李 結(jié),王培園,張 萍,劉遠(yuǎn)佳,郭建超,孟祥龍,李國(guó)清
(華南農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院,廣東廣州 510642)
賈第鞭毛蟲(chóng)(Giardiasp.)簡(jiǎn)稱(chēng)賈第蟲(chóng),是一種呈全球性分布的重要人獸共患性寄生原蟲(chóng),能廣泛寄生于人、哺乳動(dòng)物、鳥(niǎo)類(lèi)、兩棲類(lèi)及嚙齒類(lèi)動(dòng)物的腸道,導(dǎo)致腹瀉和消化不良等癥狀,諸多臨床病例和流行病學(xué)資料均已證明賈第蟲(chóng)病是一種具有重要公共衛(wèi)生意義的原蟲(chóng)?。?-3]。賈第蟲(chóng)病是一種水源性傳播的疾病,常年流行但多見(jiàn)于夏季。飲用水被污染是造成該病流行和暴發(fā)的重要因素。本病已被列為全世界危害人類(lèi)健康的10種主要寄生蟲(chóng)病之一[4]。近年來(lái)研究顯示,賈第蟲(chóng)合并人免疫缺陷病毒(HIV)感染,并在同性戀者中流行的報(bào)道不斷增多[5]。
近年來(lái),寵物犬賈第蟲(chóng)感染也較普遍,且可流行和傳播人獸共患的賈第蟲(chóng)基因型,對(duì)人類(lèi)健康構(gòu)成潛在威脅。因此,對(duì)賈第蟲(chóng)進(jìn)行研究就顯得尤為重要。賈第蟲(chóng)延長(zhǎng)因子(elongation factor 1alpha,EF1α)基因是蛋白質(zhì)合成過(guò)程中肽鏈延伸所需的蛋白因子的基因,進(jìn)化速率相對(duì)較慢,因此常被用于賈第蟲(chóng)的基因型鑒定。本試驗(yàn)以廣州犬糞便中發(fā)現(xiàn)的賈第蟲(chóng)為研究對(duì)象,針對(duì)其EF1α基因設(shè)計(jì)引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增、克隆和測(cè)序,通過(guò)序列分析比對(duì),對(duì)本次分離的犬源賈第蟲(chóng)進(jìn)行了分子鑒定,為賈第蟲(chóng)的分子遺傳學(xué)和分子診斷學(xué)研究及賈第蟲(chóng)病的防治研究奠定基礎(chǔ)。
1.1.1 糞便樣品 犬糞便樣品采自廣東廣州某寵物醫(yī)院。每個(gè)糞樣取10g~15g,加5倍自來(lái)水?dāng)噭颍?0目銅篩過(guò)濾,將濾液以2 500r/min離心10min,棄上清,按糞便量的5倍體積加入330g/L硫酸鋅漂浮液,然后用小鐵絲環(huán)蘸取漂浮液表層涂片鏡檢。將形態(tài)學(xué)鑒定為陽(yáng)性的糞便樣品保存至4℃冰箱備用。
1.1.2 主要試劑和儀器 DNA提取試劑盒(Stool DNA Kit)、WizardTM DNA Clean-Up System試劑盒、pGEM -T Easy Vector,均為Promega公司產(chǎn)品;dNTPs(2.5mmol/L)、ExTaqDNA 聚合酶、6×Loading buffer、DNA Marker DL 2 000、IPTG和X-gal均為寶生物工程(大連)有限公司產(chǎn)品;蛋白酶K為Merk公司產(chǎn)品;Biometra PCR儀器為德國(guó)Biometra公司產(chǎn)品;Bio-RAD電泳系統(tǒng)為美國(guó)Bio-RAD公司產(chǎn)品;凝膠圖像分析系統(tǒng)為英國(guó)Uvitec公司產(chǎn)品。
1.2.1 DNA提取及引物設(shè)計(jì) 將純化后的包囊用Promega公司的糞便提取試劑盒(Stool DNA Kit)抽提賈第蟲(chóng)全基因組DNA,并置于-20℃冰箱保存?zhèn)溆?。引物由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成,上游引物 EF:5′-CTGGTCACCGCGACTTCA-3′,下游 引 物 ER:5′-ACTCCTCGGCCTTCTTCC-3′,預(yù)期擴(kuò)增片段為288bp。
1.2.2 PCR擴(kuò)增目的片段 PCR擴(kuò)增體系為25μL:EF/ER引物各0.25μL,10×buffer 2.5μL,dNTP 2μL,MgCl23μL,Ex-Taq酶0.25μL,無(wú)菌水15μL,DNA樣品2μL。PCR反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性3min;94℃30s,60℃30s,72℃30s,循環(huán)35次;最后72℃5min。同時(shí)設(shè)置陰性對(duì)照組,只加入與樣品DNA量相同的無(wú)菌雙蒸水。PCR產(chǎn)物在以0.5×TBE為電泳液的10g/L瓊脂糖凝膠中電泳,0.5mg/L溴化乙錠(EB)染色,紫外分析儀下觀(guān)察,凝膠成像系統(tǒng)攝像。
1.2.3 PCR產(chǎn)物的克隆及篩選 用DNA膠回收試劑盒對(duì)擴(kuò)增片段進(jìn)行純化,純化產(chǎn)物連接到pGEM-T Easy載體上,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至感受態(tài)細(xì)胞JM 109中,振蕩培養(yǎng)后涂布在含氨芐青霉素和
圖1 犬源賈第蟲(chóng)EF1α基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.1PCR amplification result of EF1αgene from Giardia lamblia
