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非小細(xì)胞肺癌胸腔積液與小活檢標(biāo)本中EGFR基因突變檢測的比較

2014-04-25 05:14:12田俏梅吳白平
黑龍江醫(yī)藥科學(xué) 2014年3期
關(guān)鍵詞:基因突變胸腔積液

趙 瑾,田俏梅,吳白平

(湖南省腫瘤醫(yī)院/中南大學(xué)湘雅醫(yī)學(xué)院附屬腫瘤醫(yī)院,湖南長沙410013)

目前,針對初診的非小細(xì)胞肺癌晚期患者應(yīng)常規(guī)檢測表皮生長因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突變,用于選擇是否一線或二線使用非替尼、厄洛替尼等小分子酪氨酸酶抑制劑(tyrosine kinase inhibitors,TKIs)。目前臨床用于EGFR檢測的標(biāo)本主要是腫瘤組織學(xué)和細(xì)胞學(xué)標(biāo)本,包括手術(shù)切除標(biāo)本、活檢組織標(biāo)本、新鮮穿刺標(biāo)本以及胸腔積液、痰液等。血液學(xué)標(biāo)本目前處于臨床研究階段,暫

未在臨床進(jìn)行使用。由于胸腔積液中的腫瘤細(xì)胞數(shù)量較少,其主要用于無法獲得組織標(biāo)本的情況下使用,且需要靈敏度較高的檢測方法才能提高EGFR基因突變的檢出率。本研究針對中南大學(xué)湘雅醫(yī)學(xué)院附屬腫瘤醫(yī)院存檔的非小細(xì)胞肺癌活檢標(biāo)本和胸腔積液標(biāo)本,用焦磷酸測序的方法檢測EGFR基因18~21外顯子突變檢測,探討胸腔積液作為晚期非小細(xì)胞肺癌患者EGFR基因檢測標(biāo)本的臨床意義。

1 材料與方法

1.1 研究對象

收集2013-03~2014-02中南大學(xué)湘雅醫(yī)學(xué)院附屬腫瘤醫(yī)院腫瘤醫(yī)院初診的非小細(xì)胞肺癌患者胸腔鏡活檢標(biāo)本43例,配對收集相同患者胸腔積液43例。其中男24例,女19例,中位年齡58歲。病理組織類型為腺癌36例、鱗癌7例。

1.2 樣本的采集和處理

收集患者胸腔鏡下新鮮活檢標(biāo)本和50ml胸腔積液,胸腔積液在室溫下13000r/min離心10min,棄上清,將細(xì)胞沉淀進(jìn)行細(xì)胞涂片,經(jīng)病理醫(yī)生評估后,確保為非小細(xì)胞肺癌標(biāo)本,且腫瘤細(xì)胞含量>5%后,立即常溫下送至檢驗(yàn)科。采集同一患者配對的新鮮活檢組織,采用中性福爾馬林溶液固定及石蠟包埋,經(jīng)病理醫(yī)生評估選取腫瘤細(xì)胞含量>10%以上的石蠟組織,切取5μm厚的石蠟白片10~15片,置于無菌的EP管中,用二甲苯和無水乙醇脫蠟后沉淀、烘干。

1.3 基因組DNA提取

采用德國凱杰公司的QIAamp DNA FFPE Tissue試劑盒(貨號:56404),按試劑盒說明書操作提取基因組DNA,用上海元析公司的B-500超微量分光光度計(jì)測定DNA純度及含量,要求 A280/A260>1.80。

1.4 PCR擴(kuò)增和焦磷酸測序

采用長沙三濟(jì)生物科技有限公司的EGFR基因突變檢測試劑盒,對EGFR基因18~21外顯子進(jìn)行PCR擴(kuò)增和PCR產(chǎn)物的焦磷酸測序,所有操作按試劑盒說明書進(jìn)行,實(shí)驗(yàn)全程設(shè)立陰陽對照。采用德國凱杰公司的PyroMark Q24焦磷酸測序儀進(jìn)行測序。將得到的基因序列與Genbank中的EGFR基因標(biāo)準(zhǔn)序列(序列號:NG_007726)進(jìn)行比對,分析測序結(jié)果。

1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

采用SPSS 17.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,卡方檢驗(yàn),檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05,以P > 0.05為差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P < 0.05為差異具體統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 活檢標(biāo)本EGFR基因突變率

43例胸腔鏡下非小細(xì)胞肺癌活檢標(biāo)本中檢出EGFR基因突變型12例,野生型31例,EGFR基因突變率為27.9%(12/43)。其中,EGFR基因第19外顯子突變8例,突變率為66.6%(8/12),第21外顯子突變8例,突變率為33.3%(4/12),見圖1。

