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傳染性法氏囊病病毒NN1107廣西株的分離鑒定及遺傳進(jìn)化分析

2012-06-29 09:00:58蘭美益陳澤祥韋志鋒秦若甫
動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展 2012年4期
關(guān)鍵詞:進(jìn)化樹法氏囊毒力

李 軍,陶 立,蘭美益,陳澤祥,韋志鋒,秦若甫,彭 昊,楊 威*

(1.廣西獸醫(yī)研究所,廣西 南寧 530001;2.廣西畜禽疫苗新技術(shù)重點實驗室,廣西 南寧 530001)

傳染性法氏囊病病毒(Infectious bursal disease virus,IBDV)是雞傳染性法氏囊?。↖nfectious bursal disease,IBD)的病原體。IBDV感染幼齡雞后,主要在法氏囊髓質(zhì)區(qū)的未成熟B淋巴細(xì)胞和B淋巴細(xì)胞前體細(xì)胞中增殖,引起感染細(xì)胞的變性和壞死,臨床上出現(xiàn)以法氏囊水腫、出血和萎縮為特征的病理變化[1-2]。IBDV在雞群中的傳播不僅導(dǎo)致易感雞群的大量死亡,IBDV的殺淋巴細(xì)胞作用還能引起雞群的免疫應(yīng)答能力降低,使雞群對其他病毒或細(xì)菌感染的敏感性增加,給養(yǎng)雞業(yè)造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失[3-4]。近十幾年來,隨著IBDV疫苗的廣泛應(yīng)用,IBDV在疫苗免疫選擇壓力下,自身不斷發(fā)生變異,毒力獲得增強,出現(xiàn)經(jīng)典毒株(classical IBDV,cIBDV)向超強毒株(very virulent IBDV,vvIBDV)的演化,vvIBDV可以突破高水平的母源抗體保護(hù),導(dǎo)致雞發(fā)病年齡提前和病死率增高,給IBD的防控帶來了困難。

IBDV屬于雙RNA病毒科、禽雙RNA病毒屬成員,基因組由A、B兩個雙鏈RNA片段組成[5]。A片段的VP2基因是IBDV主要結(jié)構(gòu)蛋白VP2的編碼基因,VP2蛋白位于病毒粒子的外表面,是IBDV的主要毒力因子,能誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡和誘導(dǎo)產(chǎn)生保護(hù)性中和抗體[6]。研究證實VP2序列中的VP2高變區(qū)(vVP2)與IBDV的毒力密切相關(guān)。vVP2位于VP2蛋白的第206~350位氨基酸之間,由大小兩個親水區(qū)和一個七肽區(qū)組成,構(gòu)成一個構(gòu)象依賴型的抗原表位,誘導(dǎo)機體產(chǎn)生中和抗體。vVP2內(nèi)氨基酸的改變會引起IBDV 毒力的改變[7-9]。

陽秀英等和何秀苗等2000年—2007年對廣西雞群IBDV的分子流行病學(xué)研究表明,廣西雞群中主要流行vvIBDV,各地毒株來源復(fù)雜,部分IBDV毒株的抗原性可能發(fā)生漂移[10-11]。2011年7月,廣西南寧市某養(yǎng)雞場飼養(yǎng)的23日齡三黃雞暴發(fā)了一起IBD,病死率為6%。本研究對病死雞進(jìn)行了IBDV分離和鑒定,并對其vVP2進(jìn)行克隆和測序,將獲得的vVP2序列與廣西流行的IBDV毒株vVP2序列進(jìn)行比較分析,建立遺傳進(jìn)化樹,從分子水平上對廣西近期IBDV的變異情況進(jìn)行追蹤和分析。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 病料 來自廣西南寧市某養(yǎng)雞場的臨床疑似IBD的病死雞,采其法氏囊作為病料。

