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肉雞源彎曲菌的分離、多重PCR鑒定及其耐藥性分析

2014-04-09 03:18朱冬梅劉書亮賴海梅韓新鋒
中國人獸共患病學報 2014年4期
關鍵詞:空腸肉雞屠宰

朱冬梅,劉書亮,2,彭 珍,賴海梅,韓新鋒,2

彎曲菌,尤其是空腸彎曲菌(Campylobacterjejuni)和結腸彎曲菌(Campylobactercoli)是引起人類急性細菌性胃腸炎最常見的原因之一[1],主要導致人急性胃腸炎,并可能進一步引發(fā)格林-巴利綜合征(Guillain-Barré)、急性神經(jīng)肌肉癱瘓及反應性關節(jié)炎等疾病。其廣泛分布在各種溫血動物體內(nèi),其中以家禽、家畜和野禽的帶菌量最多,人主要通過食用被其污染的食物及其制品和水源患病,其感染率已經(jīng)超過了沙門氏菌、志賀氏菌和大腸桿菌O157∶H7[2],對公共衛(wèi)生安全構成嚴重威脅。由于彎曲菌的培養(yǎng)條件苛刻、生化鑒定方法操作繁瑣、耗時長,因此建立彎曲菌準確、快速的檢測方法尤為重要。近年來,PCR方法因其快速、靈敏度高、特異性強等優(yōu)點廣泛應用于細菌鑒定中,尤其是多重PCR技術在食源性致病菌的檢驗和鑒定上已得到較好應用[3]。

隨著抗菌藥在食品動物養(yǎng)殖過程中的大量使用,彎曲菌的耐藥性逐漸增強[4],且其耐藥性可通過食物鏈傳播到人群[5-6],對彎曲菌感染的治療難度加大。目前,國內(nèi)外主要針對空腸彎曲菌的耐藥性做了較多研究,很少同時針對空腸、結腸彎曲菌及其他彎曲菌的耐藥性進行分析,尤其在肉雞屠宰過程中,彎曲菌的污染和耐藥性方面尚少見報道。

因此,本研究旨在分析肉雞屠宰加工過程中彎曲菌的污染及其耐藥性情況,為彎曲菌的分離鑒定提供方法參考,同時,為肉雞屠宰加工企業(yè)和相關機構防制彎曲菌污染及其耐藥性安全評價提供基礎數(shù)據(jù)。

1 材料與方法

1.1材料

1.1.1樣品 在四川某肉雞屠宰加工廠,用無菌剪刀剪取雞盲腸2~4 cm,置于保鮮袋中;用無菌棉簽擦拭凈膛后肉雞胴體表面、分割后雞肉表面,并置于5 mL増菌液中;所有樣品置于低溫冰盒中4 h內(nèi)運回實驗室。該屠宰場的肉雞均為該企業(yè)自育的優(yōu)質(zhì)白羽肉雞,采用網(wǎng)上養(yǎng)殖的方式,飼養(yǎng)日齡35-42 d出欄后,送屠宰場統(tǒng)一屠宰。

1.1.2菌株 空腸彎曲菌(Campylobcrterjejuni)ATCC33560、結腸彎曲菌(Campylobcrtercoli)ATCC33559、大腸桿菌(Escherichiacoli)ATCC25922、金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)ATCC29213由課題組提供。

1.1.3培養(yǎng)基 改良Skirrow氏瓊脂基礎、CCDA瓊脂基礎、Bolton肉湯、布氏肉湯、哥倫比亞血瓊脂基礎、M-H培養(yǎng)基、營養(yǎng)瓊脂購自青島海博生物技術有限公司;標準新生級牛血清、脫纖維羊血購自成都微克生物技術有限公司。

1.1.4主要試劑 過氧化氫、四甲基對苯二胺鹽酸鹽為國產(chǎn)分析純試劑;Bio West瓊脂糖購自成都微克生物技術有限公司;DL 2000 DNA Marker、2× long Taq PCR MasterMix、GoldviewTM核酸染料均購自北京天根生化有限公司;其余試劑均為分析純或生化試劑。

1.1.5抗生素 氨基糖苷類:慶大霉素(gentamicin, GEN)、鏈霉素(streptomycin, STR);四環(huán)素類:四環(huán)素(tetracycline, TET);氯霉素類:氟苯尼考(florfenicol, FLO);喹諾酮類:環(huán)丙沙星(ciprofloxacin, CIP);左氧氟沙星(levofloxacin,LEV);大環(huán)內(nèi)酯類:紅霉素(erythromycin,EM);林可胺類:克林霉素(clindamycin,CLI)。以上藥物均為原粉,由課題組提供。頭孢哌酮、萬古霉素、三甲氧芐氨嘧啶乳酸鹽、多粘菌素B均購自成都奧克生物技術有限公司。

