據(jù)科技部發(fā)布的《2013年材料領(lǐng)域與工程領(lǐng)域國家重點實驗室評估報告》，水文水資源與水利工程科學(xué)國家重點實驗室(河海大學(xué)·南京水利科學(xué)研究院)被評為優(yōu)秀類國家重點實驗室。

2013年科技部委托國家自然科學(xué)基金委員會對材料領(lǐng)域與工程領(lǐng)域64個國家重點實驗室進行了評估。工程領(lǐng)域中有11個實驗室被評為優(yōu)秀類實驗室，28個實驗室被評為良好類實驗室。科技部將依據(jù)評估結(jié)果，對優(yōu)秀類國家重點實驗室加大支持力度，同時實行末位淘汰制。

水文水資源與水利工程科學(xué)國家重點實驗室在本評估期內(nèi)面向國家重大需求，瞄準(zhǔn)科學(xué)技術(shù)發(fā)展前沿，開展了大量創(chuàng)新性研究，取得了顯著的研究成果。該實驗室已成為我國在水文水資源、水利工程、水環(huán)境、水生態(tài)等領(lǐng)域開展創(chuàng)新性應(yīng)用基礎(chǔ)研究、解決重大工程關(guān)鍵技術(shù)問題、培養(yǎng)高層次人才以及進行高水平學(xué)術(shù)交流的重要基地。