齊 爾(綜述),蔣更如(審校)
(上海交通大學醫(yī)學院附屬新華醫(yī)院腎臟內科,上海200092)
IgA腎病(IgA nephropathy,IgAN)是青壯年腎功能不全的重要病因[1],占我國原發(fā)性腎小球腎炎的20%~45.26%[2]。IgAN 遺傳背景的研究主要分為兩大類:以散發(fā)性IgAN為研究對象,選取候選基因進行有關基因多態(tài)性研究的相關分析;以家族聚集性IgAN為研究對象,利用遺傳標志進行基因定位和克隆的連鎖分析。作為一種復雜性疾病模型,不完全外顯遺傳可通過要求附加的遺傳或環(huán)境因素對疾病的臨床表現(xiàn)加以闡釋?,F(xiàn)就IgAN的遺傳學研究方法予以綜述。
1.1 家族聚集性研究 家族聚集起病及發(fā)病率的人種差異均提示遺傳因素為重要致病機制之一。發(fā)病率的人種差異表明人群中存在可變頻率的易患基因。1973年,de Werra等報道了首個IgAN家系,隨后的研究發(fā)現(xiàn)家族性IgAN占IgAN的10%~15%[3]。以往研究認為家族性較散發(fā)性IgAN預后較差,進展到終末期腎臟病的患者比例較高。近年來,研究顯示兩者預后類似。亞洲人IgAN的發(fā)病率高于白種人,在非洲發(fā)病率很低[4]。擴大的家族性IgAN家系已遍及世界各地,包括美國、法國、加拿大、意大利、澳大利亞和黎巴嫩[5]。這些特征均提示遺傳因素參與IgAN的致病過程。家族性IgAN為常染色體顯性遺傳[6]。以家族性IgAN為研究對象,采用全基因組掃描和連鎖分析,最終將IgAN致病基因定位于6q22~23約6.5 cm的區(qū)間,并命名為IgAN1[7]。其真正致病或易患基因目前仍然不清。多數(shù)學者認為,以家族性IgAN為研究對象,縮小上述定位區(qū)間并最終將其致病基因定位和克隆是最有望獲得致病和(或)易患基因的研究。最近在日本的全基因組分析發(fā)現(xiàn),位于11號染色體上11q13.2~q13.4的IGHMBP2基因與IgAN的遺傳易患性有關,單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)(G34448A)引起氨基酸從谷氨酰胺向賴氨酸轉換,引起免疫球蛋白類別轉換,使攜帶有A等位基因的患者血清IgA水平升高,從而增加了患IgAN的風險。
1.2 連鎖分析 對IgAN家系進行連鎖分析是定位致病基因的主要方法之一。連鎖分析的原理是通過估計某種表型與遺傳標志物在子代中的重組率,計算兩者之間的連鎖程度和遺傳距離,從而確定該表型致病基因在染色體上的位置。在一個典型的全基因組連鎖掃描中,高達400微衛(wèi)星體或等價于10 000 SNP的標志物等距跨越全基因組,用以篩查家庭中具疾病表型的標記隔離物。其缺點是對于中效或微效致病基因的定位效能不足,對表型錯誤非常敏感,在檢測對疾病風險影響較大的罕見基因突變方面,其力量有限。IgAN家族形式尚未確定,因為受累家庭成員相關的尿檢異常是輕微或間歇性的,導致無法明確區(qū)分未受累的高危親屬。經腎活檢的系統(tǒng)篩查不能證明無癥狀的高危親屬即是家族性疾病,必須依賴不甚準確的表型,如鏡下血尿等。另據(jù)觀察IgAN與薄基膜病的家庭共同出現(xiàn),薄基膜病是Ⅳ型膠原基因的雜合突變(COL4A3/COL4A4)引起的一種常染色體顯性遺傳疾?。?]。由于缺乏腎活檢或無法直接測序很大的膠原蛋白的基因,薄基膜病不能可靠地在IgAN患者的親屬中排除。無法準確區(qū)分受累和未受累人群是常見的復雜性狀的連鎖研究,降低了研究把握度。在不同人種中進行的連鎖分析研究得到的結果各不相同,提示家族性IgAN可能存在多個易患基因,這些基因和環(huán)境因素共同決定患者的表型。
