陳文江
自1981年確認第1例艾滋病以來,發(fā)病率急劇上升,目前全球大約有6000萬人感染HIV,其中死亡2000多萬。研究表明,天然的HIV-1包膜蛋白以三聚體的形式存在于病毒顆粒和感染細胞的表面[1],所以,獲得模擬天然構(gòu)象的抗原蛋白對于改善包膜的免疫原性,研究包膜糖蛋白的生物學(xué)特性,為研制有效的HIV-1包膜疫苗、研究包膜糖蛋白的結(jié)構(gòu)及功能提供前期基礎(chǔ)。
1.1 材料 質(zhì)粒pBluescript SKII:原核表達載體,購自上海生工生物技術(shù)有限公司;質(zhì)粒pcT-MTQ(由哈醫(yī)大病原課題組構(gòu)建):含有CMV啟動子、tPA信號肽和蛋白質(zhì)三聚化模序MTQ的質(zhì)粒;HIV-1原代分離株06044:R5親嗜性,分離自黑龍江省 HIV-1感染者;宿主菌:大腸桿菌 JM109;HEK293T 細胞(ADCC No.CRL-11268);PrimeSTAR HS DNA Polymerase(日本 TaKaRa);限制性內(nèi)切酶 EcoR I、Nhe I、Xho I(日本TaKaRa);T4連接酶(美國 Invitrogen);DL2000 DNA Marker(日本 TaKaRa);ZyppyTM Plasmid Miniprep Kit(美國Zymo Research);PCR引物(上海生工生物技術(shù)生物公司);
1.2 方法
1.2.1 HIV-1 06044株gp120真核表達載體的構(gòu)建
1.2.1.1 構(gòu)建策略 首先按照真核細胞基因偏嗜性進行包膜基因密碼子優(yōu)化。PCR擴增包膜gp120基因,PCR產(chǎn)物上下游分別引入EcoR I和Xho I位點,克隆至pcT-MTQ載體的EcoR I和Xho I位點之間,刪除MTQ模序,構(gòu)建gp120單體蛋白表達載體 pcT.06044 gp120 m/co(簡稱 gp120 m);PCR擴增gp120基因,PCR產(chǎn)物上下游分別引入EcoR I和Nhe I位點,克隆至 pcT-MTQ載體 MTQ模序基因的上游,構(gòu)建gp120三聚體蛋白表達載體 pcT.06044 gp120T/co(簡稱gp120T)。
1.2.1.2 構(gòu)建過程 先對包膜基因密碼子進行修飾,調(diào)整env基因序列的GC含量至55.56%,并合成至pBluescript SKII載體上。PCR擴增不含信號肽的 gp120基因,根據(jù)06044 env序列,設(shè)計引物。PCR產(chǎn)物的純化后,將PCR產(chǎn)物和載體pcT-MTQ雙酶切,回收目的基因和線性載體。酶切產(chǎn)物連接,利用T4連接酶,將含有相同粘性末端的基因片段pcT-MTQ和gp120連接在一起,使其形成重組的閉合環(huán)狀質(zhì)粒DNA。重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌后,對陽性克隆進行篩選及鑒定,提取疑似陽性克隆的質(zhì)粒DNA,通過雙酶切的方法驗證構(gòu)建是否成功,選取3個酶切鑒定正確的克隆送至北京Invotrogen公司進行核酸序列測定。測序結(jié)果用GeneRunner3.05軟件進行分析。
1.2.2 HIV-1 gp120包膜蛋白在293T細胞中的表達及初步鑒定
1.2.2.1 重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染293T細胞 利用Lipofectamine2000將gp120蛋白表達載體gp120T或gp120 m轉(zhuǎn)染至293T細胞,使重組gp120蛋白在293T細胞中瞬時表達。轉(zhuǎn)染實驗操作參照Lipofectamine2000的說明書進行。
1.2.2.2 表達產(chǎn)物的檢測 a)樣品處理:轉(zhuǎn)染72 h后,向收獲的培養(yǎng)上清或細胞裂解產(chǎn)物中加入1/5體積的6×SDS Buffer,100℃煮沸10 min后,12000 ×g離心10 min,離心收獲上清用于SDS-PAGE檢測單體形式的gp120蛋白;向收獲的培養(yǎng)上清中加入1/5體積的6×Native Buffer,100℃煮沸30s后,8000×g離心5 min,離心收獲上清用于檢測三聚體形式的gp120蛋白。b)Western blot:配制分離膠和積層膠,上樣量20μL/孔;電泳條件為80V 30 min,160V 1.5 h。電泳結(jié)束后,將凝膠、PVDF膜、Whatman 3 mm濾紙制成轉(zhuǎn)膜“三明治”,置于半干轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)膜儀中,10V轉(zhuǎn)印,單體蛋白轉(zhuǎn)印2.5 h,三聚體蛋白轉(zhuǎn)印4 h;轉(zhuǎn)印后將PVDF膜置于封閉液中,4℃過夜孵育;膜浸入1:1000稀釋的Rabbit anti-gp120抗體中,37℃孵育1 h;TBST溶液洗滌3遍后,將膜浸入1:4000稀釋的辣根過氧化物酶(HRP)標(biāo)記的二抗中,37℃孵育1 h;TBST溶液洗滌3遍后,TBS洗滌1遍,然后向膜上滴加化學(xué)發(fā)光底物,用LAS4000檢測發(fā)光信號。
1.2.2.3 Western blot結(jié)果分析 利用LAS4000 Image Analyzer軟件掃描并計算各個特異性gp120條帶(AU)和相應(yīng)背景(BG)的灰度值,每條條帶的實際灰度值Gx=AU-BG,以各種形式gp120蛋白的總量Gt作為100%,每種形式gp120的百分數(shù)=(Gx/Gt)×100%。
2.1 HIV-1 06044 gp120真核表達載體的構(gòu)建
