国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

蛋白質(zhì)組學(xué)在急性胰腺炎中研究進展

2014-04-01 07:43:03龔騰綜述夏先明蘇松審校
海南醫(yī)學(xué) 2014年5期
關(guān)鍵詞:組學(xué)質(zhì)譜胰腺炎

龔騰綜述,夏先明,蘇松審校

(瀘州醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院肝膽外科,四川瀘州 646000)

蛋白質(zhì)組學(xué)在急性胰腺炎中研究進展

龔騰綜述,夏先明,蘇松審校

(瀘州醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院肝膽外科,四川瀘州 646000)

隨著人類基因組計劃取得的巨大成功,生命科學(xué)的研究已實質(zhì)性地進入后基因組時代,即對基因功能的研究。蛋白質(zhì)組學(xué)作為基因功能研究的重要工具,已經(jīng)廣泛用于生命科學(xué)研究的各個領(lǐng)域,其發(fā)展迅猛,是因蛋白質(zhì)組學(xué)能夠較為全面的考察蛋白層面的表達情況,有利于獲得各種蛋白、多肽、因子等信息,從而對疾病的發(fā)病機制、診斷和治療進行更深入的研究。急性胰腺炎是臨床常見的急腹癥,發(fā)病急驟,病情危重而復(fù)雜,鑒于蛋白質(zhì)組學(xué)的巨大應(yīng)用前景,本文綜述蛋白質(zhì)組學(xué)在急性胰腺炎中的研究進展。

蛋白質(zhì)組學(xué);急性胰腺炎;差異;

急性胰腺炎是臨床常見的急腹癥,發(fā)病急驟,病情危重而復(fù)雜。急性胰腺炎分為輕型和重型,重癥急性胰腺炎的確切機制至今尚不清楚,病情危重,其病死率高達30%~40%[1]。因此,探明急性胰腺炎發(fā)病機制、確定診斷標(biāo)準(zhǔn)以及早期嚴(yán)重程度判定標(biāo)準(zhǔn)仍是當(dāng)務(wù)之急。蛋白質(zhì)組學(xué)的研究特點和內(nèi)容給我們提供了一個全新的思路。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在研究蛋白的復(fù)雜性方面扮演著重要角色[2],它是以細胞或組織不同時間、環(huán)境的所有蛋白質(zhì)為研究對象,從總體上研究其蛋白的種類,相互作用以及功能結(jié)構(gòu)的方法[3]。它作為一種強大的工具,它不僅可以證實靶點多肽或蛋白質(zhì)存在與否,而且可以對上調(diào)或下調(diào)的蛋白質(zhì)表達進行定量分析,因而我們能通過蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)探討急性胰腺炎的發(fā)病機制,評估早期嚴(yán)重程度,并為其轉(zhuǎn)歸和預(yù)后找到特異性的標(biāo)志物。

1 蛋白質(zhì)組學(xué)

蛋白質(zhì)組學(xué)是通過對蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能的研究,了解蛋白質(zhì)的表達量、結(jié)構(gòu)及其代謝調(diào)節(jié),并在蛋白水平上對血清、細胞和組織形成全面而深入的認識,了解疾病的發(fā)病機制、轉(zhuǎn)歸及預(yù)后,同時也相應(yīng)的帶動了新藥開發(fā)和醫(yī)學(xué)技術(shù)的發(fā)展。蛋白質(zhì)組研究大致可以分為二類:一類是針對細胞或組織所表達全部蛋白質(zhì);另一類則是以一個完整的生物學(xué)機制或與機制相關(guān)的全部蛋白質(zhì)為著重點。

2 蛋白質(zhì)組學(xué)的研究內(nèi)容及其相關(guān)技術(shù)

2.1 蛋白質(zhì)組學(xué)的研究內(nèi)容蛋白質(zhì)組學(xué)的研究內(nèi)容大致包括以下四個方面:(1)蛋白質(zhì)組成和成分的鑒定、蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫構(gòu)建、新蛋白質(zhì)的發(fā)現(xiàn)、同源性蛋白質(zhì)之間的比較、蛋白質(zhì)的加工和修飾分析等;(2)蛋白質(zhì)家族功能的異同點、蛋白質(zhì)的生與死、蛋白質(zhì)代謝產(chǎn)物變化等;(3)重要代謝途徑的分子機制;(4)尋找靶分子、及腫瘤特異標(biāo)記物及新藥靶點等。

