于瀛龍,周姝婧,徐新建,朱翔杰,周冰峰
(福建農(nóng)林大學(xué)蜂學(xué)學(xué)院,福建福州350002)
遺傳多樣性是物種適應(yīng)環(huán)境變化的必備條件,是進(jìn)化的物質(zhì)基礎(chǔ),反映了物種的進(jìn)化潛力[1].遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)是種群遺傳學(xué)、進(jìn)化生物學(xué)和保育遺傳學(xué)等生命科學(xué)的重要內(nèi)容[1-3].在我國(guó)中華蜜蜂遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)的研究中,云南[4]、福建[5-6]、海南[7]、重慶[8]、廣東[9]、華東[10]、東北[11]等地區(qū)中華蜜蜂的研究已開(kāi)展[12-13].通過(guò)19群樣本的測(cè)定,在長(zhǎng)白山中華蜜蜂遺傳多樣性的研究中已發(fā)現(xiàn)了5種mtDNA單倍型種類[11,14-15];嘗試用2群中華蜜蜂樣本的csd基因和用12群中華蜜蜂樣本的RAPD標(biāo)記,對(duì)長(zhǎng)白山中華蜜蜂的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行探索[16-18].長(zhǎng)白山地區(qū)中華蜜蜂mtDNA標(biāo)記、微衛(wèi)星標(biāo)記的遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)的分析還需深入研究.
長(zhǎng)白山是東北中華蜜蜂的主要分布區(qū),是中華蜜蜂分布的東北部邊緣,具有獨(dú)特的生物學(xué)特性[19-20].長(zhǎng)白山中華蜜蜂在長(zhǎng)期的進(jìn)化過(guò)程中形成了群勢(shì)強(qiáng)、耐寒力高、分蜂性弱等適應(yīng)當(dāng)?shù)丨h(huán)境的特性[21],可在最低氣溫-40℃的環(huán)境自然越冬,越冬期長(zhǎng)達(dá)半年[11,20].長(zhǎng)白山中華蜜蜂在體色、體長(zhǎng)、前翅翅脈、肘脈指數(shù)等主要形態(tài)標(biāo)記表現(xiàn)出特殊性.相比于其他地區(qū)中華蜜蜂,長(zhǎng)白山中華蜜蜂個(gè)體較大,體色偏黑[21-22],肘脈指數(shù)較高,為 4.09-5.99[21,23-24],第三徑中橫脈出現(xiàn)突出的頻率較高,為 30%-80%[22,24].
本研究在長(zhǎng)白山的腹地,中華蜜蜂主產(chǎn)區(qū)采集110群樣本,采用5對(duì)微衛(wèi)星引物和mtDNA tRNAleu-COII 357 bp片段,分析該地區(qū)中華蜜蜂的遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu).本研究為長(zhǎng)白山地區(qū)中華蜜蜂資源保護(hù)和利用提供重要理論依據(jù).
中華蜜蜂樣本于2008年8月采自吉林省長(zhǎng)白山區(qū)的安圖縣池北區(qū)、二道白河鎮(zhèn)、松江鎮(zhèn)地區(qū),總計(jì)樣本數(shù)量110群蜜蜂(表1).
表1 長(zhǎng)白山中華蜜蜂樣本信息Table 1 Information of samples from Changbai Mountains
每群取1只工蜂,利用UNIQ10柱式基因組DNA抽提試劑盒(生工生物上海股份有限公司)提取基因組.
PCR擴(kuò)增微衛(wèi)星位點(diǎn)的引物來(lái)源于NCBI網(wǎng)站(表2),反應(yīng)條件為95℃預(yù)變性5 min;95℃變性50 s,退火30 s(退火溫度參照表2),72℃延伸30 s,30個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min;4℃保存.微衛(wèi)星PCR產(chǎn)物經(jīng)8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè).
表2 微衛(wèi)星位點(diǎn)信息Table 2 Information of 5 microsatellite loci
PCR擴(kuò)增mtDNA tRNAleu-COII片段,上游引物為E2:5'-GGCAGAATAAGTGCATTG-3',下游引物H2:5'-CAATATCATTGATGACC-3'[25].反應(yīng)條件為95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性30 s,50 ℃退火30 s,72 ℃ 延伸30 s,30個(gè)循環(huán);72℃延伸8 min;8℃保存.mtDNA PCR產(chǎn)物送至上海英駿生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測(cè)序.為保證結(jié)果的準(zhǔn)確性,測(cè)序結(jié)果中個(gè)體數(shù)量在3只以下的單倍型進(jìn)行重復(fù)測(cè)序.
