易小平 賀萍萍 夏啟玉 肖蘇生 謝翔 楊小亮 李美英 郭安平
摘 要 轉(zhuǎn)基因玉米MON810(YieldGardR)是孟山都公司通過DNA重組技術(shù)和微注射轟擊研發(fā)的一種具有對歐洲玉米螟(ECB;Ostrinia nublialis)有特殊抗性的轉(zhuǎn)基因玉米品系,目前在世界各地已經(jīng)得到廣泛種植,為加強(qiáng)對該品系玉米的安全管理,本研究旨在建立MON810品系玉米的轉(zhuǎn)化事件特異性定性PCR檢測方法。根據(jù)MON810的插入序列信息,在3′端的側(cè)翼序列處設(shè)計(jì)定性PCR檢測的引物,檢測MON810在其他幾種常見轉(zhuǎn)基因作物混合樣品的特異性。結(jié)果表明,該方法具有很好的特異性。同時(shí)檢測該引物系統(tǒng)的擴(kuò)增靈敏度,結(jié)果表明,檢測引物的靈敏度可達(dá)0.1%。建立的MON810特異定性PCR檢測方法經(jīng)全國7家實(shí)驗(yàn)室的驗(yàn)證,進(jìn)一步證實(shí)該方法能夠特異地檢測出樣品中的MON810轉(zhuǎn)化事件,檢測方法的靈敏度可達(dá)0.1%,且檢測結(jié)果具有良好的可重復(fù)性和可重現(xiàn)性。MON810轉(zhuǎn)化事件定性PCR檢測方法的建立可滿足于抗蟲轉(zhuǎn)基因玉米MON810及其衍生品種生物安全管理的需要。
關(guān)鍵詞 轉(zhuǎn)基因玉米MON810;定性PCR;靈敏度;特異性
中圖分類號 S19 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A
玉米是大宗糧食作物,又是重要的飼料和工業(yè)原料,由于蟲害的威脅,導(dǎo)致其產(chǎn)量和質(zhì)量嚴(yán)重下降。其中玉米螟是世界性的主要玉米害蟲,每年因玉米螟危害造成玉米產(chǎn)量損失在5%左右。中國是玉米螟的多發(fā)和重發(fā)區(qū),20世紀(jì)70年代以來,幾乎每2 a就大發(fā)生1次,年損失玉米380~640萬t,相當(dāng)于一個(gè)中等省玉米的產(chǎn)量。而MON810(YieldGardR)玉米是孟山都公司研發(fā)的一種具有對歐洲玉米螟(ECB;Ostrinia nublialis)有特殊抗性的轉(zhuǎn)基因玉米品系,能保護(hù)玉米免受歐洲玉米螟ECB幼蟲對莖葉的損害。因此MON810玉米自1996年在美國得到批準(zhǔn)商業(yè)化種植以來,相繼在歐洲、加拿大、阿根廷、澳大利亞、日本等多個(gè)國家和地區(qū)受到種植業(yè)主的歡迎[1-2]。2005年后,中國允許進(jìn)口MON810玉米用于加工飼料。MON810玉米的研發(fā)給人們帶來很大的收益和便利,但是其安全性問題目前仍存在著很大的爭議[3-6],MON810玉米的種植曾在法國和德國得到禁止[3]。因此為加強(qiáng)MON810玉米的安全管理,對MON810玉米品系的特異性檢測研究也具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。
目前對轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的檢測主要分為2類,一類是基于核酸水平的檢測方法(如定性和定量PCR方法),另一類是基于蛋白的檢測方法(如ELSA方法)。定性PCR方法具有高特異性,較高的檢測靈敏度,檢測的成本較低,因而是目前轉(zhuǎn)基因成分檢測最常用的方法[7-8]。MON810玉米自商品化種植以來,MON810玉米的轉(zhuǎn)基因成分檢測也備受關(guān)注。2003年,曹際娟[1]首先利用篩選檢測轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的CaMV35S啟動(dòng)子檢測到了195 bp的擴(kuò)增產(chǎn)物,又在質(zhì)粒載體插入玉米基因組的5′的側(cè)翼序列設(shè)計(jì)了1對MON810轉(zhuǎn)化體特異性檢測引物,其中上游引物在玉米的基因組位置,下游引物在CaMV35S啟動(dòng)子位置,擴(kuò)增片段大小為170 bp。近年來,環(huán)介導(dǎo)的等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(loop-mediated isothermal amplification method, LAMP)在MON810玉米轉(zhuǎn)化事件的檢測中也得到探討[9]。目前有關(guān)MON810檢測的熒光定量PCR方法也有很多報(bào)道[10-11]。但熒光定量PCR方法檢測轉(zhuǎn)基因成分的成本較高,不能得到普遍應(yīng)用?;谝陨戏治?,MON810轉(zhuǎn)化事件定性PCR檢測方法的研究更具有實(shí)際應(yīng)用意義。Moon等[12]建立了特異擴(kuò)增MON810 轉(zhuǎn)化事件的80 bp的新的定性PCR的引物系統(tǒng)。農(nóng)業(yè)部869號公告-9-2007有關(guān)MON810 轉(zhuǎn)化事件的檢測標(biāo)準(zhǔn)的擴(kuò)增產(chǎn)物為106 bp[13],這些檢測方法擴(kuò)增片段太小,不易與引物二聚體分開,并且還有明顯的非特異性擴(kuò)增現(xiàn)象,在對MON810轉(zhuǎn)基因成分的判定時(shí)容易誤判。