2.2 蛋白質(zhì)組學(xué)的研究流程蛋白質(zhì)組學(xué)研究的基本路線是制備組織、細胞等蛋白樣品,然后大規(guī)模分離、分析和鑒定。蛋白質(zhì)組學(xué)的研究流程大致包括以下四個方面:(1)確定你將研究的對象,即有明確可信的模型,如研究某一物種、個體、器官、組織、細胞、亞細胞乃至蛋白質(zhì)復(fù)合體。(2)選取你所需的分離技術(shù),如1-D、2-D、MS、LC、HPLC等。(3)鑒定蛋白質(zhì):分離后蛋白質(zhì)須進行鑒定,主要的鑒定技術(shù)有質(zhì)譜技術(shù)、EDman降解法、Western blot及氨基酸組成分析等。以質(zhì)譜技術(shù)由于其靈敏度高、快速準(zhǔn)確、易實現(xiàn)自動化,已成為蛋白質(zhì)組研究中的主要蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)。

2.3 蛋白質(zhì)組學(xué)研究的常用技術(shù)目前蛋白質(zhì)組學(xué)研究最常用的技術(shù)是二維凝膠電泳和質(zhì)譜分析[4-6]以及蛋白芯片技術(shù)。二維凝膠電泳是目前蛋白質(zhì)組學(xué)研究的核心技術(shù)之一,也是使用范圍最廣泛的蛋白質(zhì)分離技術(shù),是目前技術(shù)條件下常用的唯一能夠連續(xù)在一塊膠上分離數(shù)千種蛋白質(zhì)的方法,但二維凝膠電泳技術(shù)復(fù)雜,工作流程多,對分子量很大或者很小的蛋白質(zhì)分離不好。質(zhì)譜技術(shù)可以精確測量生物的大分子,也可應(yīng)對小分子生物活性物進行定性或定量的分析,并具有準(zhǔn)確、易操作、快速及普適性。蛋白芯片技術(shù)能同時從微量的樣品中檢測成千上萬個蛋白質(zhì)或多肽,并且還具有快速、易行、高效等優(yōu)點。

3 急性胰腺炎的發(fā)病機制

急性胰腺炎的發(fā)病機制比較復(fù)雜,發(fā)生發(fā)展受多個因素的影響[7-8],至今仍未被闡述清楚。關(guān)于急性胰腺炎的發(fā)病機理學(xué)者們提出了眾多學(xué)說,比較有影響的有“胰酶自身消化學(xué)說”、“炎癥因子學(xué)說”、“氧化應(yīng)激學(xué)說”、“細胞凋亡學(xué)說”、“胰腺腺泡內(nèi)鈣超載學(xué)說”、“腸道細菌移位學(xué)說”、“胰腺微循環(huán)障礙學(xué)說”等。綜合以上各種學(xué)說,即在急性胰腺炎的發(fā)病早期,各種胰酶通過不同途徑相繼激活,各種炎癥介質(zhì)、細胞因子以及大量的氧自由基的產(chǎn)生,繼而引發(fā)全身炎癥反應(yīng);內(nèi)毒素釋放入血,在通過細胞因子的誘導(dǎo)及產(chǎn)生DIC;腸道屏障因各種因素被損壞,腸道細菌移位,從而引起嚴(yán)重感染,最終引發(fā)多器官功能衰竭。

