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雞傳染支氣管炎病毒H52、H120和M41株的PCR鑒別方法研究

2012-11-29 08:08楊承槐李俊平李啟紅夏業(yè)才蔣桃珍李慧姣
中國獸藥雜志 2012年11期
關鍵詞:鑒別方法毒株傳染性

于 靜,楊承槐,李俊平,李啟紅,劉 丹,夏業(yè)才,蔣桃珍,李慧姣

(中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所,北京 100081)

雞傳染性支氣管炎(Avian Infectious Bronchitis,IB)是由傳染性支氣管炎病毒(Infectious Bronchitis Virus,IBV)引起的雞的一種急性高度接觸性呼吸道傳染?。?],主要侵害雞的呼吸、泌尿生殖和消化系統(tǒng)等[2]。其特征癥狀為病雞咳嗽、噴嚏、氣管羅音;幼雞流鼻液;蛋雞產蛋數量和品質下降,是嚴重危害養(yǎng)禽業(yè)的主要傳染病之一。IBV易發(fā)生變異[3],分型復雜,不同毒株在毒力、致病性和組織嗜性上存在很大差異[4]。一些毒株用傳統(tǒng)的種毒鑒定方法很難準確鑒別,尤其是血清型相同,但基因型不同的毒株更難鑒別。

IBV M41、H52 和 H120 株均為 M41 血清型[5]。在種毒鑒定、活疫苗鑒別檢驗時均用單特異的M41型高免血清中和后接種雞胚,觀察雞胚是否出現病變,因此無法通過血清中和試驗區(qū)分三個毒株。本研究采用分子生物學技術[6],對IBV序列中差異較大的序列進行分析,建立了IBV三個毒株的PCR鑒別方法,提高了鑒別特異性。

1 材料與方法

1.1 毒種 IBV種毒株 H52、H120及 M41株,雞傳染性法氏囊病病毒B87、火雞皰疹病毒Fc-126株以及新城疫病病毒La Sota株、雞痘病毒鵪鶉化弱毒株,均由中國獸醫(yī)微生物菌種保藏管理中心保存。

1.2 試劑 病毒RNA抽提試劑盒、病毒DNA提取試劑盒為OMEGA公司產品;反轉錄酶系統(tǒng)為Invitrogen公司產品;限制性內切酶NaeⅠ為大連寶生物公司產品;PCR產物純化試劑盒為天根生化科技公司產品。

1.3 引物設計

1.3.1 引物A的設計 參照GenBank上發(fā)表的全基因組序列,在序列差異較明顯的2898~4688 bp處設計一對引物:

該引物能從M41株基因組中特異性擴增出長度為1791 bp片斷,而不能擴增H52株和H120株。

1.3.2 引物 B的設計 參照發(fā)表的 H52株和H120株的全基因組序列,設計了一對引物:

該引物能以H52株和H120株為模板特異性擴增長度為1700 bp的目的片度,在H120株擴增片段中含有一個單酶切位點NaeⅠ,而H52擴增片段中無此位點。因此,利用限制性內切酶NaeⅠ可以區(qū)分H52株和H120株。

1.4 病毒RNA、DNA的提取 參照OMEGA公司產品說明書,提取病毒RNA和DNA。

1.5 RT -PCR

1.5.1 反轉錄 在20 μL體系中進行,按Invitrogen M-MLV反轉錄酶的說明書進行。

1.5.2 PCR 在25 μL體系中進行。反應管中依次加入 ddH2O 16.3 μL,10 × Buffer 2.5 μL,dNTP 2 μL,上游引物 1 μL,下游引物 1 μL,反轉錄產物2 μL,Ex-Taq 酶 0.2 μL。反應條件為:95 ℃預變性5 min;94℃ 1 min,50.0 ℃(A 引物)或46.3 ℃(B引物)1 min,72℃ 2 min,30個循環(huán);循環(huán)結束后72℃ 延伸10 min。