為了更好地防止轉(zhuǎn)基因玉米MON810的流轉(zhuǎn)散失,本研究根據(jù)轉(zhuǎn)基因玉米MON810的3′端側(cè)翼序列,建立了新的抗蟲轉(zhuǎn)基因玉米MON810及其衍生品種的定性PCR檢測方法,為轉(zhuǎn)基因玉米MON810的生物安全管理提供技術(shù)支撐。
1 材料與方法
1.1 材料與樣品的制備
轉(zhuǎn)基因玉米(Zea mays)MON810及其受體由農(nóng)業(yè)部科技發(fā)展中心提供。將MON810玉米與對應(yīng)的非轉(zhuǎn)基因玉米按質(zhì)量比混合,制成MON810質(zhì)量分?jǐn)?shù)分別為10%、1%、0.5%、0.1%、0.05%、0.02%、0.01%的樣品。含有MON810玉米的轉(zhuǎn)基因玉米混合物、不含有MON810玉米的轉(zhuǎn)基因玉米混合物、轉(zhuǎn)基因大豆混合物、轉(zhuǎn)基因水稻混合物、轉(zhuǎn)基因棉花混合物和轉(zhuǎn)基因油菜混合物等轉(zhuǎn)基因試驗(yàn)材料的混合樣品由農(nóng)業(yè)部科技發(fā)展中心委托農(nóng)業(yè)部轉(zhuǎn)基因植物環(huán)境安全監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心(長春)制備(每種轉(zhuǎn)化體質(zhì)量百分含量為1%),具體轉(zhuǎn)化體組分見表1。非轉(zhuǎn)基因玉米(陰性對照)由本實(shí)驗(yàn)室保存。
1.2 方法
1.2.1 轉(zhuǎn)基因玉米MON810外源基因插入位點(diǎn)旁側(cè)序列的獲得及其引物設(shè)計(jì) 在GMO檢測方法數(shù)據(jù)庫(Detection method Database,GMDD)(http://gmdd.shgmo.org/sequence/view/12)中查到MON810的旁側(cè)序列信息,在其3′端旁側(cè)的cry1Ab序列部分設(shè)計(jì)上游引物MON810-F:5′-ACCTCGAGATTTAC
CTGATCCG-3′,在玉米基因組的位置設(shè)計(jì)下游引物MON810-R:5′-TGCTGCAGGTGGTCTTACATC-3′。
1.2.2 特異性測試 特異性測試樣品見表1。以質(zhì)量百分含量為1%的MON810玉米為陽性對照,非轉(zhuǎn)基因玉米為陰性對照,同時(shí)設(shè)置空白對照。樣品基因組DNA的抽提采用CTAB方法[14],提取的DNA用NanoDrop2000C(Thermo scientific)型核酸測定儀檢測DNA的濃度和純度,DNA濃度調(diào)整到25 ng/μL后用于PCR檢測[14]。PCR 反應(yīng)體系為10×Buffer 5.0 μL, dNTPs(10 mmol/L each)0.5 μL, Taq DNA聚合酶(5 U/μL)0.125 μL,上下游引物終濃度為0.4 μmol/L, 模板2.0 μL,總體積為25 μL;PCR擴(kuò)增程序?yàn)椋?94 ℃ 5 min; 94 ℃ 30 s, 56 ℃ 30 s, 72 ℃ 30 s, 共35個(gè)循環(huán);3次平行重復(fù)。
1.2.3 靈敏度測試 以質(zhì)量分?jǐn)?shù)分別為10%、1%、0.5%、0.1%、0.05%、0.02%、0.01%的MON810樣品的DNA作為PCR反應(yīng)的模板,進(jìn)行靈敏度測試,非轉(zhuǎn)基因玉米為陰性對照,同時(shí)設(shè)置空白對照。樣品基因組DNA的抽提、PCR反應(yīng)體系和PCR擴(kuò)增程序與1.2.2相同。
1.2.4 檢出限的確定 為進(jìn)一步確定方法的檢出限,隨機(jī)稱取20份質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.1%的MON810玉米樣品,提取基因組DNA,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,每個(gè)樣品設(shè)置3次平行PCR反應(yīng)。非轉(zhuǎn)基因玉米為陰性對照,同時(shí)設(shè)置空白對照。樣品基因組DNA的抽提、PCR 反應(yīng)體系和PCR擴(kuò)增程序與1.2.2相同。
