陳 欣,肖建華,欒培賢,徐 強(qiáng),王洪斌
(東北農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院,黑龍江 哈爾濱150030)
豬繁殖與呼吸綜合征(Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome,PRRS),是由豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)引起的一種高度傳染性疾病,以懷孕母豬流產(chǎn)、早產(chǎn)、死胎和木乃伊胎等繁殖障礙以及仔豬和育肥豬的呼吸道癥狀為特征。2006年5月份開始,南方地區(qū)發(fā)生豬無名高熱病,大部分發(fā)病豬場的發(fā)病率在50%以上,死亡率高達(dá)50%~90%,給養(yǎng)豬生產(chǎn)造成了數(shù)十億的經(jīng)濟(jì)損失。2007年初,國家農(nóng)業(yè)部正式定性為高致病性藍(lán)耳病,雖然仍然列為二類動(dòng)物疫病,但是對其重視程度已不亞于高致病性禽流感。因此,PRRS發(fā)病預(yù)測模型的建立對于防控該病具有重要的意義。本研究結(jié)合PRRS發(fā)病特點(diǎn),借鑒已有的傳染病預(yù)測研究理論,利用各種關(guān)鍵氣象因素?cái)?shù)據(jù)對我國南方地區(qū)某省的PRRS發(fā)病率和發(fā)病趨勢進(jìn)行預(yù)測研究,建立BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測模型,探討利用氣象因素預(yù)測PRRS發(fā)病率和發(fā)病趨勢的方法。
1.1 資料來源 選擇我國南方地區(qū)某省作為預(yù)測模型研究對象,該省區(qū)2005年~2007年氣象數(shù)據(jù)資料來自中國氣象局,同期該地區(qū)PRRS發(fā)病數(shù)據(jù)源自中國農(nóng)業(yè)部《獸醫(yī)公報(bào)》,豬飼養(yǎng)量數(shù)據(jù)參考《中國畜牧業(yè)年鑒》。由于《中國畜牧業(yè)年鑒》中各省養(yǎng)豬量數(shù)據(jù)為年報(bào),所以計(jì)算PRRS發(fā)病率時(shí)在模型中將每年度豬存欄量作為每月豬飼養(yǎng)量,以統(tǒng)一計(jì)算方法。發(fā)病率計(jì)算公式:
PRRS月發(fā)病率=PRRS月發(fā)病數(shù)/當(dāng)年年底豬存欄量
1.2 研究方法
1.2.1 氣象因素與PRRS發(fā)病率相關(guān)性分析 大量研究表明,PRRS發(fā)病與季節(jié)變化、免疫、飼養(yǎng)方式、野毒侵襲和人員接觸以及機(jī)體由于應(yīng)激而造成免疫功能降低等原因有關(guān)。本研究將當(dāng)月氣象數(shù)據(jù)作為自變量,將次月PRRS發(fā)病率作為因變量,利用SPSS 13.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件對二者進(jìn)行相關(guān)性分析,分析與PRRS發(fā)病關(guān)系密切的氣象因子,以便為預(yù)測模型的建立提供依據(jù)。
1.2.2 BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測模型建立
(1)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的確定:本研究采用log-sigmoid函數(shù)的三層前向BP人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),參考公式N2=sqrt(N1+M)+a確定隱含層單元N2的數(shù)量范圍,其中N1為輸入單元數(shù),M為輸出單元數(shù),a為1~10的常數(shù)[1]。在確定N1與M的數(shù)值以后,通過改變a的數(shù)值來改變隱含層N2的單元個(gè)數(shù),對BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行訓(xùn)練和調(diào)整,直到神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練誤差達(dá)到預(yù)先設(shè)定的誤差最小值為止。最后通過檢驗(yàn)組數(shù)據(jù)來考核網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練擬合程度是否能夠滿足預(yù)測要求,根據(jù)最佳預(yù)測結(jié)果來確定BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)。
(2)數(shù)據(jù)分組和歸一化處理:本次研究將所獲得數(shù)據(jù)分為訓(xùn)練和檢驗(yàn)2個(gè)數(shù)據(jù)組。將2004年12月~2007年5月該省氣象數(shù)據(jù)作為輸入層,2005年1月~2007年6月該地區(qū)PRRS發(fā)病率數(shù)據(jù)作為期望輸出層。當(dāng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)確定后,可將2007年6月~11月的氣象數(shù)據(jù)帶入預(yù)測網(wǎng)絡(luò)中來驗(yàn)證所構(gòu)建的網(wǎng)絡(luò)預(yù)測模型的準(zhǔn)確性。
