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人體的“社交網(wǎng)絡(luò)”

2013-12-02 07:45錢煒
教師博覽 2013年4期
關(guān)鍵詞:社交網(wǎng)絡(luò)菌群基因組

錢煒

諾貝爾醫(yī)學(xué)獎獲得者喬舒亞·萊德伯格曾說,“人是與其共生的微生物構(gòu)成的超級生物?!比梭w內(nèi)寄生著各種微生物,光是在腸道里,就有幾千種、總重達(dá)1.5公斤的細(xì)菌。一直以來,科學(xué)家們只是隱約知道腸道菌群影響人體健康,但對于究竟有什么影響、如何發(fā)揮作用卻不甚了了。

最早研究腸道菌群的是1908年諾貝爾醫(yī)學(xué)獎得主、細(xì)胞免疫學(xué)說的建立者梅契尼科夫。這位流亡到法國的俄國動物學(xué)家晚年開始琢磨衰老與長壽。他發(fā)現(xiàn)保加利亞有很多長壽老人,而他們的共同點是愛喝酸奶。通過進(jìn)一步研究他認(rèn)為,擁有健康的腸道菌群有助于長壽。梅氏就此寫了一本名為《延長生命》的書,可算作是腸道菌群領(lǐng)域最早的論述,但這是本未經(jīng)同行審議的學(xué)術(shù)著作。

盡管如此,人們在治療中已零星地運(yùn)用腸道菌群的概念。做完手術(shù)的病人,由于術(shù)后大量使用抗生素,破壞了腸道菌群,易出現(xiàn)腹瀉不止的情況。而這種腹瀉又很難再用藥物來止住。有的醫(yī)生靈機(jī)一動,將健康人的糞便裝進(jìn)膠囊,讓病人服下去,結(jié)果發(fā)現(xiàn)效果不錯。于是,這種思路得到推廣,并加以規(guī)范。后來,醫(yī)生們就開始采用經(jīng)過處理的糞便懸浮液來為病人灌腸。這方法聽起來有些“重口味”,因此它有一個含蓄的名稱:細(xì)菌療法。這種治療腹瀉和腸道炎癥的做法,最早在1970年代就有報道,并延續(xù)至今,盡管也發(fā)了不少學(xué)術(shù)文章,不過并非主流的治療方法。在臨床上,腸道菌群也不是常規(guī)的診斷項目。

很長一段時間內(nèi),腸道菌群理論一直沒有成為學(xué)術(shù)界認(rèn)真對待的課題,造成這種狀況的一個重要原因是研究手段所限。在過去,要想認(rèn)識一個細(xì)菌,先要將它分離培養(yǎng),再用顯微鏡去鑒定。但腸道菌群有幾千個,且都是厭氧菌,一遇到有氧環(huán)境就迅速死掉,人們很難把它們逐一分離出來并識別。有些細(xì)菌是共生關(guān)系,也無法單獨培養(yǎng)。即使是現(xiàn)在,在技術(shù)上也不能完全做到這一點。此外,腸道菌群本身的復(fù)雜也增加了人們認(rèn)識它真面目的難度——就跟指紋與眼睛虹膜一樣,這世上沒有哪兩個人的腸道菌群一模一樣。

腸道菌群研究領(lǐng)域隨著生物醫(yī)學(xué)進(jìn)入基因時代而變得活躍起來。尤其是自2005年左右第二代基因測序技術(shù)出現(xiàn)以后,快速、一次性、大規(guī)模地解碼DNA成為現(xiàn)實??茖W(xué)家們從此可以扔下顯微鏡,轉(zhuǎn)而從基因的層面了解腸道細(xì)菌。