1.2.5 重演性驗(yàn)證 為驗(yàn)證建立抗蟲轉(zhuǎn)基因玉米MON810及其衍生品種的定性PCR檢測方法的重演性,在全國7家同行實(shí)驗(yàn)室對方法的檢測特異性和靈敏度進(jìn)行了測試。包括農(nóng)業(yè)部轉(zhuǎn)基因植物用微生物環(huán)境安全監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心(北京)、農(nóng)業(yè)部轉(zhuǎn)基因植物環(huán)境安全監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心(北京)、農(nóng)業(yè)部谷物及制品質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心(哈爾濱)、農(nóng)業(yè)部農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全及轉(zhuǎn)基因生物產(chǎn)品成分監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心(杭州)、農(nóng)業(yè)部轉(zhuǎn)基因生物產(chǎn)品成分監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心(天津)、農(nóng)業(yè)部轉(zhuǎn)基因生物生態(tài)環(huán)境安全監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心(天津)、農(nóng)業(yè)部轉(zhuǎn)基因植物環(huán)境安全監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心(長春)7家單位。驗(yàn)證樣品如下:a:以質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.1%(以非轉(zhuǎn)基因玉米為填充物)的MON810作為陽性對照;b:MON810玉米的受體作為陰性對照;c:特異性測試樣品包括10個(gè)樣品,包括以質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1%的MON810玉米、質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1%的Bt11玉米、質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1% Bt176玉米、質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1%的DAS-40278-9玉米、轉(zhuǎn)基因玉米混合樣品(MON863、 GA21、 NK603、 T25、 TC1507、 MON89034、 MON88017、 59122、 MIR604、 3272、 MON87460,混合制成1個(gè)樣品,每個(gè)轉(zhuǎn)化體質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1%)、轉(zhuǎn)基因大豆混合樣品(356043、305423、CV127、MON89788、A5547-127、A2704-12,混合制成1個(gè)樣品,每個(gè)轉(zhuǎn)化體質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1%)、轉(zhuǎn)基因水稻混合樣品(KF-6、KMD-1、M12、KF-8,混合制成一個(gè)樣品,每個(gè)轉(zhuǎn)化體質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1%)、轉(zhuǎn)基因油菜混合樣品(MS1、MS8、RF1、RF2、RF3、T45、Oxy235、Topas19/2,混合制成1個(gè)樣品,每個(gè)轉(zhuǎn)化體質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1%)、轉(zhuǎn)基因棉花混合樣品(MON1445、MON531、MON15985、LLCOTTON25、MON88913,混合制成1個(gè)樣品,每個(gè)轉(zhuǎn)化體質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1%)、非轉(zhuǎn)基因玉米鄭單958、吉單180、先玉335,等量混合制成1個(gè)樣品;d:質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.1%的 MON810玉米作為靈敏度測試樣品;e:以MON810玉米質(zhì)量分?jǐn)?shù)為5%的玉米面加工制作并蒸熟后的玉米饅頭制成1個(gè)樣品為加工樣品的測試。
2 結(jié)果與分析
2.1 轉(zhuǎn)基因玉米MON810外源基因插入位點(diǎn)旁側(cè)序列分析
由圖1可知,MON810分子信息顯示表達(dá)載體的部分元件整合到玉米的基因組序列中,包括強(qiáng)啟動(dòng)子CaMV35S、玉米hsp70 內(nèi)含子和cry1Ab;5′端上游部分有803 bp的玉米基因組序列,3′下游部分有588 bp的玉米基因組序列,全長為4 983 bp;并且在插入序列及其3′端的玉米基因組序列設(shè)計(jì)了定性PCR檢測MON810玉米的上下游引物。