1.1.6主要儀器 BSC-1300ⅡA2型生物安全柜(蘇州安泰空氣技術有限公司);DHP-9162恒溫培養(yǎng)箱(上海一恒科技有限公司);3111二氧化碳培養(yǎng)箱(Thermo公司);SORVALL離心機(美國科俊儀器有限公司);Milli-Q超純水系統(tǒng)(Millipore公司);C1000 Thermal Cycler PCR儀(Bio-RAD);PowerPac Basic電泳儀(Bio-RAD);水平電泳槽(Bio-RAD);凝膠成像系統(tǒng)(Bio-RAD)等。

1.2方法

1.2.1菌株的分離 用棉簽蘸取少許糞樣,劃線于Skirrow血平板上,42 ℃微需氧條件(5% O2、10% CO2、85% N2)下培養(yǎng)48 h;取0.5 mL樣品増菌液加入含5%脫纖維綿羊血的9.5 mL新鮮増菌液中,42℃微需氧増菌48 h后,劃線Skirrow血平板;挑取符合彎曲菌典型形態(tài)的菌落劃線于CCDA平板上,培養(yǎng)48 h后,在平板上挑取灰色、扁平、像水珠的菌落劃線于哥倫比亞血平板上進行純化培養(yǎng)。

1.2.2菌株的生化初步鑒定 對分離菌株進行革蘭氏鏡檢,并按照GB/T 4789.9-2008方法對分離菌株進行氧化酶實驗和過氧化氫酶實驗。

1.2.3菌株的三重PCR鑒定

1.2.3.1PCR引物設計 參考Denis M等[7]的報道,針對彎曲菌屬16SrRNA基因的引物(16S-F和16S-R)和結腸彎曲桿菌CeuE基因的引物(CeuE-F和CeuE-R)合成2對引物;根據(jù)GenBank公布的空腸彎曲桿菌HipO基因序列,設計一對引物(HipO-F和HipO-R),由(大連)寶生物公司合成。

表1 靶基因名稱、引物序列及擴增產(chǎn)物大小

1.2.3.2PCR模板的制備 將純化培養(yǎng)后的菌種接種于布氏肉湯中,42 ℃微需氧培養(yǎng)48 h,離心收集菌體,采用ISABEL M[8]等的方法提取細菌的DNA。

1.2.3.3PCR擴增 根據(jù)預試驗結果,設置三對引物濃度比例為16SrRNA:HipO:CeuE=4∶2∶1,PCR反應體系為25 μL,其中包括2× long Taq PCR MasterMix 12.5 μL ,模板1 μL,16SrRNA、HipO、CeuE基因上下游引物的終濃度分別為0.8 μmol/L、0.4 μmol/L 、0.2 μmol/L,補雙蒸水至終體積25 μL。PCR循環(huán)參數(shù):95 ℃,預變性10 min;95 ℃,30 s,50 ℃,30 s,72 ℃,60 s,35個循環(huán);72 ℃,延伸10 min。PCR產(chǎn)物于1.5%的瓊脂糖(0.5×TBE)凝膠電泳后,觀察并成像。

1.2.3.4三重PCR特異性實驗 取空腸彎曲菌ATCC33560、結腸彎曲菌ATCC33559、大腸桿菌ATCC25922的DNA,同時設計不加模版、只加單側(cè)引物兩組對照,進行三重PCR引物特異性試驗。

1.2.3.5擴增產(chǎn)物測序鑒定 對空腸彎曲菌標準菌株ATCC33560及隨機選取的空腸彎曲菌陽性菌株12-JF97的16S rRNA、HipO基因以及結腸彎曲菌標準菌株ATCC33559及隨機選取的空腸彎曲菌陽性菌株13-JF74的CeuE擴增片段進行膠回收后由invitrogen公司克隆測序,并進行序列分析。

1.2.3.6彎曲菌分離率的統(tǒng)計 經(jīng)鑒定為彎曲菌陽性的菌株,采用終濃度20%的甘油,-80℃凍藏。經(jīng)上述分離鑒定出彎曲菌的樣品為陽性樣品,從每一份陽性樣品中獲得并保存一株彎曲菌菌株。分離率計算如下:分離率=(彎曲菌分離陽性樣品數(shù)/樣品總數(shù))×100%。