1.3 關聯(lián)研究 遺傳關聯(lián)研究通常涉及一些散發(fā)病例和一組不相關的控制因素。群體關聯(lián)研究的前提是人類種群繼承來自遠祖的易患性等位基因,這些等位基因并未純化,從而增大了患病的風險,導致人群中一個比較高的頻率(常見變體/共同疾病假說)。符合這一前提,關聯(lián)研究局限于探究常見疾病相關的遺傳變異(即人群的頻率>5%)。因此,該關聯(lián)研究方法可以識別中度至相對較小效應的變異型,與連鎖分析相比,可能是不太敏感的位點異質性或表型設定誤差。關聯(lián)研究的策略主要有兩種:候選基因關聯(lián)研究和全基因組關聯(lián)研究(genome-wide association studies,GWAS)。
1.3.1 候選基因關聯(lián)研究 該研究需收集患者及正常對照組的DNA,對可能的易患基因進行檢測,以確定兩組是否存在差異。候選基因關聯(lián)研究只探討某些特定基因多態(tài)性,這些特定基因是在涉及疾病發(fā)病機制的先驗假設基礎上經多重測試和報告偏倚選出的。IgAN的許多候選基因已經被提出,大都是在IgAN進展的背景而非因果關系的背景下研究的。此外,由于缺乏有關疾病發(fā)病機制的研究,大部分候選基因的預測是基于罕有的IgAN的證據(jù)進行的。在過去的15年,有123個 IgAN的候選基因關聯(lián)研究發(fā)表在PubMed醫(yī)學索引。其中,39例(31%)研究IgAN相關的基因多態(tài)性、易患性,40例(32%)研究與疾病的嚴重程度、進展或并發(fā)癥相關,44例(35%)研究其易患性和進展的風險。所有研究中,約有1/3涉及腎素-血管緊張素系統(tǒng)相關基因的多態(tài)性。國內外研究顯示,候選基因的選擇主要集中在腎素-血管緊張素系統(tǒng)相關基因(血管緊張素轉換酶[9])、免疫識別相關基因(人類白細胞抗原)、IgAFc受體(CD89)和細胞因子相關基因(白細胞介素1、轉化生長因子β1、腫瘤壞死因子、P選擇素和 Megsin等)。由于候選基因領域的不足及變量SNP覆蓋率過低(如幾項研究只針對一個單一的基因多態(tài)性進行研究),覆蓋面不足8萬的SNP位點,至今只有一組試圖檢測整個基因組[10-11]。研究表明,只要采用足夠的樣本量,嚴格的疾病表型分類、合理的候選基因選擇以及建立表型與多個候選基因基因型之間的相關分析,并引入流行病學研究概念和方法,基因多態(tài)性的相關研究仍然是IgAN的遺傳背景研究中重要的研究手段。
1.3.2 GWAS GWAS是從人類全基因組范圍內的序列變異中篩選出與疾病性狀關聯(lián)的SNPs,進一步對致病/易患基因進行定位。GWAS無需像候選基因法預先假設致病/易患基因,而是在患者組和對照組中比較全基因組范圍內所有變異的等位基因頻率,從中發(fā)現(xiàn)與疾病關聯(lián)的序列變異或DNA結構異常。GWAS提供了一個恰當?shù)幕蚪M檢測和正確的人口分層檢查。復雜性疾病在遺傳學領域迅速發(fā)展,新一輪的IgAN基因研究即將開始??焖俣袃r值的>1萬多態(tài)性的人類基因組篩選現(xiàn)已可行,這促進了高分辨率、高效的全基因組遺傳關聯(lián)研究。在GWAS中,一個密集的SNPs染色體圖用以檢測相關性狀特點。通常大多優(yōu)勢表型的對照組(每組1000例)需要發(fā)現(xiàn)基因突變,獨立的同類組需要復制結果[12]。GWAS所面臨的主要問題是多種假設檢驗和群體分層的比例分析等挑戰(zhàn)。這些問題都已經在遺傳學界得到解決,其嚴格的標準現(xiàn)已被廣泛認同[13]。GWAS本身也只限于檢測相對普遍的易患性等位基因。