1.1.2 雞胚 9日齡健康雞胚,購自廣西華桂源種禽有限公司。

1.1.3 試劑和儀器 PCR Taq mix、DNA Marker 1、DNA膠回收試劑盒、質(zhì)粒小量抽提試劑盒購自廣州東盛生物科技有限公司;病毒基因組DNA/RNA提取試劑盒購自天根生化科技(北京)有限公司;pMD18-T載體、RNA酶抑制劑和 MLV反轉(zhuǎn)錄酶購自寶生物工程(大連)有限公司;PCR儀購自日本TaKaRa公司。

1.2 方法

1.2.1 病毒分離 病毒的分離方法按陽秀英等的方法進(jìn)行[10]。

1.2.2 病毒分離株RNA的提取 用病毒基因組DNA/RNA提取試劑盒提取接種病毒的雞胚尿囊液中的總RNA,方法按說明書進(jìn)行。

1.2.3 病毒分離株vVP2基因的擴增、克隆和測序按韋平等的方法進(jìn)行IBDV的RT-PCR檢測[12]。利用DNA膠回收試劑盒回收PCR擴增產(chǎn)物。回收純化后與pMD-18T載體連接,轉(zhuǎn)化大腸埃希菌DH5α,用質(zhì)粒小量抽提試劑盒抽提質(zhì)粒,經(jīng)雙酶切和PCR鑒定后,將陽性重組質(zhì)粒送上海英駿生物技術(shù)有限公司測序。

1.2.4 分離株vVP2序列的遺傳進(jìn)化分析 應(yīng)用DNA Star軟件包的MegAlign軟件對測序獲得的vVP2片段序列與GenBank登錄的5株IBDV疫苗株和26株2000年—2010年在廣西流行的IBDV野毒株的vVP2序列進(jìn)行核苷酸和氨基酸的序列比較和同源性分析,繪制遺傳進(jìn)化樹。分析中應(yīng)用的毒株信息見表1。

表1 所用的IBDV毒株信息Table1 The information of IBDV strains used in this study

2 結(jié)果

2.1 病毒分離和鑒定

發(fā)病雞的法氏囊研磨過濾后經(jīng)絨毛尿囊膜途徑接種9日齡健康雞胚,雞胚在43h后死亡,胚體表現(xiàn)為水腫和出血。取尿囊液進(jìn)行血凝試驗和細(xì)菌培養(yǎng)檢測均為陰性。應(yīng)用韋平等[12]的方法對雞胚尿囊液進(jìn)行IBDV的RT-PCR檢測,擴增出471bp的目的片段,證實從病料中分離到了IBDV,將此毒株命名為NN1107。

2.2 分離株vVP2序列的比較分析

2.2.1 核苷酸序列同源性比較 對NN1107分離株的vVP2進(jìn)行克隆和測序,獲得了NN1107分離株vVP2核苷酸序列,長度為471bp。對序列進(jìn)行限制性內(nèi)切酶酶切位點檢測,在271位核苷酸處有一個vvIBDV的特征性SspI酶切位點。將此序列與廣西野毒株和疫苗株的核苷酸序列進(jìn)行同源性比較,NN11017株與廣西vvIBDV毒株的同源性在96%~99.6%之間,其中與野毒株 NN07122和HP1001的同源性最高,為99.6%。NN1107株與廣西cIBDV毒株的同源性在90.3%~91.6%之間;與疫苗株的同源性則在90.3%~96.6%之間。

2.2.2 氨基酸序列同源性比較 將推導(dǎo)的氨基酸序列與廣西野毒株和疫苗株的氨基酸序列進(jìn)行同源性比較,NN1107株與廣西vvIBDV毒株的同源性在94.9%~99.4%之間,其中與野毒株 BH09、NNTZ(3)、NN07122和 HP1001的同源性最高,為99.4%。NN1107株與廣西cIBDV毒株的同源性在91.1%~93%之間;而與疫苗株的同源性在91.8%~97.5%之間,其中與 B87(in)、Bursine-2、FW2512株的同源性均為91.8%;與 B87(BJ)和MB株的同源性則為93%和97.5%。

