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胃癌古文獻(xiàn)庫的研究

2014-04-18 04:09王曉露潘宇張雷強(qiáng)
福建中醫(yī)藥 2014年1期
關(guān)鍵詞:文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫信息庫標(biāo)引

王曉露,潘宇,張雷強(qiáng)

(1.南京中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院,江蘇南京210029;2.南京中醫(yī)藥大學(xué),江蘇南京210049)

中醫(yī)古典文獻(xiàn)是古人直接醫(yī)療實踐經(jīng)驗的記錄,是古代眾多醫(yī)藥工作者長期努力、不懈探索積累起來的豐富知識寶庫。近年來,中醫(yī)藥學(xué)出現(xiàn)了數(shù)字資源缺乏統(tǒng)一的描述、傳承危機(jī)等問題[1]。因此,必須做好古典文獻(xiàn)的系統(tǒng)整理工作。信息庫是對領(lǐng)域信息的系統(tǒng)化管理和規(guī)范化呈現(xiàn),能夠?qū)崿F(xiàn)中醫(yī)藥知識的共享、重用和傳承。構(gòu)建胃癌古典文獻(xiàn)信息庫,可以進(jìn)一步理清概念,考鏡源流,認(rèn)識嬗變,構(gòu)建快速、準(zhǔn)確的胃癌知識檢索系統(tǒng),并借此實現(xiàn)知識的創(chuàng)新。國家中醫(yī)臨床研究基地建設(shè)之胃癌文獻(xiàn)信息庫構(gòu)建目前已取得階段性成果,現(xiàn)已構(gòu)建了古典文獻(xiàn)事實型數(shù)據(jù)庫,介紹如下。

1 古典文獻(xiàn)相關(guān)內(nèi)容提取

由于胃癌古今病名的對應(yīng)性較差,因此檢索詞的選擇必須準(zhǔn)確、全面。通過復(fù)習(xí)相關(guān)文獻(xiàn)資料,參考前人研究成果可知,中醫(yī)對胃癌早有認(rèn)識?!饵S帝內(nèi)經(jīng)》中提到的“食痹”,指食后不能消化,悶痛氣逆,必吐出乃止。這可能是胃癌相似癥狀較早的記載[2]。另外,還有“胃脘痛”、“心痛痞滿”、“膈中”等,都是對于胃癌相關(guān)癥狀的描述,“伏梁”、“心腹積”也是那個時期對這一類病證的稱謂?!峨y經(jīng)》提出“脾積”、“痞氣”等病名,以后的眾醫(yī)家對于脾積、痞氣的描述均源于此[3]。張仲景《金匱要略》中首次出現(xiàn)“胃反”稱謂。從此“胃反”一詞廣為后世醫(yī)家援引。至?xí)x、隋、唐時期有“癥堅”、“結(jié)積’、“腹中積”、“胃反”、“反胃”、“脾積”等稱謂[4]。宋代陳無擇在《三因極一病證方論》中提到“積心痛”一詞,該書又將“反胃”稱為“食嘔”。金元時期,李東垣《脾胃論》有“下脘不通”這一病名[5];朱丹溪稱“翻胃”、“隔噎”;羅天益在《衛(wèi)生寶鑒·卷十四》中稱為“腹中積聚”。明清時期仍沿襲稱為“翻胃”、“噎嗝”。至近代張錫純在《醫(yī)學(xué)衷中參西錄·腸胃病門·噎隔》中提到“胃癌”一詞。因此選擇胃反、反胃、翻胃、食嘔、伏梁、食痹、心腹積、癥堅、積聚等關(guān)鍵詞進(jìn)行檢索檢出率相對較高??紤]信息庫所需事實的完整全面以及信息獲取途徑的便捷準(zhǔn)確,本研究中的胃癌信息均從《中華醫(yī)典》中檢索獲得。《中華醫(yī)典》是第一部對中醫(yī)古籍進(jìn)行全面系統(tǒng)整理而制成的大型電子叢書。它收錄了民國以前中國歷代醫(yī)學(xué)古籍1 000部,卷帙過萬,近4億字,匯集了歷代主要中醫(yī)著作,其中不乏罕見的抄本和孤本,大致涵蓋了至清末為止的中國醫(yī)學(xué)文化建設(shè)的主要成就,是至今為止規(guī)模最為宏大的中醫(yī)類電子叢書。無須諱言,由于古今字形存在一定的差異,而且同一種中醫(yī)古籍的不同版本在內(nèi)容上也會有很大差別,因此從《中華醫(yī)典》中搜集的信息有待進(jìn)一步地校對和考證。但是考慮到信息庫的主要功能是系統(tǒng)的管理及規(guī)范化的呈現(xiàn),從《中華醫(yī)典》中獲取文獻(xiàn)無疑是有效且經(jīng)濟(jì)的途徑。