犬源賈第蟲(chóng)EF1α基因PCR擴(kuò)增序列長(zhǎng)為288bp,其序列核苷酸組成(圖3)。將測(cè)序結(jié)果在NCBI中進(jìn)行Blast比對(duì),然后從GenBank中下載IPTG的LB平板上,過(guò)夜培養(yǎng)后挑選白色的單菌落,進(jìn)行菌液PCR鑒定,篩選出陽(yáng)性克隆。
圖3 犬源賈第蟲(chóng)EF1α基因的序列Fig.3 Sequence of the dog-derived Giardia EF1αgene
1.2.4 序列測(cè)定與分析 挑選樣本中鑒定為陽(yáng)性的菌液送上海英濰捷基貿(mào)易有限公司進(jìn)行測(cè)序,Blast比對(duì)測(cè)序結(jié)果,然后從GenBank下載相關(guān)序列用DNA Star軟件進(jìn)行序列分析與比較,并構(gòu)建分子系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。
PCR擴(kuò)增出的片段為288bp左右,與預(yù)期目的片段大小一致(圖1)。
用純化回收試劑盒回收樣品的PCR產(chǎn)物并將之克隆到pGEM-T Easy載體中,然后轉(zhuǎn)化至感受態(tài)細(xì)胞JM 109,然后進(jìn)行菌液PCR鑒定,得到的片段為288bp左右,與預(yù)期目的條帶大小一致(圖2)。相關(guān)序列,采用DNA Star軟件建立系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖4)。結(jié)果表明本次分離的廣州犬源賈第蟲(chóng)基因型為D型。
圖2 重組質(zhì)粒的PCR鑒定Fig.2dentification of recombinant plasmids by PCR
圖4 犬源賈第蟲(chóng)EF1α基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)Fig.4 The phylogenetic tree on EF1αgene of the dog-derived Giardia
藍(lán)氏賈第蟲(chóng)(Giardialamblia)是一種呈世界性分布的人獸共感染的寄生性原蟲(chóng)。據(jù)WHO估計(jì),賈第蟲(chóng)全世界人口的感染率約為30%,在我國(guó),各地區(qū)感染率不同,約在1%~20%左右(平均約2.54%)[6]。在美國(guó),每年大約有2.8×106人感染賈第蟲(chóng),因此賈第蟲(chóng)被稱(chēng)為“頭號(hào)腸道寄生蟲(chóng)”[7]。近年來(lái),寵物犬深受人們喜愛(ài),但寵物犬能感染人獸共患賈第蟲(chóng)基因型,這可能會(huì)通過(guò)多種途徑傳染給人,對(duì)人類(lèi)健康構(gòu)成潛在威脅[8]。因此,對(duì)寵物犬源賈第蟲(chóng)進(jìn)行分子鑒定及準(zhǔn)確分型具有重要的公共衛(wèi)生意義。
藍(lán)氏賈第蟲(chóng)是一個(gè)復(fù)雜的集合體,至少可分為7個(gè)有效集聚體或基因型(A~G)。其中只有A和B型是人獸共患的基因型,可感染包括人在內(nèi)的大部分哺乳動(dòng)物。A型主要有AⅠ和AⅡ,AⅠ為人獸共患型,AⅡ只感染動(dòng)物;B型是人獸共患型且宿主范圍較廣;C和D型主要感染犬;E型可感染反芻動(dòng)物;F和G型可分別感染貓和家鼠[9]。分子生物學(xué)技術(shù)是對(duì)賈第蟲(chóng)進(jìn)行分子鑒定及基因型鑒定的重要手段,目前,常用于賈第蟲(chóng)基因型鑒定的分子標(biāo)記主要有小亞基核糖體RNA基因(SSU-rRNA)、磷酸丙糖異構(gòu)酶基因(tpi)、谷氨酸脫氫酶基因(gdh)、β-賈第素基因(bg)和α-延伸因子1基因(ef1-α)等[10]。肖淑敏等[11]針對(duì)16SrRNA基因和內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)ITS-rRNA基因序列設(shè)計(jì)引物,首次對(duì)我國(guó)分離的牛源賈第蟲(chóng)進(jìn)行了基因型鑒定,結(jié)果為E型。朱海波等[12]用16SrRNA基因和gdh基因作為分子標(biāo)記,對(duì)廣東首株犬源賈第蟲(chóng)進(jìn)行了基因型鑒定,16S-rRNA基因的序列分析結(jié)果顯示該犬源賈第蟲(chóng)的基因型為A型,對(duì)gdh基因序列進(jìn)一步分析顯示該基因型為AⅠ亞型,屬于人獸共患基因型。Minvielle M C等[13]利用tpi基因設(shè)計(jì)引物,對(duì)采自阿根廷的60份兒童糞樣進(jìn)行基因型鑒定,結(jié)果顯示43份為陽(yáng)性,其中3份為AⅡ型,40份為B型。Caccio S M等[14]用bg基因鑒定出人源賈第蟲(chóng)的基因型為AⅠ、AⅡ、BⅠ和BⅡ和BⅢ。Lalle M等[15]針對(duì)bg基因設(shè)計(jì)引物對(duì)意大利的含有賈第蟲(chóng)包囊的37份人糞樣和25份狗糞樣進(jìn)行巢式PCR擴(kuò)增,結(jié)果顯示,人糞樣中只檢測(cè)到A型和B型。狗糞樣中6份為A型,其余均為C型和D型,
