張紅瑞,馬彥秋,高致明,王文全
(1.河南農(nóng)業(yè)大學(xué)中藥材工程技術(shù)研究中心,河南鄭州450002;2.北京中醫(yī)藥大學(xué)中藥學(xué)院,北京100102)
黃芩為唇形科黃芩屬多年生草本植物,藥用部位為干燥根,主含黃酮類化合物,具有清濕熱、瀉火、解毒、安胎等功效[1].黃芩分布于黑龍江、遼寧、內(nèi)蒙古、河北、河南、甘肅、陜西、山西、山東等地[2].多年來黃芩藥源一直以野生為主,由于社會(huì)需求不斷增加,野生資源破壞嚴(yán)重[3].經(jīng)過調(diào)查發(fā)現(xiàn),不同種源野生黃芩莖色有綠、紫兩種顏色,花有紫、白、粉色之分,在葉片大小、株高、分枝等形態(tài)學(xué)性狀上有較大變異.黃芩分子生物學(xué)方面的研究較為薄弱,主要是利用隨機(jī)擴(kuò)增的DNA多態(tài)性分析(RAPD)[4,5]進(jìn) 行 分 子 遺 傳 多樣 性 研 究.由 于RAPD重復(fù)性較差,近年來,簡(jiǎn)單重復(fù)序列間擴(kuò)增(inter-simple sequence repeat,ISSR)標(biāo)記技術(shù)已廣泛應(yīng)用于植物的遺傳多樣性和親緣關(guān)系研究,所用的PCR引物長(zhǎng)度在20個(gè)核苷酸左右,可以采用與常規(guī)PCR相同的反應(yīng)條件,穩(wěn)定性比RAPD好[6].目前在藥用植物遺傳多樣性研究中也日趨增多[7~15].本試驗(yàn)采用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)野生黃芩54個(gè)種源的遺傳多樣性和親緣關(guān)系進(jìn)行研究,為黃芩種質(zhì)資源的可持續(xù)利用和保護(hù)及品種選育等提供參考.
試驗(yàn)所用材料為野生黃芩54個(gè)種源硅膠快速干燥保存的幼嫩葉片,種源來源見表1.
表1 黃芩種源來源Table 1 The resources of Scutellaria baicalensis wild provenances
1.2.1 DNA的提取 采用十二烷基苯磺酸鈉(SDS)法提取DNA,步驟如下:1)將硅膠干燥的黃芩葉片在液氮中研成粉末,置于1.5 mL離心管中,加入600 μL SDS緩沖液,65℃水浴30~60 min;2)取出,加入 5 mol·L-1KAC 200 μL,冰水浴 10 min;3)取出,加入 V(氯仿)∶V(異戊醇)為 24∶1,充分混勻,室溫下靜置 10 min,10 000 r·min-1離心12 min;4)取上清液,加入600 μL異丙醇,混勻并靜置,10 000 r·min-1離心 3 min;5)倒掉上清液,加入體積分?jǐn)?shù)為75%的乙醇浸泡,倒掉乙醇,將DNA干燥后加入200 μL雙蒸水溶解;6)紫外分光光度計(jì)測(cè)量DNA質(zhì)量濃度和相對(duì)純度,并將DNA 稀釋成 20 mg·L-1,備用.
1.2.2 ISSR引物篩選 本研究選用加拿大British Columbia大學(xué)提供的1套 (共100條)ISSR引物試劑盒(上海生工合成),通過挑選來自3個(gè)種源的3個(gè)黃芩樣品,分別用100個(gè)引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增.在所用的100個(gè)引物中,有34個(gè)引物能得到較好擴(kuò)增,這34個(gè)引物是808,810,811,812,813,814,815,817,821,823,824,825,827,830,840,841,845,846,847,850,851,852,858,859,860,866,873,878,880,881,889,890,891 和899.最終選擇了808等9條多態(tài)性較高的引物用于黃芩ISSR-PCR擴(kuò)增 (表2).
1.2.3 ISSR-PCR 擴(kuò)增 參照文獻(xiàn)[16],略有改動(dòng).PCR 反應(yīng)體系為:dd H2O 14.1 μL;10 × PCR buffer 2.5 μL(含 Mg2+);dNTP(2.5 mmol·L-1)2.5 μL;ISSR 引物 (5 μmol·L-1)2.5 μL;Taq 酶(2.5 U)0.4 μL;模板 DNA(20 mg·L-1)3 μL;總反應(yīng)體積為25 μL.
PCR擴(kuò)增程序?yàn)?94℃預(yù)變性3 min;94℃預(yù)變性1 min;52℃或54℃退火1 min;72℃延伸2 min;40個(gè)循環(huán),最后再72℃延伸 7 min.整個(gè) ISSR-PCR反應(yīng)共6步,時(shí)間大約為3.2 h.
1.2.4 電泳與成像 PCR反應(yīng)產(chǎn)物取出后進(jìn)行1.6%的瓊脂糖凝膠電泳;電泳條件為:電壓,5 V·cm-1;時(shí)間,1.5 ~2 h.經(jīng) EB 染色后,在 Genesnap凝膠成像系統(tǒng)下照相.
