孟繁杰,曹 斌,馮增利,王海剛,馬順茂,趙文增,尹東劍
無論是在自然發(fā)生的肝癌中還是在人工鼠肝癌模型中,都頻繁檢測到了H-ras的突變[1-2]。文獻(xiàn)報(bào)道,在肝癌中H-ras的突變率在29.3%~57.1%[3-4]。抑制突變的H-ras的表達(dá),可有效抑制肝癌細(xì)胞的生長[5]。因此,對肝癌的基因治療可以通過抑制突變的H-ras而實(shí)現(xiàn)。本研究采用RNA干擾(RNA interference,RNAi)技術(shù),通過檢測BEL7402肝癌細(xì)胞株H-ras的突變類型,進(jìn)而設(shè)計(jì)出特異性的短發(fā)夾RNA(shRNA)質(zhì)粒表達(dá)載體,從而達(dá)到只抑制第12位密碼子GGC突變形式為GTT的H-ras,而不影響野生型H-ras的目的。
1.1材料肝癌細(xì)胞株BEL7402(H-ras第12位密碼子GGC突變?yōu)镚TT)和SMMC7721(H-ras第12位密碼子為野生型的GGC),均購自美國American Type Culture Collection(ATCC)。pSilencerTM4.1-CMV hygro試劑盒購自美國Ambion公司。大腸埃希菌(E.coli) DH5α為本室保存。質(zhì)粒中量抽提純化的試劑盒購自Promrga公司。RPM 1640培養(yǎng)基購自Sigama公司。Trizol購自Invitrogen公司。cDNA第一鏈反應(yīng)試劑盒購自Fermentas公司。PCR引物及插入序列由上海生工生物工程公司合成。H-ras小鼠單克隆抗體購自Lab Vision公司。辣根過氧化酶標(biāo)記的羊抗鼠二抗購自北京中杉金橋生物技術(shù)有限公司??捡R斯亮藍(lán)蛋白分析試劑盒購自南京建成生物公司。
1.2方法
1.2.1細(xì)胞株H-ras的mRNA表達(dá)檢測將BEL7402和SMMC7721細(xì)胞用Trizol消化,按Trizol說明書提取總RNA備用。紫外分光光度計(jì)定量總RNA,調(diào)整濃度為1 μg/μl。按cDNA第一鏈反應(yīng)試劑盒說明書采用隨機(jī)引物法合成cDNA。H-ras的引物序列:上游5′-GCGCCTGTGAACGGTGG-3′,下游5′-TGGGCACGTCATCCGAGTCC-3′,擴(kuò)增長度397 bp。PCR 參數(shù):94 ℃ 10 min變性,94 ℃ 1 min,59 ℃ 1 min,72 ℃ 1 min,30個(gè)循環(huán),72 ℃延伸5 min。PCR產(chǎn)物于2%瓊脂糖電泳,電壓100 V,45 min。
1.2.2編碼shRNA的插入片段的合成根據(jù)GenBank數(shù)據(jù)庫提供的已知H-ras基因[NM_001130442.1]的序列,選擇一段19個(gè)堿基的核苷酸片段,把第12位密碼子的GGC換成GTT作為靶序列,將其正義和其互補(bǔ)序列分別連接在回路TTCAAGAGA堿基的兩端,在5′端和3′端加上固定的黏性末端,人工合成一對編碼針對H-rasVal12的突變特異性shRNA的DNA插入片段。用pSilencerTM4.1-CMV hygro試劑盒提供的shRNA的DNA插入片段作為對照。經(jīng)Blast同源序列分析軟件證實(shí)與人類其他基因無同源性。
1.2.3質(zhì)粒表達(dá)載體的構(gòu)建、擴(kuò)增和純化將合成的編碼針對H-rasVal12的突變特異性shRNA的DNA插入片段按說明書與載體pSilencerTM4.1-CMV hygro連接構(gòu)建重組質(zhì)粒。將重組質(zhì)粒以常規(guī)方法轉(zhuǎn)化感受態(tài)E.coli DH5α后,在含有氨芐西林的LB固體培養(yǎng)皿里培養(yǎng),12 h后挑取單克隆搖菌,重組質(zhì)粒經(jīng)測序證實(shí)。兩種重組質(zhì)粒的擴(kuò)增及純化參照Promega質(zhì)粒中量抽提純化試劑盒中的說明書進(jìn)行。
1.2.4細(xì)胞的H-ras突變鑒定、培養(yǎng)和轉(zhuǎn)染用張峰等[6]所述方法鑒定H-ras的序列。SMMC7721和BEL7402 細(xì)胞株用含10%胎牛血清的RPM 1640培養(yǎng)基于37 ℃、5%二氧化碳(CO2)孵箱內(nèi)培養(yǎng),當(dāng)細(xì)胞生長至80%融合時(shí)傳代。轉(zhuǎn)染前1 d,將對數(shù)生長期的細(xì)胞以3×105個(gè)/孔接種于6孔板,于24 h內(nèi)細(xì)胞融合達(dá)40%~60%時(shí)按Lipofectamine2000說明書進(jìn)行轉(zhuǎn)染。轉(zhuǎn)染4 h后,用含胎牛血清的RPM 1640培養(yǎng)基取代轉(zhuǎn)染混合液,在上述條件下繼續(xù)培養(yǎng)48 h。