4 急性胰腺炎的蛋白組學(xué)研究進展

自蛋白質(zhì)組[9]概念提出以來,對其的研究發(fā)展極其迅猛,不論是基礎(chǔ)理論還是技術(shù)方法,都在不斷進步和完善,并且應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)科學(xué)等方面。對于急性胰腺炎而言,近年來已逐漸出現(xiàn)其與蛋白組學(xué)相關(guān)研究的報道:在臨床方面,Papachristou等[10]比較了21例輕癥急性胰腺炎(MAP)與7例重癥急性胰腺炎(SAP)血清蛋白質(zhì)組學(xué)的特點。結(jié)果發(fā)現(xiàn)兩組AP之間有18個明顯差異的蛋白點,并且SAP患者血清分子質(zhì)量43 000和117 000的兩個蛋白質(zhì)明顯不同于MAP,通過比較證實其中分子質(zhì)量為117 000的蛋白點對SAP和MAP的敏感性具有鑒別意義,敏感度為100%,特異度為81%。Flint等[11]則研究了SAP患者尿液中蛋白質(zhì)組學(xué)的特點,結(jié)果發(fā)現(xiàn)SAP患者尿液中有17個蛋白峰,與MAP對照組具有明顯的差別,質(zhì)譜分析證實其有21種差異的蛋白質(zhì)成分。我國任俊等[12]通過比較SAP患者在治療前后蛋白質(zhì)組表達差異,發(fā)現(xiàn)SAP治療前后一共檢測到血清中的132個點,其中質(zhì)荷比2 000到40 000間共有27個差異點,并且相對分子質(zhì)量為47 000的蛋白質(zhì)在SAP病情緩解后表達明顯下調(diào),而相對分子質(zhì)量為115 000以及159 000的蛋白質(zhì)在SAP患者治療后上調(diào)。在動物模型方面,國內(nèi)Zhang等[13]研究了伴有高脂血癥的SAP的胰腺組織蛋白質(zhì)組學(xué)特點,發(fā)現(xiàn)高脂血癥SAP與正常血脂AP組有59個差異點,并且有39個差異點經(jīng)質(zhì)譜分析成功鑒定,23個蛋白質(zhì)在高脂血癥SAP組表達上調(diào),16個點表達下調(diào)。而高脂血癥MAP與正常血脂MAP組分析到12個差異點,7個差異點經(jīng)質(zhì)譜分析成功鑒定,5個差異點在高脂血癥MAP表達下調(diào),2個點在高脂血癥MAP中上調(diào)。國內(nèi)龍有明等[14]觀察用牛黃膽酸鈉誘導(dǎo)的SAP大鼠胰腺組織在各個不同時間點蛋白質(zhì)組學(xué)的變化,實驗發(fā)現(xiàn)SAP組與假手術(shù)組在24 h時共有46個表達差異的蛋白質(zhì)峰,其中有37個差異點下調(diào),9個差異點上調(diào)。SAP組與假手術(shù)在48 h時共有97個差異的蛋白質(zhì)峰,54個差異點下調(diào),43個差異點上調(diào);在72 h時SAP組與假手術(shù)組有80個差異的蛋白質(zhì)峰,其中70個點下調(diào)以及10個點上調(diào)。Yang等[15]研究了清胰顆粒對牛黃膽酸鈉誘導(dǎo)大鼠重癥急性胰腺炎胰腺組織中總蛋白表達變化的影響,經(jīng)凝膠圖像處理軟件分析胰腺組織蛋白質(zhì)組學(xué)變化,48 h時兩組有22個差異點,用藥后5個點蛋白上調(diào),17個點下調(diào)。48 h時間點比較兩組表達差異超過4倍且穩(wěn)定的蛋白質(zhì)斑點共有9個,并通過質(zhì)譜分析和數(shù)據(jù)庫檢索鑒定出這九種蛋白質(zhì)。而Mittal等[16]則研究了大鼠的SAP模型腸系膜淋巴結(jié)蛋白組學(xué)特點,結(jié)果發(fā)現(xiàn)模型組有245個差異點,包括了35個差異點下調(diào),210個差異點上調(diào),并證實有7種蛋白質(zhì)是胰腺代謝的酶類。García等[17]研究急性胰腺炎早期胰腺細胞溶酶體蛋白質(zhì)組學(xué)的變化,為急性胰腺炎早期的病理生理研究提供了有價值的信息。總之,大量研究證實急性胰腺炎不同類型、不同時點蛋白表達存在差異,提示其對胰腺炎診斷及預(yù)后判定具有重要意義。

5 問題與展望

迄今為止急性胰腺炎的發(fā)病機制未能完全闡明,目前可行的實驗室檢查仍缺乏診斷及評估其嚴(yán)重程度的金標(biāo)準(zhǔn),因此揭示急性胰腺炎內(nèi)在發(fā)病機制,找到診斷和判定其嚴(yán)重程度及預(yù)后的特異性標(biāo)志物迫在眉睫。隨著二維凝膠電泳、質(zhì)譜分析及蛋白芯片等蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的發(fā)展,蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)逐步應(yīng)用于急性胰腺炎在血清、組織及胰液等的差異蛋白分析,為進一步在分子水平揭示該病發(fā)病機制,尋找診斷和判定其嚴(yán)重程度及預(yù)后的相關(guān)蛋白質(zhì)提供了可能。雖然蛋白質(zhì)組學(xué)方法在急性胰腺炎中的應(yīng)用依然處在初期階段,需要更深入的探索和研究,但已經(jīng)給我們提供了信息和思路。

[1]邵玉東.清胰湯對重癥急性胰腺炎治療價值的系統(tǒng)評價[J].中醫(yī)臨床研究,2012,(2):83.

[2]Gundry RL,Tchernyshyov I,Sheng S,et al.Expanding the mouse embryonic stem cell proteome:combining three proteomic approaches[J].Proteomics,2010,10(14):2728~2732.

[3]Simpson RJ,Dorow DS.Cancer proteomics:from signaling networks to tumor markers[J].Trends Biotechnol,2001,19(10 Suppl): S40~S48.

[4]Zabrouskov V,Ge Y,Schwartz J,et al.Unraveling molecular complexity of phosphorylated human cardiac troponin I by top down electron capture dissociation/electron transfer dissociation mass spectrometry[J].Mol Cell Proteomics,2008,7(10):1838~1849.

