葉成玉,王光華,蔡其剛,王戈平,陸 艷,張芳芳,馬利青,周繼章*
(1.青海省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院 ,青海 西寧 810016;2.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蘭州獸醫(yī)研究所家畜疫病病原生物學(xué)國家重點實驗室 農(nóng)業(yè)部獸醫(yī)公共衛(wèi)生重點開放實驗室,甘肅 蘭州 730046)
牛病毒性腹瀉病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV),也稱牛病毒性腹瀉-黏膜病病毒,與豬瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)、羊邊界病毒(Border disease virus,BDV)同屬黃病毒科、瘟病毒屬成員,是有囊膜的單股正鏈RNA病毒,整個基因組大小約為12.5kb,包含有一個大的開放閱讀框和兩側(cè)的非編碼區(qū)[1]。開放閱讀框編碼一個近4000個氨基酸的多聚蛋白(E2的克隆與序列分析),從 N端到C端的順序為:Npro(p20)、EC(p14)、E0(gp48)、E1(gp25)、E2(gp53)、p7、NS 2-3(p125)、NS 4A(p10)、NS 4B(p32)、NS 5A(p58)、NS 5B(p75),其中 EC、E0、E1和E2為結(jié)構(gòu)蛋白,其他的為非結(jié)構(gòu)蛋白[2]。其編碼的結(jié)構(gòu)蛋白主要位于BVDV基因組5′-N端部分。其中E0、E1和E2是糖基化蛋白,而E0、E2為保護性抗原基因,其中結(jié)構(gòu)蛋白E2是牛病毒性腹瀉病毒主要的保護性抗原,具有中和表位,能誘導(dǎo)中和性抗體的產(chǎn)生,具有較強的免疫原性,可以用于研究基因工程亞單位疫苗[3],但E2是BVDV結(jié)構(gòu)蛋白中變異率較高的一種蛋白,抗原逃逸及突變頻率較高,是導(dǎo)致疫苗保護失效和牛持續(xù)性感染的主要原因[4]。E0是BVDV編碼蛋白中保守性很高的蛋白,其上有中和表位,產(chǎn)生的中和抗體具有中和BVDV和丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)的能力[5],因此,它可用于研究基因工程亞單位疫苗及基因工程診斷抗原。目前,國內(nèi)外針對牦牛源BVDV E0基因的研究報道較少[6]。本研究以青海發(fā)病牦牛中分離出的BVDV流行株為試驗材料,克隆表達了BVDV QHZK株的E0基因,為進一步研究BVDV E0蛋白的生物學(xué)活性,制備基因工程診斷抗原奠定了基礎(chǔ)。
1.1.1 試劑 限制性內(nèi)切酶EcoRⅠ、XhoⅠ、IPTG、ExTaq酶、pMD18-T載體、質(zhì)粒提取試劑盒、膠回收試劑盒,購自寶生物工程(大連)有限公司;低分子質(zhì)量蛋白質(zhì)Marker,DL2000DNA Marker,T4 DNA連接酶,氨芐青霉素,購自上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司;BVDV標準參考株、陰陽性血清,均購自中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所;辣根過氧化物酶(HRP)標記的兔抗牛IgG,購自Sigma公司。
1.1.2 質(zhì)粒與菌種 pMD18-T-E0質(zhì)粒,由青海省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院獸醫(yī)生物技術(shù)研究室構(gòu)建并保存;DH5α菌株,購自寶生物工程(大連)有限公司,Rosetta菌株,購自北京全式金生物科技有限公司,原核表達載體pET-32a,由本實驗室保存。
1.1.3 毒株 分離自青海省澤庫縣某牧戶疑似牦牛病毒性腹瀉病牛的樣品,毒株命名為“QHZK10”,由青海省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院獸醫(yī)生物技術(shù)研究室保存。
1.2.1 BVDV E0基因生物信息學(xué)分析 采用DNA Star軟件分析BVDV牦牛分離株E0基因的二級結(jié)構(gòu)、親水性,并將其抗原性與NADL、C24V毒株進行比較。
1.2.2 E0基因的擴增引物序列為:PF15′-CCCGAATTCATGGAGAACATAACACA -3′,PF25′-CCCCTCGAGTTATGCATATGCCCC -3′。反應(yīng)條件及體系:按照RT-PCR試劑盒說明書操作,反應(yīng)體系(25μL),10×RT-PCR buffer 2.5μL,dNTP mixture(2.5mmol/L)4.0μL,RNase inhibitor(40 U/μL)1.0μL,上下游引物(0.1μmol/L)各1μL,AMV reverse transcriptase(5U/μL)0.5μL,Taq polymerase(5U/μL)0.5μL,總 RNA (1μg/μL)2.0μL,DEPC水12.5μL。PCR反應(yīng)條件為:45℃30min;95℃ 3min;94℃ 30s,58℃ 30s,72℃ 1 min,35個循環(huán);72℃5min。反應(yīng)結(jié)束后取5μL PCR產(chǎn)物以5V/cm恒定電壓于10g/L瓊脂糖凝膠中電泳。