1.2.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析 在瓊脂糖凝膠上,每個(gè)材料的每一條電泳譜帶看作為一個(gè)遺傳位點(diǎn),在同一個(gè)位點(diǎn)上如有強(qiáng)帶者或重復(fù)出現(xiàn)的弱帶者計(jì)為“1”,無帶者或不重復(fù)出現(xiàn)的弱帶者計(jì)為“0”,計(jì)算其總擴(kuò)增條帶和特異性擴(kuò)增條帶數(shù)量.利用SPSS 11.5軟件的類間平均鏈鎖法,計(jì)算供試材料的歐氏距離,進(jìn)行聚類分析,構(gòu)建其聚類圖.
用從100條引物中篩選出的擴(kuò)增條帶多、清晰和穩(wěn)定性好的9條引物對(duì)黃芩54個(gè)種源進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果顯示,9條ISSR引物的擴(kuò)增位點(diǎn)為7~15個(gè),共96個(gè)位點(diǎn),擴(kuò)增位點(diǎn)的相對(duì)分子質(zhì)量為200~2 000 bp,其中多態(tài)性擴(kuò)增位點(diǎn)為5~12個(gè),共77個(gè),多態(tài)性位點(diǎn)占71.43% ~90.91%,平均值為 80.21%(表2).
表2 黃芩ISSR引物及擴(kuò)增結(jié)果Table 2 List of primers and the experiment results
黃芩54個(gè)種源的ISSR總擴(kuò)增條帶為31~56條,其中多態(tài)性擴(kuò)增條帶占18~43條(平均29.20個(gè)位點(diǎn)),多態(tài)性條帶比率為58.06% ~76.79%,平均值為68.73%,說明黃芩種源間的遺傳多態(tài)性水平差異較大,遺傳變異比較豐富.S49(吉林松原種源)的多態(tài)性擴(kuò)增條帶最多(43條),占76.79%;而S4(河北承德豐寧Ⅲ種源)的最少(18條),僅占58.06%(表3).
以類間平均連鎖法對(duì)全部供試材料進(jìn)行聚類,通過計(jì)算遺傳距離來構(gòu)建其聚類分析圖(圖1).結(jié)果顯示,黃芩54個(gè)種源比較自然地分為3個(gè)分支,其中S49(吉林乾安種源)單獨(dú)為1個(gè)分支;S41(陜西佳縣種源)和S48(遼寧建昌種源)為1個(gè)分支;其余51個(gè)種源為1個(gè)分支.從圖1可見,吉林乾安種源與其他種源之間的遺傳距離相對(duì)較大,其親緣關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn);從51個(gè)種源形成的1個(gè)分支中可以看到,地域相近的種源首先聚在一起,如S14(河北承德Ⅲ種源)和S18(河北隆化Ⅰ種源),S19(河北隆化Ⅱ種源)和S20(河北隆化Ⅲ種源),也存在很多地域相差甚遠(yuǎn)的種源聚在一起的現(xiàn)象,如S47(遼寧朝陽種源)和S54(山東淄博種源).
圖1 黃芩54個(gè)種源ISSR聚類分析圖Fig.1 Dendrogram of cluster analysis for fifty-four kinds of Scutellaria baicalensis
表3 不同種源黃芩遺傳多樣性分析結(jié)果Table 3 Genetic diversities in different population of Scutellaria baicalensis
馮學(xué)鋒等[4]對(duì)13個(gè)居群62個(gè)黃芩(Scutellaria baicalensis)和并頭黃芩(Scutellaria scordifolia)樣本進(jìn)行RAPD分析,結(jié)果表明,黃芩遺傳變異和地理環(huán)境有關(guān)系.邵愛娟等[5]對(duì)34個(gè)黃芩(包括栽培和野生)種源進(jìn)行了RAPD分析,結(jié)果表明,黃芩種源間的遺傳背景較為復(fù)雜,在遺傳學(xué)上的分析結(jié)果與其外觀形態(tài)大體相似,但與地理分布沒有一定的相關(guān)性.ISSR具有多樣性豐富、操作簡(jiǎn)單的特點(diǎn),因此被廣泛應(yīng)用于生物多樣性鑒定研究[17].本研究采用ISSR分子標(biāo)記對(duì)54個(gè)野生黃芩種源進(jìn)行分析的結(jié)果表明,黃芩種源間的親緣關(guān)系與其地理位置有一定的聯(lián)系,地域相近的種源首先聚在一起,也存在地域相差甚遠(yuǎn)的種源聚在一起的現(xiàn)象.不同的標(biāo)記方法得到的結(jié)論并不完全一致.這是由于不同的方法是從不同的水平和角度分析種質(zhì)間的差異,所得到的結(jié)果就不可能是簡(jiǎn)單的重復(fù)或絕對(duì)的一致.在具體的研究中,應(yīng)相互結(jié)合和印證,才能比較全面地解釋研究結(jié)果.