除GWAS外,其他基因方法通常是以基因鑒定為目的的整合。這些方法包括結構重組、全基因組表達和深度測序數(shù)據(jù)分析??截悢?shù)變異已確認為人類遺傳變異的重要來源。對小的插入、刪除和復制整個基因組片段的全面研究,可通過現(xiàn)代SNP基因分型平臺實現(xiàn)[14]。這與IgAN相關,因為結構突變涉及免疫介導的幾個疾病,如銀屑病或系統(tǒng)性紅斑狼瘡[15]??截悢?shù)變異全基因組分析可能與 IgAN的第一GWAS同時出現(xiàn)。全基因組轉錄圖是另一種有助于剖析IgAN的遺傳學基礎方法?;蚨ㄎ缓突虮磉_分析的結合提供了一個了解復雜性狀的功能強大的工具,這些技術產生了獨立的信息,使候選基因相互優(yōu)化。這些信息可通過GWAS整合,以便更好地明確導致疾病易患性的功能缺陷。此外,新的整合基因的方法為聯(lián)合遺傳分析、基因表達、生化表型的獲取途徑和操縱發(fā)病機制的分子網絡提供了條件[16]。此法非常適合IgAN的遺傳研究,因為其表達可以在血清IgA1分泌細胞進行,使檢測一個單一的細胞類型和缺陷型血清IgA1糖基化特定的生化表型成為可能。最后,高通量測序技術迅速發(fā)展,高效的全基因組深度測序逐漸可行。直接序列分析為檢測促進常見復雜性疾病發(fā)病的罕見遺傳變異型帶來了希望[17]。由于變異型的識別可通過GWAS對罕見表型的遺傳作出解釋,這類研究的一般方法和統(tǒng)計工具仍在發(fā)展中,將為復雜性狀的遺傳測定提供新的突破口。
IgAN必須通過腎活檢確診,這是家族性研究的主要障礙,是大樣本群體遺傳關聯(lián)研究的限制步驟。雖然大部分IgAN患者的血清IgA水平增高,但缺乏臨床診斷試驗所必需的敏感性和特異性。最近血清IgA1糖基化異常的研究提供了一個診斷IgAN更可靠的生物學標志物。
人類血清IgA1代表兩個IgA獨特的結構和功能的亞類之一。與IgA2、IgM和IgG不同,血清IgA1具有一個重鏈,該重鏈包含一個在第一和第二恒定區(qū)域之間的獨特鉸鏈區(qū),這是3~5個O-聚糖鏈段的重鏈連接的位置。循環(huán)血清IgA1上的O-聚糖由附有αβ1,3-半乳糖的N-乙酰半乳糖胺組成;兩者的殘留物都可能是唾液酸。終端半乳糖胺或唾液酸化的半乳糖胺等異常糖基化的半乳糖缺陷形式在IgAN的腎小球免疫復合物和循環(huán)復合物沉積中占主導地位[18]。
循環(huán)系統(tǒng)血清IgA1的O-聚糖的合成是分步進行的,起始于鉸鏈區(qū)絲氨酸或蘇氨酸半乳糖的連接,由半乳糖胺轉移催化。唾液酸殘基半乳糖胺、半乳糖或兩者共同連接在半乳糖上,O-糖鏈隨著這一過程而延長。聚糖結構由 α-2,6-唾液酸轉移酶 Ⅱ(ST6GalNAcⅡ)和 α-2,3-唾液酸轉移酶(ST3Gal)共同完成,分別將唾液酸連接于半乳糖胺和半乳糖殘基。另外,ST6GalNAcⅡ可以將唾液酸基添加到終端半乳糖胺上,這是一個阻止任何后續(xù)修改的步驟,也是O-聚糖合成的最后一步[19]。劃定血清IgA1糖基化途徑為遺傳關聯(lián)研究提供了新的邏輯候選基因。
最新研究表明,血清IgA1產生細胞是IgAN患者的半乳糖缺陷的血清IgA1水平增高的來源。異常糖化血清IgA1可以在這些細胞內檢測到,半乳糖缺陷的血清IgA1水平與特定免疫球蛋白的水平密切相關,這種免疫球蛋白是從同一個體外周血分離培養(yǎng)的血清IgA1產生細胞上清液中提取的。數(shù)據(jù)表明,異常糖基化不是因免疫復合物形成過程中血清IgA1的改變而產生,而是反映了特定血清IgA1產生細胞的缺陷。進一步研究并未發(fā)現(xiàn)任何具體的個體血清IgA1糖基化酶缺陷,但發(fā)現(xiàn)糖基化途徑的每步酶促反應向提高半乳糖缺陷的血清IgA1水平和唾液酸化的半乳糖胺產量轉化[20]??傊?,這些觀察結果將血清IgA1糖基化缺陷隔離到一個特定的細胞類型,并指出其紊亂可能起源于這些細胞的上游調控途徑,而非特定的糖基化酶。