2 判斷文獻(xiàn)與胃癌相關(guān)性

胃癌古今病名的差異性導(dǎo)致古典文獻(xiàn)收錄標(biāo)準(zhǔn)難以確定,這是研究者要面對的首要問題。通過學(xué)習(xí)相關(guān)診斷標(biāo)準(zhǔn),中醫(yī)診斷標(biāo)準(zhǔn)參照《中藥新藥臨床研究指導(dǎo)原則(試行)》(2002版)及中華中醫(yī)藥學(xué)會腫瘤分會《腫瘤中醫(yī)診療指南》(2007版);西醫(yī)診斷標(biāo)準(zhǔn)參照國家衛(wèi)生部頒發(fā)的《胃癌診療規(guī)范》(2011版)及《NCCN胃癌臨床實踐指南》(2011版)。對胃癌主要癥狀和體征有如下認(rèn)識:主要癥狀體征(A):①上腹痛;②惡心、嘔吐;③腹部腫塊。消化不良表現(xiàn)(B):①納差;②易飽脹。全身狀況(C):①進(jìn)行性貧血(面色萎黃);②消瘦;③乏力。并發(fā)癥(D):①嘔血;②黑便;③腹瀉。從而可進(jìn)行篩選:①由于胃癌病名演化的特殊性,凡明確記載治療胃反、反胃、翻胃、食嘔者,若有胃部(胃脘、心下)腫塊體征的描述者,均予以錄入;脾積、痞氣、伏梁等有惡病質(zhì)體征(日漸羸瘦等)描述者予以錄入。②記載有治療食痹、心下痛、胃脘痛、心下痞滿、膈中者有胃部(胃脘、心下)腫塊體征以及惡病質(zhì)體征(日漸羸瘦等)描述的予以錄入;心腹積、癥堅、結(jié)積、腹中積、積心痛、噎膈、腹中積聚者,依據(jù)其主治癥加以鑒別,屬胃中癥堅積聚者予以收錄,其它臟腑積聚排除。標(biāo)準(zhǔn)容易擬定,但實際操作頗有難度。因為僅通過文獻(xiàn)中一些只言片語的描述往往無從獲取足夠的判斷信息,納入顯得牽強(qiáng),不收錄可能錯過有價值的文獻(xiàn)。考慮構(gòu)建信息庫的主要目的是為科研工作提供素材,為臨床工作開拓思路,因此對于這樣一些文獻(xiàn)依然予以納入。

3 完成文獻(xiàn)的分類標(biāo)引

中醫(yī)藥文獻(xiàn)在內(nèi)容上存在關(guān)聯(lián)性及差異性,參照既往信息庫構(gòu)建的一般模式,本研究將胃癌文獻(xiàn)信息分為3類,即本草信息、方劑信息、辨治信息。其中本草信息指古代本草文獻(xiàn)中記載的與胃癌相關(guān)本草,將古今異名本草同條陳列。如現(xiàn)代治療胃癌常用的中藥“石見穿”,在《神農(nóng)本草經(jīng)》中記載為“紫參”,此外亦有“牡蒙”等稱謂,在標(biāo)引中表示為:“紫參·石見穿·牡蒙”[6]。方劑信息則從歷代方書、綜合性著作中收錄胃癌相關(guān)方劑,對方名進(jìn)行標(biāo)引。辨治信息收錄胃癌辨治方面的文獻(xiàn),如脈診、病機(jī)、治法等,因為這些信息在某一條記錄中緊密關(guān)聯(lián),所以往往難以用單一字段進(jìn)行標(biāo)引;即便標(biāo)引,檢出結(jié)果特異性依然很低。只有在全文檢索上下功夫,方能讓使用者得到需要的文獻(xiàn)資料。因此,在辨治文獻(xiàn)檢索方面必須實現(xiàn)多個關(guān)鍵詞共同全文檢索,這一目標(biāo)在后期交互過程的開發(fā)中基本實現(xiàn)。