本研究根據(jù)GenBank中登錄的賈第蟲(chóng)EF1α基因序列設(shè)計(jì)引物,首次對(duì)我國(guó)廣州犬糞中分離的賈第蟲(chóng)EF1α基因進(jìn)行了擴(kuò)增、克隆和測(cè)序。結(jié)果表明,本次分離的犬源賈第蟲(chóng)基因型為藍(lán)氏賈第蟲(chóng)D型,且EF1α基因適合做分子標(biāo)記,可準(zhǔn)確地對(duì)賈第蟲(chóng)進(jìn)行基因分型。同時(shí),本試驗(yàn)所測(cè)得的賈第蟲(chóng)EF1α序列系國(guó)內(nèi)首次報(bào)道,為賈第蟲(chóng)的分子遺傳學(xué)及分子流行病學(xué)的進(jìn)一步研究提供了有價(jià)值的科學(xué)資料。
[1]Xiao L,F(xiàn)ayer R.Molecular characterisation of species and genotypes of Cryptosporidium and Giardia and assessment of zoonotic transmission[J].Int J Parasitol,2008,38(11):1239-1255.
[2]Sulaiman I M,F(xiàn)ayer R,Bern C,et a1.Triosephosphate isomerase gene characterization and potential zoonotic transmission ofGiardiaduodenalis[J].Emerg Infect Dis,2003,9(11):1444-1452.
[3]CacciòS M,Ryan U.Molecular epidemiology of giardiasis[J].Mol Biochem Parasitol,2008,160(2):75-80.
[4]Sandhu H,Mahajan R C,Ganguly N K.Flowcytometric assessment of the effect of drugs on Giardia lamblia trophozoitesinvitro[J].Mol Cell Biochem,2004,265:151-160.
[5]Elmendorf H G,Dawson S C,McCaffery J M.The cytoskeleton of Giardia lamblia[J].Int J Parasitol,2003,33(1):3-28.
[6]盧思奇.國(guó)內(nèi)藍(lán)氏賈第鞭毛蟲(chóng)研究[J].寄生蟲(chóng)與醫(yī)學(xué)昆蟲(chóng)學(xué)報(bào),1999,6(4):193-197.
[7]衛(wèi) 茹,田喜風(fēng),閻靜波,等.藍(lán)氏賈第鞭毛蟲(chóng)感染的免疫學(xué)診斷方法[J].世界華人消化雜志,2006,14:3487-3492.
[8]Smith H V,Cacci S M,Cook N,et a1.Cryptosporidium and Giardia as foodborne zoonoses[J].Vet Parasitol,2007,149(1-2):29-40.
[9]Scaramozzino P,Cave D D,Berrilli F,et al.A study of the prevalence and genotypes of Giardia duodenalis infecting kennelled dogs[J].Vet J,2009,182(2):231-234.
[10]CacciòS M,Thompson R C,Mclauchlin J,et al.Unravelling Cryptosporidium and Giardia epidemiology[J].Trends Parasitol,2005,21(9):430-437.
[11]肖淑敏,李國(guó)清,王 波,等.我國(guó)首株牛源賈第蟲(chóng)的分子鑒定[J].中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào),2006,22(9):861-863.
[12]朱海波,李國(guó)清,張 萍,等.廣東首株犬源賈第蟲(chóng)的基因型鑒定[J].中國(guó)獸醫(yī)科學(xué),2011,41(2):143-147.
[13]Minvielle M C,Molina N B,Polverino D,et al.First genotyping of Giardia lamblia from human and animal feces in Ar-gentina,South America[J].Mem Inst Oswaldo Cruz,2008,103(1):98-103.
[14]CacciòSM,De Giacomo M,Pozio E.et al.Sequence analysis of beta-giardin gene and development of a polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism assay to genotype Giardia duodenalis cysts from human faecal samples[J].Int J Parasitol,2002,32(8):1023-1030.
[15]Lalle M,Pozio E,Capelli G,et al.Genetic heterogeneity at theβ-giardin locus among human and animal isolates of Giardia duodenalis and identification of potentially zoonotic subgenotypes[J].Int J Parasitol,2005(2):35:207-213.