近年來,由于國(guó)內(nèi)外市場(chǎng)對(duì)黃芩藥材和黃芩苷的需要量日益增加,野生黃芩資源破壞嚴(yán)重,在1987年頒布的《國(guó)家重點(diǎn)保護(hù)野生藥材物種名錄》里,黃芩被列為3級(jí)保護(hù)物種.本研究結(jié)果顯示,野生黃芩種內(nèi)具豐富的遺傳變異,其多態(tài)性擴(kuò)增位點(diǎn)80.21%.馮學(xué)鋒等[4]的研究結(jié)果顯示,黃芩居群間的遺傳變異占總變異的18.83%,居群內(nèi)變異占81.17%.邵愛娟等[5]的研究結(jié)果表明,不同種源黃芩(包括栽培和野生)間具有豐富的遺傳多樣性.說明導(dǎo)致野生黃芩資源不斷減少并非是其遺傳變異降低所致,人為過度采收和賴以生存的生態(tài)環(huán)境被破壞是中國(guó)野生黃芩資源急劇減少的主要因素.因此保護(hù)黃芩原產(chǎn)地生態(tài)環(huán)境和適度采收野生黃芩資源是恢復(fù)野生黃芩種群數(shù)量和蘊(yùn)藏量最有效的途徑.
黃芩在中國(guó)分布較廣,特別是中國(guó)東部、西部氣候差異較大,生態(tài)環(huán)境各異,造成了豐富多樣的黃芩野生種群,為黃芩品種選育提供了很好的基因資源,有望從中培育出符合人們需要的優(yōu)良品種.至于黃芩遺傳基因與其形態(tài)變異的相關(guān)性還有待進(jìn)一步研究.
[1] 中華人民共和國(guó)國(guó)家藥典委員會(huì).中華人民共和國(guó)藥典:1部[M].北京:中國(guó)醫(yī)藥科技出版社,2010:282-283.
[2] 中國(guó)科學(xué)院中國(guó)植物志編輯委員會(huì).中國(guó)植物志:第65卷,第2分冊(cè)[M].北京:科學(xué)出版社,1977:136-249.
[3] 楊 全,白 音,陳千良,等.黃芩資源現(xiàn)狀及可持續(xù)利用的研究[J].時(shí)珍國(guó)醫(yī)國(guó)藥,2006,17(7):1159 -1160.
[4] 馮學(xué)鋒,胡世林,郭寶林,等.黃芩種群遺傳多樣性初步研究[J].世界科學(xué)技術(shù)—中藥現(xiàn)代化,2002,4(4):38-43.
[5] 邵愛娟,李 欣,黃璐琦,等.不同種源黃芩的RAPD分析[J].中國(guó)中藥雜志,2006,31(6):452 -455.
[6] 王建波.ISSR分子標(biāo)記及其在植物遺傳學(xué)研究中的應(yīng)用[J].遺傳,2002,24(5):613 -616.
[7] 周延清,景建洲,李振勇,等.懷區(qū)地黃遺傳多樣性的ISSR 鑒定[J].中草藥,2005,36(2):257 -261.
[8] 羅 群,馬丹煒,王躍華.川烏遺傳多樣性的ISSR鑒定[J].中草藥,2006,37(10):1554 -1557.
[9] 何 俊,楊柏云,陳少風(fēng),等.多葉重樓遺傳多樣性的ISSR分析[J].云南植物研究,2007,29(4):388-392.
[10] 李 靖,程 舟,楊曉伶,等.人參農(nóng)家類型遺傳多樣性的ISSR 分析[J].中草藥,2007,38(9):1392-1395.
[11] 孫 群,佟漢文,吳 波,等.不同種源烏拉爾甘草形態(tài)和ISSR遺傳多樣性研究[J].植物遺傳資源學(xué)報(bào),2007,8(1):56 -63.
[12] 關(guān) 錳,白成科,劉 嬌,等.不同山茱萸種質(zhì)資源形態(tài)和ISSR遺傳多樣性研究[J].分子植物育種,2008,6(5):912 -920.
[13] 王曉慧,湯曉闖,楊恩秀,等.莪術(shù)不同種和居群的ISSR-PCR分析[J].中國(guó)中藥雜志,2008,33(18):2037-2040.
[14] 羅玥佶,伍賢進(jìn),彭 帥,等.12種翻白草種質(zhì)資源遺傳多樣性的 ISSR 分析[J].中草藥,2008,39(5):748-751.
[15] 包英華,白 音,田新波,等.束花石斛種質(zhì)資源的ISSR 分析[J].廣西植物,2008,28(4):447-450.
[16] 張文清.黃芩優(yōu)良種源的篩選及其與基因組相關(guān)性研究[D].北京:北京中醫(yī)藥大學(xué),2007.
[17] 林萬明.PCR技術(shù)操作和應(yīng)用指南[M].北京:人民軍醫(yī)出版社,1993:7-14.