王 赟,梅 淼,楊 雪,朱 玲
(四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物生物技術(shù)中心,四川 雅安 625014)
豬圓環(huán)病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV-2)作為斷奶仔豬多系統(tǒng)衰弱綜合征(PMWS)的主要病原體,已被世界各國(guó)的學(xué)者所認(rèn)同[1]。PMWS發(fā)生自1991年在加拿大被首次報(bào)道后,美國(guó)、法國(guó)、西班牙、德國(guó)、日本都進(jìn)行了報(bào)道,在北美和歐洲的豬群中,發(fā)病率占被侵襲豬群的5%~50%,病死率達(dá)到50%~100%[2-3]。病原學(xué)和血清學(xué)調(diào)查證實(shí),PCV-2呈世界性分布[4]。根據(jù)致病性、抗原性和核苷酸序列,PCV可分為PCV-1和PCV-2兩個(gè)血清型,PCV-1無致病性,PCV-2有致病性。國(guó)內(nèi)外研究表明,PCV-1基因胞為1759bp,PCV-2則有1767bp和1768bp兩種[5]。PCV-2毒株間核苷酸序列的相似性大于96%,PCV-2與PCV-1的相似性小于80%。世界各地的PCV-2分離株的核苷酸序列具有很高的同源性,但在不同地域間病毒基因組序列仍存在變異,這種差異可能與PCV-2的感染特性有關(guān)[6]。該病的主要癥狀為漸進(jìn)性消瘦,呼吸困難及黃疸,剖檢可見淋巴組織退化,間質(zhì)性肺炎,肝炎及腎炎。除了能引起PMWS之外,PCV-2還與豬的幾種新出現(xiàn)傳染病的發(fā)生密切相關(guān),包括豬呼吸道病綜合征(PRDC)及豬增生性和壞死性肺炎(PNP)、新生仔豬的先天性震顫(CT)和新生仔豬的腹瀉病等[7]。2000年郎洪武等[8]首次報(bào)道中國(guó)豬群存在PCV-2感染,感染率為42.9%。而2007年周緒斌等[8]報(bào)道在2000年-2005年期間20多個(gè)省市PCV-2感染平均陽性率達(dá)55.04%。如今PCV-2及其所致的相關(guān)疾病引起了獸醫(yī)界的高度重視,成為當(dāng)前研究的熱點(diǎn)。
本試驗(yàn)從所采典型PMWS病料中分離鑒定出PCV-2,并對(duì)PCV-2全基因組的擴(kuò)增、克隆和序列分析,并與GenBank中的PCV-2參考毒株進(jìn)行同源性比較,以期為四川省PCV-2的流行病學(xué)研究、診斷與防控、基因組學(xué)的完善,及其進(jìn)一步闡明其致病機(jī)理提供依據(jù)。
1.1.1 病料 選疑似典型斷奶仔豬多系統(tǒng)衰竭綜合征的病例的肺臟、脾臟、淋巴結(jié)等組織,病料采集自四川某規(guī)?;i場(chǎng),置-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.1.2 細(xì)胞、質(zhì)粒、菌種 PK-15細(xì)胞購自武漢病毒所細(xì)胞保管中心(經(jīng)PCV-1及PCV-2檢測(cè)為陰性),限制性內(nèi)切酶 BamHⅠ、HindⅢ、pMD18-T Simple載體(寶生物工程大連有限公司),DH5α宿主菌,四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物生物技術(shù)中心保存。
1.1.3 引物設(shè)計(jì) 采用Fenaux M 等[10]所設(shè)計(jì)用于擴(kuò)增PCV-2全基因組為1767bp或1768bp的特異引物序列,擴(kuò)增四川省PCV-2毒株的全基因組,并在上下游引物中引入BamHⅠ、HindⅢ酶切位點(diǎn),引物由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成。引物 序 列 為 P1,5′-GAAGGATCCCTGGCTAACTTTGAAAGT-3′;P2,5′-GCAAAGCTTAATTCTGACAACGTTACA-3′。
1.2.1 病料的PCR擴(kuò)增 將采集的肺臟、脾臟、淋巴結(jié)等病料,剪成小塊,移入勻漿器內(nèi),按1∶10(W/V)加入PBS液將其研磨成勻漿,轉(zhuǎn)移至離心管中,反復(fù)凍融3次。按常規(guī)的酚/氯仿法提取病毒基因組DNA,并以提取的目的DNA為模板進(jìn)行如下PCR擴(kuò)增:50μL反應(yīng)體系(5μL10×bufffer、3μL 25mmol/L MgCl2、1μL 10mmol/L dNTPs、20 μmol/L P1和P2各1.0μL、Taq酶0.5μL、模板3 μL、超純水補(bǔ)足50μL),于94℃變性5min,然后進(jìn)行30個(gè)循環(huán)(94℃1min,56℃1min,72℃30s),最后72℃延伸10min。用10g/L瓊脂糖凝膠電泳,在紫外燈下觀察電泳圖譜,拍照記錄結(jié)果。