4 建立相關(guān)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫

結(jié)合數(shù)據(jù)量、成本等因素考慮,本研究應(yīng)用MySQL建立文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫。MySQL是一個開放源碼的小型關(guān)聯(lián)式數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)[7]。目前MySQL被廣泛地應(yīng)用在Internet上的中小型網(wǎng)站中。它具有體積小、速度快、總體擁有成本低、開放源碼等特點,許多中小型網(wǎng)站為了降低網(wǎng)站總體擁有成本而選擇了MySQL作為網(wǎng)站數(shù)據(jù)庫。在該數(shù)據(jù)庫中建立三張表,分別存放本草、方劑、辨治信息從而建立了文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫。

5 建立交互式檢索界面

考慮網(wǎng)絡(luò)檢索的需要及成本制約,本研究的界面設(shè)計采用Java程序設(shè)計語言編譯開發(fā),對應(yīng)的選擇apache tomcat作為服務(wù)器。Java技術(shù)具有卓越的通用性、高效性、平臺移植性和安全性[8]。Apache是世界使用排名第一的Web服務(wù)器。它可以運(yùn)行在幾乎所有廣泛使用的計算機(jī)平臺上。Tomcat是一個Servlet容器,按照Sun Microsystems提供的技術(shù)規(guī)范,實現(xiàn)了對Servlet和Java Server Page(JSP)的支持[9]。通過這一組合開發(fā)的界面適用平臺廣,穩(wěn)定性強(qiáng),便于維護(hù)且成本較低。

6 數(shù)據(jù)庫更新及系統(tǒng)維護(hù)

本信息庫未建立交互式的更新系統(tǒng),因此數(shù)據(jù)的更改、增加、刪減需專業(yè)人員在數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行操作。這樣的設(shè)計雖然導(dǎo)致互動性降低,但提高了維護(hù)效率,也更加科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)。

中醫(yī)是中國傳統(tǒng)文化的瑰寶,我們應(yīng)當(dāng)好好珍惜它,傳承它,發(fā)揚(yáng)它。花開花落,歲月更替,時代在前進(jìn),社會在變化。任何事物都不是一成不變的,都要與時俱進(jìn)。中醫(yī)及其文化也是如此。因此古文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫的建立顯得尤為重要。本文從古典文獻(xiàn)相關(guān)內(nèi)容提取、判斷文獻(xiàn)與胃癌相關(guān)性、完成文獻(xiàn)的分類標(biāo)引、建立相關(guān)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫、建立交互式檢索界面、數(shù)據(jù)庫更新及系統(tǒng)維護(hù)6個方面對古文獻(xiàn)庫的建立進(jìn)行系統(tǒng)闡述,使我們的中醫(yī)藥知識的共享、重用和傳承得以呈現(xiàn)。

[1] 張五輩.中醫(yī)藥知識庫設(shè)計與實現(xiàn)[D].沈陽:沈陽航空航天大學(xué),2011.

[2] 王冰.黃帝內(nèi)經(jīng)素問[M].沈陽:遼寧科學(xué)技術(shù)出版社,1997.

[3] 煙建華.難經(jīng)講義[M].北京:中國科學(xué)文化出版社,2002:53.

[4] 范永升.金匱要略[M].北京:中國中醫(yī)藥出版社,2003:55.

[5] 文魁,丁國華.脾胃論[M].北京:人民衛(wèi)生出版社,2005.

[6] 孫星衍,孫馮翼輯.神農(nóng)本草經(jīng)[M].北京:人民衛(wèi)生出版社,1982.

[7] 李現(xiàn)艷,趙書俊,初元萍.基于MySQL的數(shù)據(jù)庫服務(wù)器性能測試[J].核電子學(xué)與探測技術(shù),2011,31(1):48-52.

[8] 張嵐.基于JAVA WEB技術(shù)旅游服務(wù)網(wǎng)站系統(tǒng)設(shè)計與實現(xiàn)[D].成都:電子科技大學(xué),2012.

[9] 孫仁鵬.Tomcat與Apache集成的研究[J].電腦編程技巧與維護(hù),2011(14):6-8.

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