2.2 特異性測試
由圖2可知,僅從MON810玉米和含有MON810的轉(zhuǎn)基因玉米混合樣品中擴(kuò)增到預(yù)期的DNA條帶,而在其他轉(zhuǎn)基因玉米(Bt176、Bt11、MON863、GA21、NK603、T25、TC1507、MON89034、59122、MIR604、MON88017、MON87460)、大豆(356043、305423、CV127、MON89788、A5547-127、A2704-12、GTS40-3-2)、水稻(KF-6、KMD-1、M12、KF-8)、油菜(MS1、MS8、RF1、RF2、RF3、T45、Oxy235、Topas19/2)、棉花(MON1445、MON531、MON15985、LLCOTTON25、MON88913)混合樣品中和非轉(zhuǎn)基因玉米陰性對照樣品中未擴(kuò)增出預(yù)期條帶的片段,上述結(jié)果表明建立的MON810玉米檢測方法具有高度特異性。
2.3 靈敏度測試
由圖3可知,在含量為0.1%以上(含0.1%)的MON810樣品中均能穩(wěn)定擴(kuò)增到預(yù)期的DNA片段,表明建立的MON810玉米檢測方法的靈敏度可達(dá)到0.1%。
2.4 檢出限的確定
由圖4可知,20份含量為0.1%的MON810試樣中均能穩(wěn)定檢測出預(yù)期的DNA片段,表明本方法的檢出限為0.1%。
2.5 重演性的驗(yàn)證結(jié)果
7家單位包括農(nóng)業(yè)部轉(zhuǎn)基因植物用微生物環(huán)境安全監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心(北京)、農(nóng)業(yè)部轉(zhuǎn)基因植物環(huán)境安全監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心(北京)、農(nóng)業(yè)部谷物及制品質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心(哈爾濱)、農(nóng)業(yè)部農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全及轉(zhuǎn)基因生物產(chǎn)品成分監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心(杭州)、農(nóng)業(yè)部轉(zhuǎn)基因生物產(chǎn)品成分監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心(天津)、農(nóng)業(yè)部轉(zhuǎn)基因生物生態(tài)環(huán)境安全監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心(天津)、農(nóng)業(yè)部轉(zhuǎn)基因植物環(huán)境安全監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心(長春)(在表2 中分別用1~7數(shù)字表示)的復(fù)核驗(yàn)證結(jié)果見表2,僅從含有MON810轉(zhuǎn)化體的樣品(含加工品)中擴(kuò)增獲得預(yù)期的DNA片段,而在其他轉(zhuǎn)基因玉米(Bt11、Bt176、DAS-40278-9、MON863、GA21、NK603、T25、TC1507、MON89034、MON88017、59122、MIR604、3272、MON87460)、轉(zhuǎn)基因大豆(356043、305423、CV127、MON89788、A5547-127、A2704-12)、轉(zhuǎn)基因水稻(KF-6、KMD-1、M12、KF-8)、轉(zhuǎn)基因油菜(MS1、 MS8、 RF1、 RF2、 RF3、 T45、 Oxy235、Topas19/2)、轉(zhuǎn)基因棉花(MON1445、MON531、MON15985、LLCOTTON25、MON88913)和非轉(zhuǎn)基因玉米陰性對照樣品中未擴(kuò)增獲得預(yù)期片段。所有驗(yàn)證單位從含量為0.1%的MON810玉米樣品中擴(kuò)增獲得預(yù)期片段,再次證明檢測方法的靈敏度可達(dá)到0.1%,在加工品測試中,可從MON810玉米加工品饅頭中擴(kuò)增獲得預(yù)期片段。
2.6 新方法與農(nóng)業(yè)部869號公告-9-2007比較
新方法與農(nóng)業(yè)部869號公告-9-2007相比見表3,引物設(shè)計(jì)的位置不同,新建立的方法引物設(shè)計(jì)的擴(kuò)增區(qū)域?yàn)? 216~4 541 bp,擴(kuò)增大小為325 bp,農(nóng)業(yè)部869號公告-9-2007的引物設(shè)計(jì)的擴(kuò)增區(qū)域?yàn)? 315~4 421 bp,擴(kuò)增大小為106 bp,因而新建立的檢測方法具有較好的特異性,不存在非特異性擴(kuò)增現(xiàn)象。在同等實(shí)驗(yàn)條件下,不能檢測出其他常見的轉(zhuǎn)基因作物(包括轉(zhuǎn)基因玉米、水稻、大豆、棉花和油菜),不會(huì)誤判,不會(huì)引起爭議。