2.2.3 氨基酸序列分析 NN1107株vVP2氨基酸序列中與病毒毒力和抗原相關(guān)的氨基酸均符合vvIBDV 特 征[13-14],即第326~332位的七肽區(qū)SWSASGS序列保持不變;大親水一區(qū)(第212~224位氨基酸)內(nèi)212、213、214和222位氨基酸為N、D、Y和A;大親水二區(qū)(第314~324位氨基酸)內(nèi)318、321、323和324位氨基酸為G、G、D和Q;小親水一區(qū)(第248~252位氨基酸)內(nèi)249位氨基酸為Q;小親水二區(qū)(第279~290位氨基酸)279和284位氨基酸為D和T。其他與病毒毒力和抗原相關(guān)的氨基酸位點,如第242、253、254、256、270、294、299和330位氨基酸分別為I、Q、G、I、A、I、S和S。NN1107株與廣西部分野毒株和疫苗株的vVP2氨基酸序列比較見圖1。

圖1 vVP2的氨基酸序列比較Fig.1 Comparison of the amino acid sequences of vVP2

2.3 分離株vVP2序列的遺傳進(jìn)化分析

將NN1107株與5株IBDV疫苗株和26株2000年—2010年在廣西流行的IBDV野毒株的vVP2核苷酸序列進(jìn)行同源性比較,繪制遺傳進(jìn)化樹(圖2)??梢园l(fā)現(xiàn)遺傳進(jìn)化樹由vvIBDV毒株、cIBDV毒株和疫苗株3個群組成,群間的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。NN1001株屬于vvIBDV毒株群,它與曾經(jīng)在2004年、2005年、2007年和2010年流行的毒株BH09、NNTZ(3)、NN07122、HP1001的親緣關(guān)系最近,共同組成亞群2;而2006年、2007年和2010年的大部分毒株以及2004年至2005年流行的大部分毒株分別組成亞群1和亞群3。

圖2 根據(jù)vVP2核苷酸序列繪制的遺傳進(jìn)化樹Fig.2 Phylogenetic tree of isolate and reference strains based on the nucleotide sequences of vVP2

3 討論

采用雞胚絨毛尿囊膜接種和RT-PCR檢測技術(shù)對臨床疑似IBD的病死雞法氏囊進(jìn)行IBDV的分離和鑒定,成功分離出一株IBDV(NN1107株)。對NN1107分離株vVP2片段進(jìn)行克隆和測序,序列分析和同源性比較結(jié)果顯示,NN1107株具有vvIBDV的特征性酶切位點SspI,且與廣西vvIBDV野毒株的同源性極高,表明NN1107株為一株vvIBDV。

VP2蛋白不僅是IBDV的一個主要結(jié)構(gòu)蛋白,誘導(dǎo)機體產(chǎn)生保護(hù)性中和抗體,還是一個變異最大的蛋白,其變異主要集中在vVP2區(qū)域(第206~350位氨基酸),vVP2內(nèi)氨基酸的改變都有可能使病毒的毒力增強,突破疫苗的免疫保護(hù)[7-9]。因此,可以通過vVP2序列的同源性比較來分析毒株的遺傳進(jìn)化。vVP2氨基酸序列同源性比較和遺傳進(jìn)化分析顯示,在近10年,廣西同時存在著cIBDV和vvIBDV兩種不同毒力的IBDV毒株流行。本研究分析的27株IBDV毒株中,只有7株毒株屬于cIBDV,且毒株大都分離于2005年以前,只有1株BB0901是分離于2009年;而vvIBDV毒株分離自2004年至2011年,表明廣西目前IBDV的主要流行毒株仍然為vvIBDV。

NN1107株與2004年毒株BH09、2005年毒株NNTZ(3)、2007年毒株 NN07122和2010年毒株HP1001的同源性高達(dá)99.4%;其主要氨基酸位點也未發(fā)生任何改變,說明這些毒株很有可能來源于同一病毒株的進(jìn)化。本研究構(gòu)建的遺傳進(jìn)化樹也顯示vvIBDV在進(jìn)化中也分成2個亞群,在同一地區(qū),如位于桂南地區(qū)的南寧市和位于桂北地區(qū)的桂林市都存在有不同亞群的vvIBDV,表明廣西vvIBDV來源復(fù)雜,流行不受地域限制。