為了滿足人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)函數(shù)的條件和提高神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的訓(xùn)練速度,需將樣本進(jìn)行歸一化處理,將輸入層數(shù)據(jù)歸一化范圍為[-1,1],公式為:X′=(X-Xmin)/(Xmax-Xmin)×2-1,輸出層數(shù)據(jù)歸一化范圍為[0.1,0.9],公式為:Y′=(Y-Ymin)/(Ymax-Ymin)×0.8+0.1。
(3)人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的建立、訓(xùn)練和仿真:采用BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),并通過 Matlab7.0軟件編程實(shí)現(xiàn)[2]。
net=newff(minmax(p1n),[n,1],{‘logsig’,‘logsig’},‘trainlm’);其中 minmax(p1n)為網(wǎng)絡(luò)輸入p1n的取值范圍,p1n為氣象數(shù)據(jù)p經(jīng)過歸一化處理后的數(shù)據(jù)。網(wǎng)絡(luò)采用3層網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),n為隱單元數(shù),由于輸出變量只有PRRS發(fā)病率一項(xiàng),故輸出單元數(shù)為1,logsig為BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)各層之間的激活函數(shù),trainlm為訓(xùn)練函數(shù)。
net=train(net,p1n,t1n);其中p1n為輸入向量,t1n為目標(biāo)向量。設(shè)定網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練精度為1×10-5,最大訓(xùn)練步數(shù)為5000。
t2n=sim(net,p2n);進(jìn)行PRRS發(fā)病預(yù)測,檢驗(yàn)t2值與PRRS實(shí)際發(fā)病率值擬合程度是否令人滿意。
(4)人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型的預(yù)測效果評價(jià)方法:預(yù)測效果評價(jià)指標(biāo)采用決定系數(shù)R2以檢驗(yàn)?zāi)P偷臄M合程度,其值越接近1說明方程或者模型擬合效果越好,預(yù)測越準(zhǔn)確,并結(jié)合實(shí)際值與預(yù)測值誤差絕對值對模型效果做出綜合評價(jià)。決定系數(shù)R2=(corrcoef(A,T))2,數(shù)值上等于實(shí)際發(fā)病率與預(yù)測值相關(guān)系數(shù)的平方,表示自變量能正確預(yù)測因變量變化的百分比[3]。
2.1 氣象因素與PRRS發(fā)病率相關(guān)性分析 由PRRS月發(fā)病率與氣象因子相關(guān)分析結(jié)果可知,PRRS發(fā)病率與月平均氣壓、極端最高氣壓、極端最低氣壓呈顯著正相關(guān),與月平均氣溫、平均最低氣溫、平均最高氣溫、極端最低氣溫、極端最高氣溫、平均相對濕度、降水量、最大風(fēng)速、極大風(fēng)速、平均水汽壓呈顯著性負(fù)相關(guān)。
其中,發(fā)病率與月平均氣溫、平均最低氣溫、平均最高氣溫、極端最低氣溫、極端最高氣溫、平均氣壓、極端最高氣壓、平均水汽壓的相關(guān)系數(shù)分別為-0.4930、-0.4944、-0.4943、-0.4761、-0.5085、0.4930、0.4890、-0.487,相關(guān)性差異極顯著;發(fā)病率與平均相對濕度、降水量、最大風(fēng)速、極大風(fēng)速、極端最低氣壓的相關(guān)系數(shù)分別為-0.3360、-0.3340、-0.4060、0.4890、0.4150,相關(guān)性差異顯著。
2.2 BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)確定及預(yù)測結(jié)果 通過多次反復(fù)調(diào)試最終在眾多網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)中確定出網(wǎng)絡(luò)隱含層單元數(shù)為5時(shí)最適宜預(yù)測。網(wǎng)絡(luò)輸入層的神經(jīng)元為13個(gè),即13個(gè)月平均氣象指標(biāo);輸出層的神經(jīng)元為1個(gè),即PRRS發(fā)病率,因此神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)確定為13-5-1。預(yù)測網(wǎng)絡(luò)模型經(jīng)過34次訓(xùn)練以后達(dá)到預(yù)先設(shè)定的最小誤差值1×10-5,訓(xùn)練情況見圖1,預(yù)測發(fā)病率與實(shí)際發(fā)病率對照見表1。
