武彩霞,高學(xué)軍,李慶章,駱超超,畢微微,史琳琳,張 莉
(1.河北北方學(xué)院生命科學(xué)研究中心,河北 張家口 075000;2.東北農(nóng)業(yè)大學(xué)乳品科學(xué)教育部重點實驗室,哈爾濱 150030)
益生菌發(fā)酵飼料集益生菌功效與優(yōu)質(zhì)飼料優(yōu)點,在畜禽生產(chǎn)中具有廣闊應(yīng)用前景[1]??莶菅挎邨U菌作為發(fā)酵飼料益生菌之一,已廣泛用于生產(chǎn),具有增進畜禽生長性能和較強抗性等優(yōu)點,在飼料制粒、儲存及在胃腸道中作用穩(wěn)定并保持較高活性[2]。賴氨酸是人類和動物營養(yǎng)所必需限制性氨基酸,在動物體內(nèi)會影響其他氨基酸利用率。利用基因工程方法已經(jīng)成功地將富含賴氨酸基因[3]和富含蛋氨酸基因[4]分別單獨轉(zhuǎn)入枯草芽孢桿菌中,并通過發(fā)酵枯草芽孢桿菌提高發(fā)酵飼料中賴氨酸和蛋氨酸含量,本文旨在研究將另外一種高賴氨酸基因(cflr)轉(zhuǎn)入枯草芽孢桿菌中,以提高枯草芽孢桿菌中賴氨酸含量,并提高發(fā)酵飼料中賴氨酸含量。
1.1.1 原料
辣椒花藥(采自東北農(nóng)業(yè)大學(xué)香坊實驗實習(xí)基地);野生型枯草芽孢桿菌168(B.subtilis168)(ATCC27370)為本實驗室保存;E.coliTOP10和pMD18-T載體,購自大連寶生物科技有限公司;枯草芽胞桿菌表達載體pHT43購自Axygen公司。
1.1.2 藥品
Trizol試劑購自Invitrogen公司;PrimeScript RT-PCR Kit、SYBR?Premix Ex Taq? Ⅱ(Perfect Real Time)、ExTaq酶、T4DNA連接酶、DNA Marker、限制性內(nèi)切酶以及蛋白Marker,購自大連寶生物科技有限公司;氨芐青霉素、氯霉素、異丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)購自上海生工生物工程公司;L-賴氨酸標準品和1-氯-2,4-二硝基苯(CDNB)購自SIGMA公司;瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒購自Axygen公司;EA?SYspin細菌RNA快速提取試劑盒購自北京艾德萊生物科技公司;引物由北京英俊公司合成;其他試劑均為進口或國產(chǎn)分析純。
1.2.1 辣椒花藥總RNA提取
采用Trizol法提取總RNA,cDNA合成采用試劑盒方法(見寶生物PrimeScript RT-PCR Kit說明書)。
1.2.2 高賴氨酸基因CflrPCR擴增
根據(jù)文獻[5]和NCBI上報道CflrcDNA全序列(基因登錄號:EU367999),設(shè)計Cflr引物,分別在上游引物和下游引物5端添加XbaⅠ和SmaⅠ限制性內(nèi)切酶酶切位點(下劃線表示)。
上游引物為:5'GCTCTAGAAAAAGATGGGTT GTGGGGAAT 3'(XbaⅠ)
下游引物為:5'TCCCCCGGGTAAACTAATA?AATAGCCCTCTTCCC 3'(SmaⅠ)
以辣椒花藥cDNA為模板,進行CflrPCR擴增,反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性1 min,94℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸3 min,30個循環(huán);72℃總延伸10 min;4℃保溫。取5 μL PCR反應(yīng)產(chǎn)物進行1%瓊脂糖凝膠電泳。按Axygen凝膠回收試劑盒說明操作,對PCR產(chǎn)物進行回收純化。
1.2.3Cflr基因克隆和序列測定
將Cflr基因PCR擴增產(chǎn)物與pMD18-T載體進行連接,將其轉(zhuǎn)化于大腸桿菌TOP10感受態(tài)中,經(jīng)氨芐篩選后,挑取單菌落培養(yǎng)并提取質(zhì)粒,通過質(zhì)粒PCR和雙酶切鑒定,篩選出陽性克隆子,然后將陽性克隆子進行核酸序列測定(由北京英俊公司完成),測序結(jié)束后,用生物信息學(xué)軟件將所得測序序列和NCBI發(fā)布序列進行比對分析。
1.2.4 枯草芽胞桿菌中重組表達質(zhì)粒pHT43/Cflr構(gòu)建以及轉(zhuǎn)化
