個(gè)關(guān)鍵因素。耐酸性是指細(xì)菌在酸性環(huán)境中生長(zhǎng)和代謝碳水化合物產(chǎn)酸的能力,其包括兩個(gè)方面:基本耐酸和耐酸反應(yīng)(ATR)?;灸退崤cATP酶的活性和最適pH 值有關(guān);耐酸反應(yīng)是指對(duì)數(shù)期生長(zhǎng)的S.mutans 在亞致死性的低pH 值生長(zhǎng)后,可抵抗致死性酸化的殺傷,產(chǎn)生適應(yīng)性耐酸的能力。耐酸性也與細(xì)菌的耐酸基因相關(guān),耐酸基因的宏觀調(diào)控,是的細(xì)菌可以在低PH條件下,正常生存代謝產(chǎn)酸。
3 Bsp蛋白結(jié)構(gòu)域的研究
3.1 無(wú)乳鏈球菌中的Bsp蛋白結(jié)構(gòu)域
GBS-Bsp-like Repeat 是大量鏈球菌蛋白的一種重復(fù),包括一些假定蛋白和Bsp。Bsp是無(wú)乳鏈球菌(GBS)中的一種控制細(xì)胞形態(tài)的蛋白。德國(guó)烏爾姆大學(xué)Reinscheid DJ[1]等人發(fā)現(xiàn)在無(wú)乳鏈球菌中存在Bsp。無(wú)乳鏈球菌有囊壁包繞,研究發(fā)現(xiàn)在GBS上清中,存在一種65kDa的蛋白,含有N-末端,分離相應(yīng)基因,稱為bsp。Bsp在GBS菌中廣泛存在。R,einscheid DJ[1]等人利用Bsp基因的刪除和過(guò)表達(dá)后,PCR擴(kuò)增導(dǎo)入GBS中,通過(guò)電鏡觀察細(xì)胞形態(tài),發(fā)現(xiàn)過(guò)表達(dá)的的Bsp導(dǎo)致無(wú)乳鏈球菌成透鏡形態(tài),這表明Bsp與細(xì)胞的形態(tài)學(xué)有關(guān)。文獻(xiàn)中提到GBS又稱為無(wú)乳鏈球菌,定植于呼吸道、胃腸消化道、泌尿生殖系統(tǒng)。同時(shí)GBS引起細(xì)菌的敗血癥,新生兒腦膜炎,對(duì)分娩的孕婦構(gòu)成極大地威脅。過(guò)去十年里GBS發(fā)病率上升,但對(duì)其細(xì)胞外蛋白和肽聚糖代謝知之甚少。文中提到Bsp蛋白的功能分析和血清學(xué)檢測(cè),發(fā)現(xiàn)Bsp不是一種溶菌酶,對(duì)細(xì)胞壁蛋白不具有溶菌作用。為了研究不同血清型的變形鏈球菌中Bsp的分布,純化融合蛋白得到抗Bsp抗體??笲sp抗體檢測(cè)到Bsp為65kDa,表明在無(wú)乳鏈球菌中Bsp的高分布和高表達(dá)。
3.2 GS-5中的GBS-Bsp-like蛋白結(jié)構(gòu)域Smb
變形鏈球菌GS-5也存在GBS-Bsp-like蛋白結(jié)構(gòu)域,稱之為Smb。變形鏈球菌GS-5是一種血清型C。在GS-5[2][3]中Smb是一種一類細(xì)菌素,依賴于CSP誘導(dǎo)群體感應(yīng)。2005年紐約州立大學(xué)口腔生物學(xué)院的Hideo Yonezawa[2]等人對(duì)GS-5中的Smb做了相關(guān)的遺傳分析。Smb在變形鏈球菌GS-5中存在七種血清型。它們分別是smbM1, smbT, smbF, smbM2,smbG, smbA, smbB。實(shí)驗(yàn)通過(guò)在基因的不同位點(diǎn)插入分類滅活不同血清型,然后在含四環(huán)素的培養(yǎng)皿中培養(yǎng),通過(guò)細(xì)菌素板化實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)它們是一類細(xì)菌素。滅活的smbM1,smbA, smbB減弱了生長(zhǎng)因子RP66的抑制作用。成熟的Smb包含了30個(gè)氨基酸的smbA和32個(gè)氨基酸的smbB。成熟的smbA類似于乳鏈球菌中的A2,smbB類似于嗜鹽芽孢桿菌和乳酸菌中的細(xì)菌素多肽。同時(shí)研究表明Smb的表達(dá)受能力刺激肽(CCP)的影響和控制。
3.3 變形鏈球菌中CWB結(jié)構(gòu)域
