董德鑫,李漢忠,石冰冰,張玉石,徐維鋒
(中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)院泌尿外科,北京100730)
腎盂尿路上皮癌術(shù)前診斷困難,需要與腎盂里的凝血塊和息肉等進(jìn)行鑒別,而尿找瘤細(xì)胞等確診陽性率較低[1]。本研究利用基質(zhì)輔助激光解吸附電離飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)(matrix assisted laser desorption ionization time of flightmass spectrometry,MALDI-TOFMS)比較腎盂尿路上皮癌組和對(duì)照組的血清樣本,尋找對(duì)于腎盂尿路上皮癌具有鑒別意義的血清差異蛋白峰,彌補(bǔ)尿找瘤細(xì)胞陽性率不高的缺點(diǎn),提高腎盂尿路上皮癌的術(shù)前診斷率。
1.1 研究對(duì)象:腎盂尿路上皮癌組:2010年12月至2011年4月期間,于北京協(xié)和醫(yī)院泌尿外科病房采集腎盂癌患者術(shù)前血清樣本共計(jì)16例,其中男性10例,女性6例,年齡范圍54~79歲,平均70.3歲。所有患者均行腹腔鏡腎盂癌根治術(shù),術(shù)后病理確診為腎盂尿路上皮癌。對(duì)照組:采集非腎盂癌對(duì)照組術(shù)前標(biāo)本共計(jì)11例,均為男性,年齡范圍34~77歲,平均52.5歲。術(shù)后病理確診為腎囊腫4例,腎結(jié)石4例,良性前列腺增生3例。
1.2 標(biāo)本收集:清晨空腹?fàn)顟B(tài)抽取肘靜脈血3~5 mL,置入真空無抗凝劑BD采血管,2 000 r/min,離心10 min后吸取上層血清,分裝入艾本德管后置于-80℃低溫冰箱凍存。
1.3 實(shí)驗(yàn)步驟:200μL樣品管加入10μL磁珠結(jié)合緩沖液、10μL磁珠和5μL血清吸打混勻,分離后加入100μL磁珠清洗緩沖液,重復(fù)上述步驟兩次,加入5μL磁珠洗脫緩沖液,分離后將上清液移入新的0.5μL樣品管,加入5μL磁珠穩(wěn)定緩沖液并吸打混勻。
取1μL標(biāo)準(zhǔn)品與10μL基質(zhì)混合,后取1μL混合液點(diǎn)在Anchorchip靶標(biāo)準(zhǔn)品位置。采用美國(guó)AutoflexTMMALDITOF-MS質(zhì)譜儀,不同結(jié)晶點(diǎn),多點(diǎn)采集,累加5~10個(gè)結(jié)晶點(diǎn)數(shù)據(jù)。取磁珠處理后的樣品,同標(biāo)準(zhǔn)品點(diǎn)樣方法,結(jié)果分子量偏差小于100 ppm。
1.4 結(jié)果判定:根據(jù)整體波形特點(diǎn),剔除不合格圖譜,并對(duì)低分子量區(qū)間波峰分子量進(jìn)行校正。采集分子質(zhì)量區(qū)間范圍為1~10 ku,選擇標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行分子質(zhì)量校正。利用Clin-ProTools2.2軟件對(duì)質(zhì)譜圖的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,篩選血清差異蛋白峰,建立腎盂尿路上皮癌的診斷模型。
2.1 腎盂尿路上皮癌與對(duì)照組之間血清差異蛋白峰篩選:質(zhì)譜儀采集分子質(zhì)量區(qū)間1~10 ku范圍內(nèi)全部可識(shí)別蛋白峰127個(gè),凝膠模擬示意圖(圖1),具有顯著差異的蛋白峰6個(gè),分子質(zhì)量分別為 4074.14、145.15、7475.45、1546.94、2547.55和4592.11(P<0.05)。
2.2 遺傳算法建立腎盂尿路上皮癌診斷模型:利用ClinPro-Tools2.2軟件通過遺傳算法優(yōu)化選擇,篩選出符合條件的14個(gè)差異蛋白峰建立診斷模型(表1),交叉驗(yàn)證后識(shí)別能力為100%。
圖1 兩組樣本血清差異蛋白峰凝膠模擬示意圖Fig 1 Gel simulation diagram of differential protein peaks of two samp les of serum
表1 篩選出符合條件的14個(gè)差異蛋白峰建立診斷模型Table 1 The diagnosismodel is established by 14 differentially expressed proteins
腎盂尿路上皮癌是發(fā)生在腎盂或腎盞上皮的惡性腫瘤,約占所有腎腫瘤的10%左右。本病大多數(shù)為尿路上皮癌,尿路上皮癌可在任何被覆有移行上皮的尿路部位先后或同時(shí)出現(xiàn)?;颊甙l(fā)病年齡多在40歲以上,男女比例約為3∶1,左右發(fā)病無明顯差異,雙側(cè)發(fā)病者約2% ~4%[2]。
約70%~90%的腎盂移行細(xì)胞癌患者早期臨床表現(xiàn)的重要癥狀為無痛性肉眼血尿,少數(shù)病人因腫瘤或凝血塊阻塞腎盂輸尿管而引起腰部不適、隱痛及脹痛。腎盂癌術(shù)前診斷困難,尤其與腎盂里的息肉、血塊等良性病變鑒別診斷困難,而尿找瘤細(xì)胞等檢查陽性率偏低。腎盂占位的術(shù)前診斷不同,采取的手術(shù)方式截然不同。
MALDI-TOFMS技術(shù)是在新近發(fā)展起來的蛋白質(zhì)組學(xué)新技術(shù),采集的差異蛋白峰分子質(zhì)量范圍在1~10 Da,結(jié)果中許多在統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著差異的蛋白質(zhì)分子質(zhì)量在5000 Da以下,MALDI-TOFMS技術(shù)在尋找小分子量差異蛋白上的優(yōu)勢(shì)明顯[3]。遺傳算法是近些年發(fā)展起來的一種全局優(yōu)化算法,借用了生物遺傳學(xué)的觀點(diǎn),通過自然選擇、遺傳及變異等作用機(jī)制,實(shí)現(xiàn)個(gè)體的適應(yīng)性提高。本研究利用ClinPro-Tools2.2軟件對(duì)質(zhì)譜圖的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,就是利用遺傳算法進(jìn)行組合優(yōu)化,篩選多個(gè)差異蛋白峰,建立腎盂尿路上皮癌的診斷模型。該診斷模型敏感性和特異性較高。
本研究是應(yīng)用蛋白組學(xué)對(duì)腎盂尿路上皮癌的初步研究,應(yīng)用蛋白組學(xué)技術(shù)篩選差異蛋白峰,并建立腎盂尿路上皮癌的診斷模型具有較高的敏感性和特異性,可以彌補(bǔ)尿找瘤細(xì)胞陽性率不高的缺陷,有利于腎盂尿路上皮癌的早期診治。
[1]Giebel R,Worden C,Rust SM,et al.Microbial fingerprinting using matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flightmass spectrometry(MALDI-TOF MS)applications and challenges[J].Adv Appl Microbiol,2010,71:149-184.
[2]Raman JD,Scherr DS.Management of patients with upper urinary tract transitional cell carcinoma[J].Nat Clin Pract Urol,2007,4:432 -443.
[3]Wong MY,Yu KO,Poon TC,etal.Amagnetic bead-based serum proteomic fingerprintingmethod for parallel analytical analysis andmicropreparative purification[J].Electrophoresis,2010,31:1721-1730.