用XbaⅠ和SmaⅠ雙酶切Cflr基因PCR擴增片段并進行膠回收,然后用T4連接酶與同樣雙酶切后膠回收pHT43連接,構(gòu)建成重組質(zhì)粒pHT43/Cflr。通過化學(xué)轉(zhuǎn)化法將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)入Bacillus sub?tilis168中[6]。LB培養(yǎng)基中培養(yǎng),氯霉素篩選。
1.2.5 枯草芽孢桿菌中含有重組質(zhì)粒鑒定
挑取單菌落于5 mL LB(含氯霉素)培養(yǎng)基中培養(yǎng),提取質(zhì)粒[7],用XbaⅠ和SmaⅠ雙酶切鑒定,篩選陽性克隆子。
1.2.6 枯草芽孢桿菌中重組質(zhì)粒pHT43/Cflr在mRNA水平表達
將含有重組表達質(zhì)粒枯草芽孢桿菌在含有氯霉素LB培養(yǎng)基中培養(yǎng)至OD值為0.5~1.0時,加入1.0 mmol·L-1IPTG,取誘導(dǎo)0、2、12和24 h后菌體,用EASYspin細菌RNA快速提取試劑盒提取細菌總RNA,用于RT-PCR。
使用Primer Premier 5.0軟件設(shè)計引物,采用SYBR染料法檢測不同誘導(dǎo)時間后Cflr基因在mRNA水平表達情況,以B.subtilis16816S rRNA為內(nèi)參,檢測Cflr基因表達情況。反轉(zhuǎn)錄和熒光定量PCR程序參照說明書進行。引物設(shè)計為:16S rRNA F:GCGTGAGTGATGAAGGTTT,16S rRNA R:GCCGTGGCTTTCTGGTTA;CflrF:GAAAGAA ATGGTGGGAC,CflrR:CTACAGCAGCAACAGC。
1.2.7 枯草芽孢桿菌中重組質(zhì)粒pHT43/Cflr在蛋白水平表達
將含有重組表達質(zhì)??莶菅挎邨U菌在含有氯霉素LB培養(yǎng)基中培養(yǎng)至OD值為0.5~1.0時,加入1.0 mmol·L-1IPTG,誘導(dǎo)24 h后,制取蛋白樣,然后進行SDS-PAGE電泳,其濃縮膠濃度為5%,電泳電壓為80 V,分離膠濃度為12%,電壓為120 V。電泳結(jié)束后,用固定液固定蛋白膠45 min,用考馬斯亮藍進行染色,經(jīng)脫色液脫色后觀察表達后產(chǎn)物條帶。
1.2.8 HPLC檢測菌液中l(wèi)ys含量
測定菌液中表達蛋白所含lys含量,取經(jīng)過IPTG誘導(dǎo)24 h野生菌和重組菌菌液8 mL,按照GB/T 18246-2000[8]中酸水解法進行水解后,定容至50 mL。吸取1 mL濾液,分別置于50 mL離心管中,再分別吸取Na2CO3-NaHCO3pH 9.0緩沖液2 mL,混勻后,加入CDNB溶液各1 mL,混勻,經(jīng)0.22 μm濾膜過濾后,取10 μL直接上樣測定其中l(wèi)ys含量,試驗重復(fù)5次,取平均值。
1.2.9 數(shù)據(jù)處理
使用SPSS 17.0統(tǒng)計學(xué)軟件進行數(shù)據(jù)統(tǒng)計和處理,P<0.05和P<0.01表示差異顯著和極顯著。
擴增出Cflr片段如圖1所示,在720 bp處出現(xiàn)條帶,與預(yù)期大小相符,測序片段全長669 bp,將測序結(jié)果與NCBI上報道CflrcDNA全序列基因(基因登錄號:EU367999)進行同源性比對分析,結(jié)果同源性為99%。測序片段全長669 bp與NCBI報道序列比對,同源性達到99%。
圖1 Cflr基因PCR產(chǎn)物電泳圖譜Fig.1 PCR products ofCflrgene
重組質(zhì)粒pHT43/Cflr,如圖2所示,片段長為8 777 bp。將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到枯草芽胞桿菌中,提取陽性克隆子,進行雙酶切鑒定,見圖3,在720 bp處出現(xiàn)目條帶,條帶大小符合預(yù)測值,證明重組表達載體質(zhì)粒已經(jīng)成功轉(zhuǎn)入到枯草芽胞桿菌中。pHT43載體片段長度為8 057 bp。
圖2 枯草芽胞桿菌重組表達載體圖譜Fig.2 Map of recombinant expression vector
圖3 重組質(zhì)粒pHT43/Cflr鑒定圖譜Fig.3 Identification of the recombinant plasmid pHT43/Cflr
RT-PCR結(jié)果顯示,在IPTG誘導(dǎo)以后,Cflr基因在mRNA水平表達,見圖4。由圖4可知,Cflr基因在2、12 h時,mRNA水平與與未誘導(dǎo)前相比均表現(xiàn)為顯著差異,24 h時,可檢測到Cflr基因mRNA,但水平與未誘導(dǎo)前相比并未表現(xiàn)為顯著差異;同時也證明Cflr基因已成功轉(zhuǎn)入枯草芽孢桿菌中并表達。