當前基于凝集素酶聯(lián)免疫吸附試驗并用以檢測血清半乳糖缺陷型IgA1的研究已有了新進展。這種簡單而價廉的的血清酶聯(lián)免疫吸附為IgAN提供了第一個非侵入性篩選試驗,前景可觀。有研究組利用這種檢測來調查IgAN中半乳糖缺陷型血清IgA1有關家族聚集與散發(fā)形式的遺傳性[21]。半乳糖缺陷的血清IgA1(性狀變異的比例由遺傳因素決定)的遺傳統(tǒng)計學意義重大。半乳糖缺陷的血清IgA1種族隔離分析闡示了一個附加多基因組件的主導顯性基因遺傳。數(shù)據(jù)證明半乳糖缺陷的血清IgA1值可以識別IgAN患者的不同的亞群,其潛在疾病的發(fā)病機制可能有所不同。半乳糖缺陷型血清IgA1的遺傳性已在中國家族性與散發(fā)的成人IgAN患者中得到證實[22],最近已擴展至小兒IgAN和紫癜性腎炎領域。因此,血清IgA1糖基化異常是一種常見的遺傳缺陷,在全球范圍內為紫癜性腎炎、家族性及散發(fā)性IgAN的發(fā)病機制提供了一個統(tǒng)籌環(huán)節(jié)。此外,數(shù)據(jù)表明半乳糖缺陷的血清IgA1水平是疾病的前因,由于大多數(shù)水平升高家庭成員是無癥狀的,單純血清IgA1糖基化異常不足以導致IgAN,必須和其他輔助因子共同觸發(fā)免疫復合物的形成。
IgAN的基因組方法是通過檢測循環(huán)半乳糖缺陷的血清IgA1和生產抗多聚糖抗體的可用性以促進基因定位的研究。定量內表型能更密切地反映具體的致病過程,并提供更多的統(tǒng)計方法以檢測基因型的相關性,故常作為一種復雜疾病基因研究的首選。在定量連鎖分析中使用的統(tǒng)計方法是相對不敏感的特征異質性。結合連鎖方法、定量內表型也可用以提高基因的關聯(lián)研究。通過全基因組的連鎖和關聯(lián)方法,血清IgE水平的定量研究識別了新的哮喘易患基因位點[23]。目前IgAN的半乳糖缺陷型血清IgA1的定量基因研究正在進行中。
根據(jù)不同的發(fā)病機制IgAN動物模型類型較多。應用細菌外膜蛋白或外毒素作為免疫原引起體內IgA復合物增加,另外病毒及真菌外膜成分也可作為免疫原。自發(fā)性高IgA血癥小鼠具有自發(fā)性IgAN傾向,利用轉基因或基因剔除手段可以制作自發(fā)性IgAN模型。體內IgA主要在肝臟代謝,肝臟損傷可以作為誘導IgAN發(fā)病的途徑[24]。人們設計或發(fā)現(xiàn)了許多IgAN動物模型,用以揭示、驗證IgAN的發(fā)病機制。近年來IgAN的動物模型研究有了長足發(fā)展,如子宮球蛋白缺陷模型、FcαRI(CD89)轉基因小鼠模型、(New Zealand White×C57BL/6)F1-Bcl-2轉基因小鼠模型、HIGA小鼠模型、仙臺病毒感染模型等[25]。Zhang 等[26]分別采用子宮球蛋白基因剔除和RNA干擾子宮球蛋白表達的方法構建子宮球蛋白缺陷IgAN小鼠模型,這兩種小鼠均表現(xiàn)為大量蛋白尿、血尿和腎小球IgA及C3沉積,提示子宮球蛋白對小鼠腎臟具有保護作用。這些新模型所用動物的血清IgA特性與人類存在較大差別,誘導出的IgAN模型并不能完全代表人類IgAN的特點。一些基因工程模型,又因其技術要求高、價格昂貴限制了其運用。
IgAN是一種具遺傳學復雜性狀的疾病,其特定的基因尚未明確。復雜性狀的基因定位研究具有挑戰(zhàn)性,這些研究結果或許會打開新型靶向治療方法的大門。臨床應用涉及遺傳篩查、診斷、改善風險分層或在基因檢測的相關人群中選擇合適的腎移植供體。結合可利用的新型基因技術,IgAN生物標志物的發(fā)現(xiàn)有望改變IgAN的遺傳研究方法。遺傳研究的對照以及血、血清、腎組織的生物體系庫將成為此類研究的關鍵。國際間和跨學科領域的合作將成為識別IgAN特定遺傳因素的必要條件。
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