1.2.5免疫印跡(Western blot)法檢測質(zhì)粒表達(dá)載體對H-ras蛋白表達(dá)的影響按Trizol說明書提取總胞質(zhì)蛋白,按孟繁杰等[7]所述方法進(jìn)行Western blot操作。結(jié)果用Gel 1D凝膠圖像分析系統(tǒng)分析測定其光密度。計(jì)算各個(gè)樣本H-ras蛋白的積分光密度。
1.2.6流式細(xì)胞儀分析細(xì)胞凋亡情況細(xì)胞轉(zhuǎn)染shRNA質(zhì)粒表達(dá)載體48 h后,按孟繁杰等[8]所述方法處理細(xì)胞,上流式細(xì)胞儀進(jìn)行細(xì)胞凋亡分析。
2.1細(xì)胞株H-ras的mRNA表達(dá)檢測SMMC7721和BEL7402細(xì)胞株均檢測到H-ras的表達(dá)(見圖1)。
圖1 SMMC7721和BEL7402 細(xì)胞株均檢測到H-ras的表達(dá)Figure 1 The H-ras gene expression detected in cell lines SMMC7721 and BEL7402
2.2細(xì)胞的H-ras突變經(jīng)測序證實(shí),SMMC7721的H-ras基因?yàn)橐吧停涞?2位密碼子為GGC,編碼甘氨酸(Gly);BEL7402的H-ras基因第12位密碼子由GGC突變?yōu)镚TT,編碼纈氨酸(Val)(見圖2)。
圖2 BEL7402的H-ras基因第12位密碼子由GGC突變?yōu)镚TTFigure 2 The GGC mutate into GTT of 12th codon of H-ras gene in cell lines BEL7402
2.3質(zhì)粒表達(dá)載體的構(gòu)建兩種質(zhì)粒表達(dá)載體的序列見圖3。
圖3 H-rasVal12的2個(gè)特異性質(zhì)粒表達(dá)載體序列Figure 3 Two sequence of the specific plasmid expression vector of the gene H-rasVal12
2.4質(zhì)粒表達(dá)載體對H-ras蛋白表達(dá)的影響圖4為Western blot檢測結(jié)果,可見轉(zhuǎn)染前、后SMMC7721的H-ras蛋白表達(dá)量(以光密度值表示)分別為(1 752±21)和(1 736±28),差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=0.474,P=0.646)。轉(zhuǎn)染了H1-shRNA的BEL7402的H-ras蛋白表達(dá)量轉(zhuǎn)染前、后分別為(1 221±11)和(920±11),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=20.126,P<0.01)。轉(zhuǎn)染了H2-shRNA的BEL7402的H-ras蛋白表達(dá)量轉(zhuǎn)染前、后分別為(1 201±10)和(872±10),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=23.477,P<0.01)。H1-shRNA和H2-shRNA組H-ras蛋白表達(dá)下調(diào)了62.8%和63.4%。
圖4 Western blot檢測H-ras蛋白的表達(dá)Figure 4 The expression of H-ras protein detected by Western blot
圖5 轉(zhuǎn)染質(zhì)粒表達(dá)載體前后BEL7402的流式細(xì)胞儀結(jié)果Figure 5 The FCM of cell lines BEL7402 before and after tansfected by different plasmid expression vector