1.2.4藥敏試驗 采用美國臨床和實驗室標準化研究所(CLSI)推薦的瓊脂稀釋法,對彎曲菌分離株進行8種臨床常用抗生素的MIC值測定,以空腸彎曲菌ATCC33560為質(zhì)控菌株,按照CLSI標準[9]和文獻[10-11]進行操作和結果判斷。

表2 彎曲菌的藥敏試驗判定標準

2 結 果

2.1分離純化 在哥倫比亞血培養(yǎng)基上挑取不溶血、扁平、灰色、半透明、有時沿接種線向外擴散生長的菌落,在CCDA培養(yǎng)基上為有光澤、灰白、濕潤的菌落。經(jīng)涂片作革蘭氏染色鏡檢為G—菌,如小逗點狀,兩菌體的末端相連時,呈S形、海鷗形或螺旋狀。

2.2生化初步鑒定 具備以下特征:鏡檢符合彎曲菌形態(tài)、氧化酶試驗陽性、過氧化氫酶試驗陽性、可在血平板上生長而營養(yǎng)瓊脂平板不生長,可初步鑒定為彎曲菌。據(jù)此從651份樣品中,分離純化得到333株彎曲菌疑似菌株。

2.3PCR引物特異性實驗結果 對所設計的三對引物進行特異性驗證,結果如圖1所示,空腸彎曲菌ATCC33560在857 bp和600 bp處,分別獲得預期的兩條條帶,結腸彎曲菌ATCC33559在857 bp和462 bp處,分別獲得預期的兩條條帶,當空腸彎曲菌和結腸彎曲菌DNA混合時,能獲得預期的三條條帶,其余對照均未擴增出片段,說明所設計的兩對引物特異性可靠。

圖1彎曲菌多重PCR特異性驗證電泳圖

Fig.1ElectrophoresisofspecificitytestofmultiplexPCR

M: DL2000 DNA marker; 1:E.coliATCC25922; 2: No template; 3: No primer; 4:Campylobactercoli; 5:Campylobacterjejuni; 6:CampylobactercoliandCampylobacterjejuni.

2.4擴增產(chǎn)物基因序列分析 以空腸彎曲菌ATCC33560、結腸彎曲菌ATCC33559的DNA為模板,擴增的16SrRNA、HipO、CeuE基因PCR產(chǎn)物純化后克隆測序分別得到長約為857 bp、600 bp和462 bp的片段,與設計大小相符,測得序列已在NCBI注冊,登錄號分別為KF541294、KF541296和KF541298;采用BLAST和DNASTAR MegAlign進行基因比對分析,ATCC33560的16SrRNA(KF541294)與彎曲菌登錄號JX912519.1、GQ167678.1、 KC197219.1等的16SrRNA基因序列有97.9%~98.2%的同源性; ATCC33560的HipO(KF541296)基因與空腸彎曲菌登錄號FJ655194.1、FJ654193.1、AY168302.1等的馬尿酸鈉酶相應基因序列有99.0%~99.5%的同源性;ATCC33559的CeuE(KF541298)基因與結腸彎曲菌登錄號FJ946065.1、X88849.1的基因序列均有98.7%~99.3%的同源性,進一步表明該方法正確和特異。

2.5三重PCR鑒定方法應用 采用建立的三重PCR方法,對分離的疑似彎曲菌進行PCR鑒定(圖2),并隨機挑取菌株號為12-JF97的的16SrRNA和HipO基因以及13-JF74的CeuE基因產(chǎn)物進行序列分析,結果表明,12-JF97的16SrRNA(KF541293)基因序列與本實驗ATCC33560的16SrRNA同源性為99.6%,12-JF97的HipO(KF541295)基因序列與本實驗ATCC33560的HipO同源性為100%,13-JF74的CeuE(KF541297)基因序列與本實驗ATCC33559的CeuE同源性為100%,表明被鑒定的陽性菌株結果正確。利用該方法,從333株疑似彎曲菌中,鑒定出空腸彎曲菌160株、結腸彎曲菌130株,其他彎曲菌11株,彎曲菌總分離率為46.24%,其中空腸彎曲菌和結腸彎曲菌的分離率分別為24.58%(160/651)、19.97%(130/651);屠宰前、屠宰過程中及屠宰后彎曲菌的分離率分別為56.10%、31.00%、17.00%,其中空腸彎曲菌在三個環(huán)節(jié)中的分離率分別為34.59%、4.00%、0,結腸彎曲菌在屠宰前、中、后3個環(huán)節(jié)中的分離率分別為19.29%、26.00%、17.00%。