圖1 焦磷酸測序檢測EGFR基因突變

2.2 胸腔積液標(biāo)本EGFR基因突變率

胸腔積液標(biāo)本中檢出EGFR基因突變型11例,野生型32例,EGFR基因突變率為25.6%(11/43)。胸腔積液標(biāo)本EGFR基因檢測結(jié)果有一例與配對活檢組織不符合,其他結(jié)果均一致,見圖2。胸腔積液中細(xì)胞的EGFR基因突變率略低于活檢組織標(biāo)本,但兩者差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見表1。

表1 非小細(xì)胞肺癌胸腔鏡下活檢標(biāo)本EGFR基因突變率(n=43)

圖2 同一患者胸腔積液標(biāo)本與活檢組織標(biāo)本中EGFR基因檢測不符合的測序

3 討論

肺癌的死亡率在世界范圍內(nèi)的癌癥中最高,絕大部分的肺癌為非小細(xì)胞肺癌。改癌癥的藥物靶向治療是目前較先進(jìn)的技術(shù)之一。其EGFR基因是參與調(diào)控腫瘤細(xì)胞的增殖、凋亡、侵襲、血管生成和轉(zhuǎn)移,是非小細(xì)胞肺癌重要的治療靶點(diǎn)之一[1]。而治療的療效往往可通過對EGFR基因的突變檢測進(jìn)行評價,酪氨酸激酶抑制劑(TKI)為靶向治療的藥物,非小細(xì)胞肺癌的EGFR基因突變與TKI有特異性反應(yīng),也是預(yù)測KTI治療療效的指標(biāo)之一,因此對非小細(xì)胞肺癌中EGFR基因突變的檢測就能評估治療的療效[2~4]。那么對于腫瘤基因的提取是整個評價過程的關(guān)鍵,通??梢赃x用腫瘤組織小活檢標(biāo)本進(jìn)行,但活檢不僅有創(chuàng)也較為復(fù)雜。而目前較多的研究表明,非小細(xì)胞肺癌晚期患者往往會有胸腔積液,且在積液中能發(fā)現(xiàn)腫瘤細(xì)胞[5]。因此胸腔積液也能提取EGFR基因進(jìn)行突變檢測而代替小活檢組織標(biāo)本。

本研究通過配對收集相同患者的腫瘤組織小活檢標(biāo)本與患者的胸腔積液采用PCR擴(kuò)增和焦磷酸測序的方法來對比分析兩種標(biāo)本是否存在檢測結(jié)果的一致性。結(jié)果表明,胸腔鏡下非小細(xì)胞肺癌活檢標(biāo)本檢出EGFR基因突變型12例,EGFR基因突變率為27.9%(12/43)。胸腔積液標(biāo)本共檢出EGFR基因突變型11例,EGFR基因突變率為25.6%(11/43),差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),這與國內(nèi)外多數(shù)研究的結(jié)果基本一致[6~8]。然而國外有研究卻不支持改觀點(diǎn)[9],本研究通過仔細(xì)核對標(biāo)本的收集、送檢、數(shù)據(jù)分析以及對比的研究的可靠性,結(jié)果還是胸腔積液標(biāo)本與腫瘤組織小活檢標(biāo)本結(jié)果無差異,支持胸腔積液標(biāo)本能代替小活檢標(biāo)本進(jìn)行檢測。

此外,在本研究中發(fā)現(xiàn)胸腔積液標(biāo)本EGFR基因檢測結(jié)果有一例與配對活檢組織不符合,其他結(jié)果均一致,這可能是胸腔積液腫瘤基因突變存在異質(zhì)性有關(guān),具體可能為靶向治療后基因的檢測的變換,更大的可能性為腫瘤的轉(zhuǎn)移與原發(fā)病灶不一樣。那么對于這種現(xiàn)象,可以在胸腔積液標(biāo)本檢測的基礎(chǔ)上取腫瘤組織標(biāo)本進(jìn)行檢測,理論上活檢組織的檢測結(jié)果更支持臨床需要。

通過實(shí)驗(yàn)以及參照文獻(xiàn),基本可以認(rèn)為非小細(xì)胞肺癌患者的胸腔積液標(biāo)本能夠代替腫瘤組織活檢標(biāo)本對EGFR基因突變的檢測?;诖擞^點(diǎn),由于胸腔積液的收集更為簡便,檢測也較可靠,在臨床上可以參考應(yīng)用。

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