原發(fā)性肝細(xì)胞癌是常見惡性腫瘤之一,占我國惡性腫瘤死亡率的第二位,手術(shù)切除后5年復(fù)發(fā)率達(dá)54.1%~61.5%。目前,雖然肝癌的治療已取得了很大進(jìn)展,但復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移仍是進(jìn)一步改善預(yù)后的障礙。如何控制肝癌的復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移,已成為提高肝癌患者預(yù)后的瓶頸?,F(xiàn)有的治療手段效果一般,臨床上迫切需要針對肝癌的新的更有效的治療方法。隨著近年人們對肝癌相關(guān)基因的進(jìn)一步了解和基因治療的迅速發(fā)展,同其他惡性腫瘤一樣,探索肝癌的基因治療已具有極其重要的現(xiàn)實(shí)意義。研究表明,肝癌細(xì)胞中存在H-ras基因的突變和高表達(dá),并且與肝癌的復(fù)發(fā)、轉(zhuǎn)移有著密切的關(guān)系。Liao等[5]學(xué)者通過反義核酸技術(shù)抑制肝癌細(xì)胞株突變的H-ras基因后,觀察到肝癌細(xì)胞株的增殖力下降,凋亡率上升,并抑制裸鼠實(shí)體瘤的生長。其他學(xué)者的動(dòng)物實(shí)驗(yàn)也證實(shí),抑制了肝癌細(xì)胞株突變的H-ras基因后肝癌的生長和轉(zhuǎn)移力下降,為肝癌的基因治療提供了一個(gè)切入點(diǎn)。但由于各種轉(zhuǎn)基因技術(shù)(如反義核酸技術(shù)和核酶技術(shù))難以同時(shí)滿足特異抑制目的基因和避免轉(zhuǎn)基因引起的干擾素反應(yīng)問題,臨床試驗(yàn)均告失敗。
隨著RNAi技術(shù)的產(chǎn)生,越來越多的研究表明用RNAi技術(shù)可有效地、特異地抑制目的基因的表達(dá)。即使目的基因只有一個(gè)堿基的不同,它也能將其有效特異抑制,而且?guī)缀醪灰鸶蓴_素反應(yīng)。這一發(fā)現(xiàn)有效地解決了上述難題。繼Brummelkamp等[9]最先用逆轉(zhuǎn)錄病毒介導(dǎo)的RNAi技術(shù)抑制了第12位密碼子突變形式為GTT的胰腺癌K-ras基因,未發(fā)現(xiàn)對野生型K-ras的影響后,眾多學(xué)者開始嘗試用這一技術(shù)來達(dá)到特異抑制目的基因的目的。用RNAi技術(shù)來抑制其他與肝癌有關(guān)的基因的研究與日俱增,但至今尚未有人用該技術(shù)來抑制肝癌細(xì)胞中的H-ras基因。Yang等[10]已經(jīng)用逆轉(zhuǎn)錄病毒介導(dǎo)的shRNA成功抑制了人卵巢癌細(xì)胞珠中的H-ras基因,提示用RNAi技術(shù)抑制肝癌細(xì)胞中H-ras基因的可行性。
RNAi是指短的雙鏈RNA(double-stranded RNA,dsRNA)可以降解內(nèi)源的同源RNA而使相應(yīng)基因沉默的現(xiàn)象。該現(xiàn)象在1998年由Fire等[11]首次報(bào)道,研究者發(fā)現(xiàn)只要有少量dsRNA分子存在,就足以幾乎完全消除與dsRNA同源的基因的表達(dá),導(dǎo)致基因沉默。這是生物進(jìn)化過程中細(xì)胞的一種保護(hù)性機(jī)制,可避免外源性基因在宿主細(xì)胞內(nèi)表達(dá),同時(shí)對于細(xì)胞內(nèi)宿主基因的表達(dá)和細(xì)胞發(fā)育發(fā)揮重要作用。RNA干擾起始于RNA酶Ⅲ家族成員DICER識別雙鏈RNA并將其切割成21~23個(gè)核苷酸片斷。然后,RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合體(RNA-inducing silencing complex,RISC)以這些片斷的一條鏈為模板切割互補(bǔ)的mRNA。目前,載體策略已逐漸成為進(jìn)行RNAi研究的首選。
本研究根據(jù)GenBank數(shù)據(jù)庫提供的已知H-ras基因[NM_001130442.1]的序列, 選擇了兩段19個(gè)堿基的核苷酸片段,把第12位密碼子的GGC換成GTT作為靶序列,人工合成兩對編碼針對H-rasVal12的突變特異性shRNA的DNA插入片段。然后將其插入Ambion公司的pSilencerTM4.1-CMV hygro載體,得到針對H-rasVal12的突變特異性shRNA的質(zhì)粒表達(dá)載體,將其轉(zhuǎn)入體外培養(yǎng)的SMMC7721和BEL7402細(xì)胞。Western blot檢測顯示,轉(zhuǎn)染后有效地抑制了H-ras蛋白的表達(dá),而對野生型的H-ras蛋白表達(dá)無影響。細(xì)胞凋亡流式細(xì)胞儀檢測結(jié)果顯示,其可增加BEL7402細(xì)胞的凋亡率。針對H-rasVal12的編碼突變特異性shRNA的質(zhì)粒表達(dá)載體的構(gòu)建成功,為進(jìn)一步研究H-ras基因在肝癌中的具體作用機(jī)制和肝癌的基因治療奠定了基礎(chǔ)。
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