3 討論與結(jié)論
目前,轉(zhuǎn)基因生物的安全性已經(jīng)成為公眾媒體輿論的焦點(diǎn)。為防范農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物的流散,農(nóng)業(yè)部一再強(qiáng)調(diào)對轉(zhuǎn)基因作物實(shí)施嚴(yán)格管理。孟山都公司研發(fā)的抗蟲MON810玉米,由于能對抗玉米螟,因而受到廣大種植戶的歡迎。但MON810玉米的安全性一直是科學(xué)家及民眾爭論的焦點(diǎn)[3-6]。MON810玉米是獲準(zhǔn)進(jìn)口到中國用作加工原料較早的一種轉(zhuǎn)基因玉米品系。它在進(jìn)口、加工或銷售過程中可能存在流散,所以應(yīng)該加強(qiáng)對該品系玉米的監(jiān)管。建立MON810玉米品系特異性的檢測方法和標(biāo)準(zhǔn)是對其監(jiān)管的前提基礎(chǔ)。
MON810自研發(fā)到應(yīng)用以來,對MON810玉米品系特異性檢測方法的研究一直沒有停止,歐盟也已經(jīng)建立了定量PCR檢測方法,并且在幾個(gè)實(shí)驗(yàn)室間已進(jìn)行循環(huán)驗(yàn)證[15]。環(huán)介導(dǎo)的等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(Loop-mediated isothermal amplification method, LAMP)也對MON810轉(zhuǎn)化事件檢測進(jìn)行了報(bào)道。實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測技術(shù)是對轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品成分含量進(jìn)行標(biāo)示的前提基礎(chǔ),而且這種檢測技術(shù)成本較高,所需要的熒光定量PCR儀器設(shè)備并非所有的基層單位所能擁有,不適用于大規(guī)模的篩選檢測。環(huán)介導(dǎo)的等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(Loop-mediated isothermal amplification method, LAMP)是一種新興技術(shù),要發(fā)展為成熟常規(guī)的轉(zhuǎn)基因成分檢測的適用技術(shù)還需要很長時(shí)間。因此,目前定性PCR技術(shù)還是比較適用于轉(zhuǎn)基因生物安全監(jiān)管的技術(shù)之一。
本研究建立的MON810及其衍生品種的定性PCR檢測方法與曹際娟[1]相比,引物設(shè)計(jì)的位置不同,新建立的抗蟲轉(zhuǎn)基因玉米MON810及其衍生品種的定性PCR檢測方法的上游設(shè)計(jì)在抗蟲基因cry1Ab序列上,下游引物設(shè)計(jì)在玉米的基因組序列,而曹際娟[1]的研究方法是上游引物設(shè)計(jì)在玉米基因組序列,下游引物在CaMV35S啟動(dòng)子的序列。這種方法也是目前檢測MON810玉米轉(zhuǎn)化體特異性的一種常用方法。新建立的方法擴(kuò)增片段序列為抗蟲基因cry1Ab部分序列與玉米基因組的部分序列,這種方法具有更好的特異性,對于抗蟲玉米MON810的檢測更具有針對性。與農(nóng)業(yè)部869號公告-9-2007相比,新建立的方法引物設(shè)計(jì)區(qū)域有差異,擴(kuò)增大小不同,新方法的擴(kuò)增大小為325 bp,農(nóng)業(yè)部869號公告-9-2007擴(kuò)增大小為106 bp,因而新建立的檢測方法具有較好的特異性,不存在非特異性擴(kuò)增現(xiàn)象。同時(shí),本研究建立的抗蟲轉(zhuǎn)基因玉米MON810及其衍生品種的定性PCR檢測方法具有良好的靈敏性,檢出限達(dá)到0.1%,能夠滿足大宗混合樣品檢測的需要,這種方法也適用于對加工樣品的測試。綜上所述,本研究建立的抗蟲轉(zhuǎn)基因玉米MON810及其衍生品種的定性PCR檢測方法的特異性、靈敏度和重復(fù)性經(jīng)過了全國7家同行實(shí)驗(yàn)室的驗(yàn)證。這是建立抗蟲轉(zhuǎn)基因玉米MON810及其衍生品種的定性PCR檢測方法的標(biāo)準(zhǔn)基礎(chǔ)。利用該方法能準(zhǔn)確鑒定出利用MON810作為親本非法轉(zhuǎn)育出的衍生品種,從而可防止MON810流散到環(huán)境中造成生態(tài)風(fēng)險(xiǎn),因此能滿足于對抗蟲轉(zhuǎn)基因玉米MON810及其衍生品種生物安全監(jiān)管的需要。
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