根據(jù)8%非變性聚丙烯酰胺電泳結(jié)果進(jìn)行微衛(wèi)星位點(diǎn)的等位基因判讀,利用Ms tools軟件計(jì)算期望雜合度(expected heterozygosity,He)、觀察雜合度(observed heterozygosity,Ho)、多態(tài)信息含量(polymorphism information content,PIC)與等位基因頻率.利用Popgene 1.31軟件計(jì)算等位基因數(shù)(observed number of alleles,Na)、有效等位基因數(shù)(effective number of alleles,Ne)與香農(nóng)指數(shù)(Shannon's information index,I).
mtDNA測(cè)序序列以非編碼區(qū)“AAAATTT”序列為開(kāi)始,截取357 bp的序列片段進(jìn)行分析,利用ClustalX 1.83軟件對(duì)其進(jìn)行比對(duì),統(tǒng)計(jì)單倍型種類,利用MEGA 4.0軟件計(jì)算序列的堿基組成,利用DnaSP 5.00.07軟件計(jì)算單倍型多樣度(haplotype diversity,Hd),核苷酸多樣度(nucleotide diversity,Pi)與平均核苷酸差異數(shù)(average number of nucleotide differences,K).
2.1.1 微衛(wèi)星位點(diǎn)的遺傳多樣性 長(zhǎng)白山中華蜜蜂在A107、AP043、AP085、AP313、AT101位點(diǎn)整體等位基因較少,遺傳多樣性水平低.每個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)發(fā)現(xiàn)1-4個(gè)等位基因,平均等位基因數(shù)為2.6000±1.1402,平均有效等位基因數(shù)為1.4181±0.6487.長(zhǎng)白山中華蜜蜂5個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的期望雜合度為0-0.6107,平均期望雜合度為0.2110±0.2333.除A107位點(diǎn)的期望雜合度為0.6107外,其余4個(gè)位點(diǎn)的期望雜合度為0-0.1780.5 個(gè)位點(diǎn)的觀察雜合度為0-0.1827,平均觀察雜合度為0.0645 ±0.0718.5 個(gè)位點(diǎn)的平均香農(nóng)指數(shù)為 0.4031 ±0.4202(表3).
表3 長(zhǎng)白山中華蜜蜂微衛(wèi)星DNA的遺傳多樣性參數(shù)Table 3 Genetic diversity parameters of Apis cerana cerana from Changbai Mountains by microsatellite loci
2.1.2 線粒體DNA遺傳多樣性 長(zhǎng)白山中華蜜蜂在mtDNA tRNAleu-COII 357 bp片段T、C、A、G 4種核苷酸的平均比例分別為44.8%、9.5%、40.6%和5.0%.長(zhǎng)白山中華蜜蜂共檢測(cè)出9種單倍型,H1單倍型(Japan1型,AB078733)是文獻(xiàn)報(bào)道中分布較為廣泛的類型,相比于H1單倍型,1種單倍型在1個(gè)位點(diǎn)上發(fā)生缺失,7種單倍型分別在1個(gè)位點(diǎn)發(fā)生突變(表4),其中單一多態(tài)位點(diǎn)4個(gè),簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)3個(gè).
表4 長(zhǎng)白山中華蜜蜂mtDNA tRNAleu-COII片段單倍型種類及變異信息1)Table 4 Variable sites and haplotypes of Apis cerana cerana from Changbai Mountains in mtDNA tRNAleu-COII region
長(zhǎng)白山中華蜜蜂mtDNA tRNAleu-COII 357 bp片段遺傳多樣性偏低,單倍型多樣度為0.249±0.054、核苷酸多樣度為0.00074 ±0.00017、平均核苷酸差異為0.263.
本研究在長(zhǎng)白山地區(qū)新發(fā)現(xiàn) H2、H3、H4、H5、H7、H8、H9等7種單倍型.與 NCBI網(wǎng)站進(jìn)行比對(duì),H3(登錄號(hào):KF673779)、H5(登錄號(hào):KF673782)、H7(登錄號(hào):KF673780)、H8(登錄號(hào):KF673781)等4種單倍型為中華蜜蜂中首次發(fā)現(xiàn)(表4),H2、H4、H9等3種單倍型為在長(zhǎng)白山地區(qū)發(fā)現(xiàn)的新記錄.
2.2.1 微衛(wèi)星遺傳結(jié)構(gòu) 長(zhǎng)白山中華蜜蜂5個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的遺傳結(jié)構(gòu)中,均以一種等位基因?yàn)橹?AP043、AP085、AP313、AT101等4個(gè)位點(diǎn)的主要主等位基因,占所檢測(cè)到的等位基因90%以上.AP313位點(diǎn)只有1種等位基因(342 bp).A107有4種等位基因,其中165 bp占所檢測(cè)到的等位基因50%以上(表5).2.2.2 線粒體遺傳結(jié)構(gòu) 長(zhǎng)白山中華蜜蜂mtDNA tRNAleu-COII 357 bp片段的遺傳結(jié)構(gòu)較單一.9種單倍型中,以H1(Japan1型)單倍型為主,占83.64%.其次為H9單倍型,占6.36%.其余7種單倍型頻率為0.91%-2.73%(表 4).