1.2.2 PK-15細(xì)胞PCV-1、PCV-2污染測(cè)定 取出1mL經(jīng)胰酶消化完全的單層PK-15細(xì)胞懸液,反復(fù)凍融3次,讓細(xì)胞充分破裂,完全釋放出病毒粒子。12000r/min 4℃離心5min,取上清液備用。按照1.2.1的PCR反應(yīng)體系來檢測(cè)PK-15細(xì)胞是否含有PCV-1、PCV-2核酸污染,選擇檢測(cè)結(jié)果為陰性的單層細(xì)胞備用。
1.2.3 病毒的分離 用無菌PBS液將經(jīng)1.2.1檢測(cè)為PCV-2陽性的相對(duì)應(yīng)的肺臟、脾臟、淋巴結(jié)等病料研磨制成1∶5(病料與PBS液體積比)的懸液,反復(fù)凍融3次,4000r/min離心30min,取上清過0.22μm濾器除菌,加入青霉素1000單位/mL,鏈霉素1000μg/mL,4℃作用6h,保存?zhèn)溆?。取上述處理好的組織樣品1mL,接種按常規(guī)方法消化制備致密PK-l5細(xì)胞單層,同時(shí)設(shè)不接種病毒的PK-15細(xì)胞作空白對(duì)照,37℃吸附作用1h,加入適量含20 mL/L小牛血清的維持營(yíng)養(yǎng)液,37℃培養(yǎng)72h。將培養(yǎng)物反復(fù)凍融3次,3000r/min離心10min,收獲上清。用上一代細(xì)胞病毒液再接種細(xì)胞連續(xù)盲傳15代后收獲病毒。
1.2.4 熒光抗體染色法檢測(cè) 將已收獲的病毒接種長(zhǎng)有致密單層的PK-15細(xì)胞[11],按熒光抗體染色法檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)步驟制備樣品,最后經(jīng)超純水沖洗,冷風(fēng)吹干,以0.5mol/L pH9.5的碳酸鹽緩沖甘油封固蓋片,鏡檢,觀察有無特異性熒光。
1.2.5 分離株的鑒定及全基因組的克隆 取出已經(jīng)長(zhǎng)成單層的接有病毒的PK-15細(xì)胞反復(fù)凍融3次,讓細(xì)胞充分破裂,釋放出病毒。在4℃以12000 r/min離心5min,取上清液,按照以上PCR反應(yīng)體系檢測(cè),如果電泳結(jié)果為陽性則用PCR回收試劑盒回收特異的擴(kuò)增片段。將回收的基因片段與克隆載體pMD18-T Simple連接,轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞。重組質(zhì)粒用BamHⅠ和HindⅢ進(jìn)行雙酶切鑒定,產(chǎn)物用10g/L瓊脂糖凝膠電泳鑒定。
1.2.6 序列測(cè)定與全序列進(jìn)化分析 對(duì)經(jīng)酶切鑒定為陽性的重組質(zhì)粒送往上海英俊生物有限公司測(cè)序。然后利用DNA Star軟件分析所得PCV-2的基因組序列并與Gen Bank中公布的其他國(guó)內(nèi)外毒株進(jìn)行序列比較分析和進(jìn)化樹分析。
病毒在接種PK-15細(xì)胞后的間接免疫熒光方法檢測(cè)結(jié)果顯示:感染病毒的陽性細(xì)胞呈現(xiàn)綠色熒光,病毒抗原主要集中在細(xì)胞核區(qū),細(xì)胞質(zhì)中也有許多抗原分布,病毒感染的陽性細(xì)胞呈散在分布;陰性對(duì)照細(xì)胞中未見熒光(圖1)。
應(yīng)用合成的引物通過反向PCR擴(kuò)增出長(zhǎng)度約為1800bp的片段,與預(yù)期目的片段大小一致(圖2)。重組質(zhì)粒經(jīng)雙酶切鑒定,顯示出長(zhǎng)度約為2600 bp和1800bp的特異性片段,結(jié)果表明克隆成功(圖3)。
圖1 間接免疫熒光鑒定PCV-2病毒粒子在PK-15細(xì)胞中的增殖Fig.1 Immunofluorescence identification of infection on PK-15cells infected with PCV-2
圖2 PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.2 The results of PCR amplication
陽性重組質(zhì)粒經(jīng)上海英俊生物有限公司測(cè)序,去除酶切位點(diǎn)及保護(hù)性堿基,得到長(zhǎng)為1767bp的外源片段,該片段與預(yù)期結(jié)果完全相符(圖3)。通過BLAST與GenBank中來自加拿大、新西蘭及中國(guó)其他部分的PCV-2毒株進(jìn)行相似性比較分析,結(jié)果與13個(gè)毒株間的相似性介于95.2%~99.5%(圖4)。該結(jié)果表明從所采病料中成功分離了PCV-2四川株。PCV2-SC分離株與山東株(AY556473)親緣關(guān)系最近,相似性高達(dá)99.7%;與日本株(AY424401)親緣關(guān)系最遠(yuǎn),相似性只有94.8%。根據(jù)比較結(jié)果繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖5),可以看出澳大利亞株(AY424401)構(gòu)成了一個(gè)獨(dú)立的分支,PCV2-SC株分離株與山東株共同組成一組微小分支,且這兩株與加拿大株、新西蘭株和中國(guó)的其他分離株構(gòu)成了另外一個(gè)大的分支??傮w看來,由于地域原因,國(guó)內(nèi)毒株同源性均較高,且與國(guó)外毒株新西蘭株同源性較近。