1.2.3 E0基因的純化及克隆 用膠回收試劑盒純化BVDV QHZK株E0基因PCR產(chǎn)物,將純化后的產(chǎn)物與pMD18-T載體連接。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至DH5α菌株,經(jīng)氨芐青霉素、X-gal篩選,挑取白色菌落接種于5 mL含氨芐青霉素(終濃度50μg/mL)的LB培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)12h之后提取質(zhì)粒。
1.2.4 重組質(zhì)粒pET-32a-E0的構(gòu)建 將pET-32a原核表達載體和pMD18-T-E0克隆質(zhì)粒分別用EcoRⅠ、XhoⅠ雙酶切,用膠回收試劑盒回收具有黏性末端的E0基因和pET-32a原核表達載體,在T4DNA連接酶作用下16℃連接5h,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至DH5α感受態(tài)細胞。酶切反應(yīng)總體積60μL,10×buffer 6μL,EcoRⅠ(10U/μL)3μL,XhoⅠ(10 U/μL)3μL,重組質(zhì)粒(50ng/μL)48μL,各成分加入PCR管后放于37℃恒溫水浴鍋內(nèi),酶切2h后用10g/L瓊脂糖凝膠電泳鑒定。
連接反應(yīng)總體積25μL,體系為:10×T4DNA ligase buffer 2.5μL,E0基因片段10μL,酶切處理的pET-32a載體5μL,T4DNA ligase 1μL,無菌水6.5μL。將各管混勻后,封口膜封口,16℃水浴,連接過夜。
1.2.5 重組質(zhì)粒的鑒定 將5μL連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化到感受態(tài)細胞 Rosetta(DE3)中,經(jīng)IPTG/X-gal瓊脂平板藍白菌落篩選,隨機挑選白色菌落用含氨芐抗性的LB培養(yǎng)基培養(yǎng),提取質(zhì)粒后進行EcoRⅠ和XhoⅠ雙酶切及PCR鑒定。將鑒定正確的質(zhì)粒命名為pET-32a-E0。
1.2.6 重組質(zhì)粒的誘導(dǎo)表達、蛋白純化與抗原性檢測 取50μL陽性克隆菌液加入到5mL含50μg/mL氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,37℃、220r/min振蕩培養(yǎng)過夜。次日按1∶50增菌于含氨芐青霉素(50μg/mL)的LB培養(yǎng)基中,培養(yǎng)至吸光度OD600nm為0.6~1.0之間,取出1mL未誘導(dǎo)菌液做陰性對照,4℃保存。余者加入IPTG至終濃度1mmol/L,200r/min、37℃誘導(dǎo)表達4h收集菌液,取1mL于1.5mL的離心管中,6000r/min離心3min,棄上清,收集菌體。用聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)檢測表達產(chǎn)物,表達的蛋白用His-Band鎳柱進行親合層析純化,并對表達出的蛋白用Western blot試驗進行抗原性檢測。
圖1為BVDV QHZK、VEDEVAC和C24V株E0蛋白氨基酸抗原指數(shù)比較圖,圖2是BVDV QHZK、VEDEVAC和C24V株E0蛋白氨基酸親水性比較圖,圖1和圖2總體表明E0氨基酸的抗原性與親水性指數(shù)呈平行相關(guān)性,QHZK株E0氨基酸的抗原性與親水性指數(shù)與標準毒株VEDEVAC和C24V非常相似,從而證明E0基因在BVDV各毒株間具有很高的保守性,有利于研究該病的基因工程疫苗。
圖1 BVDV QHZK、VEDEVAC和C24V株E0蛋白氨基酸抗原指數(shù)比較Fig.1 Compaison of amino acid antigencity of QHZK with VEDEVAC and C24V
圖2 BVDV QHZK、VEDEVAC和C24V株E0蛋白氨基酸親水性比較Fig.2 Compaison of amino acid hydrophilicity of QHZK strain with VEDEVAC and C24V
圖3表明,通過對QHZK株E0蛋白B細胞表位預(yù)測發(fā)現(xiàn),在位點60~65、72~78、118~122、128~133、215~220處的峰值較高,而在該區(qū)域內(nèi)E0蛋白氨基酸的親水性與抗原性峰值均較高,因此,這些位點可能為BVDV QHZK株的B細胞抗原表位。
