潘洪洋 楊 方 張明香 魏 倪 楊 樺 林 松
我們采用PCR產(chǎn)物直接測(cè)序法[1,2]對(duì)471例進(jìn)行了HBV-P-RT區(qū)基因序列分析的CHB患者進(jìn)行橫截面分析,以進(jìn)一步了解與耐藥相關(guān)的基因變異特點(diǎn)。
一、病例來源 2007年5月~2010年2月在我院住院的CHB患者255例,乙型肝炎肝硬化216例,男性355例,女性116例,中位年齡為46(10~85)歲,診斷符合我國(guó)2005年制定的慢性乙型肝炎防治指南[3]。全部患者血清HBV DNA陽性,平均水平為5.57±1.35lg拷貝/毫升,其中HBeAg陽性284例(60.3%)。
二、HBV-RT區(qū)基因序列分析 空腹采集靜脈血。引物序列為:上游:5'-CTTTCGCAAGATTCCTATGGGA-3',下游:5'-CCCCAACTTCCAATTACATATC-3'。采用巢式PCR法對(duì)HBV-RT區(qū)基因擴(kuò)增(四川天澤基因工程有限公司),產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定和回收純化后,進(jìn)行雙向DNA序列測(cè)定(美國(guó)ABI公司3130全自動(dòng)DNA測(cè)序儀),與GenBank參考序列進(jìn)行比對(duì),獲得樣本的突變位點(diǎn)。
三、統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS l3.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。符合正態(tài)分布的計(jì)量資料采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,否則采用中位數(shù)(四分位間距)表示,組間比較采用方差分析或秩和檢驗(yàn),P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
一、未治療患者HBV-P基因RT區(qū)變異情況 在292例未接受抗病毒治療的患者中,檢測(cè)到與NA耐藥相關(guān)的錯(cuò)義變異6例(2.0%),包括M204I3例、A181T 1例和V173L 2例。同義變異25例(8.5%),包括180位點(diǎn)14例、181和236位點(diǎn)各3例及169和180聯(lián)合變異5例。
二、停用NA治療后患者發(fā)生HBV-P基因RT區(qū)變異情況 在49例曾經(jīng)應(yīng)用過NA治療患者,在停藥至少3月后,9例(18.4%)檢測(cè)到變異位點(diǎn),包括經(jīng)典耐藥位點(diǎn)的錯(cuò)義和同義變異(表1)。
表1 停用NA治療后9例患者發(fā)生HBV-P-RT變異及類型
三、應(yīng)用NA治療期間發(fā)生HBV-P基因RT區(qū)變異情況 130例(27.6%)患者在接受NA治療過程中,在他們中檢測(cè)到與NA相關(guān)的錯(cuò)義變異50例(38.5%,表2),檢測(cè)到同義變異20例(15.4%,表3)。
四、變異患者血清HBV DNA和ALT水平的變化 見表4。
我們根據(jù)患者應(yīng)用NA治療情況將患者分為未抗病毒治療者、曾經(jīng)接受過抗病毒治療者和正在接受抗病毒治療者,結(jié)果均檢測(cè)到氨基酸置換位點(diǎn),其變異模式與既往報(bào)道一致[4~7]。在未經(jīng)NA治療的患者,報(bào)道的結(jié)果各異。2008年Nguyen[8]分別采用克隆測(cè)序法和PCR-直接測(cè)序法在未經(jīng)NA治療的HBsAg攜帶者體內(nèi)均未檢出與耐藥相關(guān)的變異。近來,李曉光等[9]用PCR-直接測(cè)序法檢測(cè)未經(jīng)NA治療的CHB患者,亦未發(fā)現(xiàn)與耐藥相關(guān)的變異。相反,2001年Kobayashi等[10]用PCR-克隆測(cè)序法檢測(cè)18例未經(jīng)抗病毒治療的慢性HBV感染者,結(jié)果5例患者檢出了rtM204I耐藥變異。我們采用PCR-直接測(cè)序法在從未接受抗病毒治療者及曾經(jīng)抗病毒者中分別檢測(cè)到6例(2.0%)和5例(10.2%)與耐藥相關(guān)的變異。
我們?cè)谡诮邮芸共《局委煹幕颊咧邪l(fā)現(xiàn)1例應(yīng)用LdT初治24個(gè)月后出現(xiàn)rtA181T變異,1例在應(yīng)用ADV初治12個(gè)月后發(fā)生rtM204I變異;在曾經(jīng)抗病毒治療的患者中發(fā)現(xiàn)1例ADV單藥治療5個(gè)月后停藥7個(gè)月發(fā)生rtM204I+V173L變異,1例ETV單藥治療1年后停藥1年發(fā)生rtV173L+rtN236同義變異,這些在以前未見類似報(bào)道,有待進(jìn)一步研究。
表2 50例患者在應(yīng)用NA治療期間發(fā)生HBV-P基因RT區(qū)錯(cuò)義變異及類型
表3 21例應(yīng)用NA治療期間患者HBV-P基因RT區(qū)同義變異類型及用藥史
表4 變異患者血清HBV DNA和ALT水平(±s)的比較
表4 變異患者血清HBV DNA和ALT水平(±s)的比較
例數(shù) HBV DNA(lgcopies/ml)ALT(U/L)錯(cuò)義變異 505.6±1.489±53同義變異 205.3±1.193±67未變異 605.0±1.599±48
遺傳密碼具有多重性,即決定一個(gè)氨基酸的密碼子大多不止一個(gè),三聯(lián)體密碼子中一個(gè)核苷酸的置換若不改變氨基酸的組成,最終得到的蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能也不會(huì)發(fā)生變化,這樣的變異被稱為同義變異。但Kimchi-Sarfaty等[11]研究發(fā)現(xiàn)多藥耐藥-1(multidrug resistance-1,MDR-1)基因的同義變異可降低化療藥物的活性。沈銀忠等[12]研究發(fā)現(xiàn)光滑念珠菌ERG11基因的同義變異導(dǎo)致的光滑念珠菌對(duì)氟康唑耐藥。本研究在三組患者中均檢測(cè)到相當(dāng)數(shù)量的同義變異,其中正在抗病毒治療的患者耐藥相關(guān)錯(cuò)義變異發(fā)生率高于測(cè)序時(shí)未治療者,同義變異在從未抗病毒治療者、曾經(jīng)抗病毒治療者及正在抗病毒治療者中逐漸升高,但同義變異對(duì)測(cè)序時(shí)HBV DNA水平的影響似乎不大。
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