[5]Drews O,Zong C,Ping P.Exploring proteasome complexes by proteomic approaches[J].Proteomics,2007,7(7):1047-1058.

[6]Fero M,Pogliano K.Automated quantitative live cell fluorescence microscopy[J].Cold Spring Harb Perspect Biol,2010,2(8):a455.

[7]李震東,馬清涌,羅羽宏.Fas/FasL介導(dǎo)的caspase-3活化與急性胰腺炎腺泡細胞凋亡的關(guān)系[J].中國病理生理雜志,2009,25(6):1197-1201.

[8]唐詩彬,張肇達,吳路楊,等.急性壞死性胰腺炎大鼠白細胞L-選擇素表達和肌動蛋白分布的變化及中藥華西胰腺炎一號的影響[J].中國病理生理雜志,2009,25(7):1381-1385.

[9]Wasinger VC,Cordwell SJ,Cerpa-Poljak A,et al.Progress with gene-product mapping of the Mollicutes:Mycoplasma genitalium [J].Electrophoresis,1995,16(7):1090-1094.

[10]Papachristou GI,Malehorn DE,Lamb J,et al.Serum proteomic patterns as a predictor of severity in acute pancreatitis[J].Pancreatology,2007,7(4):317-324.

[11]Flint RS,Phillips AR,Farrant GJ,et al.Probing the urinary proteome of severe acute pancreatitis[J].HPB(Oxford),2007,9(6): 447-455.

[12]任俊,余開煥,馬鵬,等.重癥急性胰腺炎患者治療前后血清蛋白質(zhì)組學(xué)的變化[J].中華胰腺病雜志,2012,12(13):147-149.

[13]Zhang W,Zhao Y,Zeng Y,et al.Hyperlipidemic versus normal-lipid acute necrotic pancreatitis:proteomic analysis using an animal model[J].Pancreas,2012,41(2):317-322.

[14]龍友明,肖小玉,崔淑蘭,等.大鼠重癥急性胰腺炎胰腺蛋白組學(xué)的初步研究[J].廣東藥學(xué)院學(xué)報,2010,26(3):319-321.

[15]Yang YS,Chen K,Ye S,et al.Differentially expressed proteins of severe acute pancreatitis intervened by Qingyi granule[J].Zhongguo Zhong Xi Yi Jie He Za Zhi,2013,33(1):60-64.

[16]Mittal A,Phillips AR,Middleditch M,et al.The proteome of mesentericlymph during acute pancreatitis and implications for treatmen t [J].JOP,2009,10(2):130-142.

[17]García-Hernández V,Sánchez-Bernal C,Sarmiento N,et al.Proteomic analysis of the soluble and the lysosomal+mitochondrial fractions from rat pancreas:Implications for cerulein-induced acute pancreatitis[J].Biochimica et Biophysica Acta(BBA)-Proteins and Proteomics,2012,1824(9):1058-1067.

R657.5+1

A

1003—6350(2014)05—0709—03

10.3969/j.issn.1003-6350.2014.05.0274

2013-09-24)

夏先明。E-mail:xxm6206@126.com

猜你喜歡
組學(xué)質(zhì)譜胰腺炎
氣相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀在農(nóng)殘檢測中的應(yīng)用及維護
孕期大補當(dāng)心胰腺炎
口腔代謝組學(xué)研究
基于UHPLC-Q-TOF/MS的歸身和歸尾補血機制的代謝組學(xué)初步研究
吹掃捕集-氣相色譜質(zhì)譜聯(lián)用測定水中18種揮發(fā)性有機物
代謝組學(xué)在多囊卵巢綜合征中的應(yīng)用
棗霜化學(xué)成分的色譜質(zhì)譜分析
Modeled response of talik development under thermokarst lakes to permafrost thickness on the Qinghai-Tibet Plateau
急性胰腺炎致精神失常1例
蛋白質(zhì)組學(xué)在結(jié)核桿菌研究中的應(yīng)用
宁南县| 富阳市| 松溪县| 句容市| 高碑店市| 中阳县| 米林县| 建水县| 蒙城县| 琼海市| 昌江| 五大连池市| 青龙| 大港区| 定远县| 巴南区| 迁西县| 文水县| 青龙| 澄城县| 平果县| 安丘市| 湖口县| 洮南市| 宣化县| 尼勒克县| 澎湖县| 白玉县| 砀山县| 阿克| 望奎县| 仲巴县| 阜阳市| 蒲城县| 保靖县| 和政县| 九龙县| 青龙| 神池县| 黑山县| 军事|