圖2部分疑似彎曲菌三重PCR產(chǎn)物的電泳圖

Fig.2ElectrophoresisoftriplexPCRamplifiedproductsfrompartisolatedCampylobacter

M: DL2000 DNA marker; 1-47: Part of samples

2.6彎曲菌分離菌株的耐藥情況 根據(jù)CLSI(2010)標準,本研究中301株彎曲菌對8種抗生素的耐藥率統(tǒng)計見圖3。彎曲菌分離株對CIP的耐藥率最高(93.02%),對TET、LEV以及CLI的耐藥率較高,分別為87.71%、87.71%、80.07%,對GEN(67.11%)、EM(49.50%)、STR(31.89%)的耐藥率居中,對FLO(13.29%)的耐藥率較低。本研究還發(fā)現(xiàn), 空腸彎曲菌和結腸彎曲菌對同一抗生素的耐藥性有所不同,但均對CIP的耐藥率最高,分別為88.13%、100.00%,對FLO的耐藥率均較低,分別為16.25%、8.46%;實驗結果表明,空腸彎曲菌對EM的耐藥性較低,僅為14.38%,結腸彎曲菌對其耐藥性較高,為93.85%,與相關文獻[12]報道相符;總體說來,結腸彎曲菌的耐藥率高于空腸彎曲菌。

圖3肉雞源彎曲菌對不同抗生素的耐藥率

Fig.3DrugresistancerateofchickensourceCampylobacterspp.againstdifferentantimicrobialagents

2.7彎曲菌的多重耐藥性及耐藥譜 肉雞屠宰過程中分離的301株彎曲菌對8種抗生素產(chǎn)生了52種耐藥譜,耐藥譜CIP LEV GEN TET CLI EM優(yōu)勢明顯,占所有菌株的33.89%(102/301);CIP LEV GEN STR TET CLI EM 和CIP LEV TET CLI均為占8.31%(25/301);CIP LEV TET I占6.98%(21/301)。屠宰前,雞盲腸中分離的彎曲菌共產(chǎn)生了52種耐藥譜、屠宰環(huán)節(jié)及屠宰后成品雞肉中彎曲菌的耐藥譜分別為8種、2種,從屠宰上游環(huán)節(jié)到下游環(huán)節(jié),彎曲菌耐藥譜有明顯縮小的趨勢,且其優(yōu)勢耐藥譜均為CIP LEV GEN TET CLI EM,分別占分離株的26.88%(68/253)、64.52%(20/31)、82.35%(14/17)。

本研究結果顯示,彎曲菌分離株對8種抗生素產(chǎn)生不同程度的耐藥性,多重耐藥(耐受三種及其以上抗生素)率為93.69%(282/301),耐6種藥物的菌株最多,為42.19%(127/301),耐3種、4種、7種藥物的菌株較多,分別為12.96%(39/301)、15.28%(46/301)、11.63%(35/301)(圖4),5重耐藥菌株占所有菌株的9.63%(29/301),有6株(1.99%)對8種抗生素具有耐藥性。其中空腸彎曲菌和結腸彎曲菌多重耐藥率分別為91.25%(146/160)、99.23%(129/130),其余彎曲菌的多重耐藥率為63.64%(7/11);其中,空腸彎曲菌主要集中在3、4、5、6重耐藥,為12.64%、13.95%、7.97%、9.30%,結腸彎曲菌主要集中在6重和7重耐藥,為32.23%、7.97%。

圖4肉雞源彎曲菌的多重耐藥分布情況

Fig.4Multi-antimicrobialresistancedistributionofchickensourceCampylobacterspp.

3 討 論

3.1彎曲菌為微需氧菌,對營養(yǎng)和培養(yǎng)條件要求比較苛刻,且很容易進入VBNC(Viable but Nonculturable) 狀態(tài),無法繼續(xù)用常規(guī)培養(yǎng)方法檢測,但這些細胞仍然是“活”的,通過環(huán)境或食物鏈進入動物或人體[13],對食品安全構成嚴重威脅。因此,在空腸彎曲菌和結腸彎曲菌的分離過程中,應當注意樣品的保存和運輸,保證其生長所需要的微需氧環(huán)境;且可以通過在選擇性培養(yǎng)基中添加抗生素(如萬古霉素、乳酸甲氧芐啶、多粘菌素B等),以提高其分離率。