圖3 BVDV QHZK株E0蛋白B細胞抗原表位預(yù)測Fig.3 Forecasting of B cell epitope of E0of BVDV QHZK strain
2.2.1 E0基因的 RT-PCR 擴增 將 RT-PCR產(chǎn)物用10g/L瓊脂糖凝膠電泳鑒定,在700bp左右處有一特異性擴增條帶,與預(yù)期產(chǎn)物大小相符(圖4),表明從病料中成功擴增出了BVDV的E0基因。
圖4 E0基因RT-PCR擴增產(chǎn)物的鑒定Fig.4 Identification of RT-PCR product of E0gene
2.2.2 重組質(zhì)粒pET-32a-E0的鑒定 重組質(zhì)粒pET-32a-E0經(jīng)PCR以及EcoRⅠ、XhoⅠ雙酶切得到約700bp目的基因片段,與預(yù)期的結(jié)果一致(圖5),證明重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。
圖5 重組質(zhì)粒pET-32a-E0的PCR和酶切鑒定Fig.5 PCR and enzyme digestion identification of recombinant plasmid pET-32a-E0
2.2.3 E0基因表達產(chǎn)物的檢測結(jié)果及純化 重組質(zhì)粒pET-32a-E0轉(zhuǎn)化入Rosetta感受態(tài)細胞中,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)4h,將不同時間段收集的誘導(dǎo)菌液變性處理后進行SDS-PAGE分析(圖6)。在約44ku分子質(zhì)量標記處,出現(xiàn)明顯的電泳條帶,與預(yù)期結(jié)果相符,表明目的蛋白獲得表達。表達的蛋白用His-Trap FF預(yù)裝柱(GE公司)進行親合層析純化(圖7)。
圖6 E0基因表達產(chǎn)物的SDS-PAGE分析Fig.6 SDS-PAGE of E0gene expression
圖7 E0基因表達產(chǎn)物純化的SDS-PAGE分析Fig.7 SDS-PAGE of purified products of E0gene expression
2.2.4 QHZK株E0基因表達產(chǎn)物的 Western blot鑒定 用BVDV標準陽性血清與E0基因表達產(chǎn)物進行Western blot試驗,結(jié)果顯示牛抗BVDV標準陽性血清與表達的融合蛋白呈陽性反應(yīng),并且表達的蛋白與BVDV陰性血清不反應(yīng)(圖8),表明QHZK株BVDV E0基因獲得正確表達。
圖8 表達產(chǎn)物的Western blot檢測Fig.8 Western blot analysis of the expressed protein
牦牛作為青藏高原上的稀有牛種,主要生長在我國2500m~5000m的高山草原上。自1983年,李佑民等[7]在我國首次分離并鑒定出BVDV以來,該病在我國牛群中流行較廣,造成了極大的危害,此外,BVDV還能感染豬,并且在臨床上不表現(xiàn)特征性的臨床癥狀,多為持續(xù)性感染,這也是導(dǎo)致BVD廣泛流行的原因之一,因此,建立特異、敏感、快速的診斷方法,研制有效的疫苗,預(yù)防和控制牛病毒性腹瀉病的發(fā)生意義重大[8]。目前,國內(nèi)學(xué)者對于牦牛BVDV分子生物學(xué)方面的報道較少,因此,開展牦牛BVDV的分子生物學(xué)研究意義重大。本研究對青海牦牛BVDV毒株的E0蛋白進行了生物信息學(xué)分析,采用生物學(xué)軟件對E0蛋白的抗原指數(shù)、親水性及B細胞抗原表位進行了分析。結(jié)果表明,E0蛋白氨基酸的親水性與抗原性指數(shù)呈平行相關(guān)性,QHZK株E0蛋白氨基酸的親水性與抗原性指數(shù)與標準毒株VEDEVAC、C24V非常相似,從而證明E0基因在BVDV各毒株間具有一定保守性,有利于亞單位疫苗研究。
本研究用原核表達載體表達BVDV E0基因時發(fā)現(xiàn),E0基因所含的密碼子有10%左右是E.coli不常用的稀有密碼子。有資料表明,當目的基因中存在過多E.coli不常使用的密碼子時,其在E.coli中的表達量一般很低[9],所以本研究在表達E0基因時采用了Rosetta(DE3)菌株,該菌株因可以提供密碼子tRNAs,從而可以顯著提高帶有較多稀有密碼子的E0基因在E.coli中的表達量,試驗結(jié)果也證明E0蛋白得到了較高的表達量。
E0是BVDV編碼蛋白中保守性較E2更高的蛋白,該蛋白上的中和表位產(chǎn)生的中和抗體具有中和BVDV和HCV的能力[10],氨基酸序列分析結(jié)果也表明,在此蛋白內(nèi)有一高度保守的結(jié)構(gòu)域,因此E0蛋白更適合做亞單位基因工程疫苗,E0蛋白氨基酸生物信息學(xué)分析也證明了這一點。本研究中所表達的E0蛋白在Western blot試驗中能與標準毒株制備的抗BVDV陽性血清發(fā)生免疫反應(yīng)。
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