生物學(xué)家曾經(jīng)以為,人體是一座自給自足的生物孤島,然而在過去10年里,研究人員證明,人體是一個復(fù)雜的生態(tài)系統(tǒng),或者說是一個“社會網(wǎng)絡(luò)”,其中有數(shù)以萬億的細(xì)菌和其他微生物寄居在我們的皮膚、陰部、口腔,尤其是腸道里。事實上,人體當(dāng)中細(xì)菌的細(xì)胞數(shù)量是人體自身細(xì)胞的十倍之多。而且,這些微生物細(xì)胞及其基因(被稱為“元基因組”)形成一個混合的小社會,不僅不會危害人類健康,還會在消化、生長和自我防御等方面成為我們基本生理機(jī)能的助手。

這方面最好的例子是丁酸鹽。人體腸道的上皮細(xì)胞每3天脫落更新一次,這一代謝過程需要一種名叫丁酸鹽的物質(zhì)。但食物中很少直接含有丁酸鹽,人體自身也不能合成,它的主要來源是腸道菌群的代謝廢棄物。更有趣的是,腸道細(xì)菌要靠“吃”膳食纖維才能產(chǎn)生丁酸鹽,而膳食纖維又恰恰是人體不能自身消化的。因此,人對膳食纖維的需要,不僅是為自己,而且也是為了這些細(xì)菌,否則腸道上皮細(xì)胞長不好,就容易長出息肉乃至患結(jié)腸癌。

鑒于人與寄生于其體內(nèi)的微生物的關(guān)系如此密切,2005年,美、德、日、中等13國在法國召開人類微生物組圓桌會議,會議發(fā)表的《巴黎宣言》宣布啟動人類第二基因組計劃——“人類元基因組計劃”。在上世紀(jì)90年代,歷時13年、耗費30億美元的人類基因組計劃曾測定了人類自身的25000多個基因。而人類第二基因組計劃的測序工作量,預(yù)計至少相當(dāng)于人類基因組計劃的10倍。

上海交通大學(xué)教授趙立平代表中國參加了上述會議。根據(jù)這個會議,各國自2007年始陸續(xù)開展了行動。其中比較大的項目有,美國斥資1億美元的“人體微生物群系項目”,歐盟總經(jīng)費達(dá)1200萬歐元的“人類元基因組第七框架項目”。2008年,根據(jù)中法簽署的《中法腸道元基因組研究聯(lián)合聲明》,上海交大聯(lián)合中科院幾家單位,與法國農(nóng)科院聯(lián)合啟動了“中法腸道元基因組合作項目”,著眼于腸道菌群與肥胖及糖尿病的研究,由趙立平任項目負(fù)責(zé)人。目前,該項目的第一階段工作已經(jīng)完成。

在過去10年,進(jìn)入到這個領(lǐng)域的學(xué)者,幾乎都沒有醫(yī)學(xué)背景,大多數(shù)都是像趙立平一樣的微生物學(xué)家。醫(yī)學(xué)家習(xí)慣于從某一種病原菌出發(fā),去尋找特定的微生物對人體健康的影響。而面對腸道菌群這樣一團(tuán)雜亂無章的細(xì)菌混合體時,只有熟悉微生物生態(tài)學(xué)的科學(xué)家們才能游刃有余。“這實際上是兩種思維模式:自下而上與自上而下,”趙立平說。在最開始,大家需要把腸道菌群本身的情況摸清楚,共有多少種菌都有什么基因。而現(xiàn)在已經(jīng)進(jìn)入第二階段,要研究與疾病相關(guān)的都有哪些關(guān)鍵菌群,它們都是怎么發(fā)揮作用的。

2012年11月,國家自然科學(xué)基金委在上海召開了一次會議,探討未來中國的腸道菌群研究該怎么走。與會專家,除了趙立平等兩三位微生物學(xué)者,絕大部分都是臨床各科的醫(yī)生。對此,趙立平坦承,“隨著腸道菌群的基本情況越來越清楚,腸道菌群的致病機(jī)理將會是研究的重點。醫(yī)學(xué)家在這個天地大有作為,未來他們將占據(jù)主流?!?/p>

(摘自《中國新聞周刊》2012年第45期)

責(zé)編:徐艷蘭

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