3.2彎曲菌培養(yǎng)周期長、生化鑒定較為繁瑣,且檢測結果常常不典型,特別是空腸彎曲菌和結腸彎曲菌較難通過常規(guī)生化鑒定方法區(qū)別,其差別僅在于是否分解馬脲酸。由于PCR技術特異性強、靈敏度高、操作簡單等優(yōu)點,常用于細菌的鑒定中。HipO(馬脲酸酶基因)基因為空腸彎曲菌(包括空腸亞種和德萊亞種)所特有,陳荀[14]等應用16S rRNA和HipO基因從183份樣品中鑒定了21株空腸彎曲桿菌;Huo-Shu H等[15]針對空腸彎曲菌和結腸彎曲菌ceuE基因,設計兩對引物,建立了檢測了空腸、結腸彎曲菌的二重PCR方法,可以擴增兩條大小不一的特異性片段,能有效的區(qū)分空腸彎曲菌和結腸彎曲菌。因此,本文針對彎曲菌屬的16S rRNA、空腸彎曲菌的HipO和結腸彎曲菌的CeuE基因設計引物,通過三重PCR的方法對空腸彎曲菌和結腸彎曲菌的鑒定,特異性強,操作較為簡單,檢測時間短,能特異性的鑒定空腸彎曲菌和結腸彎曲菌,進一步表明多重PCR方法可以用于常規(guī)實驗室和臨床彎曲菌的檢測中。

3.3本實驗應用GB/T4789.9-2008中的增菌培養(yǎng)、選擇性平板分離、彎曲菌屬初步鑒定及建立的空腸彎曲菌和結腸彎曲菌的三重PCR鑒定的檢測方法,從333株彎曲菌疑似菌株中,準確鑒定出301株彎曲菌,其中,空腸彎曲菌160株、結腸彎曲菌130株,其他彎曲菌11株,彎曲菌總分離率為46.24%,空腸彎曲菌和結腸彎曲菌的占彎曲菌分離株的96.35%,與Debretsion A(77.0%)[16]、Kiseon Han(37.7%)[17]、Kovalenko K(92.5%)[18]等的報道有差異,可能是不同地區(qū)彎曲菌的污染情況不一;娜仁高娃[19]等建立了一套同時檢測空腸和結腸彎曲菌的三重PCR方法,并利用該方法,分析了雞糞中彎曲菌的污染情況,其發(fā)現(xiàn)雞糞中空腸彎曲菌和結腸彎曲菌的污染率為33.7%,低于本實驗結果,說明該地區(qū)雞糞中彎曲桿菌的污染情況較為嚴重,同時說明本實驗建立的方法能夠有效的提高雞糞中彎曲菌的分離率。

3.4本實驗中空腸、結腸彎曲菌占彎曲菌陽性菌株的96.35%,與文獻報道一致[20]。結腸彎曲菌占彎曲菌陽性菌株的43.19%,高于瞿偉華[21](24.21%)、楊毓環(huán)[22](27.67%)、娜仁高娃(20.31%)等的報道,但與Zhao CW(41.30%)等人的結果相似,說明肉雞屠宰中,彎曲菌污染主要集中在空腸彎曲菌和結腸彎曲菌,應引起重視。實驗結果表明,在肉雞屠宰過程中,屠宰前、屠宰過程中及屠宰后彎曲菌的分離率分別為56.10%、31.00%、17.00%,說明從屠宰上游環(huán)節(jié)到下游環(huán)節(jié),彎曲菌的污染可能存在傳播趨勢,尚需進一步采用PFGE進行溯源分析。

3.5藥敏試驗結果表明彎曲菌的耐藥情況較嚴重,與國內(nèi)外有關彎曲菌耐藥情況的報道較為相近[23-26]。本實驗結腸彎曲菌分離株對四環(huán)素的耐藥率為99.23%,與Qin SS[23]等的實驗結果(95%)較為一致,但明顯高于許紫建[24]的研究(50.79%);本實驗彎曲菌分離株對紅霉素的耐藥率(49.50%),與Luangtongkum T[25](80%)的報道差異較大,但與Sato k[26]的結果(45%)較為一致,可能是菌株來源地區(qū)和來源樣品不同,以及國內(nèi)外對抗菌藥在食品動物中的使用標準不一,導致彎曲菌的耐藥性有所差異。

盡管彎曲菌的流行已引起各國關注,但是由于其爆發(fā)少、致死率低、且其培養(yǎng)條件苛刻,很多國家尚未建立起對彎曲菌的監(jiān)測系統(tǒng),因此本研究建立了實用的檢測方法,為相關部門分析彎曲菌的流行提供了參考,并為動物性食品源彎曲菌污染的防制提供了基礎數(shù)據(jù)。

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