將正??莶菅挎邨U菌、含空載體pHT43重組菌和含重組質(zhì)粒重組菌經(jīng)IPTG誘導(dǎo)培養(yǎng)24 h后終止,離心取菌體進行SDS-PAGE,如圖5所示,與對照組相比,在試驗組中出現(xiàn)明顯目的蛋白條帶(目的蛋白大小是24 ku),表明cflr基因在枯草芽孢桿菌中已成功表達。
圖4 cflr基因表達結(jié)果Fig.4 Expression of cflr gene
圖5 蛋白電泳檢驗枯草芽胞桿菌中目蛋白Fig.5 SDS-PAGE detection of expression cflr in Bacillus subtilis
圖6 HPLC測定菌發(fā)酵液中Lys含量Fig.6 Contents of lysine detected by HPLC in fermentation broth of bacterium
根據(jù)標準品各個濃度峰面積制作標準曲線如圖6a,給出回歸方程;Lys標準品衍生液HPLC結(jié)果如圖6b。Bacillus subtilisHPLC檢測結(jié)果和重組菌HPLC檢測結(jié)果見圖6c、6d。野生菌Lys含量是17.32 μg·mL-1,重組菌 Lys含量是 20.1 μg·mL-1,結(jié)果重組菌發(fā)酵液Lys含量比野生菌提高16.05%(n=5)。目峰出峰時間約在14.224 min。
本研究所用Cflr是高賴氨酸蛋白基因,該基因所編碼蛋白質(zhì)中賴氨酸含量為21.2%,是目前已知賴氨酸含量最高天然蛋白[5]?,F(xiàn)已報道天然存在高賴氨酸蛋白基因還有sb401、SBgLR、st901、tsb和wblrp,但這些基因所表達蛋白質(zhì)中賴氨酸含量都低于Cflr。為提高益生菌枯草芽孢桿菌作為飼料添加劑中賴氨酸含量,本研究從辣椒花藥中克隆Cflr基因,并利用基因工程手段將Cflr轉(zhuǎn)入枯草芽孢桿菌中,從而使枯草芽孢桿菌發(fā)酵液中賴氨酸含量提高16.05%。李學(xué)琳等從四棱豆中克隆wblrp基因,并將其轉(zhuǎn)入枯草芽孢桿菌中,使枯草芽孢桿菌發(fā)酵液中賴氨酸含量提高9.85%[3]。與之相比,本研究更進一步。目前關(guān)于Cflr研究不多,孫曉波等構(gòu)建高賴氨酸蛋白基因(Cflr)植物表達載體pAHC25-Cflr,并將其轉(zhuǎn)入植物小麥中[9]。而本研究將Cflr轉(zhuǎn)入微生物枯草芽孢桿菌中屬首例。
枯草芽孢桿菌遺傳背景清楚[10],蛋白分泌機制健全、生長迅速、培養(yǎng)簡便、不分泌內(nèi)毒素,具有較好生物安全性,是美國食品藥物管理局(FDA)和中國農(nóng)業(yè)部批準使用安全菌株;可直接將表達產(chǎn)物分泌到培養(yǎng)基中,產(chǎn)物便于提取和純化,是表達外源基因良好受體菌。本試驗采用野生型宿主菌B.subtilis168是枯草芽孢桿菌表達系統(tǒng)中最為廣泛應(yīng)用的宿主菌,在本試驗中外源基因表達成功(在24 ku處出現(xiàn)目條帶)。益生菌枯草芽孢桿菌作為外源蛋白宿主菌已成功表達多種類型基因[11],Liu等實現(xiàn)芽孢桿菌akibiⅠ-1內(nèi)切葡聚糖酶在枯草芽孢桿菌168中過量表達[12];Abbasi-Hosseini等克隆克勞氏芽孢桿菌中堿性絲氨酸蛋白基因,并在枯草芽孢桿菌WB600中成功表達,重組枯草芽孢桿菌比原始菌株產(chǎn)堿性蛋白酶活性增強3倍[13];李爽等構(gòu)建pHT43-VP2重組表達載體,并轉(zhuǎn)化入枯草芽孢桿菌WB600中誘導(dǎo)表達。結(jié)果表明在69 ku處存在目蛋白[14];郭菁等將構(gòu)建重組質(zhì)粒通過化學(xué)轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)入枯草芽孢桿菌蛋白酶缺失菌株WB600中,轉(zhuǎn)化子pWT22-BLG4/WB600在IPTG(1.0 mmol·L-1)誘導(dǎo)下,發(fā)酵液上清中蛋白酶活達到620 U·mL-1,高于出發(fā)菌株G4BLG4酶活(240 U·mL-1)[15];外源基因轉(zhuǎn)入枯草芽孢桿菌中例子還有很多,本研究在枯草芽孢桿菌中表達植物來源高賴氨酸蛋白基因Cflr,可為今后開展高賴氨酸蛋白基因在益生菌中高效表達和應(yīng)用提供理論基礎(chǔ)。
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