2.1.1 06044 gp120基因的擴增 用特異引物擴增獲得gp120 PCR產(chǎn)物,將其在1.0%的瓊脂糖凝膠中電泳,經(jīng)EB染色后,紫外燈下觀察到約1.5 kb的條帶,結(jié)果與預(yù)期片段大小基本相符。
2.1.2 陽性克隆雙酶切鑒定結(jié)果 重組質(zhì)粒gp120 m經(jīng)EcoR I和Xho I雙酶切鑒定,獲得大小約為5.5kb和1.5kb的兩個片段,即分別為pcT-MTQ和gp120目的基因的酶切產(chǎn)物,與預(yù)期結(jié)果一致;重組質(zhì)粒gp120T經(jīng)EcoR I和Nhe I雙酶切鑒定,獲得大小約為5.6kb和1.5kb的兩個片段,即分別為pcT-MTQ和gp120目的基因片段的酶切產(chǎn)物,與預(yù)期結(jié)果一致。
2.2 06044 gp120蛋白瞬時表達結(jié)果
2.2.1 變性SDS-PAGE檢測gp120蛋白表達 重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染293T細胞72 h后,收獲培養(yǎng)上清和細胞沉淀,以8%SDSPAGE電泳分析蛋白表達情況。在變性條件下(1% β-ME,1.7%SDS),單體gp120蛋白表達載體gp120 m和三聚體表達載體gp120T轉(zhuǎn)染后細胞上清中均檢測到特異性信號,蛋白大小約120KD,與預(yù)期相符。
2.2.2 非還原PAGE檢測gp120三聚體蛋白表達 在非還原條件下,其中g(shù)p120 m轉(zhuǎn)染組檢測到約120KD gp120蛋白,即gp120以單體形式存在;gp120T轉(zhuǎn)染組檢測到三種形式gp120蛋白,即單體、二聚體和三聚體。
2.2.3 gp120T轉(zhuǎn)染組不同形式gp120蛋白比例分布 利用LAS4000化學(xué)發(fā)光檢測系統(tǒng),掃描并計算,得到單體、二聚體和三聚體gp120蛋白的百分比分別為10%、14%和76%。
HIV-1包膜糖蛋白是病毒感染靶細胞的主要媒介,同時是病毒感染后機體抗病毒免疫的主要靶點,因此,體外表達包膜糖蛋白對于研究包膜的結(jié)構(gòu)和功能,揭示病毒侵入靶細胞的機制,以及開發(fā)有效的預(yù)防性包膜疫苗具有重要意義。但是由于病毒的包膜基因具有病毒密碼子偏嗜性[2],其序列中富含AT堿基,致使包膜蛋白在體外哺乳細胞中難以獲得高效表達。針對上述技術(shù)難題,本研究采取了相應(yīng)的應(yīng)對策略。首先根據(jù)哺乳細胞基因密碼子使用原則,人工合成包膜基因序列,解決了病毒基因偏嗜性的問題。
天然情況下,包膜糖蛋白以三聚體的形式存在于病毒表面,這種三聚體構(gòu)象是包膜發(fā)揮生物學(xué)功能的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。而HIV-1疫苗的早期研究也表明,可溶性的包膜糖蛋白gp120單體疫苗刺激產(chǎn)生的抗體能夠很強地與失去天然構(gòu)象的gp120上的表位作用,但并不能中和原代病毒分離株[3]。因此如何構(gòu)建可溶的維持寡聚化和天然構(gòu)象的包膜蛋白,模擬包膜的三聚體結(jié)構(gòu)是研究包膜功能和發(fā)展包膜疫苗的先決條件[4]。為了維持蛋白的三聚化構(gòu)象,向包膜蛋白的C末端引入蛋白質(zhì)三聚化模序。結(jié)合以上三個策略,本研究成功構(gòu)建了包膜gp120蛋白表達載體,并獲得單體和高比例三聚體gp120蛋白的表達[5],在gp120三聚體表達載體中單體、二聚體和三聚體gp120蛋白的百分比分別為10%、14%和76%,為后續(xù)研究蛋白的結(jié)構(gòu)和功能,以及研制包膜疫苗奠定了物質(zhì)與實驗基礎(chǔ)。
[1] Liu Y,Xu Y,Lou Z,Zhu J,Hu X,Gao GF,Qiu B,Rao Z,Tien P.Structural characterization of mumps virus fusion protein core.Biochem Biophys Res Commun,2006,348(3):916-922.
[2] Stephens CR,Waelbroeck H.Codon bias and mutability in HIV sequences.J Mol Evol,1999,48(4):390-397.
[3] Ledgerwood JE,Graham BS.DNA vaccines:a safe and efficient platform technology for responding to emerging infectious diseases.Hum Vaccin,2009,5(9):623-626.
[4] Binley JM,Wrin T,Korber B,Zwick MB,Wang M,Chappey C,Stiegler G,Kunert R,Zolla-Pazner S,Katinger H,Petropoulos CJ,Burton DR.Comprehensive cross-clade neutralization analysis of a panel of anti-human immunodeficiency virus type 1 monoclonal antibodies.J Virol,2004,78(23):13232-13252.
[5] Wang S,F(xiàn)arfan-Arribas DJ,Shen S,Chou TH,Hirsch A,He F,Lu S.Relative contributions of codon usage,promoter efficiency and leader sequence to the antigen expression and immunogenicity of HIV-1 Env DNA vaccine.Vaccine,2006,24(21):4531-4540.