1.6 PCR產物凝膠電泳 取適量 PCR產物于0.8%瓊脂糖凝膠中90 V穩(wěn)壓電泳25 min,在紫外透射儀上觀察并拍照。

1.7 引物B的PCR擴增產物的酶切 按試劑盒說明書純化PCR產物后,用限制性內切酶NaeⅠ進行酶切。

1.8 敏感性鑒定 對IBV種毒H52、H120和M41株種毒分別進行 10 倍倍比稀釋,選取 106.5~100.5EID50/mL七個病毒滴度,用RNA提取試劑盒提取RNA后,用引物A對M41株進行擴增,用引物B對H52株和H120株進行擴增。

1.9 特異性鑒定 用引物A和引物B分別擴增雞傳染性法氏囊病病毒 B87株、火雞皰疹病毒Fc-126株以及新城疫病病毒La Sota株、雞痘病毒鵪鶉化弱毒株,檢測能否擴增出特異性基因片段。

2 結果

2.1 IBV M41株的鑒別檢測 分別以IBV M41、H120和H52株為模板,用引物A進行擴增,M41株得到與預期大小相符的1791 bp片斷,而H52株和H120株未擴增出目的片斷,與預期結果一致(圖1)。

2.2 IBV H120株、H52株的鑒別檢測 分別以IBV H120、H52株為模板,用引物B進行擴增,均擴增到大小為1700 bp的片斷,與預期結果一致。PCR產物經試劑盒純化后,用限制性內切酶NaeⅠ酶切過夜,H52株沒有切開,依然是1700 bp的片斷,而H120株被切成兩個片斷,分別為1000 bp和700 bp,與預期結果相符(圖2)。

2.3 引物特異性 用設計的兩對引物分別對雞傳染性法氏囊病病毒、馬立克病病毒以及新城疫病毒等病毒進行擴增,均沒有出現特異性條帶,說明這兩對引物具有良好的特異性。

2.4 引物敏感性 IBV種毒 M41株、H120株和H52株三株種毒分別作10倍倍比稀釋,取106.5~100.5EID50/mL共七個稀釋度,每個稀釋度取160 μL,用于提取RNA,然后用引物A、B進行擴增。結果表明,引物A擴增IBV M41株、引物B擴增IBV H120株和H52株的最低檢測濃度均為103.5EID50/mL,即相當于480個EID50(見圖3-圖5。M:MarkerⅤ;1 ~ 7 依次為:106.5、105.5、104.5、103.5、102.5、101.5、100.5EID50/mL)。

圖3 引物A擴增IBV M41株的敏感性

3 結語

本研究建立的分子鑒別方法具有良好的敏感性和特異性,進一步完善了IBV M41、H52和H120株種毒鑒定、活疫苗鑒別檢驗方法,對疫苗生產、檢驗具有積極意義。

[1] Saif Y M.禽病學[M].11版.蘇敬良,譯.北京:北京農業(yè)出版社,2005:108-130.

[2] 王紅寧.禽呼吸系統(tǒng)疾?。跰].北京:中國農業(yè)出版社,2002.

[3] Ignjatovic J,Gould G,Sapats S,et al.Isolation of a variant infectious bronchitid virus in Australia that further illustrates diversity among emerging strains[J].Arch Virol,2006,151:1567 -1585.

[4] Mo Mei- lan,WEI Zheng - ji,WEI Ping,et al.Isolation and genetic variations of HVRⅠof S gene of infectious bronchitis viruses[J].Chinese Journal of Veterinary Medicine,2006,42(8):13-15.

[5] Koch G,Hartog L,Kant A,et al.Antigenic domains on the peplomer protein of avian infectious bronchitis virus:correlation with biological functions[J].Gen Virol,1990,71(9):1929 -1935.

[6] Cavanagh D,Davis P J,Moc- Kett A P A.Amino acids within hypervariable region 1 of avian coronavirus IBV(Massachusetts serotype)spike glycoprotein are associated with neutralization epitopes[J].Virus Research,1988,11:141 -150.

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