圖3 重組質(zhì)粒的酶切鑒定Fig.3 Identification of recombinant plasmid by enzyme digestion
圖4 PCV-2(SC)與其它PCV-2毒株的相似性比較Fig.4 Similarity comparison of the full genome sequence of PCV-2(SC)strain with other PCV-2isolates
圖5 PCV-2-SC全基因組系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹結(jié)構(gòu)圖Fig.5 Phylogenetic tree based on complete genome sequence of PCV-2-SC strain
PMWS是近10多年來出現(xiàn)的影響世界養(yǎng)豬業(yè)的重要傳染病之一,PCV-2是引起該病的主要病原,但不是惟一病原,PCV-2單獨(dú)感染可出現(xiàn)輕微的病變[12]。臨床上出現(xiàn)的PMWS病例多為PCV-2、豬細(xì)小病毒(PPV)及豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)的混合感染,尤其是最近幾年暴發(fā)的豬高致病性藍(lán)耳?。锤咧虏⌒载i繁殖與呼吸綜合征),更是伴隨有 PCV-2 的感染[13-14]。在對(duì) PCV-2進(jìn)行分離鑒定時(shí)考慮了兩個(gè)問題,即克服PCV-1的干擾和檢測(cè)方法的準(zhǔn)確性。在試驗(yàn)中選擇經(jīng)能區(qū)分PCV-1和PCV-2的PCR特異引物檢測(cè)PK-15細(xì)胞是否含有PCV-1和PCV-2污染,檢測(cè)結(jié)果為陰性后。間接免疫熒光試驗(yàn)檢測(cè)經(jīng)接種PCV-2-SC株的PK15細(xì)胞,盲傳培養(yǎng)15代次后獲得了滿意結(jié)果。
在設(shè)計(jì)引物時(shí)通過反復(fù)比較PCV-1和PCV-2的序列差異,選擇在PCV-1和PCV-2毒株間變異較大,相對(duì)于PCV-2毒株間保守性較高的區(qū)域,設(shè)計(jì)出針對(duì)PCV-2的特異性引物P1,P2一次性擴(kuò)增獲得了1800bp左右的目的片段。既克服了病毒細(xì)胞培養(yǎng)過程可能引入的污染,又避免了因病毒對(duì)細(xì)胞的適應(yīng)性而進(jìn)行的多次反復(fù)傳代,同時(shí)一次擴(kuò)增克隆PCV-2全基因組還減少了分段擴(kuò)增克降所需的多次基因操作。PCR反應(yīng)擴(kuò)增克隆測(cè)定PCV-2-SC株序列,與GenBank中的13株參考序列進(jìn)行比較分析發(fā)現(xiàn),相似性介于95.2%~99.5%。PCV-2-SC分離株與本次比較的山東株(AY556473)親緣關(guān)系最近,相似性高達(dá)99.7%;與日本株(AY424401)相似性只有94.8%。但總體來說,不同分離株之間核苷酸水平的變異性比較小,各PCV-2分離株基因組之間總體上比較保守。但也存在著變異,變異的發(fā)生與地理位置和種豬來源不同有某種程度上的相關(guān)性。尹業(yè)師等[15]曾對(duì)2005年12月31日前GenBank中的253條PCV-2序列進(jìn)行同源性比較和遺傳進(jìn)化分析,發(fā)現(xiàn)在核苷酸水平上PCV-分為兩個(gè)亞型,其中亞型1是以分離自美國(guó)、加拿大、澳大利亞的毒株為代表,亞型2是以分離自法國(guó)和新西蘭的毒株為代表。本研究所分離的PCV-2序列與新西蘭代表株在同一分支,而與日本,加拿大和澳大利亞株不在同一分支,這說明本研究所得的流行毒株與新西蘭代表株親緣關(guān)系較近。本文的進(jìn)化樹分析表明國(guó)內(nèi)外的毒株均形成了幾個(gè)小的分支,表明不同地區(qū)的PCV-2分離株在基因組序列上存在一定的變異,可能存在地域上的相關(guān)性。
本研究是從一批典型PMWS的住群眾分離到的,且全基因組的與GenBank上已提交的序列相似性分析顯示,該毒株并不與國(guó)內(nèi)外已分離的任何一株序列完全相同,因此可認(rèn)為該毒株的分離鑒定具有地方的代表性。本研究成功分離到了PCV-2四川分離株,為進(jìn)一步從分子水平研究PCV-2在四川省的流行、變異規(guī)律以及主要結(jié)構(gòu)基因的特性等提供了參考數(shù)據(jù),也為PCV-2的診斷及預(yù)防奠定了良好基礎(chǔ)。
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