從vVP2核苷酸序列繪制的遺傳進(jìn)化樹可以看出,NN1107株等vvIBDV毒株與傳統(tǒng)的疫苗株B87(in)、Bursine-2、FW2512株分屬于兩個基因群。在與病毒毒力和抗原相關(guān)的氨基酸位點中,有10個位點,即第212、222、249、256、270、279、284、286、294和299位的氨基酸發(fā)生了改變。這些氨基酸的改變可能會導(dǎo)致中和抗體識別的抗原表位發(fā)生構(gòu)象上的變化,使疫苗株 B87(in)、Bursine-2、FW2512株誘導(dǎo)機體產(chǎn)生的中和抗體不能有效地與病毒結(jié)合,阻斷vvIBDV感染B淋巴細(xì)胞,這可能是vvIBDV突破高水平母源抗體保護(hù)的原因。

[1]Lukert P D,Saif Y M.Infectious Bursal Disease[M].In:Calnek B W,Barnes H J,Beard C W,et al(Eds),Diseases of Poultry(10th ed.).Iowa State Universuty Press,1997:721-738.

[2]毛炳宇,馬曉麗,趙 暉,等.人工感染IBDV雞法氏囊的電鏡研究 [J].畜牧獸醫(yī)學(xué)報,1998,29(5):455-461.

[3]Imai K,Mase M,Tsukamoto K,et al.Persistent infection with chicken anaemia virus and some effects of highly virulent infectious bursal disease virus infection on its persistency[J].Res Vet Sci,1999,67(3):233-238.

[4]Bautista D A,Elankumaran S,Heckert R A.Effect of a variant infectious bursal disease virus(E/Del)on Salmonella typhimuriuminfection in commercial broiler chickens[J].Avian Dis,2004,48(2):361-369.

[5]Hudson P J,McKern N M,Power B E,et al.Genomic structure of the large RNA segment of infectious bursal disease virus[J].Nucleic Acids Res,1986,14:5001-5012.

[6]Fernandez-Arias A,Martinez S,Rodriguez J F.The major antigenic protein of infectious bursal disease virus,VP2,is an apoptotic inducer[J].J Virol,1997,71:8014-8018.

[7]Bayliss C D,Spies K U,Shaw R W,et al.A comparison ofthe sequences of segment A of four infectious bursal disease virus strains and identification of a variable region in VP2[J].J Gen Virol,1990,71(Pt6):1303-1312.

[8]Schnitzler D,Bernstein F,Müller H,et al.The genetic basis for the antigenicity of the VP2protein of the infectious bursal disease virus[J].J Gen Viro,1993,74(Pt 8):1563-1571.

[9]Eterradossi N,Arnauld C,Toquin D,et al.Critical amino acid changes in VP2variable domain are associated with typical and atypical antigenicity in very virulent infectious bursal disease viruses[J].Arch Virol,1998,143(8):1627-1636.

[10]陽秀英,韋 平,黃志永,等.我國部分省區(qū)雞傳染性法氏囊病病毒的分子流行病學(xué)研究 [J].畜牧獸醫(yī)學(xué)報,2007,38(6):581-588.

[11]何秀苗,韋 平,官丁明,等.2000~2007年廣西雞傳染性法氏囊病病毒的分子流行病學(xué) [J].病毒學(xué)報,2009,25(6):437-444.

[12]韋 平,龍進(jìn)學(xué),陽秀英,等.傳染性法氏囊病病毒快速檢測與分型技術(shù)的研究 [J].中國獸醫(yī)學(xué)報,2004,24(4):313-316.

[13]許信剛,李健強,王笑梅,等.傳染性法氏囊病病毒超強毒HZ株和XN株VP2基因的克隆和序列比較分析 [J].動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展,2000,21(1):39-42.

[14]曹永長,畢英佐,梁志清,等.超強傳染性法氏囊病病毒宿主保護(hù)抗原的分子特征 [J].中國獸醫(yī)學(xué)報,1998,18(6):521-526.

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