表5 長(zhǎng)白山中華蜜蜂的微衛(wèi)星遺傳結(jié)構(gòu)Table 5 Genetic structure of Apis cerana cerana based on microsatellite in Changbai Mountains
(1)在現(xiàn)有中華蜜蜂遺傳多樣性研究中,中華蜜蜂 A107、AP043、AP085、AP313、AT101 這 5 個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的 PIC 值主要范圍分別是0.5-0.6、0.2-0.5、0.7-0.85、0.2-0.4 和 0.2-0.5[5-6,26],長(zhǎng)白山中華蜜蜂的 PIC 值分別為 0.5541、0.1186、0.1319、0和0.1644,均低于PIC值的主要分布范圍或處于較低水平.期望雜合度也體現(xiàn)出相似的規(guī)律[5-6,26].目前,較少使用mtDNA tRNAleu-COII片段進(jìn)行中華蜜蜂遺傳多樣性研究,僅有海南中華蜜蜂的相關(guān)研究中運(yùn)用了該片段.海南中華蜜蜂 mtDNA tRNAleu-COII片段發(fā)現(xiàn)單倍型多樣度、核苷酸多樣度、平均核苷 酸 差異分別為 0.742 ± 0.017、0.00354 ±0.00013和1.248[7],而長(zhǎng)白山中華蜜蜂的這3個(gè)指標(biāo)均遠(yuǎn)低于海南中華蜜蜂的研究結(jié)果.所以微衛(wèi)星和線粒體分子遺傳標(biāo)記分析,均說(shuō)明長(zhǎng)白山中華蜜蜂遺傳多樣性水平處于非常低的水平.
(2)長(zhǎng)白山植被良好、具有大宗蜜源以及豐富的輔助蜜粉源,是中華蜜蜂優(yōu)良的棲息地.20世紀(jì)前長(zhǎng)白山野生中華蜜蜂資源極豐富,此地蜂蜜是皇家貢品[27].由于西方蜜蜂引進(jìn)后引起種間競(jìng)爭(zhēng),導(dǎo)致長(zhǎng)白山中華蜜蜂種群數(shù)量下降;外來(lái)中華蜜蜂基因滲入,使得當(dāng)?shù)刂腥A蜜蜂面對(duì)環(huán)境變化、疾病等惡劣條件的耐受性下降;經(jīng)濟(jì)較發(fā)達(dá)的鄰國(guó)對(duì)野生蜂蜜的高價(jià)需求,促進(jìn)毀巢取蜜的行為,毀滅性減少了當(dāng)?shù)匾吧腥A蜜蜂的種群數(shù)量;社會(huì)經(jīng)濟(jì)的發(fā)展,養(yǎng)蜂人的數(shù)量減少,養(yǎng)蜂技術(shù)下降;人工育王技術(shù)應(yīng)用不當(dāng),以上原因均使得長(zhǎng)白山中華蜜蜂種群遺傳多樣性降低.長(zhǎng)白山中華蜜蜂形成分散的小種群,遺傳變異低于其它地區(qū)的中華蜜蜂,并表現(xiàn)出較為單一的遺傳結(jié)構(gòu).
(3)長(zhǎng)白山中華蜜蜂是分布在我國(guó)東北地區(qū)的中華蜜蜂代表,是耐寒型中華蜜蜂的寶貴資源.原長(zhǎng)白山中華蜜蜂廣泛分布在黑龍江省的小興安嶺以南、吉林省和遼寧省的長(zhǎng)白山脈,具有維持強(qiáng)群、耐寒力強(qiáng)等優(yōu)良蜂種特性.但近年來(lái)長(zhǎng)白山中華蜜蜂數(shù)量大幅度減少,已成為中華蜜蜂中數(shù)量最少的生態(tài)型,處于瀕危維持狀態(tài)[9,28].長(zhǎng)白山中華蜜蜂存在著滅絕的風(fēng)險(xiǎn).生命資源的滅絕將會(huì)永久消失,因此搶救性保護(hù)長(zhǎng)白山中華蜜蜂刻不容緩.建議在長(zhǎng)白山中華蜜蜂分布較多、生態(tài)條件較好的地方設(shè)立中華蜜蜂保護(hù)區(qū);在保護(hù)區(qū)內(nèi)政府用補(bǔ)貼、技術(shù)支持等形式鼓勵(lì)當(dāng)?shù)剞r(nóng)民原始飼養(yǎng)本土的中華蜜蜂,擴(kuò)大長(zhǎng)白山中華蜜蜂的種群數(shù)量;禁止西方蜜蜂和轉(zhuǎn)地的中華蜜蜂進(jìn)入,禁止從保護(hù)區(qū)外購(gòu)買蜂種或蜂王,保持長(zhǎng)白山中華蜜蜂的遺傳特征;在保護(hù)區(qū)內(nèi)適當(dāng)?shù)挠杏?jì)劃的蜂群交流,不進(jìn)行人工選育,保持長(zhǎng)白山中華蜜蜂的遺傳多樣性.致謝:樣本采集中得到了楊明福等同志的幫助.本科生夏鳳枝參與部分實(shí)驗(yàn).謹(jǐn)此致謝!
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