2.3 預(yù)測模型效果評價(jià) 將檢驗(yàn)數(shù)據(jù)輸入建立好的預(yù)測模型后,得到相應(yīng)的PRRS發(fā)病率預(yù)測結(jié)果(見表1)。求得預(yù)測模型決定系數(shù)R2=0.821,說明模型預(yù)測性能較好。
另外,由表1可知,2007年7~12月預(yù)測發(fā)病率與實(shí)際發(fā)病率之間誤差不大,其中2007年9月模型預(yù)測值和實(shí)際發(fā)病率值的誤差絕對值為22.2×10-6,盡管這個(gè)月發(fā)病率預(yù)測數(shù)據(jù)相對誤差較大,但是在畜牧業(yè)生產(chǎn)中畜禽存欄量每年都可達(dá)幾千萬只,相比而言預(yù)測誤差仍然可以接受。預(yù)測模型的決定系數(shù)R2=0.821,說明擬合程度較好,發(fā)病率預(yù)測比較準(zhǔn)確,所以從實(shí)際預(yù)測需求來講這樣的結(jié)果仍然可以滿足預(yù)測要求。
表1 預(yù)測發(fā)病率與實(shí)際發(fā)病率對照
3.1 氣象條件對PRRS發(fā)生的影響 PRRSV的主要傳播方式是易感豬與病毒攜帶豬的密切接觸,尤其在豬群規(guī)模大和飼養(yǎng)密度高的情況下,這種危險(xiǎn)性更大[4]。蚊蟲和家蠅也可使PRRSV在易感動(dòng)物間傳播??諝鈧鞑ナ菍?dǎo)致PRRS流行的一個(gè)重要的因素,雖然對于空氣傳播的距離仍然存在爭論,但在歐洲有許多研究認(rèn)為本病可以通過空氣傳播[5-6]。
本研究通過對氣象數(shù)據(jù)和PRRS發(fā)病率進(jìn)行相關(guān)分析可知,溫度相對較低可能更有利于病毒在外界環(huán)境中生存,且該病的發(fā)生可能受氣溫驟變的影響。氣壓發(fā)生變化時(shí),動(dòng)物體內(nèi)的腔窩擴(kuò)大,會(huì)對疾病的發(fā)生產(chǎn)生影響,氣壓與發(fā)病率呈負(fù)相關(guān)也可能與溫度的影響有關(guān)。在空氣流通越快的空間內(nèi)病毒含量越少,PRRS發(fā)生的可能性也就越低。Komijn等認(rèn)為藍(lán)耳病在荷蘭最初快速傳播的一個(gè)原因是風(fēng)向和冬季的天氣狀況導(dǎo)致,較低的溫度,較高的相對濕度和較低的風(fēng)速有利于病毒的傳播[7]。本研究結(jié)果顯示,月平均濕度、降水量與PRRS發(fā)病率呈負(fù)相關(guān)關(guān)系,這似乎違背了PRRSV病毒在潮濕的環(huán)境下更易傳播的特性,但結(jié)合所調(diào)查地區(qū)常年處于相對濕度較大狀態(tài)的氣候特征,結(jié)合溫度與PRRS發(fā)病率呈極顯著負(fù)相關(guān)的結(jié)果,可以推測出PRRS受溫度的影響較大,溫度的變化在該地區(qū)可能成為疾病發(fā)生的重要提示指標(biāo)。
3.2 BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在動(dòng)物疾病預(yù)測研究中的應(yīng)用 基于人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的預(yù)測模型不像傳統(tǒng)的統(tǒng)計(jì)學(xué)模型那樣要求變量符合特定的分布類型,不必對輸入變量作復(fù)雜的相關(guān)假定,而且尤其善于處理模型復(fù)雜的非線性關(guān)系。因此基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的預(yù)測模型很好的解決了本研究中變量間不能用精確的函數(shù)表達(dá)這一問題。
本研究中BP人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型預(yù)測結(jié)果顯示,BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型對PRRS發(fā)病率具有較好的預(yù)測能力,可能是因?yàn)橛行庀笠蛩貙RRS并不是直接作用,而是通過影響傳染病發(fā)生的各個(gè)環(huán)節(jié),間接影響傳染病在易感動(dòng)物中的分布[8]。本次研究BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的預(yù)測效果較好,我們還可以通過增大樣本含量,在大樣本的前提下對網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)進(jìn)行調(diào)整,讓網(wǎng)絡(luò)繼續(xù)學(xué)習(xí)、充分訓(xùn)練獲得足夠信息,從而對網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行優(yōu)化,提高模型預(yù)測的準(zhǔn)確性,滿足預(yù)測需求。
通過本研究將BP人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型引入PRRS的預(yù)測,結(jié)果顯示預(yù)測效果較好,為其他疫病,特別是發(fā)生與氣象因素相關(guān)性十分顯著的疫病的預(yù)測在方法和技術(shù)上積累了經(jīng)驗(yàn),具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。
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