R.E. Eaton[4]等人對(duì)變形鏈球菌中能力誘導(dǎo)基因缺失的過(guò)表達(dá)引起轉(zhuǎn)化缺陷中提到在變形鏈球菌和血性鏈球菌中存在一種類似于CWB結(jié)構(gòu)域的GBS-Bsp-like,因此CWB結(jié)構(gòu)域類似于Bsp包含有CWB假定蛋白結(jié)構(gòu)域和SH3片段。盡管變形鏈球菌的GBS-Bps-like Repeat與肺炎鏈球菌中的CWB不同,但是GBS-Bps-like Repeat包含了帶電芳香基殘基,表明與細(xì)胞壁的碳水化合物之間的存在交流。Se′verine Laye[6]等人提到厚壁細(xì)胞壁的肽聚糖水解酶參與細(xì)胞子代分離,而細(xì)胞分離PGHs具有種特異性,PGHs已證明是重要因素,使LysM和GBS Bsp-like等驅(qū)動(dòng)蛋白在一個(gè)特定的位置上。
Hiroki Yamamoto,Junichi Sekiguchi[7]等人發(fā)現(xiàn)枯草芽孢桿菌中的LytF和LytC蛋白包含有兩個(gè)蛋白結(jié)構(gòu)域,一個(gè)是N-末端的CWB蛋白結(jié)構(gòu)域,另一個(gè)是C-末端的催化結(jié)構(gòu)域。CWB有人工蛋白CWBB-LipB and CWBB-CutL錨定點(diǎn),它們具有酶的活性和CWB活性。
3.4 豬鏈球菌2 型株[5]中的ORF中存在GBS-Bsp-like蛋白結(jié)構(gòu)域
顧宏偉[5]豬鏈球菌2 型(SS2)P1/7 株的自溶素的DNA 為模板,擴(kuò)增自溶素ORF 完整的編碼基因,軟件分析結(jié)果顯示,其分子量為113kDa,其等電點(diǎn)為7.27。該基因蛋白結(jié)構(gòu)含有6 個(gè)重復(fù)的“GBS_Bsp-like”域和1 個(gè)“N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸酰胺酶”域,與SS2 歐洲株有較高同源性(99.8%),但是6 次重復(fù)的“GBS_Bsp-like”域的功能目前尚不清楚。
4研究的局限和存在的問(wèn)題
國(guó)內(nèi)外對(duì)于GBS-Bsp-like蛋白結(jié)構(gòu)域研究甚少,并且在變形鏈球菌UA159中未見(jiàn)到相關(guān)方面的研究。因此在變形鏈球菌UA159中GBS-Bsp-like蛋白結(jié)構(gòu)域還是個(gè)未知因素,通過(guò)變形鏈球菌GS-5全基因組中進(jìn)行BLAST比對(duì)中基因未命名,同時(shí)蛋白表達(dá)也只是猜測(cè)它是40 kDa cell wall protein precursor。因此對(duì)于這個(gè)基因的功能及其作用都有待進(jìn)一步研究,有諸多問(wèn)題亟待解決,例如變形鏈球菌UA159是否存在GBS-Bsp-like蛋白結(jié)構(gòu)域,存在多少,其表達(dá)的蛋白有什么功能;變形鏈球菌UA159F-R中GBS-Bsp-like蛋白結(jié)構(gòu)域,是否存在改變,對(duì)細(xì)菌的產(chǎn)酸性和耐酸性是否有影響,影響是什么......
5應(yīng)用前景展望
如果變形鏈球菌其它菌中也存在GBS-Bsp-like蛋白結(jié)構(gòu)域,而它也控制著細(xì)菌細(xì)胞壁的形態(tài)學(xué)。我們就可以通過(guò)利用這個(gè)基因誘導(dǎo)突變或者使基因沉默等基因和分子生物學(xué)方法,使細(xì)菌細(xì)胞壁發(fā)生改變,如抵御外界侵入性減低或者粘附性降低,從而是這些致齲菌的致病性降低,從而降低患齲率,推動(dòng)醫(yī)學(xué)進(jìn)步。
隨著基因工程學(xué)和分子生物學(xué)的不斷發(fā)展和進(jìn)步,人們對(duì)GBS-Bsp-like蛋白結(jié)構(gòu)域的不斷研究和系統(tǒng)認(rèn)識(shí)的不斷深化,這些難題和疑問(wèn)終將得到合理科學(xué)的解釋。
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